More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_2013 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_2013  aminodeoxychorismate lyase  100 
 
 		 588 aa  1191    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000282457 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2276  aminodeoxychorismate lyase  62.05 
 
 		 485 aa  531  1e-149  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.204886  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12700  predicted periplasmic solute-binding protein  37.98 
 
 		 422 aa  261  2e-68  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16340  predicted periplasmic solute-binding protein  36.1 
 
 		 390 aa  187  3e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0377  conserved hypothetical protein, YceG family  39.16 
 
 		 396 aa  184  5.0000000000000004e-45  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12530  predicted periplasmic solute-binding protein  36.07 
 
 		 368 aa  183  9.000000000000001e-45  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00811784  normal  0.477009 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0614  aminodeoxychorismate lyase  35.78 
 
 		 393 aa  179  1e-43  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.415027  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17720  predicted periplasmic solute-binding protein  37.57 
 
 		 395 aa  177  4e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.412389  normal  0.31092 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1820  aminodeoxychorismate lyase  34.91 
 
 		 401 aa  174  2.9999999999999996e-42  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.111847  normal  0.624649 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3156  aminodeoxychorismate lyase  35.67 
 
 		 536 aa  172  1e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.489263  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2016  aminodeoxychorismate lyase  32.5 
 
 		 407 aa  169  9e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.658321  normal  0.0585657 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1349  aminodeoxychorismate lyase  32.11 
 
 		 397 aa  167  5e-40  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2409  aminodeoxychorismate lyase  33.8 
 
 		 397 aa  167  5e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.105419  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2045  aminodeoxychorismate lyase  32.35 
 
 		 342 aa  164  5.0000000000000005e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0393494  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2044  aminodeoxychorismate lyase  36.45 
 
 		 385 aa  158  2e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0389257  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2068  putative integral membrane protein  30.75 
 
 		 685 aa  157  3e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0278273  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1691  aminodeoxychorismate lyase  34.94 
 
 		 376 aa  150  5e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.527988  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1692  aminodeoxychorismate lyase  34.73 
 
 		 382 aa  150  5e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1328  aminodeoxychorismate lyase  34.12 
 
 		 372 aa  148  3e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0484668  normal  0.302335 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6091  aminodeoxychorismate lyase  35.71 
 
 		 387 aa  147  5e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.384921  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3073  aminodeoxychorismate lyase  34.06 
 
 		 456 aa  141  3e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.658866  normal  0.521991 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15290  predicted periplasmic solute-binding protein  30.71 
 
 		 493 aa  139  1e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.444068  normal  0.602564 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3876  aminodeoxychorismate lyase  30.21 
 
 		 395 aa  139  1e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3030  aminodeoxychorismate lyase  34.62 
 
 		 368 aa  139  1e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1791  aminodeoxychorismate lyase  33.53 
 
 		 339 aa  134  3.9999999999999996e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00439567  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5263  aminodeoxychorismate lyase  28.57 
 
 		 409 aa  134  5e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17710  predicted periplasmic solute-binding protein  33.96 
 
 		 388 aa  134  6.999999999999999e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0437467  normal  0.304384 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2137  aminodeoxychorismate lyase  28.47 
 
 		 456 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000886776  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2389  aminodeoxychorismate lyase  28.61 
 
 		 415 aa  133  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0575785 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2348  aminodeoxychorismate lyase  28.61 
 
 		 415 aa  133  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.776778  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2395  aminodeoxychorismate lyase  28.61 
 
 		 415 aa  133  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.178925 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1696  aminodeoxychorismate lyase  32.49 
 
 		 468 aa  128  4.0000000000000003e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.255824  normal  0.195294 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2642  aminodeoxychorismate lyase  30 
 
 		 415 aa  127  5e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0918  aminodeoxychorismate lyase  29.7 
 
 		 345 aa  126  1e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.174013  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12574  hypothetical protein  29.16 
 
 		 417 aa  122  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00172093  normal  0.0835034 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3212  aminodeoxychorismate lyase  31.41 
 
 		 413 aa  122  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0548102  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2351  aminodeoxychorismate lyase  32.17 
 
 		 620 aa  120  6e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.260551 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3295  aminodeoxychorismate lyase  29.05 
 
 		 434 aa  120  7e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000545955  normal  0.0867897 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1532  hypothetical protein  31.23 
 
 		 414 aa  119  9.999999999999999e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0269325  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1361  aminodeoxychorismate lyase  29.03 
 
 		 370 aa  117  5e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0615754  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3761  aminodeoxychorismate lyase  29.19 
 
 		 415 aa  117  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.37487 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0845  periplasmic solute-binding protein-like protein  34.68 
 
 		 320 aa  116  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0625  aminodeoxychorismate lyase  32.17 
 
 		 357 aa  116  1.0000000000000001e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0512441  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1060  aminodeoxychorismate lyase  31.23 
 
 		 412 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.017221 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0900  aminodeoxychorismate lyase  27.89 
 
 		 338 aa  115  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0650  periplasmic solute-binding protein, aminodeoxychorismate lyase-like  29.18 
 
 		 356 aa  111  3e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.368295  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1203  aminodeoxychorismate lyase  30.68 
 
 		 405 aa  111  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00148773 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0308  aminodeoxychorismate lyase  31.8 
 
 		 440 aa  111  3e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0495  aminodeoxychorismate lyase  30.6 
 
