More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_0845 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_0845  periplasmic solute-binding protein-like protein  100 
 
 		 320 aa  640    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6091  aminodeoxychorismate lyase  58.3 
 
 		 387 aa  280  2e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.384921  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2044  aminodeoxychorismate lyase  60.53 
 
 		 385 aa  280  3e-74  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0389257  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2045  aminodeoxychorismate lyase  51.33 
 
 		 342 aa  212  4.9999999999999996e-54  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0393494  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2068  putative integral membrane protein  48.07 
 
 		 685 aa  206  5e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0278273  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2137  aminodeoxychorismate lyase  42.8 
 
 		 456 aa  195  1e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000886776  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3156  aminodeoxychorismate lyase  46.32 
 
 		 536 aa  172  6.999999999999999e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.489263  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2409  aminodeoxychorismate lyase  42.24 
 
 		 397 aa  168  1e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.105419  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1696  aminodeoxychorismate lyase  39.91 
 
 		 468 aa  159  4e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.255824  normal  0.195294 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1328  aminodeoxychorismate lyase  40.64 
 
 		 372 aa  156  4e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0484668  normal  0.302335 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3021  aminodeoxychorismate lyase  36.96 
 
 		 358 aa  139  4.999999999999999e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.157507  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1820  aminodeoxychorismate lyase  36.96 
 
 		 401 aa  139  6e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.111847  normal  0.624649 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3073  aminodeoxychorismate lyase  37.55 
 
 		 456 aa  139  6e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.658866  normal  0.521991 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3876  aminodeoxychorismate lyase  34.55 
 
 		 395 aa  137  3.0000000000000003e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3212  aminodeoxychorismate lyase  37.07 
 
 		 413 aa  135  9.999999999999999e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0548102  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05820  aminodeoxychorismate lyase  35.25 
 
 		 337 aa  132  6e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0160306  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16340  predicted periplasmic solute-binding protein  34.6 
 
 		 390 aa  132  7.999999999999999e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1830  aminodeoxychorismate lyase  39.34 
 
 		 401 aa  132  1.0000000000000001e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.194696  normal  0.869905 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0953  aminodeoxychorismate lyase  38.66 
 
 		 335 aa  130  2.0000000000000002e-29  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.316253  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3030  aminodeoxychorismate lyase  41.41 
 
 		 368 aa  131  2.0000000000000002e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2016  aminodeoxychorismate lyase  37.02 
 
 		 407 aa  130  3e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.658321  normal  0.0585657 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1821  aminodeoxychorismate lyase  37.22 
 
 		 401 aa  129  5.0000000000000004e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000914518 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3295  aminodeoxychorismate lyase  40.64 
 
 		 434 aa  127  3e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000545955  normal  0.0867897 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0377  conserved hypothetical protein, YceG family  36.8 
 
 		 396 aa  127  3e-28  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12574  hypothetical protein  39.66 
 
 		 417 aa  126  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00172093  normal  0.0835034 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0966  aminodeoxychorismate lyase  35.25 
 
 		 363 aa  126  5e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2389  aminodeoxychorismate lyase  37.04 
 
 		 415 aa  124  2e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0575785 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2348  aminodeoxychorismate lyase  37.04 
 
 		 415 aa  124  2e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.776778  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2395  aminodeoxychorismate lyase  37.04 
 
 		 415 aa  124  2e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.178925 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3618  aminodeoxychorismate lyase  34.82 
 
 		 362 aa  123  3e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000276729  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2276  aminodeoxychorismate lyase  35.6 
 
 		 485 aa  124  3e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.204886  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0650  periplasmic solute-binding protein, aminodeoxychorismate lyase-like  35.19 
 
 		 356 aa  122  6e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.368295  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3761  aminodeoxychorismate lyase  38 
 
 		 415 aa  122  7e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.37487 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1977  aminodeoxychorismate lyase  35.95 
 
 		 418 aa  121  1.9999999999999998e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.337407  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1691  aminodeoxychorismate lyase  35.71 
 
 		 376 aa  121  1.9999999999999998e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.527988  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0614  aminodeoxychorismate lyase  35.56 
 
 		 393 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.415027  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2459  aminodeoxychorismate lyase  35.37 
 
 		 344 aa  120  3e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.5911  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1692  aminodeoxychorismate lyase  37.28 
 
 		 382 aa  119  7e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2642  aminodeoxychorismate lyase  35.75 
 
 		 415 aa  119  9.999999999999999e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0900  aminodeoxychorismate lyase  32.24 
 
 		 338 aa  117  3e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2013  aminodeoxychorismate lyase  34.68 
 
 		 588 aa  116  3.9999999999999997e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000282457 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2486  aminodeoxychorismate lyase  31.44 
 
 		 364 aa  116  5e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00502838  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12530  predicted periplasmic solute-binding protein  35.68 
 
 		 368 aa  116  6e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00811784  normal  0.477009 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05120  conserved hypothetical protein TIGR00247  35.42 
 
 		 403 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.924204  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0625  aminodeoxychorismate lyase  34.65 
 
 		 357 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0512441  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0694  aminodeoxychorismate lyase  36.08 
 
 		 327 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000296609 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1349  aminodeoxychorismate lyase  35.75 
 
 		 397 aa  114  3e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5263  aminodeoxychorismate lyase  35.85 
 
 		 409 aa  114  3e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0204  aminodeoxychorismate lyase  35.29 
 
