More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_1820 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_1820  aminodeoxychorismate lyase  100 
 
 		 401 aa  807    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.111847  normal  0.624649 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1691  aminodeoxychorismate lyase  44.74 
 
 		 376 aa  264  2e-69  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.527988  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1692  aminodeoxychorismate lyase  50.33 
 
 		 382 aa  263  4e-69  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2016  aminodeoxychorismate lyase  42.37 
 
 		 407 aa  254  1.0000000000000001e-66  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.658321  normal  0.0585657 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3156  aminodeoxychorismate lyase  41.93 
 
 		 536 aa  231  2e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.489263  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1349  aminodeoxychorismate lyase  38.27 
 
 		 397 aa  228  2e-58  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16340  predicted periplasmic solute-binding protein  40.51 
 
 		 390 aa  225  8e-58  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3030  aminodeoxychorismate lyase  46.79 
 
 		 368 aa  209  6e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17720  predicted periplasmic solute-binding protein  41.82 
 
 		 395 aa  207  2e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.412389  normal  0.31092 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17710  predicted periplasmic solute-binding protein  38.54 
 
 		 388 aa  207  4e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0437467  normal  0.304384 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1830  aminodeoxychorismate lyase  40.88 
 
 		 401 aa  200  3.9999999999999996e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.194696  normal  0.869905 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12530  predicted periplasmic solute-binding protein  37.25 
 
 		 368 aa  199  5e-50  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00811784  normal  0.477009 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3073  aminodeoxychorismate lyase  39.3 
 
 		 456 aa  197  3e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.658866  normal  0.521991 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0377  conserved hypothetical protein, YceG family  36.69 
 
 		 396 aa  196  5.000000000000001e-49  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1328  aminodeoxychorismate lyase  39.43 
 
 		 372 aa  196  6e-49  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0484668  normal  0.302335 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2409  aminodeoxychorismate lyase  37.04 
 
 		 397 aa  192  6e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.105419  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2137  aminodeoxychorismate lyase  36.69 
 
 		 456 aa  187  2e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000886776  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2068  putative integral membrane protein  36.19 
 
 		 685 aa  187  3e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0278273  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0614  aminodeoxychorismate lyase  36.77 
 
 		 393 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.415027  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2045  aminodeoxychorismate lyase  35.86 
 
 		 342 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0393494  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6091  aminodeoxychorismate lyase  37.42 
 
 		 387 aa  181  1e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.384921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1821  aminodeoxychorismate lyase  39.01 
 
 		 401 aa  182  1e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000914518 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2044  aminodeoxychorismate lyase  36.36 
 
 		 385 aa  180  4e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0389257  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2013  aminodeoxychorismate lyase  34.91 
 
 		 588 aa  174  1.9999999999999998e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000282457 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3212  aminodeoxychorismate lyase  37.54 
 
 		 413 aa  169  6e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0548102  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5263  aminodeoxychorismate lyase  33.96 
 
 		 409 aa  166  5e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2276  aminodeoxychorismate lyase  32.56 
 
 		 485 aa  162  7e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.204886  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3876  aminodeoxychorismate lyase  34.91 
 
 		 395 aa  162  9e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1696  aminodeoxychorismate lyase  37.46 
 
 		 468 aa  160  4e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.255824  normal  0.195294 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12574  hypothetical protein  32.93 
 
 		 417 aa  157  4e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00172093  normal  0.0835034 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2389  aminodeoxychorismate lyase  33.99 
 
 		 415 aa  150  5e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0575785 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2348  aminodeoxychorismate lyase  33.99 
 
 		 415 aa  150  5e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.776778  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2395  aminodeoxychorismate lyase  33.99 
 
 		 415 aa  150  5e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.178925 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2026  hypothetical protein  30.64 
 
 		 333 aa  146  7.0000000000000006e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12700  predicted periplasmic solute-binding protein  34.25 
 
 		 422 aa  146  8.000000000000001e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1743  hypothetical protein  33.2 
 
 		 333 aa  144  3e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0845  periplasmic solute-binding protein-like protein  36.96 
 
 		 320 aa  138  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1361  aminodeoxychorismate lyase  30.77 
 
 		 370 aa  138  2e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0615754  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1497  aminodeoxychorismate lyase  31.82 
 
 		 351 aa  136  7.000000000000001e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0459  aminodeoxychorismate lyase  30.98 
 
 		 451 aa  134  1.9999999999999998e-30  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0473  periplasmic solute-binding protein  31.76 
 
 		 345 aa  135  1.9999999999999998e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0206414  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1637  aminodeoxychorismate lyase  33.22 
 
 		 352 aa  132  7.999999999999999e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.521882 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07820  conserved hypothetical protein TIGR00247  35.94 
 
 		 389 aa  132  1.0000000000000001e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0223518 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3761  aminodeoxychorismate lyase  31.78 
 
 		 415 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.37487 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2642  aminodeoxychorismate lyase  31.61 
 
 		 415 aa  131  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05120  conserved hypothetical protein TIGR00247  34.87 
 
 		 403 aa  130  5.0000000000000004e-29  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.924204  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2459  aminodeoxychorismate lyase  32.31 
 
 		 344 aa  130  6e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.5911  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4504  conserved hypothetical protein TIGR00247  28.8 
 
 		 356 aa  129  6e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05820  aminodeoxychorismate lyase  32.33 
 
