More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_2728 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011891  A2cp1_2728  aminodeoxychorismate lyase  100 
 
 		 343 aa  696    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2634  aminodeoxychorismate lyase  99.13 
 
 		 343 aa  688    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1231  aminodeoxychorismate lyase  96.88 
 
 		 343 aa  603  9.999999999999999e-173  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2536  aminodeoxychorismate lyase  75.62 
 
 		 338 aa  452  1.0000000000000001e-126  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.408514 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0625  aminodeoxychorismate lyase  42.73 
 
 		 357 aa  242  6e-63  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0512441  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2459  aminodeoxychorismate lyase  40.88 
 
 		 344 aa  210  3e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.5911  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0308  aminodeoxychorismate lyase  42.63 
 
 		 440 aa  207  3e-52  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0557  aminodeoxychorismate lyase  39.29 
 
 		 326 aa  204  1e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.245938  normal  0.0550645 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0650  periplasmic solute-binding protein, aminodeoxychorismate lyase-like  38.21 
 
 		 356 aa  201  9.999999999999999e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.368295  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0508  hypothetical protein  39.94 
 
 		 340 aa  199  5e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0682  aminodeoxychorismate lyase  36.36 
 
 		 333 aa  199  6e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0424367  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0694  aminodeoxychorismate lyase  37.63 
 
 		 327 aa  197  3e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000296609 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3021  aminodeoxychorismate lyase  39 
 
 		 358 aa  192  6e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.157507  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1544  aminodeoxychorismate lyase  42.33 
 
 		 333 aa  192  7e-48  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0483176  normal  0.0781021 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3279  aminodeoxychorismate lyase  37.58 
 
 		 376 aa  192  7e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.258116  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14960  hypothetical protein  40.66 
 
 		 358 aa  191  1e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0419  aminodeoxychorismate lyase  38.93 
 
 		 328 aa  190  2e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.290965  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1090  aminodeoxychorismate lyase  40.48 
 
 		 331 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0030  aminodeoxychorismate lyase  41.81 
 
 		 349 aa  190  2.9999999999999997e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.647846  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2573  aminodeoxychorismate lyase  38.23 
 
 		 345 aa  187  2e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0650379  normal  0.0398652 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2453  aminodeoxychorismate lyase  38.23 
 
 		 345 aa  187  2e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0182667  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2460  aminodeoxychorismate lyase  38.23 
 
 		 345 aa  187  2e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00717262  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1660  aminodeoxychorismate lyase  37.93 
 
 		 336 aa  187  2e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.132451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1735  aminodeoxychorismate lyase  37.93 
 
 		 336 aa  187  2e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.163239  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1891  aminodeoxychorismate lyase  37.92 
 
 		 345 aa  186  4e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.253385  normal  0.0515475 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0315  aminodeoxychorismate lyase  39.74 
 
 		 389 aa  186  6e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2351  aminodeoxychorismate lyase  41.91 
 
 		 620 aa  185  1.0000000000000001e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.260551 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1632  aminodeoxychorismate lyase  39.83 
 
 		 351 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2614  hypothetical protein  37.66 
 
 		 336 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1532  hypothetical protein  37.8 
 
 		 414 aa  184  2.0000000000000003e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0269325  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2215  aminodeoxychorismate lyase  36.99 
 
 		 345 aa  183  3e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0918  aminodeoxychorismate lyase  38.13 
 
 		 345 aa  183  3e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.174013  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3387  aminodeoxychorismate lyase  39.64 
 
 		 329 aa  183  4.0000000000000006e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.107935  normal  0.0743499 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1467  aminodeoxychorismate lyase  40.48 
 
 		 332 aa  183  4.0000000000000006e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0630531  normal  0.0141986 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1919  aminodeoxychorismate lyase  39.54 
 
 		 363 aa  182  9.000000000000001e-45  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.402452  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1716  aminodeoxychorismate lyase  37.76 
 
 		 333 aa  180  2.9999999999999997e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.998027  normal  0.24374 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3618  aminodeoxychorismate lyase  36.36 
 
 		 362 aa  180  4e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000276729  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1417  aminodeoxychorismate lyase  39.14 
 
 		 338 aa  180  4e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.626218  normal  0.75601 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2516  aminodeoxychorismate lyase  39.74 
 
 		 351 aa  178  1e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.470286  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1426  aminodeoxychorismate lyase  41.28 
 
 		 332 aa  178  1e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.219736  normal  0.242343 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1637  aminodeoxychorismate lyase  39.06 
 
 		 352 aa  177  2e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.521882 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1765  aminodeoxychorismate lyase  37.03 
 
 		 336 aa  177  2e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0979727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1791  aminodeoxychorismate lyase  36.15 
 
 		 339 aa  177  3e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00439567  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0748  aminodeoxychorismate lyase  37 
 
 		 399 aa  177  3e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.309418  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1988  aminodeoxychorismate lyase  37.17 
 
 		 345 aa  177  3e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1831  aminodeoxychorismate lyase  44.23 
 
 		 339 aa  177  3e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5194  aminodeoxychorismate lyase  44.11 
 
 		 339 aa  176  6e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.374187 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2044  hypothetical protein  38.18 
 
 		 324 aa  176  6e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.47923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2521  aminodeoxychorismate lyase  37.43 
 