 		 314 aa  112  8.000000000000001e-24  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1497  aminodeoxychorismate lyase  40.13 
 
 		 351 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0484  aminodeoxychorismate lyase  35.78 
 
 		 335 aa  112  1.0000000000000001e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2275  aminodeoxychorismate lyase  31.97 
 
 		 349 aa  111  2.0000000000000002e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0682  aminodeoxychorismate lyase  35.57 
 
 		 333 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0424367  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0508  hypothetical protein  34.51 
 
 		 340 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2262  aminodeoxychorismate lyase  31.06 
 
 		 344 aa  108  1e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.945495  hitchhiker  0.000317634 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1435  aminodeoxychorismate lyase  33.05 
 
 		 344 aa  108  1e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2514  aminodeoxychorismate lyase  36.87 
 
 		 337 aa  108  1e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.636222  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1743  hypothetical protein  31.98 
 
 		 333 aa  108  1e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12700  predicted periplasmic solute-binding protein  35.5 
 
 		 422 aa  108  1e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2122  aminodeoxychorismate lyase  38.38 
 
 		 340 aa  107  2e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2322  aminodeoxychorismate lyase  29.77 
 
 		 587 aa  107  2e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.284127  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1361  aminodeoxychorismate lyase  32.74 
 
 		 370 aa  107  2e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0615754  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15290  predicted periplasmic solute-binding protein  35.98 
 
 		 493 aa  107  3e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.444068  normal  0.602564 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2026  hypothetical protein  32.6 
 
 		 333 aa  106  4e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4657  aminodeoxychorismate lyase  31.95 
 
 		 362 aa  106  5e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.333524  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1410  aminodeoxychorismate lyase  30 
 
 		 347 aa  106  5e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2733  aminodeoxychorismate lyase  33.48 
 
 		 337 aa  106  5e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.269056  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17710  predicted periplasmic solute-binding protein  33.94 
 
 		 388 aa  106  5e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0437467  normal  0.304384 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1776  aminodeoxychorismate lyase  32.39 
 
 		 355 aa  106  7e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.81136  normal  0.183273 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2905  aminodeoxychorismate lyase  36.28 
 
 		 337 aa  105  1e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2534  aminodeoxychorismate lyase  36.36 
 
 		 339 aa  103  3e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.714245  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1090  aminodeoxychorismate lyase  33.06 
 
 		 331 aa  102  9e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0557  aminodeoxychorismate lyase  34.2 
 
 		 326 aa  101  1e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.245938  normal  0.0550645 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0225  aminodeoxychorismate lyase  36.13 
 
 		 322 aa  100  2e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.58497  normal  0.0291883 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0918  aminodeoxychorismate lyase  31.98 
 
 		 345 aa  100  3e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.174013  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0459  aminodeoxychorismate lyase  33.47 
 
 		 451 aa  100  3e-20  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1783  hypothetical protein  37.97 
 
 		 377 aa  98.6  1e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0308564  normal  0.608544 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0473  periplasmic solute-binding protein  29.73 
 
 		 345 aa  99  1e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0206414  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1089  hypothetical protein  34.25 
 
 		 314 aa  97.8  2e-19  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.021227  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3097  aminodeoxychorismate lyase  29.34 
 
 		 355 aa  97.8  2e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00109006  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0732  hypothetical protein TIGR00247  29.17 
 
 		 356 aa  97.4  3e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000024462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1563  aminodeoxychorismate lyase  35.25 
 
 		 369 aa  97.4  3e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3279  aminodeoxychorismate lyase  31.3 
 
 		 376 aa  97.4  3e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.258116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4467  aminodeoxychorismate lyase  33.61 
 
 		 357 aa  97.1  4e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000156063  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1467  aminodeoxychorismate lyase  37.7 
 
 		 332 aa  95.9  7e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0630531  normal  0.0141986 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0842  aminodeoxychorismate lyase  33.83 
 
 		 327 aa  95.9  8e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0834555 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2465  hypothetical protein  34.76 
 
 		 393 aa  95.1  1e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.347128  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1127  aminodeoxychorismate lyase  34.76 
 
 		 392 aa  95.1  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.66542 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1390  aminodeoxychorismate lyase  29.52 
 
 		 364 aa  95.5  1e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000172807  hitchhiker  3.2530600000000004e-23 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4504  conserved hypothetical protein TIGR00247  28.75 
 
 		 356 aa  95.5  1e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3414  aminodeoxychorismate lyase  35.22 
 
 		 369 aa  94.7  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0388714  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4517  conserved hypothetical protein TIGR00247  29.17 
 
 		 356 aa  94.4  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000911066  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07820  conserved hypothetical protein TIGR00247  30.42 
 
 		 389 aa  94.4  3e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0223518 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2254  aminodeoxychorismate lyase  38.25 
 
 		 323 aa  94  3e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1426  aminodeoxychorismate lyase  37.16 
 
 		 332 aa  94  3e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.219736  normal  0.242343 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4466  hypothetical protein  29.17 
 
 		 259 aa  93.6  4e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000131965  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4117  aminodeoxychorismate lyase  29.01 
 
 		 356 aa  93.6  4e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000093714  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1472  aminodeoxychorismate lyase  30.64 
 
 		 424 aa  93.6  4e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.120948  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1637  aminodeoxychorismate lyase  32.75 
 
 		 352 aa  93.6  4e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.521882 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2553  aminodeoxychorismate lyase  32.8 
 
 		 385 aa  93.6  4e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>