More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_1618 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_1618  aminodeoxychorismate lyase  100 
 
 		 345 aa  716    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.122439  normal  0.126639 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5013  aminodeoxychorismate lyase  56.94 
 
 		 345 aa  428  1e-119  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1072  hypothetical protein  49.55 
 
 		 337 aa  347  1e-94  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.524315 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1094  hypothetical protein  41.92 
 
 		 352 aa  284  1.0000000000000001e-75  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.38305 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5921  aminodeoxychorismate lyase  42.86 
 
 		 352 aa  273  4.0000000000000004e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.108379  normal  0.71245 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1845  aminodeoxychorismate lyase  42.68 
 
 		 348 aa  270  4e-71  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.575162  hitchhiker  0.00667659 
 
 
-
 
NC_002950  PG1694  hypothetical protein  41 
 
 		 364 aa  263  4e-69  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.717086 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12763  putative aminodeoxychorismate lyase  38.51 
 
 		 347 aa  236  5.0000000000000005e-61  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1696  aminodeoxychorismate lyase  38.11 
 
 		 341 aa  234  2.0000000000000002e-60  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0016  aminodeoxychorismate lyase  37.79 
 
 		 344 aa  230  3e-59  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2268  aminodeoxychorismate lyase  40.33 
 
 		 347 aa  224  2e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2733  aminodeoxychorismate lyase  37.07 
 
 		 337 aa  198  1.0000000000000001e-49  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.269056  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0045  aminodeoxychorismate lyase  37.69 
 
 		 336 aa  197  2.0000000000000003e-49  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.266308  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0321  aminodeoxychorismate lyase-like protein  31.87 
 
 		 363 aa  187  2e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2534  aminodeoxychorismate lyase  35.03 
 
 		 339 aa  178  1e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.714245  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2275  aminodeoxychorismate lyase  35.76 
 
 		 349 aa  177  3e-43  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2122  aminodeoxychorismate lyase  36.6 
 
 		 340 aa  176  5e-43  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2514  aminodeoxychorismate lyase  32.31 
 
 		 337 aa  167  2.9999999999999998e-40  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.636222  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2905  aminodeoxychorismate lyase  33.94 
 
 		 337 aa  160  4e-38  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2459  aminodeoxychorismate lyase  33.33 
 
 		 344 aa  156  5.0000000000000005e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.5911  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003000  hypothetical protein  31.67 
 
 		 338 aa  151  2e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0577137  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02904  hypothetical protein  32.55 
 
 		 338 aa  149  5e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0918  aminodeoxychorismate lyase  34.33 
 
 		 345 aa  149  7e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.174013  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1417  aminodeoxychorismate lyase  31.66 
 
 		 338 aa  147  4.0000000000000006e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.626218  normal  0.75601 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0650  periplasmic solute-binding protein, aminodeoxychorismate lyase-like  31.16 
 
 		 356 aa  144  2e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.368295  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1776  aminodeoxychorismate lyase  30.24 
 
 		 355 aa  144  2e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.81136  normal  0.183273 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1603  hypothetical protein  33.33 
 
 		 338 aa  144  3e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0141578  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1501  aminodeoxychorismate lyase  31.66 
 
 		 334 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00653214  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2244  aminodeoxychorismate lyase  30.56 
 
 		 336 aa  138  1e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00467758  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0625  aminodeoxychorismate lyase  32.2 
 
 		 357 aa  137  2e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0512441  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0871  aminodeoxychorismate lyase  31.33 
 
 		 339 aa  135  9.999999999999999e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1605  aminodeoxychorismate lyase  30.77 
 
 		 339 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0288124  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0030  aminodeoxychorismate lyase  32.91 
 
 		 349 aa  133  3.9999999999999996e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.647846  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1660  aminodeoxychorismate lyase  31 
 
 		 336 aa  132  9e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.132451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1735  aminodeoxychorismate lyase  31 
 
 		 336 aa  132  9e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.163239  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0508  hypothetical protein  30.9 
 
 		 340 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1129  aminodeoxychorismate lyase  31.25 
 
 		 336 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.399769 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2803  aminodeoxychorismate lyase  30.18 
 
 		 339 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0153211  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1591  aminodeoxychorismate lyase  29.91 
 
 		 343 aa  130  4.0000000000000003e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0649717  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3021  aminodeoxychorismate lyase  28.18 
 
 		 358 aa  130  4.0000000000000003e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.157507  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1203  aminodeoxychorismate lyase  29.5 
 
 		 405 aa  129  7.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00148773 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0694  aminodeoxychorismate lyase  29 
 
 		 327 aa  129  7.000000000000001e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000296609 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1529  aminodeoxychorismate lyase  33.02 
 
 		 331 aa  129  8.000000000000001e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.305783  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3559  aminodeoxychorismate lyase  29.91 
 
 		 341 aa  129  8.000000000000001e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000155777  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0717  aminodeoxychorismate lyase  33.78 
 
 		 335 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.16974  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2499  aminodeoxychorismate lyase  29.6 
 
 		 339 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00196213  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1008  aminodeoxychorismate lyase  29.87 
 
 		 373 aa  128  1.0000000000000001e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00821655  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0607  hypothetical protein  30.25 
 
