More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_17710 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_17710  predicted periplasmic solute-binding protein  100 
 
 		 388 aa  768    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0437467  normal  0.304384 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1349  aminodeoxychorismate lyase  38.17 
 
 		 397 aa  244  3e-63  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17720  predicted periplasmic solute-binding protein  43.73 
 
 		 395 aa  243  3.9999999999999997e-63  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.412389  normal  0.31092 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2016  aminodeoxychorismate lyase  38.63 
 
 		 407 aa  213  5.999999999999999e-54  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.658321  normal  0.0585657 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1820  aminodeoxychorismate lyase  41.29 
 
 		 401 aa  209  5e-53  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.111847  normal  0.624649 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3156  aminodeoxychorismate lyase  43.38 
 
 		 536 aa  209  7e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.489263  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1692  aminodeoxychorismate lyase  37.54 
 
 		 382 aa  185  1.0000000000000001e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1691  aminodeoxychorismate lyase  37.34 
 
 		 376 aa  183  5.0000000000000004e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.527988  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16340  predicted periplasmic solute-binding protein  36.74 
 
 		 390 aa  179  4.999999999999999e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2045  aminodeoxychorismate lyase  35.78 
 
 		 342 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0393494  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12530  predicted periplasmic solute-binding protein  33.72 
 
 		 368 aa  159  1e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00811784  normal  0.477009 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2409  aminodeoxychorismate lyase  33.61 
 
 		 397 aa  155  1e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.105419  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3030  aminodeoxychorismate lyase  40.4 
 
 		 368 aa  155  2e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0614  aminodeoxychorismate lyase  30.84 
 
 		 393 aa  149  8e-35  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.415027  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0377  conserved hypothetical protein, YceG family  32.6 
 
 		 396 aa  149  1.0000000000000001e-34  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2044  aminodeoxychorismate lyase  33.44 
 
 		 385 aa  144  2e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0389257  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2013  aminodeoxychorismate lyase  33.96 
 
 		 588 aa  143  5e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000282457 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1328  aminodeoxychorismate lyase  34.64 
 
 		 372 aa  142  9.999999999999999e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0484668  normal  0.302335 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3073  aminodeoxychorismate lyase  32.8 
 
 		 456 aa  141  1.9999999999999998e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.658866  normal  0.521991 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2137  aminodeoxychorismate lyase  33.33 
 
 		 456 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000886776  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2068  putative integral membrane protein  29.16 
 
 		 685 aa  136  8e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0278273  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12700  predicted periplasmic solute-binding protein  34.51 
 
 		 422 aa  135  9.999999999999999e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2276  aminodeoxychorismate lyase  30.23 
 
 		 485 aa  133  5e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.204886  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6091  aminodeoxychorismate lyase  33.66 
 
 		 387 aa  132  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.384921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2389  aminodeoxychorismate lyase  31.55 
 
 		 415 aa  121  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0575785 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2348  aminodeoxychorismate lyase  31.55 
 
 		 415 aa  121  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.776778  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2395  aminodeoxychorismate lyase  31.55 
 
 		 415 aa  121  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.178925 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12574  hypothetical protein  28.5 
 
 		 417 aa  117  5e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00172093  normal  0.0835034 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2642  aminodeoxychorismate lyase  33.23 
 
 		 415 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5263  aminodeoxychorismate lyase  27.72 
 
 		 409 aa  115  2.0000000000000002e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3295  aminodeoxychorismate lyase  30.95 
 
 		 434 aa  114  3e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000545955  normal  0.0867897 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3212  aminodeoxychorismate lyase  34.18 
 
 		 413 aa  114  4.0000000000000004e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0548102  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1696  aminodeoxychorismate lyase  36.05 
 
 		 468 aa  114  4.0000000000000004e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.255824  normal  0.195294 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1361  aminodeoxychorismate lyase  32.26 
 
 		 370 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0615754  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3876  aminodeoxychorismate lyase  29.72 
 
 		 395 aa  111  3e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1977  aminodeoxychorismate lyase  28.47 
 
 		 418 aa  108  1e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.337407  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1613  hypothetical protein  29.27 
 
 		 600 aa  107  4e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3761  aminodeoxychorismate lyase  31.27 
 
 		 415 aa  106  9e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.37487 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2030  hypothetical protein  28.31 
 
 		 340 aa  105  9e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000821549  hitchhiker  0.00000424543 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01093  predicted aminodeoxychorismate lyase  28.4 
 
 		 340 aa  105  1e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000123905  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2550  aminodeoxychorismate lyase  28.4 
 
 		 340 aa  105  1e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000202204  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2504  hypothetical protein  28.4 
 
 		 340 aa  105  1e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000670285  unclonable  0.0000000117832 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2227  hypothetical protein  28.4 
 
 		 340 aa  105  1e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000358206  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1219  hypothetical protein  28.4 
 
 		 340 aa  105  1e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000544785  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0966  aminodeoxychorismate lyase  28.11 
 
 		 363 aa  105  1e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0845  periplasmic solute-binding protein-like protein  33.94 
 
 		 320 aa  105  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1218  hypothetical protein  28.4 
 
 		 340 aa  105  1e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000109839  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01101  hypothetical protein  28.4 
 
 		 340 aa  105  1e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000104993  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1543  hypothetical protein  27.54 
 
