More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_16340 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_16340  predicted periplasmic solute-binding protein  100 
 
 		 390 aa  787    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1349  aminodeoxychorismate lyase  38.92 
 
 		 397 aa  261  1e-68  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3156  aminodeoxychorismate lyase  43.83 
 
 		 536 aa  239  5.999999999999999e-62  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.489263  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1820  aminodeoxychorismate lyase  39.82 
 
 		 401 aa  225  8e-58  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.111847  normal  0.624649 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12530  predicted periplasmic solute-binding protein  39.48 
 
 		 368 aa  225  1e-57  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00811784  normal  0.477009 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2016  aminodeoxychorismate lyase  38.51 
 
 		 407 aa  219  5e-56  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.658321  normal  0.0585657 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2137  aminodeoxychorismate lyase  39.69 
 
 		 456 aa  215  8e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000886776  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6091  aminodeoxychorismate lyase  38.86 
 
 		 387 aa  214  9.999999999999999e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.384921  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2044  aminodeoxychorismate lyase  40.39 
 
 		 385 aa  210  3e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0389257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3030  aminodeoxychorismate lyase  43.09 
 
 		 368 aa  209  8e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0614  aminodeoxychorismate lyase  35.24 
 
 		 393 aa  207  2e-52  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.415027  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1328  aminodeoxychorismate lyase  38.2 
 
 		 372 aa  207  3e-52  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0484668  normal  0.302335 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2409  aminodeoxychorismate lyase  36.8 
 
 		 397 aa  204  3e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.105419  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17720  predicted periplasmic solute-binding protein  38.58 
 
 		 395 aa  196  7e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.412389  normal  0.31092 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1830  aminodeoxychorismate lyase  37.24 
 
 		 401 aa  192  1e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.194696  normal  0.869905 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2013  aminodeoxychorismate lyase  36.1 
 
 		 588 aa  187  3e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000282457 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2068  putative integral membrane protein  34.22 
 
 		 685 aa  187  4e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0278273  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1692  aminodeoxychorismate lyase  37.9 
 
 		 382 aa  185  9e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1691  aminodeoxychorismate lyase  35.87 
 
 		 376 aa  184  2.0000000000000003e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.527988  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2045  aminodeoxychorismate lyase  34.38 
 
 		 342 aa  183  4.0000000000000006e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0393494  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1821  aminodeoxychorismate lyase  35.74 
 
 		 401 aa  180  4.999999999999999e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000914518 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0377  conserved hypothetical protein, YceG family  33.98 
 
 		 396 aa  178  1e-43  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3876  aminodeoxychorismate lyase  34.44 
 
 		 395 aa  171  2e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17710  predicted periplasmic solute-binding protein  36.74 
 
 		 388 aa  163  6e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0437467  normal  0.304384 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2276  aminodeoxychorismate lyase  33.12 
 
 		 485 aa  162  7e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.204886  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12700  predicted periplasmic solute-binding protein  33.42 
 
 		 422 aa  162  1e-38  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2389  aminodeoxychorismate lyase  31.36 
 
 		 415 aa  162  1e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0575785 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2348  aminodeoxychorismate lyase  31.36 
 
 		 415 aa  162  1e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.776778  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2395  aminodeoxychorismate lyase  31.36 
 
 		 415 aa  162  1e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.178925 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3073  aminodeoxychorismate lyase  32.29 
 
 		 456 aa  158  2e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.658866  normal  0.521991 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12574  hypothetical protein  31 
 
 		 417 aa  152  1e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00172093  normal  0.0835034 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2275  aminodeoxychorismate lyase  33.12 
 
 		 349 aa  148  1.0000000000000001e-34  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5263  aminodeoxychorismate lyase  31.07 
 
 		 409 aa  145  1e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1696  aminodeoxychorismate lyase  36.59 
 
 		 468 aa  143  4e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.255824  normal  0.195294 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3559  aminodeoxychorismate lyase  29.21 
 
 		 341 aa  142  9.999999999999999e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000155777  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2642  aminodeoxychorismate lyase  30.72 
 
 		 415 aa  142  9.999999999999999e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3761  aminodeoxychorismate lyase  30.7 
 
 		 415 aa  141  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.37487 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2534  aminodeoxychorismate lyase  33.44 
 
 		 339 aa  139  7.999999999999999e-32  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.714245  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3212  aminodeoxychorismate lyase  32.84 
 
 		 413 aa  134  3e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0548102  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2262  aminodeoxychorismate lyase  29.07 
 
 		 344 aa  132  7.999999999999999e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.945495  hitchhiker  0.000317634 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0845  periplasmic solute-binding protein-like protein  34.6 
 
 		 320 aa  131  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0918  aminodeoxychorismate lyase  30.2 
 
 		 345 aa  131  3e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.174013  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0288  aminodeoxychorismate lyase  28.82 
 
 		 658 aa  130  3e-29  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3295  aminodeoxychorismate lyase  30.67 
 
 		 434 aa  130  4.0000000000000003e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000545955  normal  0.0867897 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15290  predicted periplasmic solute-binding protein  29.72 
 
 		 493 aa  130  4.0000000000000003e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.444068  normal  0.602564 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0900  aminodeoxychorismate lyase  32.01 
 
 		 338 aa  130  5.0000000000000004e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2026  hypothetical protein  28.69 
 
 		 333 aa  129  1.0000000000000001e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2514  aminodeoxychorismate lyase  31.41 
 
