More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_1587 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011206  Lferr_1587  aminodeoxychorismate lyase  100 
 
 		 332 aa  668    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.076405 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1077  aminodeoxychorismate lyase  40.63 
 
 		 315 aa  218  2e-55  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.578473  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1042  aminodeoxychorismate lyase  38.32 
 
 		 336 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0148163  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1380  aminodeoxychorismate lyase  39.37 
 
 		 339 aa  210  3e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5194  aminodeoxychorismate lyase  40.82 
 
 		 339 aa  209  4e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.374187 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1803  aminodeoxychorismate lyase  40.82 
 
 		 339 aa  207  2e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0606768  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1831  aminodeoxychorismate lyase  40.82 
 
 		 339 aa  207  2e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1917  aminodeoxychorismate lyase  39.8 
 
 		 339 aa  206  4e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.136892 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6185  aminodeoxychorismate lyase  39.8 
 
 		 339 aa  206  7e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1894  aminodeoxychorismate lyase  39.8 
 
 		 339 aa  206  7e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.474153  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2153  hypothetical protein  36.99 
 
 		 339 aa  204  2e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.692536  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1829  aminodeoxychorismate lyase  41.01 
 
 		 332 aa  203  3e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.021454  normal  0.121238 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1467  aminodeoxychorismate lyase  37.23 
 
 		 332 aa  203  3e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0630531  normal  0.0141986 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2264  hypothetical protein  39.22 
 
 		 345 aa  203  4e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.188751  normal  0.305668 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1877  aminodeoxychorismate lyase  43.58 
 
 		 328 aa  203  4e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.10744 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1938  aminodeoxychorismate lyase  38.35 
 
 		 345 aa  202  4e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.110627  normal  0.289211 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1501  aminodeoxychorismate lyase  36.26 
 
 		 334 aa  202  6e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00653214  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2504  aminodeoxychorismate lyase  42.12 
 
 		 337 aa  202  8e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.917927  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1578  hypothetical protein  37.5 
 
 		 343 aa  202  9e-51  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00227984  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1190  putative lipoprotein  36.99 
 
 		 339 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1426  putative lipoprotein  36.99 
 
 		 339 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.425496  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2444  hypothetical protein  36.99 
 
 		 339 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.700087  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1690  aminodeoxychorismate lyase  34.42 
 
 		 341 aa  201  9.999999999999999e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0437285  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2321  putative lipoprotein  36.99 
 
 		 339 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2282  putative lipoprotein  36.99 
 
 		 339 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3494  hypothetical protein  34.42 
 
 		 363 aa  201  9.999999999999999e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000556203  normal  0.010619 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3387  putative lipoprotein  36.99 
 
 		 339 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1917  hypothetical protein  36.99 
 
 		 339 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1582  hypothetical protein  34.12 
 
 		 341 aa  200  3e-50  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000314961  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3387  aminodeoxychorismate lyase  37.61 
 
 		 329 aa  199  7.999999999999999e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.107935  normal  0.0743499 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1605  aminodeoxychorismate lyase  39.17 
 
 		 339 aa  198  1.0000000000000001e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0288124  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1783  hypothetical protein  36.98 
 
 		 377 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0308564  normal  0.608544 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14960  hypothetical protein  38.72 
 
 		 358 aa  197  2.0000000000000003e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0607  hypothetical protein  36.82 
 
 		 370 aa  197  2.0000000000000003e-49  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000669467  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1997  hypothetical protein  37.23 
 
 		 331 aa  197  3e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2803  aminodeoxychorismate lyase  39.77 
 
 		 339 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0153211  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1544  aminodeoxychorismate lyase  41.72 
 
 		 333 aa  196  5.000000000000001e-49  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0483176  normal  0.0781021 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1861  hypothetical protein  36.16 
 
 		 337 aa  196  5.000000000000001e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0824281 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1433  aminodeoxychorismate lyase  40 
 
 		 331 aa  194  1e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1426  aminodeoxychorismate lyase  37.62 
 
 		 332 aa  195  1e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.219736  normal  0.242343 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1716  aminodeoxychorismate lyase  40.86 
 
 		 333 aa  194  1e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.998027  normal  0.24374 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1591  aminodeoxychorismate lyase  40.57 
 
 		 343 aa  194  2e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0649717  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2499  aminodeoxychorismate lyase  39.03 
 
 		 339 aa  194  2e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00196213  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2198  aminodeoxychorismate lyase  37.35 
 
 		 331 aa  193  3e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.955684 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1988  aminodeoxychorismate lyase  36.23 
 
 		 345 aa  193  3e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2859  aminodeoxychorismate lyase  38.46 
 
 		 340 aa  193  4e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3796  aminodeoxychorismate lyase  37.8 
 
 		 406 aa  192  6e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.77523  normal  0.494507 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2301  hypothetical protein  41.02 
 
 		 337 aa  192  1e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.142743  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1633  hypothetical protein  35.99 
 
 		 355 aa  191  2e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.153927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2254  aminodeoxychorismate lyase  39.86 
 
 		 323 aa  190  2.9999999999999997e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1918  aminodeoxychorismate lyase  37.11 
 
