More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_1630 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_1630  aminodeoxychorismate lyase  100 
 
 
385 aa  769    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.118431  normal  0.589184 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2179  hypothetical protein  61.82 
 
 
384 aa  474  1e-133  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1072  aminodeoxychorismate lyase  54.45 
 
 
392 aa  414  1e-114  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.232656  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1127  aminodeoxychorismate lyase  53.66 
 
 
392 aa  408  1e-113  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.66542 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2465  hypothetical protein  53.93 
 
 
393 aa  410  1e-113  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.347128  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1055  aminodeoxychorismate lyase  52.84 
 
 
384 aa  393  1e-108  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.921254  normal  0.096534 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2903  aminodeoxychorismate lyase  53.39 
 
 
392 aa  364  2e-99  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.167786  normal  0.431828 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1218  aminodeoxychorismate lyase  42.71 
 
 
348 aa  268  8.999999999999999e-71  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.319435 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3356  aminodeoxychorismate lyase  41.18 
 
 
349 aa  259  5.0000000000000005e-68  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.681449 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0892  aminodeoxychorismate lyase  51.26 
 
 
579 aa  256  3e-67  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0855314 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2296  aminodeoxychorismate lyase  38.71 
 
 
599 aa  256  5e-67  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2470  aminodeoxychorismate lyase  38.61 
 
 
415 aa  253  3e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.16603  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1203  aminodeoxychorismate lyase  37.73 
 
 
405 aa  251  1e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00148773 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3481  aminodeoxychorismate lyase  38.07 
 
 
418 aa  251  2e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.114938  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3821  hypothetical protein  38.34 
 
 
406 aa  251  2e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.133528 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1060  aminodeoxychorismate lyase  37.73 
 
 
412 aa  249  6e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.017221 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2783  aminodeoxychorismate lyase  38.11 
 
 
456 aa  248  9e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2350  aminodeoxychorismate lyase  53.02 
 
 
416 aa  246  4.9999999999999997e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3195  aminodeoxychorismate lyase  53.21 
 
 
454 aa  245  8e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.934507  hitchhiker  0.00937701 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1685  aminodeoxychorismate lyase  51.11 
 
 
407 aa  243  3e-63  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0531  aminodeoxychorismate lyase  52.53 
 
 
464 aa  243  3.9999999999999997e-63  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.40268 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3134  aminodeoxychorismate lyase  50 
 
 
442 aa  242  7e-63  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.486263 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0495  aminodeoxychorismate lyase  52.53 
 
 
467 aa  242  7.999999999999999e-63  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.843817  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0560  aminodeoxychorismate lyase  52.53 
 
 
467 aa  242  7.999999999999999e-63  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.133777  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2303  aminodeoxychorismate lyase  36.77 
 
 
422 aa  241  1e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0207028  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3717  aminodeoxychorismate lyase  53 
 
 
471 aa  241  2e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.444196  normal  0.13956 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2976  aminodeoxychorismate lyase  51.82 
 
 
425 aa  236  4e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.202928 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0574  aminodeoxychorismate lyase  37.6 
 
 
403 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0466  hypothetical protein  37.43 
 
 
438 aa  234  2.0000000000000002e-60  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.262236  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1532  hypothetical protein  36.77 
 
 
414 aa  233  4.0000000000000004e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0269325  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0462  hypothetical protein  37.16 
 
 
412 aa  232  9e-60  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.218984  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0501  hypothetical protein  35.22 
 
 
369 aa  231  1e-59  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0419  aminodeoxychorismate lyase  36.7 
 
 
328 aa  230  4e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.290965  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0748  aminodeoxychorismate lyase  50.66 
 
 
399 aa  230  4e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.309418  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2521  aminodeoxychorismate lyase  52.78 
 
 
372 aa  227  2e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1765  aminodeoxychorismate lyase  37.57 
 
 
391 aa  228  2e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.310683  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1341  aminodeoxychorismate lyase  38.64 
 
 
325 aa  219  7e-56  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0090  aminodeoxychorismate lyase  39.39 
 
 
323 aa  219  7e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.537273  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0448  aminodeoxychorismate lyase  40.4 
 
 
312 aa  202  6e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.83946 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003000  hypothetical protein  36.18 
 
 
338 aa  202  7e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0577137  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1603  hypothetical protein  56.07 
 
 
338 aa  198  2.0000000000000003e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0141578  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1919  aminodeoxychorismate lyase  39.38 
 
 
363 aa  195  9e-49  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.402452  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1529  aminodeoxychorismate lyase  36.13 
 
 
331 aa  193  4e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.305783  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02904  hypothetical protein  35.88 
 
 
338 aa  190  4e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3409  aminodeoxychorismate lyase  35.04 
 
 
339 aa  188  2e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0125  aminodeoxychorismate lyase  34.79 
 
 
393 aa  186  5e-46  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000881139  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1417  aminodeoxychorismate lyase  37.74 
 
 
338 aa  186  5e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.626218  normal  0.75601 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1605  aminodeoxychorismate lyase  40.98 
 
 
339 aa  186  7e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0288124  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1632  aminodeoxychorismate lyase  46.19 
 
 
351 aa  184  3e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2499  aminodeoxychorismate lyase  49.19 
 