 		 337 aa  129  6e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0160306  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3021  aminodeoxychorismate lyase  30.85 
 
 		 358 aa  129  7.000000000000001e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.157507  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2023  aminodeoxychorismate lyase  32.4 
 
 		 363 aa  129  9.000000000000001e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.309788  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0966  aminodeoxychorismate lyase  33.04 
 
 		 363 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4657  aminodeoxychorismate lyase  29.97 
 
 		 362 aa  129  1.0000000000000001e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.333524  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4128  aminodeoxychorismate lyase  28.8 
 
 		 356 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000574197  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4231  aminodeoxychorismate lyase  28.53 
 
 		 356 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000711244  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4464  conserved hypothetical protein TIGR00247  28.8 
 
 		 356 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000911703 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15290  predicted periplasmic solute-binding protein  31.93 
 
 		 493 aa  127  3e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.444068  normal  0.602564 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0732  hypothetical protein TIGR00247  28.26 
 
 		 356 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000024462  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4280  hypothetical protein  29.08 
 
 		 356 aa  127  5e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000498286  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2486  aminodeoxychorismate lyase  32.13 
 
 		 364 aa  126  6e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00502838  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0842  aminodeoxychorismate lyase  32.11 
 
 		 327 aa  126  6e-28  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0834555 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3036  aminodeoxychorismate lyase  31.67 
 
 		 623 aa  126  7e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0256494  normal  0.08592 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4612  hypothetical protein  29.12 
 
 		 351 aa  126  7e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000312577  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1410  aminodeoxychorismate lyase  33.82 
 
 		 347 aa  126  7e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0204  aminodeoxychorismate lyase  36.32 
 
 		 314 aa  125  1e-27  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4117  aminodeoxychorismate lyase  28.8 
 
 		 356 aa  125  1e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000093714  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4517  conserved hypothetical protein TIGR00247  28.26 
 
 		 356 aa  125  1e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000911066  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3295  aminodeoxychorismate lyase  30.9 
 
 		 434 aa  124  2e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000545955  normal  0.0867897 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3559  aminodeoxychorismate lyase  30.9 
 
 		 341 aa  125  2e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000155777  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1776  aminodeoxychorismate lyase  31.16 
 
 		 355 aa  121  1.9999999999999998e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.81136  normal  0.183273 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2122  aminodeoxychorismate lyase  32.03 
 
 		 340 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3097  aminodeoxychorismate lyase  27.47 
 
 		 355 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00109006  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1435  aminodeoxychorismate lyase  31.92 
 
 		 344 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1129  aminodeoxychorismate lyase  30.07 
 
 		 336 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.399769 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0417  aminodeoxychorismate lyase  33.46 
 
 		 331 aa  119  7.999999999999999e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0900  aminodeoxychorismate lyase  30.61 
 
 		 338 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0733  aminodeoxychorismate lyase  33.21 
 
 		 335 aa  117  3e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.224262  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0225  aminodeoxychorismate lyase  30.58 
 
 		 322 aa  117  3e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.58497  normal  0.0291883 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0918  aminodeoxychorismate lyase  30.99 
 
 		 345 aa  117  3e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.174013  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2950  aminodeoxychorismate lyase  31.49 
 
 		 353 aa  117  5e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2534  aminodeoxychorismate lyase  29.69 
 
 		 339 aa  116  6e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.714245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0625  aminodeoxychorismate lyase  31.29 
 
 		 357 aa  116  7.999999999999999e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0512441  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1837  aminodeoxychorismate lyase  32.3 
 
 		 360 aa  115  8.999999999999998e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2262  aminodeoxychorismate lyase  30.68 
 
 		 344 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.945495  hitchhiker  0.000317634 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0650  periplasmic solute-binding protein, aminodeoxychorismate lyase-like  29.24 
 
 		 356 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.368295  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1390  aminodeoxychorismate lyase  27.32 
 
 		 364 aa  112  8.000000000000001e-24  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000172807  hitchhiker  3.2530600000000004e-23 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4144  aminodeoxychorismate lyase  30.34 
 
 		 409 aa  112  9e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0208419  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1830  aminodeoxychorismate lyase  30.45 
 
 		 342 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1791  aminodeoxychorismate lyase  30.88 
 
 		 339 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00439567  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2322  aminodeoxychorismate lyase  29.03 
 
 		 587 aa  112  1.0000000000000001e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.284127  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3279  aminodeoxychorismate lyase  30.03 
 
 		 376 aa  112  1.0000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.258116  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1977  aminodeoxychorismate lyase  26.97 
 
 		 418 aa  111  2.0000000000000002e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.337407  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0871  aminodeoxychorismate lyase  27.3 
 
 		 339 aa  110  4.0000000000000004e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2499  aminodeoxychorismate lyase  27.08 
 
 		 339 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00196213  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4467  aminodeoxychorismate lyase  27.58 
 
 		 357 aa  110  5e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000156063  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2803  aminodeoxychorismate lyase  28.1 
 
 		 339 aa  110  5e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0153211  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0953  aminodeoxychorismate lyase  38.79 
 
 		 335 aa  110  6e-23  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.316253  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2275  aminodeoxychorismate lyase  27.69 
 
 		 349 aa  110  6e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0629  aminodeoxychorismate lyase  27.11 
 
 		 310 aa  110  6e-23  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0682  aminodeoxychorismate lyase  26.67 
 
 		 333 aa  108  1e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0424367  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>