More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_1390 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_1390  aminodeoxychorismate lyase  100 
 
 		 364 aa  750    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000172807  hitchhiker  3.2530600000000004e-23 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0288  aminodeoxychorismate lyase  41.29 
 
 		 658 aa  277  2e-73  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1613  hypothetical protein  38.04 
 
 		 600 aa  272  8.000000000000001e-72  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0659  aminodeoxychorismate lyase  39.58 
 
 		 546 aa  263  4e-69  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00259316  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4517  conserved hypothetical protein TIGR00247  38.51 
 
 		 356 aa  261  1e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000911066  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4464  conserved hypothetical protein TIGR00247  38.79 
 
 		 356 aa  259  7e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000911703 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4280  hypothetical protein  38.79 
 
 		 356 aa  258  1e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000498286  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4128  aminodeoxychorismate lyase  38.51 
 
 		 356 aa  257  2e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000574197  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3097  aminodeoxychorismate lyase  40.12 
 
 		 355 aa  257  2e-67  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00109006  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4117  aminodeoxychorismate lyase  38.51 
 
 		 356 aa  257  3e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000093714  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0732  hypothetical protein TIGR00247  37.93 
 
 		 356 aa  257  3e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000024462  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4612  hypothetical protein  39.18 
 
 		 351 aa  256  4e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000312577  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4504  conserved hypothetical protein TIGR00247  37.64 
 
 		 356 aa  255  9e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4231  aminodeoxychorismate lyase  37.07 
 
 		 356 aa  248  1e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000711244  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2486  aminodeoxychorismate lyase  36.65 
 
 		 364 aa  248  1e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00502838  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0966  aminodeoxychorismate lyase  35.69 
 
 		 363 aa  248  1e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4466  hypothetical protein  39.11 
 
 		 259 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000131965  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1497  aminodeoxychorismate lyase  37.86 
 
 		 351 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3559  aminodeoxychorismate lyase  32.66 
 
 		 341 aa  176  5e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000155777  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2023  aminodeoxychorismate lyase  33.91 
 
 		 363 aa  173  3.9999999999999995e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.309788  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0918  aminodeoxychorismate lyase  32.42 
 
 		 345 aa  164  2.0000000000000002e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.174013  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0871  aminodeoxychorismate lyase  31.93 
 
 		 339 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1776  aminodeoxychorismate lyase  32.11 
 
 		 355 aa  164  3e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.81136  normal  0.183273 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0733  aminodeoxychorismate lyase  34.3 
 
 		 335 aa  164  3e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.224262  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05820  aminodeoxychorismate lyase  31.02 
 
 		 337 aa  163  5.0000000000000005e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0160306  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0473  periplasmic solute-binding protein  31.69 
 
 		 345 aa  163  5.0000000000000005e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0206414  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1435  aminodeoxychorismate lyase  30.49 
 
 		 344 aa  160  3e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1361  aminodeoxychorismate lyase  27.54 
 
 		 370 aa  159  5e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0615754  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1637  aminodeoxychorismate lyase  32.29 
 
 		 352 aa  159  6e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.521882 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0900  aminodeoxychorismate lyase  31.63 
 
 		 338 aa  157  3e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2262  aminodeoxychorismate lyase  32.49 
 
 		 344 aa  157  3e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.945495  hitchhiker  0.000317634 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2516  aminodeoxychorismate lyase  29.85 
 
 		 351 aa  152  8e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.470286  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2459  aminodeoxychorismate lyase  30.32 
 
 		 344 aa  150  3e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.5911  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1472  aminodeoxychorismate lyase  31.15 
 
 		 424 aa  148  1.0000000000000001e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.120948  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2950  aminodeoxychorismate lyase  28.69 
 
 		 353 aa  148  2.0000000000000003e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3279  aminodeoxychorismate lyase  31.15 
 
 		 376 aa  148  2.0000000000000003e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.258116  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3021  aminodeoxychorismate lyase  32.11 
 
 		 358 aa  147  3e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.157507  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05120  conserved hypothetical protein TIGR00247  32.46 
 
 		 403 aa  146  5e-34  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.924204  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4376  aminodeoxychorismate lyase  32.65 
 
 		 362 aa  145  9e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0936456  normal  0.529135 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1008  aminodeoxychorismate lyase  32.39 
 
 		 373 aa  145  9e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00821655  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3618  aminodeoxychorismate lyase  31.49 
 
 		 362 aa  143  4e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000276729  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0842  aminodeoxychorismate lyase  30.36 
 
 		 327 aa  142  8e-33  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0834555 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1743  hypothetical protein  28.66 
 
 		 333 aa  142  9e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0204  aminodeoxychorismate lyase  36.13 
 
 		 314 aa  141  1.9999999999999998e-32  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0459  aminodeoxychorismate lyase  29.38 
 
 		 451 aa  140  3e-32  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2026  hypothetical protein  28.12 
 
 		 333 aa  140  3e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07820  conserved hypothetical protein TIGR00247  31.82 
 
 		 389 aa  139  1e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0223518 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0682  aminodeoxychorismate lyase  27.99 
 
 		 333 aa  138  2e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0424367  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1410  aminodeoxychorismate lyase  30.56 
 
 		 347 aa  133  5e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0694  aminodeoxychorismate lyase  28.82 
 
