More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_0288 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008532  STER_0288  aminodeoxychorismate lyase  100 
 
 
658 aa  1340    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1613  hypothetical protein  58.99 
 
 
600 aa  462  9.999999999999999e-129  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0659  aminodeoxychorismate lyase  52.27 
 
 
546 aa  394  1e-108  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00259316  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1390  aminodeoxychorismate lyase  41.29 
 
 
364 aa  277  5e-73  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000172807  hitchhiker  3.2530600000000004e-23 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4517  conserved hypothetical protein TIGR00247  40 
 
 
356 aa  243  1e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000911066  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4128  aminodeoxychorismate lyase  39.45 
 
 
356 aa  240  8e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000574197  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4464  conserved hypothetical protein TIGR00247  39.18 
 
 
356 aa  239  1e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000911703 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4280  hypothetical protein  39.45 
 
 
356 aa  238  2e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000498286  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4612  hypothetical protein  39.45 
 
 
351 aa  238  4e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000312577  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4231  aminodeoxychorismate lyase  39.39 
 
 
356 aa  238  4e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000711244  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4117  aminodeoxychorismate lyase  38.9 
 
 
356 aa  236  9e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000093714  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0732  hypothetical protein TIGR00247  39.18 
 
 
356 aa  235  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000024462  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4504  conserved hypothetical protein TIGR00247  39.24 
 
 
356 aa  235  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3097  aminodeoxychorismate lyase  36.97 
 
 
355 aa  222  1.9999999999999999e-56  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00109006  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0966  aminodeoxychorismate lyase  33.85 
 
 
363 aa  207  4e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2486  aminodeoxychorismate lyase  34.14 
 
 
364 aa  202  9.999999999999999e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00502838  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4466  hypothetical protein  38.27 
 
 
259 aa  173  9e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000131965  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0900  aminodeoxychorismate lyase  34.35 
 
 
338 aa  162  2e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0459  aminodeoxychorismate lyase  28.54 
 
 
451 aa  162  3e-38  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0918  aminodeoxychorismate lyase  30.08 
 
 
345 aa  160  1e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.174013  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0484  aminodeoxychorismate lyase  32.42 
 
 
335 aa  152  2e-35  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0871  aminodeoxychorismate lyase  32.78 
 
 
339 aa  149  1.0000000000000001e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2023  aminodeoxychorismate lyase  34.19 
 
 
363 aa  150  1.0000000000000001e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.309788  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2950  aminodeoxychorismate lyase  30.19 
 
 
353 aa  147  4.0000000000000006e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05120  conserved hypothetical protein TIGR00247  32.21 
 
 
403 aa  147  7.0000000000000006e-34  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.924204  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2275  aminodeoxychorismate lyase  30.29 
 
 
349 aa  147  8.000000000000001e-34  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07820  conserved hypothetical protein TIGR00247  31.63 
 
 
389 aa  147  8.000000000000001e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0223518 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1776  aminodeoxychorismate lyase  29.71 
 
 
355 aa  145  2e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.81136  normal  0.183273 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1497  aminodeoxychorismate lyase  35.4 
 
 
351 aa  145  3e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0473  periplasmic solute-binding protein  28.96 
 
 
345 aa  144  4e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0206414  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1435  aminodeoxychorismate lyase  29.46 
 
 
344 aa  143  9.999999999999999e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1637  aminodeoxychorismate lyase  32.02 
 
 
352 aa  142  1.9999999999999998e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.521882 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1410  aminodeoxychorismate lyase  41.75 
 
 
347 aa  142  1.9999999999999998e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3021  aminodeoxychorismate lyase  29.36 
 
 
358 aa  142  3e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.157507  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4376  aminodeoxychorismate lyase  28.41 
 
 
362 aa  140  6e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0936456  normal  0.529135 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3559  aminodeoxychorismate lyase  29.01 
 
 
341 aa  140  7.999999999999999e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000155777  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1563  aminodeoxychorismate lyase  31.72 
 
 
369 aa  140  1e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3279  aminodeoxychorismate lyase  30.67 
 
 
376 aa  139  1e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.258116  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2262  aminodeoxychorismate lyase  30.52 
 
 
344 aa  136  9.999999999999999e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.945495  hitchhiker  0.000317634 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1532  hypothetical protein  30 
 
 
414 aa  136  9.999999999999999e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0269325  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1203  aminodeoxychorismate lyase  28.22 
 
 
405 aa  136  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00148773 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2026  hypothetical protein  31.18 
 
 
333 aa  135  3e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3414  aminodeoxychorismate lyase  31.18 
 
 
369 aa  134  3.9999999999999996e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0388714  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0557  aminodeoxychorismate lyase  30.81 
 
 
326 aa  134  5e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.245938  normal  0.0550645 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0531  aminodeoxychorismate lyase  29.12 
 
 
464 aa  134  5e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.40268 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0495  aminodeoxychorismate lyase  28.65 
 
 
467 aa  134  6e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.843817  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05820  aminodeoxychorismate lyase  30.38 
 
 
337 aa  134  6e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0160306  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0560  aminodeoxychorismate lyase  28.65 
 
 
467 aa  134  7.999999999999999e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.133777  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1055  aminodeoxychorismate lyase  27.51 
 
 
384 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.921254  normal  0.096534 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2459  aminodeoxychorismate lyase  27.71 
 
 
344 aa  133  1.0000000000000001e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.5911  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1008  aminodeoxychorismate lyase  31.12 
 
