More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_0953 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013124  Afer_0953  aminodeoxychorismate lyase  100 
 
 
335 aa  664    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.316253  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1435  aminodeoxychorismate lyase  36.96 
 
 
344 aa  167  2.9999999999999998e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2023  aminodeoxychorismate lyase  37.41 
 
 
363 aa  165  1.0000000000000001e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.309788  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1361  aminodeoxychorismate lyase  33.02 
 
 
370 aa  158  1e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0615754  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07820  conserved hypothetical protein TIGR00247  36.39 
 
 
389 aa  153  4e-36  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0223518 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2044  aminodeoxychorismate lyase  36.58 
 
 
385 aa  153  5e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0389257  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1328  aminodeoxychorismate lyase  38.12 
 
 
372 aa  152  5.9999999999999996e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0484668  normal  0.302335 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2045  aminodeoxychorismate lyase  34.74 
 
 
342 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0393494  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1776  aminodeoxychorismate lyase  32.66 
 
 
355 aa  145  8.000000000000001e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.81136  normal  0.183273 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2026  hypothetical protein  28.53 
 
 
333 aa  145  1e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0625  aminodeoxychorismate lyase  33.83 
 
 
357 aa  145  1e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0512441  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1743  hypothetical protein  28.79 
 
 
333 aa  144  2e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2262  aminodeoxychorismate lyase  28.71 
 
 
344 aa  140  3e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.945495  hitchhiker  0.000317634 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1497  aminodeoxychorismate lyase  32.86 
 
 
351 aa  140  3.9999999999999997e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1410  aminodeoxychorismate lyase  29.82 
 
 
347 aa  139  7e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3212  aminodeoxychorismate lyase  37.19 
 
 
413 aa  138  1e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0548102  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0682  aminodeoxychorismate lyase  32.43 
 
 
333 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0424367  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3036  aminodeoxychorismate lyase  34.43 
 
 
623 aa  136  4e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0256494  normal  0.08592 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0650  periplasmic solute-binding protein, aminodeoxychorismate lyase-like  33.67 
 
 
356 aa  136  5e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.368295  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0900  aminodeoxychorismate lyase  27.85 
 
 
338 aa  136  6.0000000000000005e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0694  aminodeoxychorismate lyase  32.58 
 
 
327 aa  136  6.0000000000000005e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000296609 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3559  aminodeoxychorismate lyase  33.23 
 
 
341 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000155777  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05820  aminodeoxychorismate lyase  26.51 
 
 
337 aa  134  1.9999999999999998e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0160306  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6091  aminodeoxychorismate lyase  34.11 
 
 
387 aa  133  3.9999999999999996e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.384921  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0557  aminodeoxychorismate lyase  34.08 
 
 
326 aa  133  3.9999999999999996e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.245938  normal  0.0550645 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3097  aminodeoxychorismate lyase  28.09 
 
 
355 aa  133  3.9999999999999996e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00109006  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0918  aminodeoxychorismate lyase  31.89 
 
 
345 aa  132  6e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.174013  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4376  aminodeoxychorismate lyase  33.11 
 
 
362 aa  132  1.0000000000000001e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0936456  normal  0.529135 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0459  aminodeoxychorismate lyase  32.86 
 
 
451 aa  131  1.0000000000000001e-29  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0204  aminodeoxychorismate lyase  34.7 
 
 
314 aa  131  2.0000000000000002e-29  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3021  aminodeoxychorismate lyase  32.79 
 
 
358 aa  130  3e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.157507  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0845  periplasmic solute-binding protein-like protein  38.66 
 
 
320 aa  130  3e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1467  aminodeoxychorismate lyase  32.74 
 
 
332 aa  130  4.0000000000000003e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0630531  normal  0.0141986 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0842  aminodeoxychorismate lyase  30.77 
 
 
327 aa  130  5.0000000000000004e-29  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0834555 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0225  aminodeoxychorismate lyase  36.36 
 
 
322 aa  129  8.000000000000001e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.58497  normal  0.0291883 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1578  hypothetical protein  31.33 
 
 
343 aa  129  8.000000000000001e-29  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00227984  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1696  aminodeoxychorismate lyase  33.03 
 
 
468 aa  127  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.255824  normal  0.195294 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4117  aminodeoxychorismate lyase  28.22 
 
 
356 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000093714  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3030  aminodeoxychorismate lyase  35.93 
 
 
368 aa  127  2.0000000000000002e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2516  aminodeoxychorismate lyase  35.18 
 
 
351 aa  128  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.470286  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4517  conserved hypothetical protein TIGR00247  28.22 
 
 
356 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000911066  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4504  conserved hypothetical protein TIGR00247  28.22 
 
 
356 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1390  aminodeoxychorismate lyase  28.06 
 
 
364 aa  127  3e-28  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000172807  hitchhiker  3.2530600000000004e-23 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0733  aminodeoxychorismate lyase  27.99 
 
 
335 aa  126  4.0000000000000003e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.224262  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0732  hypothetical protein TIGR00247  27.91 
 
 
356 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000024462  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1544  aminodeoxychorismate lyase  34.21 
 
 
333 aa  126  5e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0483176  normal  0.0781021 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3156  aminodeoxychorismate lyase  35.15 
 
 
536 aa  126  5e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.489263  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2459  aminodeoxychorismate lyase  32.54 
 
