More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4144 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_4144  aminodeoxychorismate lyase  100 
 
 		 409 aa  844    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0208419  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2380  aminodeoxychorismate lyase  83.18 
 
 		 691 aa  559  1e-158  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2055  aminodeoxychorismate lyase  45.68 
 
 		 407 aa  275  1.0000000000000001e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1328  aminodeoxychorismate lyase  35.53 
 
 		 372 aa  119  9e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0484668  normal  0.302335 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2045  aminodeoxychorismate lyase  31.56 
 
 		 342 aa  116  7.999999999999999e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0393494  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1692  aminodeoxychorismate lyase  32.61 
 
 		 382 aa  115  2.0000000000000002e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2137  aminodeoxychorismate lyase  30.48 
 
 		 456 aa  114  3e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000886776  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2044  aminodeoxychorismate lyase  30.25 
 
 		 385 aa  112  9e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0389257  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3212  aminodeoxychorismate lyase  32.53 
 
 		 413 aa  110  5e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0548102  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1696  aminodeoxychorismate lyase  31.21 
 
 		 468 aa  110  6e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.255824  normal  0.195294 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0614  aminodeoxychorismate lyase  30.84 
 
 		 393 aa  106  8e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.415027  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1691  aminodeoxychorismate lyase  30.28 
 
 		 376 aa  104  3e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.527988  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1830  aminodeoxychorismate lyase  29.67 
 
 		 401 aa  103  4e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.194696  normal  0.869905 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2016  aminodeoxychorismate lyase  31.43 
 
 		 407 aa  103  4e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.658321  normal  0.0585657 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3156  aminodeoxychorismate lyase  31.66 
 
 		 536 aa  102  9e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.489263  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2068  putative integral membrane protein  27.82 
 
 		 685 aa  101  3e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0278273  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1821  aminodeoxychorismate lyase  28.83 
 
 		 401 aa  99.8  9e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000914518 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4128  aminodeoxychorismate lyase  25.07 
 
 		 356 aa  99.4  1e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000574197  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0607  hypothetical protein  28.33 
 
 		 370 aa  98.6  2e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000669467  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1578  hypothetical protein  28.33 
 
 		 343 aa  97.8  3e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00227984  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4517  conserved hypothetical protein TIGR00247  24.21 
 
 		 356 aa  97.8  3e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000911066  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1820  aminodeoxychorismate lyase  30.52 
 
 		 401 aa  97.8  3e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.111847  normal  0.624649 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4612  hypothetical protein  24.87 
 
 		 351 aa  97.1  5e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000312577  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2409  aminodeoxychorismate lyase  28.75 
 
 		 397 aa  97.1  5e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.105419  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4231  aminodeoxychorismate lyase  24.67 
 
 		 356 aa  96.7  7e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000711244  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4117  aminodeoxychorismate lyase  25.4 
 
 		 356 aa  96.3  8e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000093714  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4464  conserved hypothetical protein TIGR00247  24.54 
 
 		 356 aa  95.5  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000911703 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4280  hypothetical protein  24.54 
 
 		 356 aa  95.1  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000498286  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0377  conserved hypothetical protein, YceG family  29.14 
 
 		 396 aa  95.1  2e-18  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4504  conserved hypothetical protein TIGR00247  23.47 
 
 		 356 aa  94  4e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2348  aminodeoxychorismate lyase  28.4 
 
 		 415 aa  94  4e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.776778  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2389  aminodeoxychorismate lyase  28.4 
 
 		 415 aa  94  4e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0575785 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2395  aminodeoxychorismate lyase  28.4 
 
 		 415 aa  94  4e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.178925 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2642  aminodeoxychorismate lyase  27.65 
 
 		 415 aa  93.2  7e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0732  hypothetical protein TIGR00247  23.2 
 
 		 356 aa  93.2  8e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000024462  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1349  aminodeoxychorismate lyase  28.22 
 
 		 397 aa  92.8  1e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12574  hypothetical protein  25.19 
 
 		 417 aa  91.7  2e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00172093  normal  0.0835034 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3761  aminodeoxychorismate lyase  27.14 
 
 		 415 aa  90.1  6e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.37487 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12700  predicted periplasmic solute-binding protein  27.36 
 
 		 422 aa  89.4  1e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3097  aminodeoxychorismate lyase  24.94 
 
 		 355 aa  88.2  2e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00109006  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3876  aminodeoxychorismate lyase  27.63 
 
 		 395 aa  87.4  4e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15290  predicted periplasmic solute-binding protein  27.41 
 
 		 493 aa  87.4  4e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.444068  normal  0.602564 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6091  aminodeoxychorismate lyase  29.71 
 
 		 387 aa  87  6e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.384921  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0459  aminodeoxychorismate lyase  27.99 
 
 		 451 aa  86.3  8e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1997  hypothetical protein  25.31 
 
 		 331 aa  85.9  0.000000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3073  aminodeoxychorismate lyase  26.64 
 
 		 456 aa  85.5  0.000000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.658866  normal  0.521991 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5263  aminodeoxychorismate lyase  29.36 
 
 		 409 aa  85.9  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0288  aminodeoxychorismate lyase  24.57 
 
 		 658 aa  84.7  0.000000000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0966  aminodeoxychorismate lyase  28.75 
 
 		 363 aa  84  0.000000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17720  predicted periplasmic solute-binding protein  30.28 
 
 		 395 aa  84  0.000000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.412389  normal  0.31092 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2486  aminodeoxychorismate lyase  23.57 
 
