More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_2950 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_2950  aminodeoxychorismate lyase  100 
 
 		 353 aa  713    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0225  aminodeoxychorismate lyase  65.84 
 
 		 322 aa  421  1e-116  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.58497  normal  0.0291883 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0417  aminodeoxychorismate lyase  47.65 
 
 		 331 aa  254  1.0000000000000001e-66  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0871  aminodeoxychorismate lyase  37.31 
 
 		 339 aa  175  9.999999999999999e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2459  aminodeoxychorismate lyase  37.82 
 
 		 344 aa  172  1e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.5911  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1410  aminodeoxychorismate lyase  34.4 
 
 		 347 aa  170  4e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1776  aminodeoxychorismate lyase  39.5 
 
 		 355 aa  168  1e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.81136  normal  0.183273 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2262  aminodeoxychorismate lyase  35.57 
 
 		 344 aa  163  4.0000000000000004e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.945495  hitchhiker  0.000317634 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0682  aminodeoxychorismate lyase  34.55 
 
 		 333 aa  161  2e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0424367  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0842  aminodeoxychorismate lyase  32.12 
 
 		 327 aa  159  6e-38  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0834555 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0531  aminodeoxychorismate lyase  34.43 
 
 		 464 aa  157  2e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.40268 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0560  aminodeoxychorismate lyase  33.89 
 
 		 467 aa  157  3e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.133777  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0694  aminodeoxychorismate lyase  33.84 
 
 		 327 aa  157  3e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000296609 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0495  aminodeoxychorismate lyase  33.89 
 
 		 467 aa  157  3e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.843817  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1497  aminodeoxychorismate lyase  32.89 
 
 		 351 aa  156  4e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3559  aminodeoxychorismate lyase  33.33 
 
 		 341 aa  155  1e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000155777  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1435  aminodeoxychorismate lyase  37.5 
 
 		 344 aa  154  2e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0650  periplasmic solute-binding protein, aminodeoxychorismate lyase-like  34.64 
 
 		 356 aa  154  2e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.368295  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3097  aminodeoxychorismate lyase  30.95 
 
 		 355 aa  153  5e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00109006  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2516  aminodeoxychorismate lyase  39.22 
 
 		 351 aa  153  5e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.470286  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2486  aminodeoxychorismate lyase  30.92 
 
 		 364 aa  152  5.9999999999999996e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00502838  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4376  aminodeoxychorismate lyase  39.44 
 
 		 362 aa  152  1e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0936456  normal  0.529135 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3717  aminodeoxychorismate lyase  33.23 
 
 		 471 aa  151  2e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.444196  normal  0.13956 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1765  aminodeoxychorismate lyase  31.02 
 
 		 391 aa  151  2e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.310683  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3618  aminodeoxychorismate lyase  31.25 
 
 		 362 aa  150  4e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000276729  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0732  hypothetical protein TIGR00247  30.39 
 
 		 356 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000024462  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2026  hypothetical protein  29.85 
 
 		 333 aa  148  1.0000000000000001e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3021  aminodeoxychorismate lyase  32.39 
 
 		 358 aa  148  2.0000000000000003e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.157507  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1390  aminodeoxychorismate lyase  28.69 
 
 		 364 aa  148  2.0000000000000003e-34  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000172807  hitchhiker  3.2530600000000004e-23 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0288  aminodeoxychorismate lyase  30.19 
 
 		 658 aa  148  2.0000000000000003e-34  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0900  aminodeoxychorismate lyase  32.31 
 
 		 338 aa  147  3e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0625  aminodeoxychorismate lyase  34.94 
 
 		 357 aa  146  5e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0512441  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2268  aminodeoxychorismate lyase  38.49 
 
 		 347 aa  146  6e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05820  aminodeoxychorismate lyase  31.95 
 
 		 337 aa  145  8.000000000000001e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0160306  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0918  aminodeoxychorismate lyase  34.17 
 
 		 345 aa  145  9e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.174013  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0045  aminodeoxychorismate lyase  33.83 
 
 		 336 aa  144  2e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.266308  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0557  aminodeoxychorismate lyase  34.11 
 
 		 326 aa  144  2e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.245938  normal  0.0550645 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2514  aminodeoxychorismate lyase  33.83 
 
 		 337 aa  144  2e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.636222  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1743  hypothetical protein  32.82 
 
 		 333 aa  144  2e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4504  conserved hypothetical protein TIGR00247  30.11 
 
 		 356 aa  144  2e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2122  aminodeoxychorismate lyase  34.42 
 
 		 340 aa  143  3e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4117  aminodeoxychorismate lyase  29.25 
 
 		 356 aa  143  5e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000093714  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4231  aminodeoxychorismate lyase  29.83 
 
 		 356 aa  143  5e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000711244  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2783  aminodeoxychorismate lyase  31.45 
 
 		 456 aa  143  5e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1613  hypothetical protein  31.94 
 
 		 600 aa  142  6e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4128  aminodeoxychorismate lyase  30.11 
 
 		 356 aa  142  6e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000574197  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4517  conserved hypothetical protein TIGR00247  29.83 
 
 		 356 aa  142  8e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000911066  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4464  conserved hypothetical protein TIGR00247  29.83 
 
 		 356 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000911703 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1090  aminodeoxychorismate lyase  35.37 
 
 		 331 aa  142  9.999999999999999e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4280  hypothetical protein  29.97 
 
 		 356 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000498286  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3134  aminodeoxychorismate lyase  33.23 
 