 		 340 aa  105  2e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1410  aminodeoxychorismate lyase  27.91 
 
 		 347 aa  104  3e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1476  hypothetical protein  28.02 
 
 		 340 aa  104  3e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000304616  hitchhiker  0.00000000000128745 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2026  hypothetical protein  32.55 
 
 		 333 aa  103  4e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1578  hypothetical protein  27.04 
 
 		 343 aa  103  4e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00227984  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2055  aminodeoxychorismate lyase  31.16 
 
 		 407 aa  103  5e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1743  hypothetical protein  30.8 
 
 		 333 aa  103  7e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0288  aminodeoxychorismate lyase  26.73 
 
 		 658 aa  102  8e-21  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0607  hypothetical protein  26.74 
 
 		 370 aa  102  1e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000669467  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1488  hypothetical protein  27.46 
 
 		 346 aa  102  1e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0806646  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1587  aminodeoxychorismate lyase  30.04 
 
 		 332 aa  100  3e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.076405 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1129  aminodeoxychorismate lyase  28.41 
 
 		 336 aa  100  6e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.399769 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1830  aminodeoxychorismate lyase  29.23 
 
 		 401 aa  98.2  2e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.194696  normal  0.869905 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2198  hypothetical protein  27.36 
 
 		 349 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.850653  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1877  aminodeoxychorismate lyase  29.37 
 
 		 328 aa  97.8  2e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.10744 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15290  predicted periplasmic solute-binding protein  27.66 
 
 		 493 aa  97.8  3e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.444068  normal  0.602564 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4517  conserved hypothetical protein TIGR00247  27.25 
 
 		 356 aa  97.4  4e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000911066  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0125  aminodeoxychorismate lyase  30.3 
 
 		 393 aa  97.4  4e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000881139  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1612  hypothetical protein  28.68 
 
 		 340 aa  97.1  5e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000845082  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1830  aminodeoxychorismate lyase  32.91 
 
 		 342 aa  96.7  6e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0900  aminodeoxychorismate lyase  29.69 
 
 		 338 aa  96.3  8e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0625  aminodeoxychorismate lyase  30 
 
 		 357 aa  95.9  1e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0512441  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1313  hypothetical protein  26.87 
 
 		 340 aa  95.1  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000010184 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1987  hypothetical protein  26.87 
 
 		 340 aa  95.1  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000318105  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1298  hypothetical protein  26.87 
 
 		 340 aa  95.1  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.166048  hitchhiker  0.00000000000000101215 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2170  hypothetical protein  26.87 
 
 		 340 aa  95.1  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.7368  hitchhiker  0.0000000000000363112 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1821  aminodeoxychorismate lyase  30.12 
 
 		 401 aa  95.1  2e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000914518 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1275  hypothetical protein  26.87 
 
 		 340 aa  95.1  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.310439  normal  0.846206 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2486  aminodeoxychorismate lyase  28.67 
 
 		 364 aa  94  4e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00502838  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2322  aminodeoxychorismate lyase  29.84 
 
 		 587 aa  94  4e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.284127  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1578  aminodeoxychorismate lyase  27.06 
 
 		 335 aa  94  4e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.853067  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4504  conserved hypothetical protein TIGR00247  27.22 
 
 		 356 aa  94  4e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25730  hypothetical protein  26.38 
 
 		 349 aa  94  4e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0867332  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1632  aminodeoxychorismate lyase  26.44 
 
 		 351 aa  93.6  5e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2459  aminodeoxychorismate lyase  31.29 
 
 		 344 aa  94  5e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.5911  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4231  aminodeoxychorismate lyase  27.51 
 
 		 356 aa  93.6  5e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000711244  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4536  aminodeoxychorismate lyase  32.42 
 
 		 371 aa  92.4  1e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0144  hypothetical protein  30.9 
 
 		 427 aa  92.4  1e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00352023 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4144  aminodeoxychorismate lyase  30.7 
 
 		 409 aa  92.4  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0208419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1716  aminodeoxychorismate lyase  27.96 
 
 		 333 aa  92.8  1e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.998027  normal  0.24374 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0953  aminodeoxychorismate lyase  31.39 
 
 		 335 aa  92  1e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.316253  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2023  aminodeoxychorismate lyase  31.54 
 
 		 363 aa  92.4  1e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.309788  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0732  hypothetical protein TIGR00247  26.93 
 
 		 356 aa  92  1e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000024462  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05820  aminodeoxychorismate lyase  26.54 
 
 		 337 aa  92.4  1e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0160306  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0225  aminodeoxychorismate lyase  31.99 
 
 		 322 aa  92  2e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.58497  normal  0.0291883 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4280  hypothetical protein  26.43 
 
 		 356 aa  91.7  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000498286  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4128  aminodeoxychorismate lyase  26.43 
 
 		 356 aa  91.7  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000574197  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4464  conserved hypothetical protein TIGR00247  26.43 
 
 		 356 aa  91.7  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000911703 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2499  aminodeoxychorismate lyase  27.64 
 
 		 339 aa  92  2e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00196213  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4612  hypothetical protein  27.07 
 
 		 351 aa  91.7  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000312577  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1529  aminodeoxychorismate lyase  29.82 
 
 		 387 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.538963 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0473  periplasmic solute-binding protein  27.47 
 
 		 345 aa  92  2e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0206414  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>