More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_5263 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_5263  aminodeoxychorismate lyase  100 
 
 		 409 aa  840    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15290  predicted periplasmic solute-binding protein  48.26 
 
 		 493 aa  360  2e-98  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.444068  normal  0.602564 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2389  aminodeoxychorismate lyase  40.22 
 
 		 415 aa  290  5.0000000000000004e-77  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0575785 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2348  aminodeoxychorismate lyase  40.22 
 
 		 415 aa  290  5.0000000000000004e-77  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.776778  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2395  aminodeoxychorismate lyase  40.22 
 
 		 415 aa  290  5.0000000000000004e-77  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.178925 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2642  aminodeoxychorismate lyase  40.29 
 
 		 415 aa  281  2e-74  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3761  aminodeoxychorismate lyase  39.43 
 
 		 415 aa  277  2e-73  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.37487 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3295  aminodeoxychorismate lyase  39.32 
 
 		 434 aa  266  5.999999999999999e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000545955  normal  0.0867897 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12574  hypothetical protein  37.71 
 
 		 417 aa  263  4.999999999999999e-69  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00172093  normal  0.0835034 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4536  aminodeoxychorismate lyase  39.58 
 
 		 371 aa  226  6e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2322  aminodeoxychorismate lyase  36.64 
 
 		 587 aa  221  9.999999999999999e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.284127  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3156  aminodeoxychorismate lyase  35.53 
 
 		 536 aa  189  1e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.489263  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1830  aminodeoxychorismate lyase  34.7 
 
 		 401 aa  188  2e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.194696  normal  0.869905 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2045  aminodeoxychorismate lyase  34.42 
 
 		 342 aa  179  7e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0393494  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1821  aminodeoxychorismate lyase  33.61 
 
 		 401 aa  179  8e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000914518 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1328  aminodeoxychorismate lyase  33.99 
 
 		 372 aa  177  3e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0484668  normal  0.302335 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1977  aminodeoxychorismate lyase  31.54 
 
 		 418 aa  175  1.9999999999999998e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.337407  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1820  aminodeoxychorismate lyase  34.09 
 
 		 401 aa  164  3e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.111847  normal  0.624649 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2044  aminodeoxychorismate lyase  32.43 
 
 		 385 aa  160  4e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0389257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1349  aminodeoxychorismate lyase  29.9 
 
 		 397 aa  157  3e-37  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2137  aminodeoxychorismate lyase  33.03 
 
 		 456 aa  156  5.0000000000000005e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000886776  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3876  aminodeoxychorismate lyase  31.69 
 
 		 395 aa  155  1e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6091  aminodeoxychorismate lyase  33.52 
 
 		 387 aa  149  1.0000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.384921  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2068  putative integral membrane protein  30.63 
 
 		 685 aa  145  1e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0278273  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16340  predicted periplasmic solute-binding protein  31.09 
 
 		 390 aa  145  1e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12530  predicted periplasmic solute-binding protein  29.48 
 
 		 368 aa  144  2e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00811784  normal  0.477009 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3073  aminodeoxychorismate lyase  31.75 
 
 		 456 aa  144  4e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.658866  normal  0.521991 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2016  aminodeoxychorismate lyase  31.42 
 
 		 407 aa  141  1.9999999999999998e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.658321  normal  0.0585657 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3030  aminodeoxychorismate lyase  33.64 
 
 		 368 aa  140  3.9999999999999997e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0614  aminodeoxychorismate lyase  30.36 
 
 		 393 aa  140  4.999999999999999e-32  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.415027  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0900  aminodeoxychorismate lyase  28.79 
 
 		 338 aa  138  2e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2409  aminodeoxychorismate lyase  29.23 
 
 		 397 aa  137  2e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.105419  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1691  aminodeoxychorismate lyase  33.43 
 
 		 376 aa  137  5e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.527988  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3021  aminodeoxychorismate lyase  29.66 
 
 		 358 aa  134  3.9999999999999996e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.157507  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17720  predicted periplasmic solute-binding protein  31.05 
 
 		 395 aa  133  6e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.412389  normal  0.31092 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2013  aminodeoxychorismate lyase  29.54 
 
 		 588 aa  132  9e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000282457 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12700  predicted periplasmic solute-binding protein  30.93 
 
 		 422 aa  130  3e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3212  aminodeoxychorismate lyase  30.79 
 
 		 413 aa  130  6e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0548102  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1696  aminodeoxychorismate lyase  29.41 
 
 		 468 aa  127  4.0000000000000003e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.255824  normal  0.195294 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0377  conserved hypothetical protein, YceG family  29.49 
 
 		 396 aa  125  1e-27  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1497  aminodeoxychorismate lyase  29.85 
 
 		 351 aa  125  1e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2276  aminodeoxychorismate lyase  28.65 
 
 		 485 aa  125  2e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.204886  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1692  aminodeoxychorismate lyase  33.54 
 
 		 382 aa  123  7e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0682  aminodeoxychorismate lyase  28.74 
 
 		 333 aa  122  9e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0424367  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0694  aminodeoxychorismate lyase  29 
 
 		 327 aa  122  1.9999999999999998e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000296609 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1435  aminodeoxychorismate lyase  27.51 
 
 		 344 aa  120  6e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3618  aminodeoxychorismate lyase  27.71 
 
