More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_07820 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_07820  conserved hypothetical protein TIGR00247  100 
 
 		 389 aa  799    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0223518 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05120  conserved hypothetical protein TIGR00247  47.4 
 
 		 403 aa  325  1e-87  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.924204  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2553  aminodeoxychorismate lyase  44.76 
 
 		 385 aa  285  7e-76  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0459  aminodeoxychorismate lyase  37.21 
 
 		 451 aa  226  4e-58  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1361  aminodeoxychorismate lyase  37.73 
 
 		 370 aa  195  9e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0615754  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1637  aminodeoxychorismate lyase  37.91 
 
 		 352 aa  187  3e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.521882 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1776  aminodeoxychorismate lyase  36.6 
 
 		 355 aa  180  2.9999999999999997e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.81136  normal  0.183273 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1497  aminodeoxychorismate lyase  36.09 
 
 		 351 aa  178  1e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0918  aminodeoxychorismate lyase  37.7 
 
 		 345 aa  172  5.999999999999999e-42  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.174013  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2459  aminodeoxychorismate lyase  35.86 
 
 		 344 aa  172  5.999999999999999e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.5911  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3021  aminodeoxychorismate lyase  36.74 
 
 		 358 aa  172  7.999999999999999e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.157507  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3618  aminodeoxychorismate lyase  34.67 
 
 		 362 aa  171  3e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000276729  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3279  aminodeoxychorismate lyase  36.36 
 
 		 376 aa  170  4e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.258116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1435  aminodeoxychorismate lyase  35.9 
 
 		 344 aa  169  9e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2262  aminodeoxychorismate lyase  32.95 
 
 		 344 aa  167  2.9999999999999998e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.945495  hitchhiker  0.000317634 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0650  periplasmic solute-binding protein, aminodeoxychorismate lyase-like  33.66 
 
 		 356 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.368295  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0694  aminodeoxychorismate lyase  32.38 
 
 		 327 aa  165  1.0000000000000001e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000296609 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0473  periplasmic solute-binding protein  31.39 
 
 		 345 aa  165  1.0000000000000001e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0206414  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05820  aminodeoxychorismate lyase  31.81 
 
 		 337 aa  164  2.0000000000000002e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0160306  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0900  aminodeoxychorismate lyase  34.31 
 
 		 338 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0871  aminodeoxychorismate lyase  33.14 
 
 		 339 aa  164  3e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0508  hypothetical protein  36.21 
 
 		 340 aa  162  1e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2516  aminodeoxychorismate lyase  37.34 
 
 		 351 aa  161  2e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.470286  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1685  aminodeoxychorismate lyase  33.06 
 
 		 407 aa  160  4e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2486  aminodeoxychorismate lyase  32.41 
 
 		 364 aa  159  6e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00502838  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1090  aminodeoxychorismate lyase  35 
 
 		 331 aa  159  6e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0682  aminodeoxychorismate lyase  32.23 
 
 		 333 aa  159  8e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0424367  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3036  aminodeoxychorismate lyase  29.95 
 
 		 623 aa  158  2e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0256494  normal  0.08592 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0733  aminodeoxychorismate lyase  35.79 
 
 		 335 aa  158  2e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.224262  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2350  aminodeoxychorismate lyase  32.13 
 
 		 416 aa  157  3e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2044  aminodeoxychorismate lyase  35.34 
 
 		 385 aa  156  5.0000000000000005e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0389257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0625  aminodeoxychorismate lyase  34.56 
 
 		 357 aa  156  6e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0512441  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0484  aminodeoxychorismate lyase  32.69 
 
 		 335 aa  155  1e-36  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1543  hypothetical protein  34 
 
 		 340 aa  154  2.9999999999999998e-36  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2976  aminodeoxychorismate lyase  31.71 
 
 		 425 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.202928 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0732  hypothetical protein  32.78 
 
 		 343 aa  153  4e-36  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1008  aminodeoxychorismate lyase  33.96 
 
 		 373 aa  153  4e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00821655  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0953  aminodeoxychorismate lyase  36.39 
 
 		 335 aa  153  5.9999999999999996e-36  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.316253  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1587  aminodeoxychorismate lyase  33.86 
 
 		 332 aa  152  1e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.076405 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5194  aminodeoxychorismate lyase  34.88 
 
 		 339 aa  151  2e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.374187 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1830  aminodeoxychorismate lyase  34.6 
 
 		 342 aa  151  2e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0288  aminodeoxychorismate lyase  31.55 
 
 		 658 aa  151  2e-35  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2303  aminodeoxychorismate lyase  31.01 
 
 		 422 aa  150  3e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0207028  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1472  aminodeoxychorismate lyase  30.41 
 
 		 424 aa  149  6e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.120948  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1791  aminodeoxychorismate lyase  32.18 
 
 		 339 aa  149  7e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00439567  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0030  aminodeoxychorismate lyase  34.17 
 
 		 349 aa  149  7e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.647846  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1613  hypothetical protein  32.33 
 
 		 600 aa  149  8e-35  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3559  aminodeoxychorismate lyase  33.24 
 
 		 341 aa  148  1.0000000000000001e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000155777  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1917  aminodeoxychorismate lyase  35.11 
 
 		 339 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.136892 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1129  aminodeoxychorismate lyase  33.12 
 