 		 327 aa  133  5e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000296609 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0508  hypothetical protein  31.19 
 
 		 340 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0625  aminodeoxychorismate lyase  27.19 
 
 		 357 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0512441  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0650  periplasmic solute-binding protein, aminodeoxychorismate lyase-like  26.98 
 
 		 356 aa  130  3e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.368295  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2268  aminodeoxychorismate lyase  30.19 
 
 		 347 aa  129  6e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1587  aminodeoxychorismate lyase  29.55 
 
 		 332 aa  128  1.0000000000000001e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.076405 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2044  aminodeoxychorismate lyase  28.76 
 
 		 385 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0389257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0016  aminodeoxychorismate lyase  27.22 
 
 		 344 aa  128  1.0000000000000001e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3156  aminodeoxychorismate lyase  31 
 
 		 536 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.489263  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2783  aminodeoxychorismate lyase  28.12 
 
 		 456 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0417  aminodeoxychorismate lyase  29.55 
 
 		 331 aa  127  3e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2275  aminodeoxychorismate lyase  29.64 
 
 		 349 aa  127  3e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1090  aminodeoxychorismate lyase  30.9 
 
 		 331 aa  127  3e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3134  aminodeoxychorismate lyase  29.19 
 
 		 442 aa  125  8.000000000000001e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.486263 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0484  aminodeoxychorismate lyase  28.09 
 
 		 335 aa  125  1e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2976  aminodeoxychorismate lyase  30.55 
 
 		 425 aa  124  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.202928 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1129  aminodeoxychorismate lyase  29.55 
 
 		 336 aa  123  4e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.399769 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0953  aminodeoxychorismate lyase  28.29 
 
 		 335 aa  124  4e-27  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.316253  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1532  hypothetical protein  29 
 
 		 414 aa  122  7e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0269325  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2521  aminodeoxychorismate lyase  27.7 
 
 		 372 aa  122  7e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2905  aminodeoxychorismate lyase  32.69 
 
 		 337 aa  122  8e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2470  aminodeoxychorismate lyase  29.15 
 
 		 415 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.16603  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0225  aminodeoxychorismate lyase  26.53 
 
 		 322 aa  122  9.999999999999999e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.58497  normal  0.0291883 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2122  aminodeoxychorismate lyase  26.33 
 
 		 340 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1055  aminodeoxychorismate lyase  24.79 
 
 		 384 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.921254  normal  0.096534 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1543  hypothetical protein  27.46 
 
 		 340 aa  120  3.9999999999999996e-26  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1582  hypothetical protein  28.83 
 
 		 341 aa  120  3.9999999999999996e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000314961  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3494  hypothetical protein  26.72 
 
 		 363 aa  120  3.9999999999999996e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000556203  normal  0.010619 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2733  aminodeoxychorismate lyase  39.05 
 
 		 337 aa  119  7e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.269056  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1837  aminodeoxychorismate lyase  29.37 
 
 		 360 aa  119  9e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0732  hypothetical protein  28.65 
 
 		 343 aa  119  9e-26  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0473  aminodeoxychorismate lyase  28.71 
 
 		 330 aa  118  9.999999999999999e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0117874  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1690  aminodeoxychorismate lyase  28.18 
 
 		 341 aa  119  9.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0437285  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1919  aminodeoxychorismate lyase  29.48 
 
 		 363 aa  118  1.9999999999999998e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.402452  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12530  predicted periplasmic solute-binding protein  26.91 
 
 		 368 aa  118  1.9999999999999998e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00811784  normal  0.477009 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2534  aminodeoxychorismate lyase  33.49 
 
 		 339 aa  118  1.9999999999999998e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.714245  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1060  aminodeoxychorismate lyase  29.97 
 
 		 412 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.017221 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0748  aminodeoxychorismate lyase  28.57 
 
 		 399 aa  117  3e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.309418  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1691  aminodeoxychorismate lyase  27.72 
 
 		 376 aa  117  3e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.527988  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1591  aminodeoxychorismate lyase  27.33 
 
 		 343 aa  117  3e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0649717  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1605  aminodeoxychorismate lyase  29.84 
 
 		 339 aa  117  3.9999999999999997e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0288124  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2514  aminodeoxychorismate lyase  39.64 
 
 		 337 aa  116  5e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.636222  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1627  aminodeoxychorismate lyase  27.33 
 
 		 343 aa  116  6e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000211162  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2045  aminodeoxychorismate lyase  28.67 
 
 		 342 aa  115  7.999999999999999e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0393494  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1563  aminodeoxychorismate lyase  28.57 
 
 		 369 aa  116  7.999999999999999e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1203  aminodeoxychorismate lyase  29.32 
 
 		 405 aa  115  8.999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00148773 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3036  aminodeoxychorismate lyase  27.25 
 
 		 623 aa  115  1.0000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0256494  normal  0.08592 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2553  aminodeoxychorismate lyase  29.13 
 
 		 385 aa  115  1.0000000000000001e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1685  aminodeoxychorismate lyase  29.25 
 
 		 407 aa  115  2.0000000000000002e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6091  aminodeoxychorismate lyase  29.72 
 
 		 387 aa  114  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.384921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0967  aminodeoxychorismate lyase  30.88 
 
 		 357 aa  115  2.0000000000000002e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.829028  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>