More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_05120 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013170  Ccur_05120  conserved hypothetical protein TIGR00247  100 
 
 		 403 aa  817    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.924204  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2553  aminodeoxychorismate lyase  51.42 
 
 		 385 aa  345  8e-94  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07820  conserved hypothetical protein TIGR00247  47.27 
 
 		 389 aa  329  4e-89  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0223518 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0459  aminodeoxychorismate lyase  39.11 
 
 		 451 aa  234  2.0000000000000002e-60  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1435  aminodeoxychorismate lyase  37.5 
 
 		 344 aa  190  4e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0918  aminodeoxychorismate lyase  40.53 
 
 		 345 aa  182  8.000000000000001e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.174013  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1497  aminodeoxychorismate lyase  34.74 
 
 		 351 aa  182  1e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1361  aminodeoxychorismate lyase  36.86 
 
 		 370 aa  179  8e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0615754  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1637  aminodeoxychorismate lyase  37.1 
 
 		 352 aa  172  1e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.521882 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3279  aminodeoxychorismate lyase  36.89 
 
 		 376 aa  170  4e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.258116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0473  periplasmic solute-binding protein  34.39 
 
 		 345 aa  169  6e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0206414  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1837  aminodeoxychorismate lyase  35.67 
 
 		 360 aa  168  2e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1472  aminodeoxychorismate lyase  33.55 
 
 		 424 aa  166  8e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.120948  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2459  aminodeoxychorismate lyase  36.15 
 
 		 344 aa  165  1.0000000000000001e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.5911  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0900  aminodeoxychorismate lyase  35.55 
 
 		 338 aa  163  5.0000000000000005e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1776  aminodeoxychorismate lyase  34.02 
 
 		 355 aa  162  7e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.81136  normal  0.183273 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2026  hypothetical protein  34.03 
 
 		 333 aa  162  7e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0733  aminodeoxychorismate lyase  34.32 
 
 		 335 aa  162  1e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.224262  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1743  hypothetical protein  33.43 
 
 		 333 aa  159  6e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1410  aminodeoxychorismate lyase  34.53 
 
 		 347 aa  159  7e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0871  aminodeoxychorismate lyase  34.03 
 
 		 339 aa  159  9e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1543  hypothetical protein  34.53 
 
 		 340 aa  157  4e-37  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0650  periplasmic solute-binding protein, aminodeoxychorismate lyase-like  32.26 
 
 		 356 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.368295  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2262  aminodeoxychorismate lyase  31.98 
 
 		 344 aa  156  5.0000000000000005e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.945495  hitchhiker  0.000317634 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3036  aminodeoxychorismate lyase  33.25 
 
 		 623 aa  155  2e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0256494  normal  0.08592 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4504  conserved hypothetical protein TIGR00247  30.14 
 
 		 356 aa  153  4e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2486  aminodeoxychorismate lyase  29.41 
 
 		 364 aa  153  5.9999999999999996e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00502838  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1129  aminodeoxychorismate lyase  34.21 
 
 		 336 aa  152  1e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.399769 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0732  hypothetical protein TIGR00247  29.86 
 
 		 356 aa  150  3e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000024462  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1390  aminodeoxychorismate lyase  31.29 
 
 		 364 aa  150  3e-35  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000172807  hitchhiker  3.2530600000000004e-23 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0288  aminodeoxychorismate lyase  31.78 
 
 		 658 aa  150  3e-35  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4517  conserved hypothetical protein TIGR00247  29.86 
 
 		 356 aa  150  4e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000911066  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4467  aminodeoxychorismate lyase  34.78 
 
 		 357 aa  149  8e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000156063  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4117  aminodeoxychorismate lyase  30.33 
 
 		 356 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000093714  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4280  hypothetical protein  29.86 
 
 		 356 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000498286  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4128  aminodeoxychorismate lyase  29.86 
 
 		 356 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000574197  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4464  conserved hypothetical protein TIGR00247  29.86 
 
 		 356 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000911703 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4231  aminodeoxychorismate lyase  29.59 
 
 		 356 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000711244  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2045  aminodeoxychorismate lyase  34.1 
 
 		 342 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0393494  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2044  aminodeoxychorismate lyase  34.26 
 
 		 385 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0389257  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3559  aminodeoxychorismate lyase  31.4 
 
 		 341 aa  147  3e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000155777  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1008  aminodeoxychorismate lyase  32.92 
 
 		 373 aa  147  4.0000000000000006e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00821655  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3021  aminodeoxychorismate lyase  34.46 
 
 		 358 aa  147  4.0000000000000006e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.157507  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0030  aminodeoxychorismate lyase  34.15 
 
 		 349 aa  147  4.0000000000000006e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.647846  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3097  aminodeoxychorismate lyase  30.25 
 
 		 355 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00109006  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4612  hypothetical protein  29.75 
 
 		 351 aa  146  6e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000312577  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2534  aminodeoxychorismate lyase  33.67 
 
 		 339 aa  146  6e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.714245  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0966  aminodeoxychorismate lyase  30.39 
 
 		 363 aa  145  9e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0508  hypothetical protein  35.19 
 
 		 340 aa  144  2e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1090  aminodeoxychorismate lyase  32.95 
 
 		 331 aa  144  4e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4376  aminodeoxychorismate lyase  32.6 
 
