More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU0508 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0508  hypothetical protein  100 
 
 		 340 aa  686    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3021  aminodeoxychorismate lyase  62.73 
 
 		 358 aa  413  1e-114  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.157507  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3618  aminodeoxychorismate lyase  57.69 
 
 		 362 aa  387  1e-106  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000276729  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0682  aminodeoxychorismate lyase  51.24 
 
 		 333 aa  353  2.9999999999999997e-96  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0424367  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0694  aminodeoxychorismate lyase  50.63 
 
 		 327 aa  345  6e-94  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000296609 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1090  aminodeoxychorismate lyase  58.51 
 
 		 331 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2459  aminodeoxychorismate lyase  53.7 
 
 		 344 aa  318  7e-86  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.5911  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0625  aminodeoxychorismate lyase  45.99 
 
 		 357 aa  270  2e-71  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0512441  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0650  periplasmic solute-binding protein, aminodeoxychorismate lyase-like  43.34 
 
 		 356 aa  269  5e-71  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.368295  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0900  aminodeoxychorismate lyase  37.65 
 
 		 338 aa  228  1e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3279  aminodeoxychorismate lyase  39.02 
 
 		 376 aa  224  1e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.258116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0557  aminodeoxychorismate lyase  40.25 
 
 		 326 aa  222  9e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.245938  normal  0.0550645 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1129  aminodeoxychorismate lyase  39.57 
 
 		 336 aa  216  2.9999999999999998e-55  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.399769 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1637  aminodeoxychorismate lyase  41.24 
 
 		 352 aa  213  3.9999999999999995e-54  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.521882 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1776  aminodeoxychorismate lyase  38.1 
 
 		 355 aa  207  2e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.81136  normal  0.183273 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2262  aminodeoxychorismate lyase  37.37 
 
 		 344 aa  206  4e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.945495  hitchhiker  0.000317634 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0473  periplasmic solute-binding protein  35.09 
 
 		 345 aa  204  1e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0206414  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0918  aminodeoxychorismate lyase  41.38 
 
 		 345 aa  202  8e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.174013  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0315  aminodeoxychorismate lyase  38.51 
 
 		 389 aa  199  5e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1497  aminodeoxychorismate lyase  33.55 
 
 		 351 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3387  aminodeoxychorismate lyase  37.46 
 
 		 329 aa  198  1.0000000000000001e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.107935  normal  0.0743499 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05820  aminodeoxychorismate lyase  33.13 
 
 		 337 aa  196  6e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0160306  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0030  aminodeoxychorismate lyase  38.1 
 
 		 349 aa  195  8.000000000000001e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.647846  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1578  hypothetical protein  33.14 
 
 		 343 aa  194  2e-48  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00227984  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1877  aminodeoxychorismate lyase  40.2 
 
 		 328 aa  194  2e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.10744 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2634  aminodeoxychorismate lyase  40.79 
 
 		 343 aa  193  3e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0308  aminodeoxychorismate lyase  37.86 
 
 		 440 aa  193  3e-48  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2351  aminodeoxychorismate lyase  37.91 
 
 		 620 aa  191  1e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.260551 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3134  aminodeoxychorismate lyase  35.24 
 
 		 442 aa  191  2e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.486263 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1435  aminodeoxychorismate lyase  38.33 
 
 		 344 aa  191  2e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2728  aminodeoxychorismate lyase  40.79 
 
 		 343 aa  190  2.9999999999999997e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1231  aminodeoxychorismate lyase  41.72 
 
 		 343 aa  190  2.9999999999999997e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0484  aminodeoxychorismate lyase  34.84 
 
 		 335 aa  189  4e-47  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1716  aminodeoxychorismate lyase  36.61 
 
 		 333 aa  189  5e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.998027  normal  0.24374 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1988  aminodeoxychorismate lyase  36.31 
 
 		 345 aa  188  1e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1791  aminodeoxychorismate lyase  37.62 
 
 		 339 aa  188  1e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00439567  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2254  aminodeoxychorismate lyase  38.18 
 
 		 323 aa  188  1e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1501  aminodeoxychorismate lyase  35.45 
 
 		 334 aa  188  1e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00653214  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0607  hypothetical protein  32.34 
 
 		 370 aa  188  1e-46  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000669467  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1783  hypothetical protein  38.87 
 
 		 377 aa  187  2e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0308564  normal  0.608544 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0204  aminodeoxychorismate lyase  31.85 
 
 		 314 aa  186  4e-46  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0717  aminodeoxychorismate lyase  35.5 
 
 		 335 aa  185  8e-46  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.16974  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1605  aminodeoxychorismate lyase  37.07 
 
 		 339 aa  185  1.0000000000000001e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0288124  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0448  aminodeoxychorismate lyase  37.17 
 
 		 312 aa  184  1.0000000000000001e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.83946 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1417  aminodeoxychorismate lyase  36.67 
 
 		 338 aa  185  1.0000000000000001e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.626218  normal  0.75601 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2536  aminodeoxychorismate lyase  39.16 
 
 		 338 aa  184  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.408514 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1467  aminodeoxychorismate lyase  34.56 
 
 		 332 aa  183  3e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0630531  normal  0.0141986 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0892  aminodeoxychorismate lyase  37.97 
 
 		 579 aa  183  3e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0855314 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1830  aminodeoxychorismate lyase  34.8 
 
