More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_2044 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_2044  aminodeoxychorismate lyase  100 
 
 		 385 aa  783    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0389257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6091  aminodeoxychorismate lyase  58.66 
 
 		 387 aa  403  1e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.384921  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2045  aminodeoxychorismate lyase  52.28 
 
 		 342 aa  330  3e-89  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0393494  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2068  putative integral membrane protein  46.67 
 
 		 685 aa  305  1.0000000000000001e-81  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0278273  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2137  aminodeoxychorismate lyase  44.71 
 
 		 456 aa  279  5e-74  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000886776  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0845  periplasmic solute-binding protein-like protein  60.53 
 
 		 320 aa  278  9e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1328  aminodeoxychorismate lyase  44.97 
 
 		 372 aa  265  1e-69  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0484668  normal  0.302335 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3156  aminodeoxychorismate lyase  44.97 
 
 		 536 aa  260  3e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.489263  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2409  aminodeoxychorismate lyase  44.29 
 
 		 397 aa  259  6e-68  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.105419  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3073  aminodeoxychorismate lyase  43.44 
 
 		 456 aa  245  9e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.658866  normal  0.521991 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12530  predicted periplasmic solute-binding protein  41.18 
 
 		 368 aa  220  3.9999999999999997e-56  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00811784  normal  0.477009 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1696  aminodeoxychorismate lyase  41.99 
 
 		 468 aa  214  1.9999999999999998e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.255824  normal  0.195294 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16340  predicted periplasmic solute-binding protein  40.72 
 
 		 390 aa  212  1e-53  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1821  aminodeoxychorismate lyase  40.24 
 
 		 401 aa  203  4e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000914518 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3212  aminodeoxychorismate lyase  39.56 
 
 		 413 aa  202  9e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0548102  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1830  aminodeoxychorismate lyase  38.25 
 
 		 401 aa  200  3e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.194696  normal  0.869905 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2016  aminodeoxychorismate lyase  35.67 
 
 		 407 aa  197  3e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.658321  normal  0.0585657 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3876  aminodeoxychorismate lyase  35.88 
 
 		 395 aa  194  3e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1349  aminodeoxychorismate lyase  37.26 
 
 		 397 aa  193  4e-48  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2389  aminodeoxychorismate lyase  33.5 
 
 		 415 aa  191  2e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0575785 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2348  aminodeoxychorismate lyase  33.5 
 
 		 415 aa  191  2e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.776778  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2395  aminodeoxychorismate lyase  33.5 
 
 		 415 aa  191  2e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.178925 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12574  hypothetical protein  34.54 
 
 		 417 aa  189  8e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00172093  normal  0.0835034 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1691  aminodeoxychorismate lyase  39.68 
 
 		 376 aa  188  1e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.527988  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1820  aminodeoxychorismate lyase  35.54 
 
 		 401 aa  186  7e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.111847  normal  0.624649 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1692  aminodeoxychorismate lyase  40.78 
 
 		 382 aa  184  3e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3030  aminodeoxychorismate lyase  41.16 
 
 		 368 aa  182  7e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0377  conserved hypothetical protein, YceG family  34.24 
 
 		 396 aa  181  1e-44  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0614  aminodeoxychorismate lyase  37.11 
 
 		 393 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.415027  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3761  aminodeoxychorismate lyase  34.45 
 
 		 415 aa  180  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.37487 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3295  aminodeoxychorismate lyase  33.69 
 
 		 434 aa  173  3.9999999999999995e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000545955  normal  0.0867897 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1361  aminodeoxychorismate lyase  34.31 
 
 		 370 aa  172  1e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0615754  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2642  aminodeoxychorismate lyase  33.72 
 
 		 415 aa  172  1e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1497  aminodeoxychorismate lyase  36.75 
 
 		 351 aa  171  2e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5263  aminodeoxychorismate lyase  30.81 
 
 		 409 aa  162  1e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2013  aminodeoxychorismate lyase  36.45 
 
 		 588 aa  158  1e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000282457 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07820  conserved hypothetical protein TIGR00247  35.34 
 
 		 389 aa  158  1e-37  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0223518 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17720  predicted periplasmic solute-binding protein  35.65 
 
 		 395 aa  155  1e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.412389  normal  0.31092 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15290  predicted periplasmic solute-binding protein  33.94 
 
 		 493 aa  154  2e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.444068  normal  0.602564 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2026  hypothetical protein  31.79 
 
 		 333 aa  155  2e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05820  aminodeoxychorismate lyase  32.35 
 
 		 337 aa  155  2e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0160306  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2262  aminodeoxychorismate lyase  32.72 
 
 		 344 aa  154  2.9999999999999998e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.945495  hitchhiker  0.000317634 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4504  conserved hypothetical protein TIGR00247  31.66 
 
 		 356 aa  153  4e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0953  aminodeoxychorismate lyase  36.58 
 
 		 335 aa  153  5e-36  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.316253  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4231  aminodeoxychorismate lyase  32.54 
 
 		 356 aa  153  5e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000711244  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3021  aminodeoxychorismate lyase  33.33 
 
 		 358 aa  152  8.999999999999999e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.157507  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4280  hypothetical protein  32.25 
 
 		 356 aa  151  2e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000498286  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4612  hypothetical protein  32.25 
 
 		 351 aa  151  2e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000312577  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4517  conserved hypothetical protein TIGR00247  31.66 
 
 		 356 aa  151  2e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000911066  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4464  conserved hypothetical protein TIGR00247  32.25 
 