 		 362 aa  119  7e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000276729  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2262  aminodeoxychorismate lyase  26.52 
 
 		 344 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.945495  hitchhiker  0.000317634 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4231  aminodeoxychorismate lyase  29.27 
 
 		 356 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000711244  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4517  conserved hypothetical protein TIGR00247  29.13 
 
 		 356 aa  117  3e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000911066  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4128  aminodeoxychorismate lyase  29.38 
 
 		 356 aa  117  3e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000574197  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0953  aminodeoxychorismate lyase  34.66 
 
 		 335 aa  117  3e-25  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.316253  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4504  conserved hypothetical protein TIGR00247  29.02 
 
 		 356 aa  117  3e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1361  aminodeoxychorismate lyase  26.4 
 
 		 370 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0615754  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0732  hypothetical protein TIGR00247  29.02 
 
 		 356 aa  117  5e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000024462  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0288  aminodeoxychorismate lyase  26.67 
 
 		 658 aa  116  7.999999999999999e-25  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4464  conserved hypothetical protein TIGR00247  29.13 
 
 		 356 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000911703 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4280  hypothetical protein  29.13 
 
 		 356 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000498286  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4117  aminodeoxychorismate lyase  29.13 
 
 		 356 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000093714  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4612  hypothetical protein  29.13 
 
 		 351 aa  114  3e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000312577  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2486  aminodeoxychorismate lyase  27.03 
 
 		 364 aa  114  3e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00502838  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3097  aminodeoxychorismate lyase  26.89 
 
 		 355 aa  113  8.000000000000001e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00109006  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0845  periplasmic solute-binding protein-like protein  35.85 
 
 		 320 aa  112  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0918  aminodeoxychorismate lyase  26.17 
 
 		 345 aa  110  3e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.174013  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5194  aminodeoxychorismate lyase  41.01 
 
 		 339 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.374187 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1578  hypothetical protein  29.82 
 
 		 343 aa  109  8.000000000000001e-23  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00227984  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05820  aminodeoxychorismate lyase  27.5 
 
 		 337 aa  109  9.000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0160306  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1917  aminodeoxychorismate lyase  41.57 
 
 		 339 aa  108  2e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.136892 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05120  conserved hypothetical protein TIGR00247  29.85 
 
 		 403 aa  108  2e-22  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.924204  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6185  aminodeoxychorismate lyase  41.57 
 
 		 339 aa  108  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1894  aminodeoxychorismate lyase  41.57 
 
 		 339 aa  108  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.474153  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0607  hypothetical protein  29.79 
 
 		 370 aa  108  2e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000669467  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1380  aminodeoxychorismate lyase  41.01 
 
 		 339 aa  107  3e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2504  aminodeoxychorismate lyase  34.01 
 
 		 337 aa  107  4e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.917927  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1093  aminodeoxychorismate lyase  35.96 
 
 		 332 aa  107  4e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.72202  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07820  conserved hypothetical protein TIGR00247  26.67 
 
 		 389 aa  107  5e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0223518 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0966  aminodeoxychorismate lyase  28.97 
 
 		 363 aa  106  7e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0967  aminodeoxychorismate lyase  29.32 
 
 		 357 aa  106  9e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.829028  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1637  aminodeoxychorismate lyase  26.1 
 
 		 352 aa  105  1e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.521882 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0030  aminodeoxychorismate lyase  28.96 
 
 		 349 aa  105  2e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.647846  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2282  putative lipoprotein  47.66 
 
 		 339 aa  104  2e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1426  putative lipoprotein  47.66 
 
 		 339 aa  104  2e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.425496  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2321  putative lipoprotein  47.66 
 
 		 339 aa  104  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2444  hypothetical protein  47.66 
 
 		 339 aa  104  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.700087  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1190  putative lipoprotein  47.66 
 
 		 339 aa  104  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3387  putative lipoprotein  47.66 
 
 		 339 aa  104  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1803  aminodeoxychorismate lyase  39.89 
 
 		 339 aa  104  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0606768  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1917  hypothetical protein  47.66 
 
 		 339 aa  104  2e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1831  aminodeoxychorismate lyase  30.37 
 
 		 339 aa  105  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0871  aminodeoxychorismate lyase  26.15 
 
 		 339 aa  104  3e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0473  periplasmic solute-binding protein  33 
 
 		 345 aa  104  3e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0206414  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2264  hypothetical protein  37.5 
 
 		 345 aa  103  7e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.188751  normal  0.305668 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1072  aminodeoxychorismate lyase  28.8 
 
 		 392 aa  102  9e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.232656  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2153  hypothetical protein  46.09 
 
 		 339 aa  102  1e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.692536  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2459  aminodeoxychorismate lyase  32.02 
 
 		 344 aa  101  2e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.5911  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17710  predicted periplasmic solute-binding protein  28.57 
 
 		 388 aa  102  2e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0437467  normal  0.304384 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2023  aminodeoxychorismate lyase  28.83 
 
 		 363 aa  102  2e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.309788  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0625  aminodeoxychorismate lyase  27.22 
 
 		 357 aa  101  3e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0512441  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2614  hypothetical protein  27.12 
 
 		 336 aa  101  3e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0882  aminodeoxychorismate lyase  26.54 
 
 		 357 aa  100  4e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.871937 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>