 		 342 aa  182  6e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1426  aminodeoxychorismate lyase  37.28 
 
 		 332 aa  182  6e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.219736  normal  0.242343 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2044  hypothetical protein  36.95 
 
 		 324 aa  181  1e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.47923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1004  aminodeoxychorismate lyase  38.75 
 
 		 320 aa  181  2e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2514  aminodeoxychorismate lyase  32 
 
 		 337 aa  180  2.9999999999999997e-44  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.636222  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2198  hypothetical protein  36.05 
 
 		 349 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.850653  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25730  hypothetical protein  36.05 
 
 		 349 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0867332  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1863  aminodeoxychorismate lyase  34.13 
 
 		 356 aa  180  2.9999999999999997e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.322444  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1632  aminodeoxychorismate lyase  38.75 
 
 		 351 aa  180  4e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4376  aminodeoxychorismate lyase  37.93 
 
 		 362 aa  179  4.999999999999999e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0936456  normal  0.529135 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2275  aminodeoxychorismate lyase  32.3 
 
 		 349 aa  179  8e-44  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1660  aminodeoxychorismate lyase  37.33 
 
 		 336 aa  178  1e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.132451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1735  aminodeoxychorismate lyase  37.33 
 
 		 336 aa  178  1e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.163239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0748  aminodeoxychorismate lyase  37.88 
 
 		 399 aa  177  2e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.309418  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4657  aminodeoxychorismate lyase  34.92 
 
 		 362 aa  177  2e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.333524  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02713  hypothetical protein  39.15 
 
 		 357 aa  177  2e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.117678  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2198  aminodeoxychorismate lyase  35.05 
 
 		 331 aa  176  4e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.955684 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2859  aminodeoxychorismate lyase  37.93 
 
 		 340 aa  176  5e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4231  aminodeoxychorismate lyase  30.79 
 
 		 356 aa  176  5e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000711244  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1544  aminodeoxychorismate lyase  38.57 
 
 		 333 aa  176  6e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0483176  normal  0.0781021 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1871  aminodeoxychorismate lyase  35.05 
 
 		 336 aa  176  7e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1661  aminodeoxychorismate lyase  36.01 
 
 		 341 aa  175  8e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.148869  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0574  aminodeoxychorismate lyase  35.84 
 
 		 403 aa  175  9e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2649  aminodeoxychorismate lyase  37.16 
 
 		 335 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.108193 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2453  aminodeoxychorismate lyase  35.91 
 
 		 345 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0182667  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1203  aminodeoxychorismate lyase  39.19 
 
 		 405 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00148773 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1633  hypothetical protein  35.29 
 
 		 355 aa  175  9.999999999999999e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.153927  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14960  hypothetical protein  36.39 
 
 		 358 aa  175  9.999999999999999e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2521  aminodeoxychorismate lyase  36.18 
 
 		 372 aa  174  9.999999999999999e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3413  aminodeoxychorismate lyase  37.67 
 
 		 334 aa  174  9.999999999999999e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2614  hypothetical protein  37.33 
 
 		 336 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0733  aminodeoxychorismate lyase  34.98 
 
 		 335 aa  174  1.9999999999999998e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.224262  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0045  aminodeoxychorismate lyase  35.06 
 
 		 336 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.266308  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07820  conserved hypothetical protein TIGR00247  36.21 
 
 		 389 aa  174  1.9999999999999998e-42  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0223518 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2573  aminodeoxychorismate lyase  35.91 
 
 		 345 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0650379  normal  0.0398652 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2215  aminodeoxychorismate lyase  36.58 
 
 		 345 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2460  aminodeoxychorismate lyase  35.91 
 
 		 345 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00717262  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0462  hypothetical protein  37.29 
 
 		 412 aa  173  2.9999999999999996e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.218984  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0466  hypothetical protein  37.29 
 
 		 438 aa  173  2.9999999999999996e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.262236  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1891  aminodeoxychorismate lyase  35.57 
 
 		 345 aa  173  2.9999999999999996e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.253385  normal  0.0515475 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4517  conserved hypothetical protein TIGR00247  31.3 
 
 		 356 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000911066  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1060  aminodeoxychorismate lyase  39.53 
 
 		 412 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.017221 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1861  hypothetical protein  36.86 
 
 		 337 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0824281 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2301  hypothetical protein  36.36 
 
 		 337 aa  173  3.9999999999999995e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.142743  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4128  aminodeoxychorismate lyase  31.3 
 
 		 356 aa  172  5e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000574197  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4464  conserved hypothetical protein TIGR00247  31.3 
 
 		 356 aa  172  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000911703 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0966  aminodeoxychorismate lyase  35.26 
 
 		 363 aa  172  5.999999999999999e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1829  aminodeoxychorismate lyase  35.48 
 
 		 332 aa  172  5.999999999999999e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.021454  normal  0.121238 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2520  aminodeoxychorismate lyase  34.9 
 
 		 325 aa  172  6.999999999999999e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0480566  hitchhiker  0.003327 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4504  conserved hypothetical protein TIGR00247  31.3 
 
 		 356 aa  172  7.999999999999999e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4280  hypothetical protein  31.3 
 
 		 356 aa  171  1e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000498286  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4612  hypothetical protein  31.3 
 
 		 351 aa  171  1e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000312577  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>