 		 364 aa  82.4  0.00000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00502838  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2351  aminodeoxychorismate lyase  28.34 
 
 		 620 aa  82.4  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.260551 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2275  aminodeoxychorismate lyase  28.15 
 
 		 349 aa  82  0.00000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1497  aminodeoxychorismate lyase  25.65 
 
 		 351 aa  80.5  0.00000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0682  aminodeoxychorismate lyase  24.91 
 
 		 333 aa  80.1  0.00000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0424367  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3828  hypothetical protein  27.67 
 
 		 379 aa  79.7  0.00000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0420652  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17710  predicted periplasmic solute-binding protein  30.7 
 
 		 388 aa  79  0.0000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0437467  normal  0.304384 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0900  aminodeoxychorismate lyase  24.58 
 
 		 338 aa  79.3  0.0000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1417  aminodeoxychorismate lyase  26.06 
 
 		 338 aa  79.3  0.0000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.626218  normal  0.75601 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12530  predicted periplasmic solute-binding protein  25.08 
 
 		 368 aa  78.6  0.0000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00811784  normal  0.477009 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0030  aminodeoxychorismate lyase  27.88 
 
 		 349 aa  78.2  0.0000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.647846  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2514  aminodeoxychorismate lyase  26.46 
 
 		 337 aa  77.4  0.0000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.636222  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0882  aminodeoxychorismate lyase  24.21 
 
 		 357 aa  77  0.0000000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.871937 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1472  aminodeoxychorismate lyase  24.74 
 
 		 424 aa  77.4  0.0000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.120948  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0308  aminodeoxychorismate lyase  27.39 
 
 		 440 aa  77  0.0000000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1651  hypothetical protein  26.67 
 
 		 371 aa  76.6  0.0000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.245799  normal  0.342253 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14960  hypothetical protein  26.33 
 
 		 358 aa  75.9  0.000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0694  aminodeoxychorismate lyase  25.67 
 
 		 327 aa  75.9  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000296609 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1578  aminodeoxychorismate lyase  25.07 
 
 		 335 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.853067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2268  aminodeoxychorismate lyase  27.45 
 
 		 343 aa  75.1  0.000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.642  normal  0.198206 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1632  aminodeoxychorismate lyase  25.94 
 
 		 351 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0845  periplasmic solute-binding protein-like protein  30.97 
 
 		 320 aa  75.1  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0473  periplasmic solute-binding protein  23.93 
 
 		 345 aa  75.1  0.000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0206414  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0918  aminodeoxychorismate lyase  26.71 
 
 		 345 aa  74.7  0.000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.174013  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3618  aminodeoxychorismate lyase  25.17 
 
 		 362 aa  74.7  0.000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000276729  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2023  aminodeoxychorismate lyase  25.55 
 
 		 363 aa  73.9  0.000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.309788  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4153  aminodeoxychorismate lyase  25.17 
 
 		 393 aa  73.9  0.000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.507493  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1743  hypothetical protein  26.92 
 
 		 333 aa  73.9  0.000000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2026  hypothetical protein  26.02 
 
 		 333 aa  73.6  0.000000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1390  aminodeoxychorismate lyase  23.67 
 
 		 364 aa  73.6  0.000000000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000172807  hitchhiker  3.2530600000000004e-23 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4466  hypothetical protein  26.61 
 
 		 259 aa  73.2  0.000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000131965  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25730  hypothetical protein  26.67 
 
 		 349 aa  73.2  0.000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0867332  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16340  predicted periplasmic solute-binding protein  27.52 
 
 		 390 aa  73.2  0.000000000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2198  hypothetical protein  26.67 
 
 		 349 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.850653  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1919  aminodeoxychorismate lyase  25.16 
 
 		 363 aa  72.8  0.00000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.402452  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2322  aminodeoxychorismate lyase  26.61 
 
 		 587 aa  72.8  0.00000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.284127  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1910  aminodeoxychorismate lyase  32.14 
 
 		 341 aa  72.8  0.00000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000953369  decreased coverage  0.000000738863 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1501  aminodeoxychorismate lyase  24.83 
 
 		 334 aa  71.6  0.00000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00653214  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4376  aminodeoxychorismate lyase  24.85 
 
 		 362 aa  72  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0936456  normal  0.529135 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2504  aminodeoxychorismate lyase  24.92 
 
 		 337 aa  71.6  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.917927  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0315  aminodeoxychorismate lyase  29.68 
 
 		 389 aa  71.2  0.00000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1633  hypothetical protein  27.05 
 
 		 355 aa  71.2  0.00000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.153927  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1618  aminodeoxychorismate lyase  25.96 
 
 		 345 aa  71.2  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.122439  normal  0.126639 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2733  aminodeoxychorismate lyase  28.24 
 
 		 337 aa  71.2  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.269056  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5194  aminodeoxychorismate lyase  25.96 
 
 		 339 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.374187 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1791  aminodeoxychorismate lyase  31.61 
 
 		 339 aa  70.5  0.00000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00439567  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1803  aminodeoxychorismate lyase  24.26 
 
 		 339 aa  69.7  0.00000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0606768  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1831  aminodeoxychorismate lyase  24.26 
 
 		 339 aa  70.1  0.00000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4657  aminodeoxychorismate lyase  22.99 
 
 		 362 aa  69.7  0.00000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.333524  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1380  aminodeoxychorismate lyase  25.64 
 
 		 339 aa  69.7  0.00000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>