More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_0614 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010816  BLD_0614  aminodeoxychorismate lyase  100 
 
 		 393 aa  811    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.415027  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0377  conserved hypothetical protein, YceG family  52.09 
 
 		 396 aa  404  1e-111  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1349  aminodeoxychorismate lyase  37.67 
 
 		 397 aa  221  1.9999999999999999e-56  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2016  aminodeoxychorismate lyase  35.69 
 
 		 407 aa  213  3.9999999999999995e-54  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.658321  normal  0.0585657 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16340  predicted periplasmic solute-binding protein  35.8 
 
 		 390 aa  207  3e-52  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17720  predicted periplasmic solute-binding protein  39.24 
 
 		 395 aa  203  3e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.412389  normal  0.31092 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1691  aminodeoxychorismate lyase  38.11 
 
 		 376 aa  190  4e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.527988  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1692  aminodeoxychorismate lyase  37.66 
 
 		 382 aa  186  7e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1820  aminodeoxychorismate lyase  36.77 
 
 		 401 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.111847  normal  0.624649 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12530  predicted periplasmic solute-binding protein  34.48 
 
 		 368 aa  182  7e-45  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00811784  normal  0.477009 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3156  aminodeoxychorismate lyase  36.27 
 
 		 536 aa  182  1e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.489263  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3030  aminodeoxychorismate lyase  40.2 
 
 		 368 aa  180  4.999999999999999e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2013  aminodeoxychorismate lyase  35.78 
 
 		 588 aa  179  9e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000282457 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2044  aminodeoxychorismate lyase  38.57 
 
 		 385 aa  179  1e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0389257  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2409  aminodeoxychorismate lyase  34.93 
 
 		 397 aa  177  2e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.105419  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2045  aminodeoxychorismate lyase  35.8 
 
 		 342 aa  177  3e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0393494  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2137  aminodeoxychorismate lyase  36.25 
 
 		 456 aa  177  3e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000886776  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6091  aminodeoxychorismate lyase  37.32 
 
 		 387 aa  177  3e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.384921  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12700  predicted periplasmic solute-binding protein  32.97 
 
 		 422 aa  175  9.999999999999999e-43  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2276  aminodeoxychorismate lyase  33.53 
 
 		 485 aa  174  1.9999999999999998e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.204886  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2068  putative integral membrane protein  33.88 
 
 		 685 aa  171  2e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0278273  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1328  aminodeoxychorismate lyase  33.51 
 
 		 372 aa  166  5e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0484668  normal  0.302335 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3073  aminodeoxychorismate lyase  31.61 
 
 		 456 aa  149  9e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.658866  normal  0.521991 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3876  aminodeoxychorismate lyase  31.16 
 
 		 395 aa  146  5e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17710  predicted periplasmic solute-binding protein  29.2 
 
 		 388 aa  142  8e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0437467  normal  0.304384 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1830  aminodeoxychorismate lyase  33.54 
 
 		 401 aa  142  9.999999999999999e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.194696  normal  0.869905 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5263  aminodeoxychorismate lyase  31.12 
 
 		 409 aa  139  6e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15290  predicted periplasmic solute-binding protein  28.57 
 
 		 493 aa  139  1e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.444068  normal  0.602564 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3295  aminodeoxychorismate lyase  30.37 
 
 		 434 aa  137  2e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000545955  normal  0.0867897 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3212  aminodeoxychorismate lyase  34.7 
 
 		 413 aa  135  9e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0548102  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1821  aminodeoxychorismate lyase  32 
 
 		 401 aa  133  5e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000914518 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2055  aminodeoxychorismate lyase  29.38 
 
 		 407 aa  131  2.0000000000000002e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1696  aminodeoxychorismate lyase  34.14 
 
 		 468 aa  130  3e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.255824  normal  0.195294 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0748  aminodeoxychorismate lyase  33.33 
 
 		 399 aa  126  8.000000000000001e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.309418  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1060  aminodeoxychorismate lyase  28.42 
 
 		 412 aa  124  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.017221 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12574  hypothetical protein  26.55 
 
 		 417 aa  124  4e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00172093  normal  0.0835034 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1203  aminodeoxychorismate lyase  28.53 
 
 		 405 aa  122  8e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00148773 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0845  periplasmic solute-binding protein-like protein  35.56 
 
 		 320 aa  120  3e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3761  aminodeoxychorismate lyase  27.84 
 
 		 415 aa  120  6e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.37487 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2521  aminodeoxychorismate lyase  31.35 
 
 		 372 aa  119  9.999999999999999e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1532  hypothetical protein  30.45 
 
 		 414 aa  117  1.9999999999999998e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0269325  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2322  aminodeoxychorismate lyase  28.13 
 
 		 587 aa  117  3e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.284127  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2459  aminodeoxychorismate lyase  32.57 
 
 		 344 aa  117  5e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.5911  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2389  aminodeoxychorismate lyase  25.85 
 
 		 415 aa  115  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0575785 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1055  aminodeoxychorismate lyase  39.7 
 
 		 384 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.921254  normal  0.096534 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2348  aminodeoxychorismate lyase  25.85 
 
 		 415 aa  115  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.776778  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2395  aminodeoxychorismate lyase  25.85 
 
 		 415 aa  115  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.178925 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4144  aminodeoxychorismate lyase  30.14 
 
 		 409 aa  114  3e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0208419  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1977  aminodeoxychorismate lyase  28.67 
 