 		 442 aa  140  3e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.486263 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1637  aminodeoxychorismate lyase  35.71 
 
 		 352 aa  140  3e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.521882 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1501  aminodeoxychorismate lyase  32.89 
 
 		 334 aa  140  3e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00653214  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4612  hypothetical protein  30.36 
 
 		 351 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000312577  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0473  periplasmic solute-binding protein  32.79 
 
 		 345 aa  140  3.9999999999999997e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0206414  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0484  aminodeoxychorismate lyase  27.5 
 
 		 335 aa  140  4.999999999999999e-32  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2733  aminodeoxychorismate lyase  33.33 
 
 		 337 aa  139  6e-32  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.269056  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0966  aminodeoxychorismate lyase  33.02 
 
 		 363 aa  138  1e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2275  aminodeoxychorismate lyase  33.23 
 
 		 349 aa  138  1e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2976  aminodeoxychorismate lyase  29.59 
 
 		 425 aa  137  2e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.202928 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1919  aminodeoxychorismate lyase  30.43 
 
 		 363 aa  137  3.0000000000000003e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.402452  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1361  aminodeoxychorismate lyase  32.93 
 
 		 370 aa  137  4e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0615754  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3481  aminodeoxychorismate lyase  29.97 
 
 		 418 aa  135  7.000000000000001e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.114938  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0733  aminodeoxychorismate lyase  32.78 
 
 		 335 aa  135  9e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.224262  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1417  aminodeoxychorismate lyase  36.79 
 
 		 338 aa  135  9e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.626218  normal  0.75601 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2045  aminodeoxychorismate lyase  38.69 
 
 		 342 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0393494  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0659  aminodeoxychorismate lyase  29.7 
 
 		 546 aa  134  1.9999999999999998e-30  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00259316  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3279  aminodeoxychorismate lyase  31.61 
 
 		 376 aa  134  1.9999999999999998e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.258116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2044  hypothetical protein  33.8 
 
 		 324 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.47923  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2470  aminodeoxychorismate lyase  29.31 
 
 		 415 aa  134  3e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.16603  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1544  aminodeoxychorismate lyase  35.2 
 
 		 333 aa  133  3.9999999999999996e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0483176  normal  0.0781021 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2303  aminodeoxychorismate lyase  29.33 
 
 		 422 aa  133  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0207028  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2350  aminodeoxychorismate lyase  29.3 
 
 		 416 aa  133  3.9999999999999996e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0748  aminodeoxychorismate lyase  32.04 
 
 		 399 aa  132  6e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.309418  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3195  aminodeoxychorismate lyase  33.33 
 
 		 454 aa  133  6e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.934507  hitchhiker  0.00937701 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0508  hypothetical protein  34.71 
 
 		 340 aa  132  6.999999999999999e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05120  conserved hypothetical protein TIGR00247  32.89 
 
 		 403 aa  132  6.999999999999999e-30  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.924204  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12530  predicted periplasmic solute-binding protein  34.88 
 
 		 368 aa  132  1.0000000000000001e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00811784  normal  0.477009 
 
 
-
 
NC_004310  BR0462  hypothetical protein  33.23 
 
 		 412 aa  131  2.0000000000000002e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.218984  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0466  hypothetical protein  33.23 
 
 		 438 aa  131  2.0000000000000002e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.262236  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0574  aminodeoxychorismate lyase  34.49 
 
 		 403 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1467  aminodeoxychorismate lyase  32.15 
 
 		 332 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0630531  normal  0.0141986 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1563  aminodeoxychorismate lyase  35.84 
 
 		 369 aa  131  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0448  aminodeoxychorismate lyase  31.55 
 
 		 312 aa  131  2.0000000000000002e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.83946 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1532  hypothetical protein  32.05 
 
 		 414 aa  131  2.0000000000000002e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0269325  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1791  aminodeoxychorismate lyase  32.24 
 
 		 339 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00439567  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3414  aminodeoxychorismate lyase  35.47 
 
 		 369 aa  130  3e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0388714  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2254  aminodeoxychorismate lyase  33.13 
 
 		 323 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1685  aminodeoxychorismate lyase  29.44 
 
 		 407 aa  130  5.0000000000000004e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3821  hypothetical protein  29.18 
 
 		 406 aa  130  5.0000000000000004e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.133528 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0732  hypothetical protein  28.53 
 
 		 343 aa  129  6e-29  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1988  aminodeoxychorismate lyase  32.26 
 
 		 345 aa  129  7.000000000000001e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0892  aminodeoxychorismate lyase  34.04 
 
 		 579 aa  129  7.000000000000001e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0855314 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3356  aminodeoxychorismate lyase  34.49 
 
 		 349 aa  129  7.000000000000001e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.681449 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1042  aminodeoxychorismate lyase  33.14 
 
 		 336 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0148163  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1587  aminodeoxychorismate lyase  34.63 
 
 		 332 aa  128  1.0000000000000001e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.076405 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2553  aminodeoxychorismate lyase  36.49 
 
 		 385 aa  128  1.0000000000000001e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2534  aminodeoxychorismate lyase  36.5 
 
 		 339 aa  128  1.0000000000000001e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.714245  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1060  aminodeoxychorismate lyase  30.77 
 
 		 412 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.017221 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1716  aminodeoxychorismate lyase  32.35 
 
 		 333 aa  128  2.0000000000000002e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.998027  normal  0.24374 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>