More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_2409 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_2409  aminodeoxychorismate lyase  100 
 
 		 397 aa  804    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.105419  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2045  aminodeoxychorismate lyase  43.6 
 
 		 342 aa  273  4.0000000000000004e-72  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0393494  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2044  aminodeoxychorismate lyase  46.06 
 
 		 385 aa  265  1e-69  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0389257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6091  aminodeoxychorismate lyase  45.74 
 
 		 387 aa  259  5.0000000000000005e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.384921  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1328  aminodeoxychorismate lyase  39.78 
 
 		 372 aa  234  2.0000000000000002e-60  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0484668  normal  0.302335 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2137  aminodeoxychorismate lyase  40.48 
 
 		 456 aa  233  4.0000000000000004e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000886776  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2068  putative integral membrane protein  37.47 
 
 		 685 aa  216  4e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0278273  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3156  aminodeoxychorismate lyase  44.06 
 
 		 536 aa  213  4.9999999999999996e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.489263  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1349  aminodeoxychorismate lyase  38.2 
 
 		 397 aa  204  2e-51  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16340  predicted periplasmic solute-binding protein  38.32 
 
 		 390 aa  200  3e-50  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3073  aminodeoxychorismate lyase  39.68 
 
 		 456 aa  197  3e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.658866  normal  0.521991 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2016  aminodeoxychorismate lyase  36.16 
 
 		 407 aa  196  9e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.658321  normal  0.0585657 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12530  predicted periplasmic solute-binding protein  37.2 
 
 		 368 aa  195  9e-49  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00811784  normal  0.477009 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3212  aminodeoxychorismate lyase  37.93 
 
 		 413 aa  193  6e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0548102  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1820  aminodeoxychorismate lyase  38.89 
 
 		 401 aa  189  5e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.111847  normal  0.624649 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1830  aminodeoxychorismate lyase  36.83 
 
 		 401 aa  184  3e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.194696  normal  0.869905 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1821  aminodeoxychorismate lyase  36.9 
 
 		 401 aa  183  4.0000000000000006e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000914518 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12574  hypothetical protein  33.16 
 
 		 417 aa  183  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00172093  normal  0.0835034 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1691  aminodeoxychorismate lyase  37.74 
 
 		 376 aa  179  7e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.527988  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0845  periplasmic solute-binding protein-like protein  42.24 
 
 		 320 aa  179  1e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2348  aminodeoxychorismate lyase  33.16 
 
 		 415 aa  177  2e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.776778  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2389  aminodeoxychorismate lyase  33.16 
 
 		 415 aa  177  2e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0575785 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2395  aminodeoxychorismate lyase  33.16 
 
 		 415 aa  177  2e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.178925 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3030  aminodeoxychorismate lyase  40.76 
 
 		 368 aa  174  1.9999999999999998e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0614  aminodeoxychorismate lyase  36.22 
 
 		 393 aa  175  1.9999999999999998e-42  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.415027  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3761  aminodeoxychorismate lyase  33.33 
 
 		 415 aa  174  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.37487 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12700  predicted periplasmic solute-binding protein  32.27 
 
 		 422 aa  169  5e-41  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2276  aminodeoxychorismate lyase  32.58 
 
 		 485 aa  169  7e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.204886  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1692  aminodeoxychorismate lyase  37.46 
 
 		 382 aa  169  8e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3876  aminodeoxychorismate lyase  35.33 
 
 		 395 aa  168  1e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2013  aminodeoxychorismate lyase  32.67 
 
 		 588 aa  166  1.0000000000000001e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000282457 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2642  aminodeoxychorismate lyase  33.33 
 
 		 415 aa  164  3e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1696  aminodeoxychorismate lyase  36.56 
 
 		 468 aa  157  4e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.255824  normal  0.195294 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0377  conserved hypothetical protein, YceG family  32.03 
 
 		 396 aa  156  5.0000000000000005e-37  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3295  aminodeoxychorismate lyase  32.09 
 
 		 434 aa  155  2e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000545955  normal  0.0867897 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17720  predicted periplasmic solute-binding protein  34.72 
 
 		 395 aa  154  2.9999999999999998e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.412389  normal  0.31092 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5263  aminodeoxychorismate lyase  28.04 
 
 		 409 aa  147  3e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15290  predicted periplasmic solute-binding protein  31.77 
 
 		 493 aa  146  6e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.444068  normal  0.602564 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1977  aminodeoxychorismate lyase  31.2 
 
 		 418 aa  145  1e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.337407  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17710  predicted periplasmic solute-binding protein  34.97 
 
 		 388 aa  138  2e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0437467  normal  0.304384 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3559  aminodeoxychorismate lyase  28.17 
 
 		 341 aa  134  3e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000155777  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0417  aminodeoxychorismate lyase  34.1 
 
 		 331 aa  132  9e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0918  aminodeoxychorismate lyase  32.23 
 
 		 345 aa  131  2.0000000000000002e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.174013  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05820  aminodeoxychorismate lyase  32.12 
 
 		 337 aa  129  7.000000000000001e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0160306  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2026  hypothetical protein  30.08 
 
 		 333 aa  125  1e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0900  aminodeoxychorismate lyase  29.9 
 
 		 338 aa  124  4e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2275  aminodeoxychorismate lyase  29.58 
 
 		 349 aa  123  5e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0966  aminodeoxychorismate lyase  31.55 
 
 		 363 aa  122  8e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0288  aminodeoxychorismate lyase  29.68 
 
 		 658 aa  122  9e-27  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3036  aminodeoxychorismate lyase  30.58 
 
