More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_3134 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_3134  aminodeoxychorismate lyase  100 
 
 		 442 aa  878    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.486263 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3821  hypothetical protein  54.35 
 
 		 406 aa  378  1e-104  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.133528 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1685  aminodeoxychorismate lyase  54.79 
 
 		 407 aa  372  1e-102  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2350  aminodeoxychorismate lyase  54.49 
 
 		 416 aa  372  1e-102  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2783  aminodeoxychorismate lyase  53.01 
 
 		 456 aa  374  1e-102  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0560  aminodeoxychorismate lyase  54.44 
 
 		 467 aa  369  1e-101  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.133777  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3717  aminodeoxychorismate lyase  55.42 
 
 		 471 aa  370  1e-101  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.444196  normal  0.13956 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2470  aminodeoxychorismate lyase  50.4 
 
 		 415 aa  370  1e-101  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.16603  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2303  aminodeoxychorismate lyase  54.08 
 
 		 422 aa  371  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0207028  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0495  aminodeoxychorismate lyase  54.44 
 
 		 467 aa  369  1e-101  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.843817  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3481  aminodeoxychorismate lyase  50.14 
 
 		 418 aa  368  1e-100  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.114938  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2976  aminodeoxychorismate lyase  49.6 
 
 		 425 aa  367  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.202928 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0892  aminodeoxychorismate lyase  53.11 
 
 		 579 aa  366  1e-100  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0855314 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2296  aminodeoxychorismate lyase  51.9 
 
 		 599 aa  362  8e-99  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3195  aminodeoxychorismate lyase  53.97 
 
 		 454 aa  361  1e-98  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.934507  hitchhiker  0.00937701 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0531  aminodeoxychorismate lyase  54.66 
 
 		 464 aa  358  1.9999999999999998e-97  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.40268 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3356  aminodeoxychorismate lyase  53.31 
 
 		 349 aa  328  1.0000000000000001e-88  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.681449 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1765  aminodeoxychorismate lyase  46.26 
 
 		 391 aa  328  2.0000000000000001e-88  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.310683  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1060  aminodeoxychorismate lyase  45.82 
 
 		 412 aa  318  2e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.017221 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0466  hypothetical protein  43.8 
 
 		 438 aa  317  3e-85  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.262236  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1532  hypothetical protein  46.69 
 
 		 414 aa  314  1.9999999999999998e-84  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0269325  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0501  hypothetical protein  44.67 
 
 		 369 aa  314  1.9999999999999998e-84  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0462  hypothetical protein  43.54 
 
 		 412 aa  313  3.9999999999999997e-84  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.218984  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0574  aminodeoxychorismate lyase  42.05 
 
 		 403 aa  313  4.999999999999999e-84  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1203  aminodeoxychorismate lyase  43.6 
 
 		 405 aa  311  2e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00148773 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0419  aminodeoxychorismate lyase  48.45 
 
 		 328 aa  302  7.000000000000001e-81  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.290965  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0748  aminodeoxychorismate lyase  47.58 
 
 		 399 aa  298  2e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.309418  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2521  aminodeoxychorismate lyase  45.5 
 
 		 372 aa  297  3e-79  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1218  aminodeoxychorismate lyase  47.34 
 
 		 348 aa  288  1e-76  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.319435 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1072  aminodeoxychorismate lyase  40.27 
 
 		 392 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.232656  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2465  hypothetical protein  39.25 
 
 		 393 aa  270  5e-71  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.347128  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1127  aminodeoxychorismate lyase  39.25 
 
 		 392 aa  270  5e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.66542 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2179  hypothetical protein  40.27 
 
 		 384 aa  265  1e-69  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1341  aminodeoxychorismate lyase  46.08 
 
 		 325 aa  258  1e-67  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1055  aminodeoxychorismate lyase  37.33 
 
 		 384 aa  255  1.0000000000000001e-66  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.921254  normal  0.096534 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1630  aminodeoxychorismate lyase  50 
 
 		 385 aa  243  5e-63  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.118431  normal  0.589184 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0090  aminodeoxychorismate lyase  45.45 
 
 		 323 aa  242  7.999999999999999e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.537273  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0448  aminodeoxychorismate lyase  46.26 
 
 		 312 aa  242  1e-62  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.83946 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1529  aminodeoxychorismate lyase  42.77 
 
 		 331 aa  229  5e-59  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.305783  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3409  aminodeoxychorismate lyase  42.02 
 
 		 339 aa  225  1e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2903  aminodeoxychorismate lyase  36.44 
 
 		 392 aa  222  9e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.167786  normal  0.431828 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0717  aminodeoxychorismate lyase  39.16 
 
 		 335 aa  209  1e-52  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.16974  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1919  aminodeoxychorismate lyase  39.02 
 
 		 363 aa  208  2e-52  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.402452  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1582  hypothetical protein  39.14 
 
 		 341 aa  204  2e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000314961  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2198  hypothetical protein  34.32 
 
 		 349 aa  204  2e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.850653  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25730  hypothetical protein  34.32 
 
 		 349 aa  204  2e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0867332  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1690  aminodeoxychorismate lyase  38.84 
 
 		 341 aa  204  3e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0437285  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3494  hypothetical protein  38.53 
 
 		 363 aa  202  9.999999999999999e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000556203  normal  0.010619 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1633  hypothetical protein  34.76 
 
 		 355 aa  201  1.9999999999999998e-50  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.153927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1871  aminodeoxychorismate lyase  39.33 
 
