More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_0918 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010424  Daud_0918  aminodeoxychorismate lyase  100 
 
 
345 aa  691    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.174013  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0900  aminodeoxychorismate lyase  49.52 
 
 
338 aa  318  9e-86  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2262  aminodeoxychorismate lyase  42.39 
 
 
344 aa  283  4.0000000000000003e-75  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.945495  hitchhiker  0.000317634 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1435  aminodeoxychorismate lyase  48.28 
 
 
344 aa  271  9e-72  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1637  aminodeoxychorismate lyase  47.3 
 
 
352 aa  261  1e-68  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.521882 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1497  aminodeoxychorismate lyase  41.72 
 
 
351 aa  245  9e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1776  aminodeoxychorismate lyase  42.01 
 
 
355 aa  240  2e-62  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.81136  normal  0.183273 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0473  periplasmic solute-binding protein  39.82 
 
 
345 aa  238  1e-61  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0206414  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05820  aminodeoxychorismate lyase  38.6 
 
 
337 aa  231  2e-59  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0160306  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2516  aminodeoxychorismate lyase  44.31 
 
 
351 aa  226  6e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.470286  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0871  aminodeoxychorismate lyase  38.69 
 
 
339 aa  215  9.999999999999999e-55  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4231  aminodeoxychorismate lyase  37.01 
 
 
356 aa  212  7e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000711244  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0733  aminodeoxychorismate lyase  39.31 
 
 
335 aa  211  2e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.224262  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4517  conserved hypothetical protein TIGR00247  36.57 
 
 
356 aa  210  3e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000911066  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4280  hypothetical protein  36.86 
 
 
356 aa  210  3e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000498286  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4376  aminodeoxychorismate lyase  36.52 
 
 
362 aa  209  4e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0936456  normal  0.529135 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0732  hypothetical protein TIGR00247  36.96 
 
 
356 aa  209  5e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000024462  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4612  hypothetical protein  36.86 
 
 
351 aa  209  5e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000312577  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2459  aminodeoxychorismate lyase  40.96 
 
 
344 aa  209  7e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.5911  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4504  conserved hypothetical protein TIGR00247  36.96 
 
 
356 aa  208  9e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0966  aminodeoxychorismate lyase  36.86 
 
 
363 aa  208  1e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4464  conserved hypothetical protein TIGR00247  36.86 
 
 
356 aa  208  1e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000911703 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4128  aminodeoxychorismate lyase  36.57 
 
 
356 aa  207  3e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000574197  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4117  aminodeoxychorismate lyase  36.57 
 
 
356 aa  205  9e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000093714  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3559  aminodeoxychorismate lyase  36.2 
 
 
341 aa  204  2e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000155777  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3097  aminodeoxychorismate lyase  37.35 
 
 
355 aa  203  3e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00109006  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0625  aminodeoxychorismate lyase  40.54 
 
 
357 aa  204  3e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0512441  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1743  hypothetical protein  33.53 
 
 
333 aa  202  7e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2026  hypothetical protein  33.53 
 
 
333 aa  202  8e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2486  aminodeoxychorismate lyase  35.82 
 
 
364 aa  201  9.999999999999999e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00502838  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3618  aminodeoxychorismate lyase  39.19 
 
 
362 aa  200  3e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000276729  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1791  aminodeoxychorismate lyase  37.01 
 
 
339 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00439567  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0650  periplasmic solute-binding protein, aminodeoxychorismate lyase-like  36.36 
 
 
356 aa  197  3e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.368295  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1008  aminodeoxychorismate lyase  35.38 
 
 
373 aa  196  4.0000000000000005e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00821655  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3021  aminodeoxychorismate lyase  39.13 
 
 
358 aa  196  6e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.157507  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1472  aminodeoxychorismate lyase  32.39 
 
 
424 aa  194  2e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.120948  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1863  aminodeoxychorismate lyase  34.01 
 
 
356 aa  191  1e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.322444  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1417  aminodeoxychorismate lyase  39.14 
 
 
338 aa  191  1e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.626218  normal  0.75601 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0508  hypothetical protein  41.38 
 
 
340 aa  191  2e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1129  aminodeoxychorismate lyase  36.28 
 
 
336 aa  191  2e-47  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.399769 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3279  aminodeoxychorismate lyase  39.58 
 
 
376 aa  190  2.9999999999999997e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.258116  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1605  aminodeoxychorismate lyase  40.23 
 
 
339 aa  187  2e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0288124  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0557  aminodeoxychorismate lyase  37.39 
 
 
326 aa  186  4e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.245938  normal  0.0550645 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1090  aminodeoxychorismate lyase  42.37 
 
 
331 aa  186  7e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1543  hypothetical protein  36.49 
 
 
340 aa  185  1.0000000000000001e-45  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2044  hypothetical protein  38.71 
 
 
324 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.47923  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1837  aminodeoxychorismate lyase  38.99 
 
 
360 aa  182  5.0000000000000004e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05120  conserved hypothetical protein TIGR00247  40.53 
 
 
403 aa  182  6e-45  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.924204  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0030  aminodeoxychorismate lyase  36.84 
 
 
349 aa  182  6e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.647846  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0484  aminodeoxychorismate lyase  34.08 
 