 		 623 aa  121  1.9999999999999998e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0256494  normal  0.08592 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1743  hypothetical protein  28.97 
 
 		 333 aa  122  1.9999999999999998e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2380  aminodeoxychorismate lyase  28.65 
 
 		 691 aa  120  3e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1776  aminodeoxychorismate lyase  28.22 
 
 		 355 aa  120  4.9999999999999996e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.81136  normal  0.183273 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0650  periplasmic solute-binding protein, aminodeoxychorismate lyase-like  31.4 
 
 		 356 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.368295  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2950  aminodeoxychorismate lyase  34.89 
 
 		 353 aa  118  1.9999999999999998e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3097  aminodeoxychorismate lyase  29.07 
 
 		 355 aa  117  3e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00109006  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2514  aminodeoxychorismate lyase  29.9 
 
 		 337 aa  117  3e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.636222  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1390  aminodeoxychorismate lyase  29.72 
 
 		 364 aa  117  3.9999999999999997e-25  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000172807  hitchhiker  3.2530600000000004e-23 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1361  aminodeoxychorismate lyase  32.04 
 
 		 370 aa  117  5e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0615754  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1497  aminodeoxychorismate lyase  30.31 
 
 		 351 aa  116  6e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1613  hypothetical protein  29.91 
 
 		 600 aa  115  8.999999999999998e-25  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3021  aminodeoxychorismate lyase  29.79 
 
 		 358 aa  116  8.999999999999998e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.157507  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2486  aminodeoxychorismate lyase  29.19 
 
 		 364 aa  115  8.999999999999998e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00502838  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0842  aminodeoxychorismate lyase  30.79 
 
 		 327 aa  116  8.999999999999998e-25  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0834555 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2023  aminodeoxychorismate lyase  34.08 
 
 		 363 aa  114  2.0000000000000002e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.309788  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0484  aminodeoxychorismate lyase  30.13 
 
 		 335 aa  114  2.0000000000000002e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2262  aminodeoxychorismate lyase  29.97 
 
 		 344 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.945495  hitchhiker  0.000317634 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0459  aminodeoxychorismate lyase  27.72 
 
 		 451 aa  114  3e-24  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0473  periplasmic solute-binding protein  31.03 
 
 		 345 aa  114  4.0000000000000004e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0206414  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4117  aminodeoxychorismate lyase  28.61 
 
 		 356 aa  113  5e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000093714  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0732  hypothetical protein TIGR00247  28.76 
 
 		 356 aa  113  5e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000024462  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2303  aminodeoxychorismate lyase  29.86 
 
 		 422 aa  113  5e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0207028  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4517  conserved hypothetical protein TIGR00247  28.49 
 
 		 356 aa  113  6e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000911066  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2322  aminodeoxychorismate lyase  28.73 
 
 		 587 aa  113  6e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.284127  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4128  aminodeoxychorismate lyase  28.76 
 
 		 356 aa  112  9e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000574197  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4467  aminodeoxychorismate lyase  31.52 
 
 		 357 aa  112  2.0000000000000002e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000156063  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4280  hypothetical protein  28.49 
 
 		 356 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000498286  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4464  conserved hypothetical protein TIGR00247  28.49 
 
 		 356 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000911703 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4612  hypothetical protein  28.49 
 
 		 351 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000312577  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4504  conserved hypothetical protein TIGR00247  28.69 
 
 		 356 aa  111  3e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0625  aminodeoxychorismate lyase  30.17 
 
 		 357 aa  110  3e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0512441  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4231  aminodeoxychorismate lyase  28.23 
 
 		 356 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000711244  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2733  aminodeoxychorismate lyase  36.59 
 
 		 337 aa  110  4.0000000000000004e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.269056  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4657  aminodeoxychorismate lyase  26.17 
 
 		 362 aa  110  4.0000000000000004e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.333524  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0225  aminodeoxychorismate lyase  31.07 
 
 		 322 aa  110  5e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.58497  normal  0.0291883 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05120  conserved hypothetical protein TIGR00247  29.93 
 
 		 403 aa  110  5e-23  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.924204  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2534  aminodeoxychorismate lyase  31.27 
 
 		 339 aa  110  5e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.714245  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4144  aminodeoxychorismate lyase  28.93 
 
 		 409 aa  110  6e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0208419  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1837  aminodeoxychorismate lyase  32.39 
 
 		 360 aa  110  6e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1435  aminodeoxychorismate lyase  35.32 
 
 		 344 aa  110  6e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2905  aminodeoxychorismate lyase  29.32 
 
 		 337 aa  109  8.000000000000001e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4536  aminodeoxychorismate lyase  30.91 
 
 		 371 aa  109  9.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3717  aminodeoxychorismate lyase  30.25 
 
 		 471 aa  108  1e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.444196  normal  0.13956 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0560  aminodeoxychorismate lyase  29.36 
 
 		 467 aa  109  1e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.133777  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0495  aminodeoxychorismate lyase  29.36 
 
 		 467 aa  109  1e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.843817  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1472  aminodeoxychorismate lyase  30.03 
 
 		 424 aa  108  2e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.120948  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2350  aminodeoxychorismate lyase  28.61 
 
 		 416 aa  108  2e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3279  aminodeoxychorismate lyase  30.26 
 
 		 376 aa  107  5e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.258116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2055  aminodeoxychorismate lyase  29.57 
 
 		 407 aa  105  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0531  aminodeoxychorismate lyase  29.32 
 
 		 464 aa  105  1e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.40268 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>