More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_2276 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_2276  aminodeoxychorismate lyase  100 
 
 		 485 aa  992    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.204886  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2013  aminodeoxychorismate lyase  66.67 
 
 		 588 aa  538  1e-151  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000282457 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12700  predicted periplasmic solute-binding protein  39.34 
 
 		 422 aa  277  3e-73  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12530  predicted periplasmic solute-binding protein  37.19 
 
 		 368 aa  180  4e-44  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00811784  normal  0.477009 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0614  aminodeoxychorismate lyase  35.37 
 
 		 393 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.415027  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2409  aminodeoxychorismate lyase  34.17 
 
 		 397 aa  171  3e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.105419  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2045  aminodeoxychorismate lyase  32.37 
 
 		 342 aa  170  5e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0393494  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2016  aminodeoxychorismate lyase  31.11 
 
 		 407 aa  164  3e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.658321  normal  0.0585657 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16340  predicted periplasmic solute-binding protein  33.12 
 
 		 390 aa  163  5.0000000000000005e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1820  aminodeoxychorismate lyase  33.84 
 
 		 401 aa  160  6e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.111847  normal  0.624649 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0377  conserved hypothetical protein, YceG family  32.75 
 
 		 396 aa  159  8e-38  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17720  predicted periplasmic solute-binding protein  35.61 
 
 		 395 aa  159  1e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.412389  normal  0.31092 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3156  aminodeoxychorismate lyase  34.39 
 
 		 536 aa  159  1e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.489263  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2068  putative integral membrane protein  32.22 
 
 		 685 aa  157  5.0000000000000005e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0278273  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15290  predicted periplasmic solute-binding protein  30.91 
 
 		 493 aa  152  1e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.444068  normal  0.602564 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3073  aminodeoxychorismate lyase  34.89 
 
 		 456 aa  150  4e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.658866  normal  0.521991 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1692  aminodeoxychorismate lyase  35.78 
 
 		 382 aa  150  6e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1349  aminodeoxychorismate lyase  28.93 
 
 		 397 aa  146  7.0000000000000006e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6091  aminodeoxychorismate lyase  33.65 
 
 		 387 aa  145  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.384921  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2044  aminodeoxychorismate lyase  34.62 
 
 		 385 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0389257  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1328  aminodeoxychorismate lyase  33.24 
 
 		 372 aa  135  9.999999999999999e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0484668  normal  0.302335 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2137  aminodeoxychorismate lyase  27.66 
 
 		 456 aa  134  3e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000886776  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1691  aminodeoxychorismate lyase  32.27 
 
 		 376 aa  134  5e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.527988  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5263  aminodeoxychorismate lyase  27.92 
 
 		 409 aa  133  7.999999999999999e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2389  aminodeoxychorismate lyase  30.85 
 
 		 415 aa  132  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0575785 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2348  aminodeoxychorismate lyase  30.85 
 
 		 415 aa  132  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.776778  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2395  aminodeoxychorismate lyase  30.85 
 
 		 415 aa  132  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.178925 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12574  hypothetical protein  29.79 
 
 		 417 aa  129  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00172093  normal  0.0835034 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1696  aminodeoxychorismate lyase  32.39 
 
 		 468 aa  128  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.255824  normal  0.195294 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3030  aminodeoxychorismate lyase  33.22 
 
 		 368 aa  127  4.0000000000000003e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0845  periplasmic solute-binding protein-like protein  35.22 
 
 		 320 aa  123  6e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3761  aminodeoxychorismate lyase  29.84 
 
 		 415 aa  123  7e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.37487 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3295  aminodeoxychorismate lyase  28.5 
 
 		 434 aa  122  1.9999999999999998e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000545955  normal  0.0867897 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0918  aminodeoxychorismate lyase  28.71 
 
 		 345 aa  121  3.9999999999999996e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.174013  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3212  aminodeoxychorismate lyase  32.06 
 
 		 413 aa  120  6e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0548102  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17710  predicted periplasmic solute-binding protein  30.79 
 
 		 388 aa  119  9.999999999999999e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0437467  normal  0.304384 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3876  aminodeoxychorismate lyase  27.88 
 
 		 395 aa  117  3e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05120  conserved hypothetical protein TIGR00247  30.65 
 
 		 403 aa  117  3.9999999999999997e-25  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.924204  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0625  aminodeoxychorismate lyase  33.04 
 
 		 357 aa  117  3.9999999999999997e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0512441  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0650  periplasmic solute-binding protein, aminodeoxychorismate lyase-like  30.46 
 
 		 356 aa  117  5e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.368295  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2642  aminodeoxychorismate lyase  28.61 
 
 		 415 aa  114  3e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1791  aminodeoxychorismate lyase  31.2 
 
 		 339 aa  110  4.0000000000000004e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00439567  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1435  aminodeoxychorismate lyase  30.03 
 
 		 344 aa  108  2e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4657  aminodeoxychorismate lyase  27.1 
 
 		 362 aa  108  3e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.333524  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2026  hypothetical protein  28.22 
 
 		 333 aa  106  9e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1637  aminodeoxychorismate lyase  30.82 
 
 		 352 aa  106  1e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.521882 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1821  aminodeoxychorismate lyase  28.66 
 
 		 401 aa  105  1e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000914518 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1977  aminodeoxychorismate lyase  27.97 
 
 		 418 aa  105  2e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.337407  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1743  hypothetical protein  28.4 
 