 		 337 aa  128  1.0000000000000001e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.636222  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2322  aminodeoxychorismate lyase  31.04 
 
 		 587 aa  127  3e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.284127  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0871  aminodeoxychorismate lyase  29.75 
 
 		 339 aa  127  3e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1410  aminodeoxychorismate lyase  31.37 
 
 		 347 aa  127  3e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2905  aminodeoxychorismate lyase  31.23 
 
 		 337 aa  124  2e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2486  aminodeoxychorismate lyase  28.57 
 
 		 364 aa  124  3e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00502838  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1637  aminodeoxychorismate lyase  30.35 
 
 		 352 aa  124  3e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.521882 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4231  aminodeoxychorismate lyase  29.19 
 
 		 356 aa  124  3e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000711244  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0732  hypothetical protein TIGR00247  28.92 
 
 		 356 aa  124  4e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000024462  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2733  aminodeoxychorismate lyase  31.68 
 
 		 337 aa  123  5e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.269056  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1435  aminodeoxychorismate lyase  36.17 
 
 		 344 aa  123  6e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4280  hypothetical protein  28.92 
 
 		 356 aa  123  7e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000498286  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4117  aminodeoxychorismate lyase  29.19 
 
 		 356 aa  123  7e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000093714  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4612  hypothetical protein  28.92 
 
 		 351 aa  122  9e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000312577  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0473  periplasmic solute-binding protein  28.03 
 
 		 345 aa  122  9e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0206414  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4517  conserved hypothetical protein TIGR00247  28.92 
 
 		 356 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000911066  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4128  aminodeoxychorismate lyase  28.92 
 
 		 356 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000574197  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4464  conserved hypothetical protein TIGR00247  28.92 
 
 		 356 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000911703 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2614  hypothetical protein  31.48 
 
 		 336 aa  120  3e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1743  hypothetical protein  27.56 
 
 		 333 aa  121  3e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4504  conserved hypothetical protein TIGR00247  28.92 
 
 		 356 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4657  aminodeoxychorismate lyase  29.85 
 
 		 362 aa  120  3.9999999999999996e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.333524  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2459  aminodeoxychorismate lyase  32.44 
 
 		 344 aa  119  7e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.5911  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1776  aminodeoxychorismate lyase  30.51 
 
 		 355 aa  119  9e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.81136  normal  0.183273 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2122  aminodeoxychorismate lyase  30.65 
 
 		 340 aa  119  9.999999999999999e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1543  hypothetical protein  31.66 
 
 		 340 aa  118  1.9999999999999998e-25  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0557  aminodeoxychorismate lyase  32.36 
 
 		 326 aa  118  1.9999999999999998e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.245938  normal  0.0550645 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2521  aminodeoxychorismate lyase  30.45 
 
 		 372 aa  117  3.9999999999999997e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05820  aminodeoxychorismate lyase  28.95 
 
 		 337 aa  116  6e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0160306  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1765  aminodeoxychorismate lyase  29.78 
 
 		 391 aa  116  6e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.310683  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2950  aminodeoxychorismate lyase  30.45 
 
 		 353 aa  115  1.0000000000000001e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1129  aminodeoxychorismate lyase  32.48 
 
 		 336 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.399769 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1390  aminodeoxychorismate lyase  27.81 
 
 		 364 aa  115  1.0000000000000001e-24  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000172807  hitchhiker  3.2530600000000004e-23 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2044  hypothetical protein  29.3 
 
 		 324 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.47923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1578  aminodeoxychorismate lyase  29.05 
 
 		 335 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.853067  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1660  aminodeoxychorismate lyase  30.49 
 
 		 336 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.132451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1735  aminodeoxychorismate lyase  30.49 
 
 		 336 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.163239  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1891  aminodeoxychorismate lyase  28.99 
 
 		 345 aa  114  3e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.253385  normal  0.0515475 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3414  aminodeoxychorismate lyase  31.65 
 
 		 369 aa  114  3e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0388714  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1765  aminodeoxychorismate lyase  30.49 
 
 		 336 aa  114  3e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0979727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2453  aminodeoxychorismate lyase  28.99 
 
 		 345 aa  114  4.0000000000000004e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0182667  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1837  aminodeoxychorismate lyase  31.68 
 
 		 360 aa  114  4.0000000000000004e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0225  aminodeoxychorismate lyase  27.99 
 
 		 322 aa  113  5e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.58497  normal  0.0291883 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3717  aminodeoxychorismate lyase  30.49 
 
 		 471 aa  113  6e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.444196  normal  0.13956 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1008  aminodeoxychorismate lyase  29.97 
 
 		 373 aa  113  6e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00821655  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05120  conserved hypothetical protein TIGR00247  28.48 
 
 		 403 aa  113  6e-24  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.924204  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1203  aminodeoxychorismate lyase  29.44 
 
 		 405 aa  113  6e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00148773 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3036  aminodeoxychorismate lyase  28.97 
 
 		 623 aa  112  7.000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0256494  normal  0.08592 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0682  aminodeoxychorismate lyase  28.38 
 
 		 333 aa  113  7.000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0424367  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1501  aminodeoxychorismate lyase  28.33 
 
 		 334 aa  112  7.000000000000001e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00653214  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4536  aminodeoxychorismate lyase  31.09 
 
 		 371 aa  113  7.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2215  aminodeoxychorismate lyase  30.49 
 
 		 345 aa  113  7.000000000000001e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1361  aminodeoxychorismate lyase  32.04 
 
 		 370 aa  112  8.000000000000001e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0615754  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>