 		 372 aa  175  8e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1380  aminodeoxychorismate lyase  43.73 
 
 		 339 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1877  aminodeoxychorismate lyase  40 
 
 		 328 aa  175  9.999999999999999e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.10744 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1776  aminodeoxychorismate lyase  36.39 
 
 		 355 aa  175  9.999999999999999e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.81136  normal  0.183273 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2254  aminodeoxychorismate lyase  37.58 
 
 		 323 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0574  aminodeoxychorismate lyase  38.54 
 
 		 403 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1494  aminodeoxychorismate lyase  38.19 
 
 		 400 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1803  aminodeoxychorismate lyase  43.85 
 
 		 339 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0606768  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25730  hypothetical protein  38.21 
 
 		 349 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0867332  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0005  aminodeoxychorismate lyase  39 
 
 		 327 aa  174  2.9999999999999996e-42  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000992333  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1529  aminodeoxychorismate lyase  38.19 
 
 		 387 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.538963 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1129  aminodeoxychorismate lyase  36.42 
 
 		 336 aa  173  2.9999999999999996e-42  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.399769 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1917  aminodeoxychorismate lyase  44.23 
 
 		 339 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.136892 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0466  hypothetical protein  38.87 
 
 		 438 aa  172  5e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.262236  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6185  aminodeoxychorismate lyase  43.73 
 
 		 339 aa  172  5e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1894  aminodeoxychorismate lyase  43.73 
 
 		 339 aa  172  5e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.474153  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1783  hypothetical protein  40.6 
 
 		 377 aa  172  5.999999999999999e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0308564  normal  0.608544 
 
 
-
 
NC_004310  BR0462  hypothetical protein  38.87 
 
 		 412 aa  172  5.999999999999999e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.218984  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1918  aminodeoxychorismate lyase  37.5 
 
 		 421 aa  172  6.999999999999999e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.204138  unclonable  0.000000331509 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1651  hypothetical protein  35.95 
 
 		 371 aa  172  6.999999999999999e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.245799  normal  0.342253 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1578  aminodeoxychorismate lyase  34.5 
 
 		 335 aa  172  6.999999999999999e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.853067  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1605  aminodeoxychorismate lyase  37.83 
 
 		 339 aa  172  7.999999999999999e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0288124  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2198  hypothetical protein  37.87 
 
 		 349 aa  172  9e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.850653  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2520  aminodeoxychorismate lyase  38.98 
 
 		 325 aa  171  1e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0480566  hitchhiker  0.003327 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1042  aminodeoxychorismate lyase  38.12 
 
 		 336 aa  171  1e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0148163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3796  aminodeoxychorismate lyase  37.42 
 
 		 406 aa  172  1e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.77523  normal  0.494507 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1435  aminodeoxychorismate lyase  34.71 
 
 		 344 aa  171  2e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0204  aminodeoxychorismate lyase  33.57 
 
 		 314 aa  171  2e-41  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1765  aminodeoxychorismate lyase  36.13 
 
 		 391 aa  171  2e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.310683  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2262  aminodeoxychorismate lyase  34.58 
 
 		 344 aa  170  3e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.945495  hitchhiker  0.000317634 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3821  hypothetical protein  35.44 
 
 		 406 aa  170  3e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.133528 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2153  hypothetical protein  40.74 
 
 		 339 aa  170  4e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.692536  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1497  aminodeoxychorismate lyase  33.11 
 
 		 351 aa  170  4e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1830  aminodeoxychorismate lyase  38.87 
 
 		 342 aa  169  5e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0484  aminodeoxychorismate lyase  30.65 
 
 		 335 aa  169  6e-41  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2783  aminodeoxychorismate lyase  35.22 
 
 		 456 aa  169  6e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1426  putative lipoprotein  41.16 
 
 		 339 aa  169  9e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.425496  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1190  putative lipoprotein  41.16 
 
 		 339 aa  169  9e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1917  hypothetical protein  41.16 
 
 		 339 aa  169  9e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2444  hypothetical protein  41.16 
 
 		 339 aa  169  9e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.700087  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2321  putative lipoprotein  41.16 
 
 		 339 aa  169  9e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2282  putative lipoprotein  41.16 
 
 		 339 aa  169  9e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3387  putative lipoprotein  41.16 
 
 		 339 aa  169  9e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2859  aminodeoxychorismate lyase  38.85 
 
 		 340 aa  168  1e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4153  aminodeoxychorismate lyase  36.57 
 
 		 393 aa  168  1e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.507493  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4657  aminodeoxychorismate lyase  36.18 
 
 		 362 aa  168  1e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.333524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1910  aminodeoxychorismate lyase  35.8 
 
 		 341 aa  168  1e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000953369  decreased coverage  0.000000738863 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3828  hypothetical protein  35.39 
 
 		 379 aa  167  2e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0420652  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1603  hypothetical protein  35.03 
 
 		 338 aa  167  2e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0141578  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2198  aminodeoxychorismate lyase  37.12 
 
 		 331 aa  166  4e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.955684 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3494  hypothetical protein  33.62 
 
 		 363 aa  166  4e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000556203  normal  0.010619 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2241  aminodeoxychorismate lyase  36.3 
 
 		 337 aa  166  4e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>