 		 421 aa  189  7e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.204138  unclonable  0.000000331509 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1919  aminodeoxychorismate lyase  38.19 
 
 		 363 aa  189  7e-47  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.402452  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2520  aminodeoxychorismate lyase  40.89 
 
 		 325 aa  189  7e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0480566  hitchhiker  0.003327 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2044  hypothetical protein  39.33 
 
 		 324 aa  189  7e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.47923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1612  hypothetical protein  34.55 
 
 		 340 aa  189  8e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000845082  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1298  hypothetical protein  38.04 
 
 		 340 aa  188  9e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.166048  hitchhiker  0.00000000000000101215 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2170  hypothetical protein  38.04 
 
 		 340 aa  188  9e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.7368  hitchhiker  0.0000000000000363112 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1313  hypothetical protein  38.04 
 
 		 340 aa  188  9e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000010184 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1987  hypothetical protein  38.04 
 
 		 340 aa  188  9e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000318105  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1529  aminodeoxychorismate lyase  37.46 
 
 		 387 aa  188  1e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.538963 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01093  predicted aminodeoxychorismate lyase  37.68 
 
 		 340 aa  187  2e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000123905  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2550  aminodeoxychorismate lyase  37.68 
 
 		 340 aa  187  2e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000202204  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2504  hypothetical protein  37.68 
 
 		 340 aa  187  2e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000670285  unclonable  0.0000000117832 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1219  hypothetical protein  37.68 
 
 		 340 aa  187  2e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000544785  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01101  hypothetical protein  37.68 
 
 		 340 aa  187  2e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000104993  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2227  hypothetical protein  37.68 
 
 		 340 aa  187  2e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000358206  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2030  hypothetical protein  37.68 
 
 		 340 aa  187  2e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000821549  hitchhiker  0.00000424543 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1218  hypothetical protein  37.68 
 
 		 340 aa  187  2e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000109839  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1476  hypothetical protein  38.04 
 
 		 340 aa  187  3e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000304616  hitchhiker  0.00000000000128745 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1275  hypothetical protein  37.32 
 
 		 340 aa  187  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.310439  normal  0.846206 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1830  aminodeoxychorismate lyase  37.93 
 
 		 342 aa  186  3e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1603  hypothetical protein  36.7 
 
 		 338 aa  187  3e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0141578  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1004  aminodeoxychorismate lyase  42.19 
 
 		 320 aa  186  4e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1863  aminodeoxychorismate lyase  39.22 
 
 		 356 aa  186  4e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.322444  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1494  aminodeoxychorismate lyase  36.43 
 
 		 400 aa  186  6e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25730  hypothetical protein  37.8 
 
 		 349 aa  185  9e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0867332  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1093  aminodeoxychorismate lyase  37.22 
 
 		 332 aa  185  9e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.72202  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1661  aminodeoxychorismate lyase  36.42 
 
 		 341 aa  184  2.0000000000000003e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.148869  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1584  aminodeoxychorismate lyase  38.49 
 
 		 364 aa  184  2.0000000000000003e-45  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0339039  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2198  hypothetical protein  37.24 
 
 		 349 aa  183  3e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.850653  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0967  aminodeoxychorismate lyase  38.72 
 
 		 357 aa  183  3e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.829028  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2573  aminodeoxychorismate lyase  39.79 
 
 		 345 aa  183  3e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0650379  normal  0.0398652 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1632  aminodeoxychorismate lyase  37.25 
 
 		 351 aa  183  3e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1417  aminodeoxychorismate lyase  38.51 
 
 		 338 aa  183  3e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.626218  normal  0.75601 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2453  aminodeoxychorismate lyase  39.79 
 
 		 345 aa  183  3e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0182667  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2460  aminodeoxychorismate lyase  39.79 
 
 		 345 aa  183  3e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00717262  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1641  hypothetical protein  38.49 
 
 		 350 aa  183  3e-45  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.667934  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2118  aminodeoxychorismate lyase  39.68 
 
 		 312 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0134865  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1891  aminodeoxychorismate lyase  40.43 
 
 		 345 aa  182  6e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.253385  normal  0.0515475 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1488  hypothetical protein  38.83 
 
 		 346 aa  182  6e-45  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0806646  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3413  aminodeoxychorismate lyase  38.66 
 
 		 334 aa  182  6e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1349  hypothetical protein  40.87 
 
 		 332 aa  182  1e-44  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0882  aminodeoxychorismate lyase  38.11 
 
 		 357 aa  181  2e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.871937 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2215  aminodeoxychorismate lyase  38.41 
 
 		 345 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003000  hypothetical protein  40.08 
 
 		 338 aa  180  2.9999999999999997e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0577137  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1627  aminodeoxychorismate lyase  39.22 
 
 		 343 aa  180  2.9999999999999997e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000211162  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1910  aminodeoxychorismate lyase  38.11 
 
 		 341 aa  180  2.9999999999999997e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000953369  decreased coverage  0.000000738863 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4153  aminodeoxychorismate lyase  35.05 
 
 		 393 aa  180  4e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.507493  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1735  aminodeoxychorismate lyase  38.87 
 
 		 336 aa  179  4e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.163239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02904  hypothetical protein  38.67 
 
 		 338 aa  179  4e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>