 
373 aa  132  2.0000000000000002e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00821655  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2783  aminodeoxychorismate lyase  29.45 
 
 
456 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1765  aminodeoxychorismate lyase  29.27 
 
 
391 aa  132  2.0000000000000002e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.310683  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3134  aminodeoxychorismate lyase  29.32 
 
 
442 aa  132  2.0000000000000002e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.486263 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4467  aminodeoxychorismate lyase  32.3 
 
 
357 aa  132  2.0000000000000002e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000156063  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0748  aminodeoxychorismate lyase  30.75 
 
 
399 aa  131  4.0000000000000003e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.309418  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3717  aminodeoxychorismate lyase  29.48 
 
 
471 aa  131  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.444196  normal  0.13956 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1743  hypothetical protein  31.18 
 
 
333 aa  131  5.0000000000000004e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0733  aminodeoxychorismate lyase  31.97 
 
 
335 aa  130  5.0000000000000004e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.224262  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2303  aminodeoxychorismate lyase  28.34 
 
 
422 aa  130  6e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0207028  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0625  aminodeoxychorismate lyase  28.88 
 
 
357 aa  130  7.000000000000001e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0512441  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2350  aminodeoxychorismate lyase  27.13 
 
 
416 aa  130  1.0000000000000001e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12530  predicted periplasmic solute-binding protein  28.96 
 
 
368 aa  129  1.0000000000000001e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00811784  normal  0.477009 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1543  hypothetical protein  30.28 
 
 
340 aa  129  2.0000000000000002e-28  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1060  aminodeoxychorismate lyase  27.59 
 
 
412 aa  129  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.017221 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2470  aminodeoxychorismate lyase  28.26 
 
 
415 aa  129  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.16603  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0842  aminodeoxychorismate lyase  29.28 
 
 
327 aa  129  2.0000000000000002e-28  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0834555 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3481  aminodeoxychorismate lyase  28.88 
 
 
418 aa  128  3e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.114938  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1685  aminodeoxychorismate lyase  28.76 
 
 
407 aa  128  3e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0225  aminodeoxychorismate lyase  27.42 
 
 
322 aa  128  4.0000000000000003e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.58497  normal  0.0291883 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3036  aminodeoxychorismate lyase  28.1 
 
 
623 aa  127  4.0000000000000003e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0256494  normal  0.08592 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1837  aminodeoxychorismate lyase  31.03 
 
 
360 aa  128  4.0000000000000003e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1090  aminodeoxychorismate lyase  29.81 
 
 
331 aa  127  5e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2516  aminodeoxychorismate lyase  27.22 
 
 
351 aa  127  7e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.470286  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1472  aminodeoxychorismate lyase  30 
 
 
424 aa  127  9e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.120948  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1791  aminodeoxychorismate lyase  29.54 
 
 
339 aa  126  1e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00439567  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3195  aminodeoxychorismate lyase  29.84 
 
 
454 aa  126  2e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.934507  hitchhiker  0.00937701 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2122  aminodeoxychorismate lyase  30.17 
 
 
340 aa  126  2e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3618  aminodeoxychorismate lyase  28.16 
 
 
362 aa  125  3e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000276729  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1587  aminodeoxychorismate lyase  27.27 
 
 
332 aa  125  3e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.076405 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2553  aminodeoxychorismate lyase  30.91 
 
 
385 aa  125  3e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1361  aminodeoxychorismate lyase  28.25 
 
 
370 aa  124  4e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0615754  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3821  hypothetical protein  29.14 
 
 
406 aa  124  6e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.133528 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0892  aminodeoxychorismate lyase  28.26 
 
 
579 aa  123  8e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0855314 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2514  aminodeoxychorismate lyase  40.11 
 
 
337 aa  124  8e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.636222  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0694  aminodeoxychorismate lyase  29.75 
 
 
327 aa  123  9.999999999999999e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000296609 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1988  aminodeoxychorismate lyase  25.89 
 
 
345 aa  122  1.9999999999999998e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3156  aminodeoxychorismate lyase  31.03 
 
 
536 aa  122  1.9999999999999998e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.489263  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1612  hypothetical protein  26.54 
 
 
340 aa  122  1.9999999999999998e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000845082  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0682  aminodeoxychorismate lyase  28.03 
 
 
333 aa  122  1.9999999999999998e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0424367  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1582  hypothetical protein  29.19 
 
 
341 aa  121  3e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000314961  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1690  aminodeoxychorismate lyase  26.81 
 
 
341 aa  121  3.9999999999999996e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0437285  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3494  hypothetical protein  26.95 
 
 
363 aa  121  3.9999999999999996e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000556203  normal  0.010619 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1605  aminodeoxychorismate lyase  27.25 
 
 
339 aa  121  4.9999999999999996e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0288124  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2045  aminodeoxychorismate lyase  29.18 
 
 
342 aa  120  6e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0393494  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2976  aminodeoxychorismate lyase  26.49 
 
 
425 aa  120  7e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.202928 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1716  aminodeoxychorismate lyase  25 
 
 
333 aa  119  9.999999999999999e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.998027  normal  0.24374 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2534  aminodeoxychorismate lyase  29.97 
 
 
339 aa  120  9.999999999999999e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.714245  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1910  aminodeoxychorismate lyase  26.86 
 
 
341 aa  119  1.9999999999999998e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000953369  decreased coverage  0.000000738863 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2905  aminodeoxychorismate lyase  38.12 
 
 
337 aa  118  3e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>