 		 370 aa  127  2.0000000000000002e-28  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000669467  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1765  aminodeoxychorismate lyase  31.67 
 
 		 336 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0979727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1578  hypothetical protein  30.25 
 
 		 343 aa  127  3e-28  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00227984  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0748  aminodeoxychorismate lyase  29.63 
 
 		 399 aa  127  3e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.309418  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1532  hypothetical protein  29.5 
 
 		 414 aa  127  4.0000000000000003e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0269325  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3279  aminodeoxychorismate lyase  29.19 
 
 		 376 aa  126  5e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.258116  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1544  aminodeoxychorismate lyase  31.85 
 
 		 333 aa  126  6e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0483176  normal  0.0781021 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2118  aminodeoxychorismate lyase  30.3 
 
 		 312 aa  126  6e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0134865  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1863  aminodeoxychorismate lyase  28.57 
 
 		 356 aa  125  9e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.322444  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2634  aminodeoxychorismate lyase  28.25 
 
 		 343 aa  125  1e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2301  hypothetical protein  30.09 
 
 		 337 aa  125  1e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.142743  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1637  aminodeoxychorismate lyase  33.22 
 
 		 352 aa  125  1e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.521882 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2614  hypothetical protein  31.67 
 
 		 336 aa  124  2e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0417  aminodeoxychorismate lyase  30.13 
 
 		 331 aa  124  2e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0682  aminodeoxychorismate lyase  27.95 
 
 		 333 aa  124  3e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0424367  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0557  aminodeoxychorismate lyase  30.54 
 
 		 326 aa  124  3e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.245938  normal  0.0550645 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0005  aminodeoxychorismate lyase  31.23 
 
 		 327 aa  123  4e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000992333  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1231  aminodeoxychorismate lyase  29.39 
 
 		 343 aa  123  4e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2215  aminodeoxychorismate lyase  30.13 
 
 		 345 aa  123  4e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2521  aminodeoxychorismate lyase  29.59 
 
 		 372 aa  123  4e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2516  aminodeoxychorismate lyase  33.44 
 
 		 351 aa  123  4e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.470286  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0732  hypothetical protein TIGR00247  28.01 
 
 		 356 aa  123  5e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000024462  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1497  aminodeoxychorismate lyase  29.83 
 
 		 351 aa  123  5e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1641  hypothetical protein  28.75 
 
 		 350 aa  123  6e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.667934  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1435  aminodeoxychorismate lyase  29.45 
 
 		 344 aa  123  6e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1584  aminodeoxychorismate lyase  29.18 
 
 		 364 aa  122  7e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0339039  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1488  hypothetical protein  31.25 
 
 		 346 aa  122  9e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0806646  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2460  aminodeoxychorismate lyase  30 
 
 		 345 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00717262  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2573  aminodeoxychorismate lyase  30 
 
 		 345 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0650379  normal  0.0398652 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0484  aminodeoxychorismate lyase  28.71 
 
 		 335 aa  122  9.999999999999999e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1060  aminodeoxychorismate lyase  28.7 
 
 		 412 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.017221 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3717  aminodeoxychorismate lyase  28.99 
 
 		 471 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.444196  normal  0.13956 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2453  aminodeoxychorismate lyase  30 
 
 		 345 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0182667  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3618  aminodeoxychorismate lyase  28.82 
 
 		 362 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000276729  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2044  hypothetical protein  34.26 
 
 		 324 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.47923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1891  aminodeoxychorismate lyase  30 
 
 		 345 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.253385  normal  0.0515475 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0842  aminodeoxychorismate lyase  30.61 
 
 		 327 aa  121  1.9999999999999998e-26  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0834555 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02713  hypothetical protein  31.1 
 
 		 357 aa  121  1.9999999999999998e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.117678  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0448  aminodeoxychorismate lyase  32.67 
 
 		 312 aa  121  1.9999999999999998e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.83946 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0473  periplasmic solute-binding protein  28.49 
 
 		 345 aa  120  1.9999999999999998e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0206414  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2728  aminodeoxychorismate lyase  27.94 
 
 		 343 aa  120  3e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4504  conserved hypothetical protein TIGR00247  27.73 
 
 		 356 aa  120  3e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1410  aminodeoxychorismate lyase  29.64 
 
 		 347 aa  120  3e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1871  aminodeoxychorismate lyase  30.48 
 
 		 336 aa  120  3e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4464  conserved hypothetical protein TIGR00247  28.01 
 
 		 356 aa  120  3e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000911703 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4128  aminodeoxychorismate lyase  28.01 
 
 		 356 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000574197  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0419  aminodeoxychorismate lyase  28.91 
 
 		 328 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.290965  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0574  aminodeoxychorismate lyase  28.2 
 
 		 403 aa  120  3.9999999999999996e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4517  conserved hypothetical protein TIGR00247  27.73 
 
 		 356 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000911066  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1077  aminodeoxychorismate lyase  31.21 
 
 		 315 aa  119  7e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.578473  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2268  aminodeoxychorismate lyase  32.09 
 
 		 343 aa  119  7.999999999999999e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.642  normal  0.198206 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1922  aminodeoxychorismate lyase  30.59 
 
 		 335 aa  119  7.999999999999999e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0308  aminodeoxychorismate lyase  31.25 
 
 		 440 aa  119  9e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>