 		 336 aa  201  1.9999999999999998e-50  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1612  hypothetical protein  35.69 
 
 		 340 aa  200  3.9999999999999996e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000845082  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1417  aminodeoxychorismate lyase  39.69 
 
 		 338 aa  200  5e-50  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.626218  normal  0.75601 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2499  aminodeoxychorismate lyase  38.49 
 
 		 339 aa  199  6e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00196213  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1529  aminodeoxychorismate lyase  34.01 
 
 		 387 aa  199  6e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.538963 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14960  hypothetical protein  34.15 
 
 		 358 aa  198  1.0000000000000001e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1918  aminodeoxychorismate lyase  33.44 
 
 		 421 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.204138  unclonable  0.000000331509 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1313  hypothetical protein  35.74 
 
 		 340 aa  198  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000010184 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1275  hypothetical protein  35.74 
 
 		 340 aa  197  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.310439  normal  0.846206 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1987  hypothetical protein  35.74 
 
 		 340 aa  198  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000318105  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2170  hypothetical protein  35.74 
 
 		 340 aa  198  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.7368  hitchhiker  0.0000000000000363112 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1910  aminodeoxychorismate lyase  38.21 
 
 		 341 aa  197  2.0000000000000003e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000953369  decreased coverage  0.000000738863 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1298  hypothetical protein  35.74 
 
 		 340 aa  197  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.166048  hitchhiker  0.00000000000000101215 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3796  aminodeoxychorismate lyase  32.94 
 
 		 406 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.77523  normal  0.494507 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1476  hypothetical protein  36.7 
 
 		 340 aa  195  1e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000304616  hitchhiker  0.00000000000128745 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2649  aminodeoxychorismate lyase  34.45 
 
 		 335 aa  195  1e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.108193 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2550  aminodeoxychorismate lyase  37 
 
 		 340 aa  195  2e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000202204  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2030  hypothetical protein  36.7 
 
 		 340 aa  194  2e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000821549  hitchhiker  0.00000424543 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1488  hypothetical protein  36.36 
 
 		 346 aa  194  2e-48  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0806646  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01093  predicted aminodeoxychorismate lyase  36.7 
 
 		 340 aa  194  4e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000123905  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1603  hypothetical protein  37.42 
 
 		 338 aa  193  4e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0141578  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2227  hypothetical protein  36.7 
 
 		 340 aa  194  4e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000358206  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2504  hypothetical protein  36.7 
 
 		 340 aa  194  4e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000670285  unclonable  0.0000000117832 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1494  aminodeoxychorismate lyase  33.13 
 
 		 400 aa  193  4e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2803  aminodeoxychorismate lyase  37.85 
 
 		 339 aa  193  4e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0153211  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1219  hypothetical protein  36.7 
 
 		 340 aa  194  4e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000544785  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1218  hypothetical protein  36.7 
 
 		 340 aa  194  4e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000109839  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01101  hypothetical protein  36.7 
 
 		 340 aa  194  4e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000104993  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1467  aminodeoxychorismate lyase  37.42 
 
 		 332 aa  193  5e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0630531  normal  0.0141986 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1501  aminodeoxychorismate lyase  36.34 
 
 		 334 aa  192  9e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00653214  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1632  aminodeoxychorismate lyase  35.1 
 
 		 351 aa  191  2e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1605  aminodeoxychorismate lyase  35.6 
 
 		 339 aa  191  2e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0288124  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4153  aminodeoxychorismate lyase  36.01 
 
 		 393 aa  189  8e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.507493  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1651  hypothetical protein  34.86 
 
 		 371 aa  189  9e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.245799  normal  0.342253 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2268  aminodeoxychorismate lyase  33.14 
 
 		 343 aa  188  1e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.642  normal  0.198206 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0625  aminodeoxychorismate lyase  36.14 
 
 		 357 aa  188  2e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0512441  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2044  hypothetical protein  36.16 
 
 		 324 aa  188  2e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.47923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0682  aminodeoxychorismate lyase  37.62 
 
 		 333 aa  187  3e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0424367  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1426  aminodeoxychorismate lyase  37.46 
 
 		 332 aa  186  6e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.219736  normal  0.242343 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1627  aminodeoxychorismate lyase  36.07 
 
 		 343 aa  186  7e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000211162  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2453  aminodeoxychorismate lyase  36.47 
 
 		 345 aa  186  8e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0182667  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1660  aminodeoxychorismate lyase  37.3 
 
 		 336 aa  186  9e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.132451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1735  aminodeoxychorismate lyase  37.3 
 
 		 336 aa  186  9e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.163239  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0694  aminodeoxychorismate lyase  37.74 
 
 		 327 aa  186  1.0000000000000001e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000296609 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2460  aminodeoxychorismate lyase  36.91 
 
 		 345 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00717262  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2573  aminodeoxychorismate lyase  36.91 
 
 		 345 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0650379  normal  0.0398652 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1765  aminodeoxychorismate lyase  37.62 
 
 		 336 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0979727  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1891  aminodeoxychorismate lyase  36.17 
 
 		 345 aa  185  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.253385  normal  0.0515475 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0005  aminodeoxychorismate lyase  34.98 
 
 		 327 aa  184  2.0000000000000003e-45  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000992333  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2614  hypothetical protein  37.46 
 
 		 336 aa  184  3e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1093  aminodeoxychorismate lyase  34.82 
 
 		 332 aa  184  3e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.72202  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>