 
335 aa  181  2e-44  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1410  aminodeoxychorismate lyase  35.28 
 
 
347 aa  180  2.9999999999999997e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0448  aminodeoxychorismate lyase  37.5 
 
 
312 aa  179  4.999999999999999e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.83946 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2783  aminodeoxychorismate lyase  36.47 
 
 
456 aa  179  8e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2733  aminodeoxychorismate lyase  39.37 
 
 
337 aa  179  9e-44  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.269056  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1361  aminodeoxychorismate lyase  40.07 
 
 
370 aa  177  3e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0615754  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3134  aminodeoxychorismate lyase  36.07 
 
 
442 aa  176  4e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.486263 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1578  hypothetical protein  34.24 
 
 
343 aa  176  4e-43  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00227984  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0531  aminodeoxychorismate lyase  35.91 
 
 
464 aa  175  9e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.40268 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0682  aminodeoxychorismate lyase  36.79 
 
 
333 aa  175  9.999999999999999e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0424367  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2275  aminodeoxychorismate lyase  34.29 
 
 
349 aa  174  1.9999999999999998e-42  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14960  hypothetical protein  34.57 
 
 
358 aa  174  1.9999999999999998e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1488  hypothetical protein  32.06 
 
 
346 aa  174  1.9999999999999998e-42  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0806646  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2118  aminodeoxychorismate lyase  35 
 
 
312 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0134865  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2351  aminodeoxychorismate lyase  36.51 
 
 
620 aa  173  3.9999999999999995e-42  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.260551 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0607  hypothetical protein  34.38 
 
 
370 aa  173  3.9999999999999995e-42  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000669467  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0308  aminodeoxychorismate lyase  37.16 
 
 
440 aa  173  3.9999999999999995e-42  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07820  conserved hypothetical protein TIGR00247  37.7 
 
 
389 aa  172  5.999999999999999e-42  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0223518 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0694  aminodeoxychorismate lyase  35.18 
 
 
327 aa  172  6.999999999999999e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000296609 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2514  aminodeoxychorismate lyase  38.85 
 
 
337 aa  172  9e-42  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.636222  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2023  aminodeoxychorismate lyase  38.89 
 
 
363 aa  171  1e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.309788  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1060  aminodeoxychorismate lyase  37.67 
 
 
412 aa  171  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.017221 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0315  aminodeoxychorismate lyase  34.94 
 
 
389 aa  171  2e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0005  aminodeoxychorismate lyase  37.66 
 
 
327 aa  170  3e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000992333  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2198  hypothetical protein  33.95 
 
 
349 aa  170  3e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.850653  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0495  aminodeoxychorismate lyase  34.42 
 
 
467 aa  170  4e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.843817  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0560  aminodeoxychorismate lyase  34.42 
 
 
467 aa  170  4e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.133777  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0842  aminodeoxychorismate lyase  35.22 
 
 
327 aa  169  4e-41  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0834555 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1632  aminodeoxychorismate lyase  35.4 
 
 
351 aa  169  5e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1765  aminodeoxychorismate lyase  34.57 
 
 
391 aa  169  5e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.310683  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2215  aminodeoxychorismate lyase  35.37 
 
 
345 aa  169  7e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2534  aminodeoxychorismate lyase  38.04 
 
 
339 aa  169  8e-41  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.714245  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2634  aminodeoxychorismate lyase  38.13 
 
 
343 aa  169  9e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3195  aminodeoxychorismate lyase  38.41 
 
 
454 aa  169  9e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.934507  hitchhiker  0.00937701 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2728  aminodeoxychorismate lyase  38.13 
 
 
343 aa  169  9e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0748  aminodeoxychorismate lyase  36.86 
 
 
399 aa  168  1e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.309418  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1203  aminodeoxychorismate lyase  37.79 
 
 
405 aa  168  1e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00148773 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25730  hypothetical protein  33.33 
 
 
349 aa  168  1e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0867332  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2905  aminodeoxychorismate lyase  37.4 
 
 
337 aa  167  2e-40  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2122  aminodeoxychorismate lyase  38.46 
 
 
340 aa  167  2e-40  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1231  aminodeoxychorismate lyase  37.79 
 
 
343 aa  167  2e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3387  aminodeoxychorismate lyase  35.78 
 
 
329 aa  167  2e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.107935  normal  0.0743499 
 
 
-
 
NC_004310  BR0462  hypothetical protein  36.3 
 
 
412 aa  166  4e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.218984  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1891  aminodeoxychorismate lyase  34.9 
 
 
345 aa  166  6.9999999999999995e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.253385  normal  0.0515475 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0466  hypothetical protein  36.3 
 
 
438 aa  166  6.9999999999999995e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.262236  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2573  aminodeoxychorismate lyase  34.9 
 
 
345 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0650379  normal  0.0398652 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2453  aminodeoxychorismate lyase  34.9 
 
 
345 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0182667  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1578  aminodeoxychorismate lyase  34.68 
 
 
335 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.853067  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2460  aminodeoxychorismate lyase  34.9 
 
 
345 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00717262  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1467  aminodeoxychorismate lyase  36.54 
 
 
332 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0630531  normal  0.0141986 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1603  hypothetical protein  33.04 
 
 
338 aa  164  2.0000000000000002e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0141578  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>