 
344 aa  126  6e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.5911  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0966  aminodeoxychorismate lyase  31.58 
 
 
363 aa  126  6e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4612  hypothetical protein  27.49 
 
 
351 aa  126  7e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000312577  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1587  aminodeoxychorismate lyase  33.72 
 
 
332 aa  125  8.000000000000001e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.076405 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3295  aminodeoxychorismate lyase  39.79 
 
 
434 aa  125  1e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000545955  normal  0.0867897 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05120  conserved hypothetical protein TIGR00247  32 
 
 
403 aa  125  1e-27  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.924204  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0607  hypothetical protein  30.85 
 
 
370 aa  124  2e-27  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000669467  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1716  aminodeoxychorismate lyase  31.09 
 
 
333 aa  124  2e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.998027  normal  0.24374 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4464  conserved hypothetical protein TIGR00247  27.61 
 
 
356 aa  124  2e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000911703 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4280  hypothetical protein  27.61 
 
 
356 aa  124  3e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000498286  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1349  aminodeoxychorismate lyase  35.96 
 
 
397 aa  124  3e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1501  aminodeoxychorismate lyase  31.38 
 
 
334 aa  123  4e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00653214  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2264  hypothetical protein  31.89 
 
 
345 aa  123  4e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.188751  normal  0.305668 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1791  aminodeoxychorismate lyase  31.81 
 
 
339 aa  123  5e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00439567  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2137  aminodeoxychorismate lyase  36.93 
 
 
456 aa  123  5e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000886776  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0417  aminodeoxychorismate lyase  33.99 
 
 
331 aa  122  6e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1349  hypothetical protein  31.1 
 
 
332 aa  122  8e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0967  aminodeoxychorismate lyase  32.34 
 
 
357 aa  122  8e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.829028  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0871  aminodeoxychorismate lyase  27.76 
 
 
339 aa  122  9e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4231  aminodeoxychorismate lyase  27.3 
 
 
356 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000711244  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2322  aminodeoxychorismate lyase  38.07 
 
 
587 aa  122  9.999999999999999e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.284127  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1988  aminodeoxychorismate lyase  30.79 
 
 
345 aa  122  9.999999999999999e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0473  periplasmic solute-binding protein  29.47 
 
 
345 aa  121  9.999999999999999e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0206414  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2486  aminodeoxychorismate lyase  26.83 
 
 
364 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00502838  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4128  aminodeoxychorismate lyase  27.3 
 
 
356 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000574197  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2859  aminodeoxychorismate lyase  33.55 
 
 
340 aa  120  1.9999999999999998e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1637  aminodeoxychorismate lyase  31.46 
 
 
352 aa  121  1.9999999999999998e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.521882 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1353  hypothetical protein  31.77 
 
 
332 aa  120  3e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2198  aminodeoxychorismate lyase  32.43 
 
 
331 aa  120  3e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.955684 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0882  aminodeoxychorismate lyase  30.32 
 
 
357 aa  120  3e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.871937 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2803  aminodeoxychorismate lyase  30.36 
 
 
339 aa  119  7.999999999999999e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0153211  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2499  aminodeoxychorismate lyase  30.36 
 
 
339 aa  119  7.999999999999999e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00196213  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1938  aminodeoxychorismate lyase  30.9 
 
 
345 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.110627  normal  0.289211 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1690  aminodeoxychorismate lyase  30.52 
 
 
341 aa  117  1.9999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0437285  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3494  hypothetical protein  30.52 
 
 
363 aa  117  1.9999999999999998e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000556203  normal  0.010619 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1917  aminodeoxychorismate lyase  33.33 
 
 
339 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.136892 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1977  aminodeoxychorismate lyase  37.57 
 
 
418 aa  117  1.9999999999999998e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.337407  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1129  aminodeoxychorismate lyase  31.12 
 
 
336 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.399769 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1691  aminodeoxychorismate lyase  34.49 
 
 
376 aa  118  1.9999999999999998e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.527988  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1042  aminodeoxychorismate lyase  31.44 
 
 
336 aa  117  3e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0148163  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5263  aminodeoxychorismate lyase  34.08 
 
 
409 aa  117  3e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5194  aminodeoxychorismate lyase  33.33 
 
 
339 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.374187 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1426  aminodeoxychorismate lyase  31.23 
 
 
332 aa  116  5e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.219736  normal  0.242343 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6185  aminodeoxychorismate lyase  33.33 
 
 
339 aa  116  6e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1008  aminodeoxychorismate lyase  26.77 
 
 
373 aa  116  6e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00821655  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1894  aminodeoxychorismate lyase  33.33 
 
 
339 aa  116  6e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.474153  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1910  aminodeoxychorismate lyase  30.12 
 
 
341 aa  116  6.9999999999999995e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000953369  decreased coverage  0.000000738863 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3618  aminodeoxychorismate lyase  29.51 
 
 
362 aa  115  7.999999999999999e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000276729  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1380  aminodeoxychorismate lyase  33.44 
 
 
339 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1783  hypothetical protein  31.48 
 
 
377 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0308564  normal  0.608544 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1837  aminodeoxychorismate lyase  30.65 
 
 
360 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4657  aminodeoxychorismate lyase  28.53 
 
 
362 aa  115  1.0000000000000001e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.333524  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2950  aminodeoxychorismate lyase  32.11 
 
 
353 aa  114  2.0000000000000002e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>