 		 418 aa  113  5e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.337407  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0459  aminodeoxychorismate lyase  27.69 
 
 		 451 aa  113  6e-24  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1791  aminodeoxychorismate lyase  28.45 
 
 		 339 aa  112  8.000000000000001e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00439567  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05120  conserved hypothetical protein TIGR00247  31.37 
 
 		 403 aa  113  8.000000000000001e-24  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.924204  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2380  aminodeoxychorismate lyase  28.41 
 
 		 691 aa  112  9e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0842  aminodeoxychorismate lyase  31.08 
 
 		 327 aa  112  2.0000000000000002e-23  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0834555 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1129  aminodeoxychorismate lyase  29.41 
 
 		 336 aa  112  2.0000000000000002e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.399769 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0557  aminodeoxychorismate lyase  39.57 
 
 		 326 aa  110  3e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.245938  normal  0.0550645 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2351  aminodeoxychorismate lyase  37.57 
 
 		 620 aa  109  9.000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.260551 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4517  conserved hypothetical protein TIGR00247  27 
 
 		 356 aa  108  1e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000911066  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1630  aminodeoxychorismate lyase  39.46 
 
 		 385 aa  108  1e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.118431  normal  0.589184 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0966  aminodeoxychorismate lyase  28.02 
 
 		 363 aa  108  2e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2486  aminodeoxychorismate lyase  27.47 
 
 		 364 aa  108  2e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00502838  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2465  hypothetical protein  39.46 
 
 		 393 aa  108  2e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.347128  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1127  aminodeoxychorismate lyase  39.46 
 
 		 392 aa  108  2e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.66542 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2642  aminodeoxychorismate lyase  25.67 
 
 		 415 aa  108  2e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4117  aminodeoxychorismate lyase  25.96 
 
 		 356 aa  107  3e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000093714  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1072  aminodeoxychorismate lyase  39.78 
 
 		 392 aa  107  3e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.232656  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0732  hypothetical protein TIGR00247  26.72 
 
 		 356 aa  107  3e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000024462  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4128  aminodeoxychorismate lyase  26.45 
 
 		 356 aa  107  4e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000574197  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4231  aminodeoxychorismate lyase  26.72 
 
 		 356 aa  107  5e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000711244  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2803  aminodeoxychorismate lyase  27.22 
 
 		 339 aa  106  7e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0153211  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2783  aminodeoxychorismate lyase  28.49 
 
 		 456 aa  106  8e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0625  aminodeoxychorismate lyase  30 
 
 		 357 aa  106  9e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0512441  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2268  aminodeoxychorismate lyase  30.26 
 
 		 343 aa  105  1e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.642  normal  0.198206 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2499  aminodeoxychorismate lyase  27.22 
 
 		 339 aa  105  1e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00196213  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1765  aminodeoxychorismate lyase  27.97 
 
 		 391 aa  105  1e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.310683  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1743  hypothetical protein  27.73 
 
 		 333 aa  105  1e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1582  hypothetical protein  28.57 
 
 		 341 aa  104  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000314961  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4464  conserved hypothetical protein TIGR00247  25.9 
 
 		 356 aa  105  2e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000911703 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4657  aminodeoxychorismate lyase  25.74 
 
 		 362 aa  105  2e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.333524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0574  aminodeoxychorismate lyase  28.09 
 
 		 403 aa  104  2e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4280  hypothetical protein  25.62 
 
 		 356 aa  104  3e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000498286  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1685  aminodeoxychorismate lyase  29.09 
 
 		 407 aa  104  3e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1690  aminodeoxychorismate lyase  28.45 
 
 		 341 aa  104  3e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0437285  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2350  aminodeoxychorismate lyase  28.93 
 
 		 416 aa  103  4e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3494  hypothetical protein  28.17 
 
 		 363 aa  103  4e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000556203  normal  0.010619 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3036  aminodeoxychorismate lyase  28.85 
 
 		 623 aa  103  4e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0256494  normal  0.08592 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2534  aminodeoxychorismate lyase  27.12 
 
 		 339 aa  103  6e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.714245  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4504  conserved hypothetical protein TIGR00247  25.96 
 
 		 356 aa  103  7e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0892  aminodeoxychorismate lyase  29.06 
 
 		 579 aa  103  7e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0855314 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0419  aminodeoxychorismate lyase  29.38 
 
 		 328 aa  103  7e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.290965  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1627  aminodeoxychorismate lyase  29.37 
 
 		 343 aa  103  7e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000211162  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4612  hypothetical protein  25.77 
 
 		 351 aa  102  8e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000312577  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2026  hypothetical protein  26.48 
 
 		 333 aa  103  8e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3821  hypothetical protein  28.42 
 
 		 406 aa  103  8e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.133528 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0125  aminodeoxychorismate lyase  28.43 
 
 		 393 aa  102  1e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000881139  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0953  aminodeoxychorismate lyase  39.05 
 
 		 335 aa  102  1e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.316253  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1410  aminodeoxychorismate lyase  28 
 
 		 347 aa  102  1e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0315  aminodeoxychorismate lyase  28.62 
 
 		 389 aa  101  2e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1093  aminodeoxychorismate lyase  25.28 
 
 		 332 aa  101  2e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.72202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3618  aminodeoxychorismate lyase  34.43 
 
 		 362 aa  100  3e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000276729  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>