 
339 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00196213  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1910  aminodeoxychorismate lyase  52.17 
 
 
341 aa  183  4.0000000000000006e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000953369  decreased coverage  0.000000738863 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2268  aminodeoxychorismate lyase  44.44 
 
 
343 aa  183  5.0000000000000004e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.642  normal  0.198206 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1690  aminodeoxychorismate lyase  33.16 
 
 
341 aa  181  1e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0437285  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02331  hypothetical protein  43.21 
 
 
316 aa  182  1e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1582  hypothetical protein  32.45 
 
 
341 aa  181  2e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000314961  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2803  aminodeoxychorismate lyase  48.65 
 
 
339 aa  181  2e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0153211  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2244  aminodeoxychorismate lyase  35.71 
 
 
336 aa  180  2.9999999999999997e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00467758  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3494  hypothetical protein  33.24 
 
 
363 aa  180  4e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000556203  normal  0.010619 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0144  hypothetical protein  49.19 
 
 
427 aa  179  7e-44  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00352023 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1633  hypothetical protein  42.5 
 
 
355 aa  178  1e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.153927  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1591  aminodeoxychorismate lyase  34.76 
 
 
343 aa  178  1e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0649717  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1501  aminodeoxychorismate lyase  51.89 
 
 
334 aa  177  2e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00653214  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1627  aminodeoxychorismate lyase  33.97 
 
 
343 aa  177  3e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000211162  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1093  aminodeoxychorismate lyase  31.61 
 
 
332 aa  177  4e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.72202  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2118  aminodeoxychorismate lyase  33.33 
 
 
312 aa  176  7e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0134865  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02713  hypothetical protein  36.36 
 
 
357 aa  176  9e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.117678  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1612  hypothetical protein  32.47 
 
 
340 aa  174  1.9999999999999998e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000845082  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0154  aminodeoxychorismate lyase  47.57 
 
 
427 aa  173  5e-42  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3387  aminodeoxychorismate lyase  34.6 
 
 
329 aa  172  9e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.107935  normal  0.0743499 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1830  aminodeoxychorismate lyase  43.62 
 
 
342 aa  172  1e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1488  hypothetical protein  48.33 
 
 
346 aa  171  2e-41  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0806646  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1863  aminodeoxychorismate lyase  42.51 
 
 
356 aa  171  2e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.322444  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1584  aminodeoxychorismate lyase  32.71 
 
 
364 aa  171  3e-41  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0339039  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2198  aminodeoxychorismate lyase  51.98 
 
 
331 aa  170  4e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.955684 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1641  hypothetical protein  32.97 
 
 
350 aa  170  4e-41  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.667934  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14960  hypothetical protein  39.68 
 
 
358 aa  169  5e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1988  aminodeoxychorismate lyase  34.43 
 
 
345 aa  169  6e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1783  hypothetical protein  43.3 
 
 
377 aa  169  9e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0308564  normal  0.608544 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1716  aminodeoxychorismate lyase  34.43 
 
 
333 aa  169  9e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.998027  normal  0.24374 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1275  hypothetical protein  32.16 
 
 
340 aa  167  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.310439  normal  0.846206 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1660  aminodeoxychorismate lyase  34.52 
 
 
336 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.132451  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1735  aminodeoxychorismate lyase  34.52 
 
 
336 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.163239  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2504  aminodeoxychorismate lyase  45.98 
 
 
337 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.917927  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1891  aminodeoxychorismate lyase  35.12 
 
 
345 aa  167  4e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.253385  normal  0.0515475 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2453  aminodeoxychorismate lyase  35.12 
 
 
345 aa  166  5e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0182667  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2460  aminodeoxychorismate lyase  35.12 
 
 
345 aa  166  5.9999999999999996e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00717262  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2254  aminodeoxychorismate lyase  41.09 
 
 
323 aa  166  5.9999999999999996e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2573  aminodeoxychorismate lyase  35.12 
 
 
345 aa  166  5.9999999999999996e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0650379  normal  0.0398652 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2170  hypothetical protein  31.89 
 
 
340 aa  166  6.9999999999999995e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.7368  hitchhiker  0.0000000000000363112 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1313  hypothetical protein  31.89 
 
 
340 aa  166  6.9999999999999995e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000010184 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3021  aminodeoxychorismate lyase  33.64 
 
 
358 aa  166  6.9999999999999995e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.157507  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1298  hypothetical protein  31.89 
 
 
340 aa  166  6.9999999999999995e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.166048  hitchhiker  0.00000000000000101215 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1987  hypothetical protein  31.89 
 
 
340 aa  166  6.9999999999999995e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000318105  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1004  aminodeoxychorismate lyase  50.28 
 
 
320 aa  166  8e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0717  aminodeoxychorismate lyase  48.88 
 
 
335 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.16974  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1467  aminodeoxychorismate lyase  48.59 
 
 
332 aa  165  1.0000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0630531  normal  0.0141986 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1529  aminodeoxychorismate lyase  33.07 
 
 
387 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.538963 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25730  hypothetical protein  33.69 
 
 
349 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0867332  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2649  aminodeoxychorismate lyase  32.63 
 
 
335 aa  164  3e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.108193 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1765  aminodeoxychorismate lyase  33.62 
 
 
336 aa  164  3e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0979727  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>