 		 467 aa  111  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.843817  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0560  aminodeoxychorismate lyase  30.6 
 
 		 467 aa  111  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.133777  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1743  hypothetical protein  29.63 
 
 		 333 aa  111  4.0000000000000004e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1837  aminodeoxychorismate lyase  30.66 
 
 		 360 aa  110  7.000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3559  aminodeoxychorismate lyase  29.14 
 
 		 341 aa  109  2e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000155777  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2026  hypothetical protein  29.6 
 
 		 333 aa  108  3e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1830  aminodeoxychorismate lyase  28.61 
 
 		 401 aa  107  5e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.194696  normal  0.869905 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1765  aminodeoxychorismate lyase  29.56 
 
 		 391 aa  107  5e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.310683  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0225  aminodeoxychorismate lyase  31.52 
 
 		 322 aa  107  8e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.58497  normal  0.0291883 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0574  aminodeoxychorismate lyase  30.62 
 
 		 403 aa  107  8e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1776  aminodeoxychorismate lyase  30.54 
 
 		 355 aa  106  1e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.81136  normal  0.183273 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0748  aminodeoxychorismate lyase  29.66 
 
 		 399 aa  106  1e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.309418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1821  aminodeoxychorismate lyase  28.61 
 
 		 401 aa  105  2e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000914518 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2950  aminodeoxychorismate lyase  32.2 
 
 		 353 aa  105  2e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1129  aminodeoxychorismate lyase  28.95 
 
 		 336 aa  105  2e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.399769 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05120  conserved hypothetical protein TIGR00247  30.1 
 
 		 403 aa  104  3e-21  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.924204  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05820  aminodeoxychorismate lyase  27.25 
 
 		 337 aa  105  3e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0160306  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3021  aminodeoxychorismate lyase  29.17 
 
 		 358 aa  104  4e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.157507  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4657  aminodeoxychorismate lyase  27.1 
 
 		 362 aa  104  4e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.333524  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0315  aminodeoxychorismate lyase  28.84 
 
 		 389 aa  104  5e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0694  aminodeoxychorismate lyase  30.69 
 
 		 327 aa  103  6e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000296609 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0682  aminodeoxychorismate lyase  30.32 
 
 		 333 aa  103  6e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0424367  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1410  aminodeoxychorismate lyase  28.61 
 
 		 347 aa  104  6e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1435  aminodeoxychorismate lyase  28.57 
 
 		 344 aa  103  7e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0531  aminodeoxychorismate lyase  28.53 
 
 		 464 aa  103  8e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.40268 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1877  aminodeoxychorismate lyase  30.55 
 
 		 328 aa  103  1e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.10744 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0030  aminodeoxychorismate lyase  31.56 
 
 		 349 aa  102  2e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.647846  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1488  hypothetical protein  29.34 
 
 		 346 aa  102  2e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0806646  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2534  aminodeoxychorismate lyase  27.89 
 
 		 339 aa  101  4e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.714245  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0733  aminodeoxychorismate lyase  29.86 
 
 		 335 aa  100  6e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.224262  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1988  aminodeoxychorismate lyase  29.41 
 
 		 345 aa  100  7e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0732  hypothetical protein TIGR00247  26.85 
 
 		 356 aa  99.8  1e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000024462  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2296  aminodeoxychorismate lyase  27.87 
 
 		 599 aa  99.4  2e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4517  conserved hypothetical protein TIGR00247  26.3 
 
 		 356 aa  99  2e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000911066  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1716  aminodeoxychorismate lyase  29.13 
 
 		 333 aa  99.4  2e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.998027  normal  0.24374 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2044  hypothetical protein  30.84 
 
 		 324 aa  99  2e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.47923  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1977  aminodeoxychorismate lyase  27.41 
 
 		 418 aa  98.6  3e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.337407  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3618  aminodeoxychorismate lyase  29.64 
 
 		 362 aa  98.6  3e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000276729  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3717  aminodeoxychorismate lyase  28.37 
 
 		 471 aa  98.6  3e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.444196  normal  0.13956 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3036  aminodeoxychorismate lyase  28.48 
 
 		 623 aa  98.6  3e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0256494  normal  0.08592 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2728  aminodeoxychorismate lyase  30.63 
 
 		 343 aa  98.2  3e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1417  aminodeoxychorismate lyase  27 
 
 		 338 aa  98.6  3e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.626218  normal  0.75601 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2634  aminodeoxychorismate lyase  31.06 
 
 		 343 aa  98.6  3e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3279  aminodeoxychorismate lyase  29.87 
 
 		 376 aa  98.6  3e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.258116  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1584  aminodeoxychorismate lyase  28.25 
 
 		 364 aa  98.2  4e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0339039  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3097  aminodeoxychorismate lyase  26.47 
 
 		 355 aa  97.8  4e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00109006  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4467  aminodeoxychorismate lyase  30.88 
 
 		 357 aa  98.2  4e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000156063  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2350  aminodeoxychorismate lyase  29.24 
 
 		 416 aa  98.2  4e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3134  aminodeoxychorismate lyase  29.2 
 
 		 442 aa  97.8  4e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.486263 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1641  hypothetical protein  28.25 
 
 		 350 aa  97.8  5e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.667934  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0459  aminodeoxychorismate lyase  27.67 
 
 		 451 aa  97.8  5e-19  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2783  aminodeoxychorismate lyase  29.28 
 
 		 456 aa  97.4  6e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>