 		 356 aa  150  3e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000911703 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4117  aminodeoxychorismate lyase  30.77 
 
 		 356 aa  150  5e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000093714  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4128  aminodeoxychorismate lyase  31.66 
 
 		 356 aa  149  7e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000574197  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0732  hypothetical protein TIGR00247  31.07 
 
 		 356 aa  149  7e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000024462  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1977  aminodeoxychorismate lyase  30.94 
 
 		 418 aa  149  8e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.337407  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05120  conserved hypothetical protein TIGR00247  34.26 
 
 		 403 aa  148  1.0000000000000001e-34  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.924204  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0484  aminodeoxychorismate lyase  34.41 
 
 		 335 aa  149  1.0000000000000001e-34  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3097  aminodeoxychorismate lyase  30.06 
 
 		 355 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00109006  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3559  aminodeoxychorismate lyase  30.47 
 
 		 341 aa  149  1.0000000000000001e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000155777  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1743  hypothetical protein  30.06 
 
 		 333 aa  148  2.0000000000000003e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2322  aminodeoxychorismate lyase  30.28 
 
 		 587 aa  145  1e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.284127  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0625  aminodeoxychorismate lyase  33.97 
 
 		 357 aa  145  1e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0512441  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2486  aminodeoxychorismate lyase  30.05 
 
 		 364 aa  144  3e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00502838  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0650  periplasmic solute-binding protein, aminodeoxychorismate lyase-like  31.41 
 
 		 356 aa  142  7e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.368295  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1637  aminodeoxychorismate lyase  34.41 
 
 		 352 aa  142  8e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.521882 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2276  aminodeoxychorismate lyase  33.43 
 
 		 485 aa  142  9.999999999999999e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.204886  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0966  aminodeoxychorismate lyase  30.75 
 
 		 363 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12700  predicted periplasmic solute-binding protein  32.95 
 
 		 422 aa  140  3e-32  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0225  aminodeoxychorismate lyase  36.84 
 
 		 322 aa  139  7e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.58497  normal  0.0291883 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3279  aminodeoxychorismate lyase  33.11 
 
 		 376 aa  137  2e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.258116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0417  aminodeoxychorismate lyase  36.8 
 
 		 331 aa  137  3.0000000000000003e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0900  aminodeoxychorismate lyase  29.34 
 
 		 338 aa  137  3.0000000000000003e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1435  aminodeoxychorismate lyase  33.23 
 
 		 344 aa  137  4e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4657  aminodeoxychorismate lyase  29.28 
 
 		 362 aa  137  4e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.333524  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0204  aminodeoxychorismate lyase  39.04 
 
 		 314 aa  136  5e-31  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2275  aminodeoxychorismate lyase  34.06 
 
 		 349 aa  136  6.0000000000000005e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0473  periplasmic solute-binding protein  30.3 
 
 		 345 aa  136  6.0000000000000005e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0206414  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1008  aminodeoxychorismate lyase  31.8 
 
 		 373 aa  136  7.000000000000001e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00821655  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0459  aminodeoxychorismate lyase  28.86 
 
 		 451 aa  135  9.999999999999999e-31  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17710  predicted periplasmic solute-binding protein  30.49 
 
 		 388 aa  134  3e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0437467  normal  0.304384 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1472  aminodeoxychorismate lyase  28.49 
 
 		 424 aa  134  3e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.120948  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1410  aminodeoxychorismate lyase  30.48 
 
 		 347 aa  133  5e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1390  aminodeoxychorismate lyase  27.87 
 
 		 364 aa  132  6.999999999999999e-30  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000172807  hitchhiker  3.2530600000000004e-23 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0682  aminodeoxychorismate lyase  32.48 
 
 		 333 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0424367  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2350  aminodeoxychorismate lyase  33.93 
 
 		 416 aa  131  2.0000000000000002e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0288  aminodeoxychorismate lyase  27.41 
 
 		 658 aa  131  2.0000000000000002e-29  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0842  aminodeoxychorismate lyase  32.17 
 
 		 327 aa  130  3e-29  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0834555 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2514  aminodeoxychorismate lyase  33.46 
 
 		 337 aa  130  4.0000000000000003e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.636222  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0918  aminodeoxychorismate lyase  30.7 
 
 		 345 aa  130  5.0000000000000004e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.174013  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2268  aminodeoxychorismate lyase  31.97 
 
 		 343 aa  129  6e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.642  normal  0.198206 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2733  aminodeoxychorismate lyase  37.12 
 
 		 337 aa  129  6e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.269056  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1685  aminodeoxychorismate lyase  33.63 
 
 		 407 aa  129  7.000000000000001e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2553  aminodeoxychorismate lyase  31.77 
 
 		 385 aa  128  1.0000000000000001e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0030  aminodeoxychorismate lyase  33.79 
 
 		 349 aa  129  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.647846  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0694  aminodeoxychorismate lyase  32.71 
 
 		 327 aa  128  2.0000000000000002e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000296609 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1129  aminodeoxychorismate lyase  32.97 
 
 		 336 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.399769 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3481  aminodeoxychorismate lyase  32.81 
 
 		 418 aa  127  3e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.114938  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3821  hypothetical protein  32.34 
 
 		 406 aa  127  5e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.133528 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2122  aminodeoxychorismate lyase  31.01 
 
 		 340 aa  126  6e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3134  aminodeoxychorismate lyase  30.26 
 
 		 442 aa  126  7e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.486263 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0557  aminodeoxychorismate lyase  31.99 
 
 		 326 aa  125  1e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.245938  normal  0.0550645 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>