 		 362 aa  143  5e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0936456  normal  0.529135 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2516  aminodeoxychorismate lyase  38.27 
 
 		 351 aa  143  6e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.470286  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0308  aminodeoxychorismate lyase  35.58 
 
 		 440 aa  143  7e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1685  aminodeoxychorismate lyase  33.33 
 
 		 407 aa  142  9.999999999999999e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0659  aminodeoxychorismate lyase  32.02 
 
 		 546 aa  142  9.999999999999999e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00259316  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2950  aminodeoxychorismate lyase  32.86 
 
 		 353 aa  141  1.9999999999999998e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3618  aminodeoxychorismate lyase  33.78 
 
 		 362 aa  140  3.9999999999999997e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000276729  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12530  predicted periplasmic solute-binding protein  34.12 
 
 		 368 aa  140  6e-32  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00811784  normal  0.477009 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1328  aminodeoxychorismate lyase  35.58 
 
 		 372 aa  140  6e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0484668  normal  0.302335 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4657  aminodeoxychorismate lyase  30.42 
 
 		 362 aa  139  1e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.333524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3414  aminodeoxychorismate lyase  34.1 
 
 		 369 aa  138  2e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0388714  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2976  aminodeoxychorismate lyase  30.5 
 
 		 425 aa  138  2e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.202928 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3481  aminodeoxychorismate lyase  31.58 
 
 		 418 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.114938  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05820  aminodeoxychorismate lyase  30.77 
 
 		 337 aa  137  4e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0160306  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2351  aminodeoxychorismate lyase  35.02 
 
 		 620 aa  137  4e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.260551 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1563  aminodeoxychorismate lyase  32.95 
 
 		 369 aa  137  5e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0842  aminodeoxychorismate lyase  29.71 
 
 		 327 aa  136  6.0000000000000005e-31  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0834555 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2350  aminodeoxychorismate lyase  31.92 
 
 		 416 aa  136  7.000000000000001e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3821  hypothetical protein  31.9 
 
 		 406 aa  135  9.999999999999999e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.133528 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0484  aminodeoxychorismate lyase  32.15 
 
 		 335 aa  135  9.999999999999999e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3761  aminodeoxychorismate lyase  33.54 
 
 		 415 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.37487 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2275  aminodeoxychorismate lyase  31.46 
 
 		 349 aa  135  9.999999999999999e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2470  aminodeoxychorismate lyase  32.18 
 
 		 415 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.16603  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2303  aminodeoxychorismate lyase  31.84 
 
 		 422 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0207028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1791  aminodeoxychorismate lyase  34.12 
 
 		 339 aa  135  1.9999999999999998e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00439567  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0625  aminodeoxychorismate lyase  35.16 
 
 		 357 aa  135  1.9999999999999998e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0512441  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0694  aminodeoxychorismate lyase  33.56 
 
 		 327 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000296609 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1353  hypothetical protein  28.17 
 
 		 332 aa  134  3e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1871  aminodeoxychorismate lyase  32.12 
 
 		 336 aa  134  3e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1613  hypothetical protein  32.12 
 
 		 600 aa  134  3.9999999999999996e-30  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0682  aminodeoxychorismate lyase  33.56 
 
 		 333 aa  134  3.9999999999999996e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0424367  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2122  aminodeoxychorismate lyase  34.34 
 
 		 340 aa  133  5e-30  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3156  aminodeoxychorismate lyase  34.43 
 
 		 536 aa  133  5e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.489263  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2044  hypothetical protein  33.67 
 
 		 324 aa  133  5e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.47923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2118  aminodeoxychorismate lyase  31.8 
 
 		 312 aa  132  9e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0134865  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0417  aminodeoxychorismate lyase  32.25 
 
 		 331 aa  132  1.0000000000000001e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1349  hypothetical protein  28.93 
 
 		 332 aa  131  2.0000000000000002e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1820  aminodeoxychorismate lyase  34.87 
 
 		 401 aa  129  7.000000000000001e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.111847  normal  0.624649 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0473  aminodeoxychorismate lyase  30.67 
 
 		 330 aa  129  7.000000000000001e-29  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0117874  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2733  aminodeoxychorismate lyase  33.33 
 
 		 337 aa  129  8.000000000000001e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.269056  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2514  aminodeoxychorismate lyase  30.18 
 
 		 337 aa  129  1.0000000000000001e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.636222  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0315  aminodeoxychorismate lyase  32.19 
 
 		 389 aa  127  3e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1488  hypothetical protein  29.68 
 
 		 346 aa  127  4.0000000000000003e-28  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0806646  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2348  aminodeoxychorismate lyase  29.82 
 
 		 415 aa  126  5e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.776778  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2389  aminodeoxychorismate lyase  29.82 
 
 		 415 aa  126  5e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0575785 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2395  aminodeoxychorismate lyase  29.82 
 
 		 415 aa  126  5e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.178925 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2642  aminodeoxychorismate lyase  32.33 
 
 		 415 aa  126  6e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1605  aminodeoxychorismate lyase  32.85 
 
 		 339 aa  126  7e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0288124  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1863  aminodeoxychorismate lyase  31.03 
 
 		 356 aa  126  8.000000000000001e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.322444  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0225  aminodeoxychorismate lyase  32.21 
 
 		 322 aa  126  8.000000000000001e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.58497  normal  0.0291883 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>