 		 333 aa  105  2e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0900  aminodeoxychorismate lyase  26.97 
 
 		 338 aa  104  4e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1361  aminodeoxychorismate lyase  30.14 
 
 		 370 aa  104  4e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0615754  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2534  aminodeoxychorismate lyase  30.03 
 
 		 339 aa  103  9e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.714245  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0459  aminodeoxychorismate lyase  29.36 
 
 		 451 aa  102  1e-20  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1060  aminodeoxychorismate lyase  28.33 
 
 		 412 aa  102  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.017221 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1837  aminodeoxychorismate lyase  30.61 
 
 		 360 aa  102  1e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3279  aminodeoxychorismate lyase  30.19 
 
 		 376 aa  102  1e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.258116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3414  aminodeoxychorismate lyase  30.12 
 
 		 369 aa  101  3e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0388714  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0682  aminodeoxychorismate lyase  30 
 
 		 333 aa  100  5e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0424367  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3618  aminodeoxychorismate lyase  29.15 
 
 		 362 aa  100  7e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000276729  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2486  aminodeoxychorismate lyase  27.27 
 
 		 364 aa  100  7e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00502838  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0495  aminodeoxychorismate lyase  30.48 
 
 		 467 aa  100  8e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.843817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1830  aminodeoxychorismate lyase  27.63 
 
 		 401 aa  100  8e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.194696  normal  0.869905 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0560  aminodeoxychorismate lyase  30.48 
 
 		 467 aa  100  8e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.133777  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2118  aminodeoxychorismate lyase  29 
 
 		 312 aa  99.4  1e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0134865  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2499  aminodeoxychorismate lyase  29.24 
 
 		 339 aa  99.8  1e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00196213  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2351  aminodeoxychorismate lyase  31.03 
 
 		 620 aa  99.4  1e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.260551 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1203  aminodeoxychorismate lyase  29.12 
 
 		 405 aa  98.6  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00148773 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2322  aminodeoxychorismate lyase  26.38 
 
 		 587 aa  99  2e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.284127  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2803  aminodeoxychorismate lyase  28.95 
 
 		 339 aa  98.2  3e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0153211  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1563  aminodeoxychorismate lyase  30.43 
 
 		 369 aa  98.2  3e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1532  hypothetical protein  27.51 
 
 		 414 aa  97.4  4e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0269325  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1129  aminodeoxychorismate lyase  27.51 
 
 		 336 aa  97.4  5e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.399769 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1765  aminodeoxychorismate lyase  28.1 
 
 		 391 aa  97.4  5e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.310683  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0748  aminodeoxychorismate lyase  29.03 
 
 		 399 aa  97.1  6e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.309418  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2044  hypothetical protein  30.94 
 
 		 324 aa  97.1  6e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.47923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1988  aminodeoxychorismate lyase  29.77 
 
 		 345 aa  96.7  9e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1089  hypothetical protein  32.74 
 
 		 314 aa  96.3  1e-18  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.021227  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3097  aminodeoxychorismate lyase  27.54 
 
 		 355 aa  96.3  1e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00109006  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2459  aminodeoxychorismate lyase  29.28 
 
 		 344 aa  96.3  1e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.5911  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1410  aminodeoxychorismate lyase  28.53 
 
 		 347 aa  96.3  1e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1863  aminodeoxychorismate lyase  29.67 
 
 		 356 aa  96.3  1e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.322444  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0225  aminodeoxychorismate lyase  30.71 
 
 		 322 aa  95.5  2e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.58497  normal  0.0291883 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0308  aminodeoxychorismate lyase  29.03 
 
 		 440 aa  95.5  2e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3021  aminodeoxychorismate lyase  29.17 
 
 		 358 aa  94.7  3e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.157507  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0694  aminodeoxychorismate lyase  30.45 
 
 		 327 aa  94.4  4e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000296609 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3559  aminodeoxychorismate lyase  26.72 
 
 		 341 aa  94.4  4e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000155777  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1716  aminodeoxychorismate lyase  29.48 
 
 		 333 aa  94.4  4e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.998027  normal  0.24374 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1877  aminodeoxychorismate lyase  31.31 
 
 		 328 aa  94.4  5e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.10744 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1776  aminodeoxychorismate lyase  28.16 
 
 		 355 aa  94.4  5e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.81136  normal  0.183273 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2950  aminodeoxychorismate lyase  28.7 
 
 		 353 aa  94  6e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1497  aminodeoxychorismate lyase  27.72 
 
 		 351 aa  93.2  9e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07820  conserved hypothetical protein TIGR00247  27.97 
 
 		 389 aa  92.8  1e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0223518 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0531  aminodeoxychorismate lyase  29.97 
 
 		 464 aa  92.8  1e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.40268 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0574  aminodeoxychorismate lyase  29.75 
 
 		 403 aa  92.8  1e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2783  aminodeoxychorismate lyase  28.69 
 
 		 456 aa  92.8  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3036  aminodeoxychorismate lyase  28.53 
 
 		 623 aa  92.8  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0256494  normal  0.08592 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0732  hypothetical protein TIGR00247  27.61 
 
 		 356 aa  92.4  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000024462  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1417  aminodeoxychorismate lyase  33.65 
 
 		 338 aa  92.4  2e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.626218  normal  0.75601 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3821  hypothetical protein  30.07 
 
 		 406 aa  91.3  3e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.133528 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2553  aminodeoxychorismate lyase  27.97 
 
 		 385 aa  91.7  3e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>