 		 336 aa  148  2.0000000000000003e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.399769 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2045  aminodeoxychorismate lyase  31.37 
 
 		 342 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0393494  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4376  aminodeoxychorismate lyase  33.55 
 
 		 362 aa  148  2.0000000000000003e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0936456  normal  0.529135 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2470  aminodeoxychorismate lyase  30.57 
 
 		 415 aa  147  3e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.16603  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1410  aminodeoxychorismate lyase  32.48 
 
 		 347 aa  147  3e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1803  aminodeoxychorismate lyase  35.74 
 
 		 339 aa  147  3e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0606768  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6185  aminodeoxychorismate lyase  34.26 
 
 		 339 aa  147  3e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3134  aminodeoxychorismate lyase  31.7 
 
 		 442 aa  147  3e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.486263 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1894  aminodeoxychorismate lyase  34.26 
 
 		 339 aa  147  3e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.474153  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1380  aminodeoxychorismate lyase  35.37 
 
 		 339 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3821  hypothetical protein  32.49 
 
 		 406 aa  146  5e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.133528 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1831  aminodeoxychorismate lyase  35.74 
 
 		 339 aa  147  5e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1837  aminodeoxychorismate lyase  32.14 
 
 		 360 aa  145  1e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0659  aminodeoxychorismate lyase  31.63 
 
 		 546 aa  145  1e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00259316  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1938  aminodeoxychorismate lyase  35.35 
 
 		 345 aa  144  4e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.110627  normal  0.289211 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2264  hypothetical protein  34.92 
 
 		 345 aa  143  4e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.188751  normal  0.305668 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0966  aminodeoxychorismate lyase  32.04 
 
 		 363 aa  144  4e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3481  aminodeoxychorismate lyase  33.88 
 
 		 418 aa  143  4e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.114938  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1603  hypothetical protein  32.38 
 
 		 338 aa  143  5e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0141578  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1042  aminodeoxychorismate lyase  35.67 
 
 		 336 aa  143  5e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0148163  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1605  aminodeoxychorismate lyase  31.05 
 
 		 339 aa  143  5e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0288124  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1633  hypothetical protein  35.46 
 
 		 355 aa  143  6e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.153927  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2499  aminodeoxychorismate lyase  30.75 
 
 		 339 aa  142  9.999999999999999e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00196213  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1660  aminodeoxychorismate lyase  33.85 
 
 		 336 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.132451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1735  aminodeoxychorismate lyase  33.85 
 
 		 336 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.163239  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0892  aminodeoxychorismate lyase  34.13 
 
 		 579 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0855314 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0967  aminodeoxychorismate lyase  30.65 
 
 		 357 aa  141  1.9999999999999998e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.829028  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2614  hypothetical protein  33.33 
 
 		 336 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3494  hypothetical protein  30.42 
 
 		 363 aa  141  1.9999999999999998e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000556203  normal  0.010619 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2118  aminodeoxychorismate lyase  33.65 
 
 		 312 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0134865  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1765  aminodeoxychorismate lyase  33.02 
 
 		 336 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0979727  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1863  aminodeoxychorismate lyase  31.01 
 
 		 356 aa  141  1.9999999999999998e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.322444  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1997  hypothetical protein  31.61 
 
 		 331 aa  140  3e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3097  aminodeoxychorismate lyase  32.38 
 
 		 355 aa  140  3e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00109006  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0419  aminodeoxychorismate lyase  33.66 
 
 		 328 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.290965  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1426  aminodeoxychorismate lyase  34.41 
 
 		 332 aa  140  4.999999999999999e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.219736  normal  0.242343 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1077  aminodeoxychorismate lyase  31.53 
 
 		 315 aa  140  4.999999999999999e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.578473  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2026  hypothetical protein  36.26 
 
 		 333 aa  140  4.999999999999999e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1467  aminodeoxychorismate lyase  34.08 
 
 		 332 aa  139  7.999999999999999e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0630531  normal  0.0141986 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1582  hypothetical protein  31.05 
 
 		 341 aa  139  1e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000314961  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2803  aminodeoxychorismate lyase  30.33 
 
 		 339 aa  138  1e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0153211  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0204  aminodeoxychorismate lyase  32.21 
 
 		 314 aa  138  1e-31  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2514  aminodeoxychorismate lyase  30.94 
 
 		 337 aa  138  1e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.636222  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0557  aminodeoxychorismate lyase  33.82 
 
 		 326 aa  139  1e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.245938  normal  0.0550645 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1743  hypothetical protein  36.68 
 
 		 333 aa  138  1e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1390  aminodeoxychorismate lyase  31.82 
 
 		 364 aa  139  1e-31  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000172807  hitchhiker  3.2530600000000004e-23 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1910  aminodeoxychorismate lyase  32.39 
 
 		 341 aa  138  1e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000953369  decreased coverage  0.000000738863 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2296  aminodeoxychorismate lyase  32.03 
 
 		 599 aa  139  1e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0560  aminodeoxychorismate lyase  29.69 
 
 		 467 aa  138  2e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.133777  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0495  aminodeoxychorismate lyase  29.69 
 
 		 467 aa  138  2e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.843817  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1093  aminodeoxychorismate lyase  31.2 
 
 		 332 aa  137  2e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.72202  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>