More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0459 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_0459  aminodeoxychorismate lyase  100 
 
 		 451 aa  935    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05120  conserved hypothetical protein TIGR00247  43.51 
 
 		 403 aa  223  4.9999999999999996e-57  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.924204  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07820  conserved hypothetical protein TIGR00247  37.21 
 
 		 389 aa  218  2e-55  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0223518 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2553  aminodeoxychorismate lyase  37.76 
 
 		 385 aa  194  4e-48  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2262  aminodeoxychorismate lyase  34.51 
 
 		 344 aa  182  1e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.945495  hitchhiker  0.000317634 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1637  aminodeoxychorismate lyase  38.44 
 
 		 352 aa  179  5.999999999999999e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.521882 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1497  aminodeoxychorismate lyase  34.45 
 
 		 351 aa  172  1e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0871  aminodeoxychorismate lyase  30.64 
 
 		 339 aa  172  2e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1435  aminodeoxychorismate lyase  32.58 
 
 		 344 aa  170  4e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3021  aminodeoxychorismate lyase  35.78 
 
 		 358 aa  170  4e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.157507  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1361  aminodeoxychorismate lyase  34.84 
 
 		 370 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0615754  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3559  aminodeoxychorismate lyase  31.58 
 
 		 341 aa  166  1.0000000000000001e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000155777  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2486  aminodeoxychorismate lyase  30.68 
 
 		 364 aa  162  9e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00502838  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0966  aminodeoxychorismate lyase  34.63 
 
 		 363 aa  162  1e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0900  aminodeoxychorismate lyase  35.45 
 
 		 338 aa  161  2e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0288  aminodeoxychorismate lyase  28.54 
 
 		 658 aa  162  2e-38  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0473  periplasmic solute-binding protein  34.54 
 
 		 345 aa  160  4e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0206414  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1776  aminodeoxychorismate lyase  32.67 
 
 		 355 aa  160  5e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.81136  normal  0.183273 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2459  aminodeoxychorismate lyase  33.44 
 
 		 344 aa  156  7e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.5911  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0918  aminodeoxychorismate lyase  35.43 
 
 		 345 aa  155  1e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.174013  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3618  aminodeoxychorismate lyase  33.65 
 
 		 362 aa  155  1e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000276729  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1410  aminodeoxychorismate lyase  33.76 
 
 		 347 aa  152  1e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3097  aminodeoxychorismate lyase  30.86 
 
 		 355 aa  149  8e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00109006  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0508  hypothetical protein  35.37 
 
 		 340 aa  149  1.0000000000000001e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3279  aminodeoxychorismate lyase  34.18 
 
 		 376 aa  148  2.0000000000000003e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.258116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4657  aminodeoxychorismate lyase  30.25 
 
 		 362 aa  147  6e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.333524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1008  aminodeoxychorismate lyase  31.83 
 
 		 373 aa  146  6e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00821655  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0733  aminodeoxychorismate lyase  32.59 
 
 		 335 aa  145  1e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.224262  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0625  aminodeoxychorismate lyase  33.53 
 
 		 357 aa  144  3e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0512441  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0842  aminodeoxychorismate lyase  30.97 
 
 		 327 aa  144  4e-33  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0834555 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2514  aminodeoxychorismate lyase  30.97 
 
 		 337 aa  143  5e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.636222  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12530  predicted periplasmic solute-binding protein  30.81 
 
 		 368 aa  143  6e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00811784  normal  0.477009 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0557  aminodeoxychorismate lyase  31.84 
 
 		 326 aa  142  1.9999999999999998e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.245938  normal  0.0550645 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1743  hypothetical protein  29.86 
 
 		 333 aa  142  1.9999999999999998e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1090  aminodeoxychorismate lyase  31.05 
 
 		 331 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2296  aminodeoxychorismate lyase  30.03 
 
 		 599 aa  141  3e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2045  aminodeoxychorismate lyase  31.1 
 
 		 342 aa  140  3.9999999999999997e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0393494  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1390  aminodeoxychorismate lyase  29.38 
 
 		 364 aa  140  3.9999999999999997e-32  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000172807  hitchhiker  3.2530600000000004e-23 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3036  aminodeoxychorismate lyase  30.81 
 
 		 623 aa  140  7e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0256494  normal  0.08592 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2026  hypothetical protein  29.57 
 
 		 333 aa  139  7.999999999999999e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3356  aminodeoxychorismate lyase  32.51 
 
 		 349 aa  139  1e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.681449 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1837  aminodeoxychorismate lyase  30.56 
 
 		 360 aa  139  1e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0659  aminodeoxychorismate lyase  31.23 
 
 		 546 aa  139  1e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00259316  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1129  aminodeoxychorismate lyase  30.95 
 
 		 336 aa  139  1e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.399769 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4517  conserved hypothetical protein TIGR00247  30.05 
 
 		 356 aa  139  1e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000911066  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2516  aminodeoxychorismate lyase  31.04 
 
 		 351 aa  138  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.470286  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2023  aminodeoxychorismate lyase  36.65 
 
 		 363 aa  138  2e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.309788  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4464  conserved hypothetical protein TIGR00247  30.05 
 
 		 356 aa  138  2e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000911703 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4280  hypothetical protein  30.05 
 
 		 356 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000498286  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4117  aminodeoxychorismate lyase  29.78 
 
 		 356 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000093714  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4376  aminodeoxychorismate lyase  31.49 
 
 		 362 aa  137  4e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0936456  normal  0.529135 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4128  aminodeoxychorismate lyase  29.78 
 
 		 356 aa  137  5e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000574197  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0650  periplasmic solute-binding protein, aminodeoxychorismate lyase-like  28.45 
 
 		 356 aa  137  5e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.368295  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4612  hypothetical protein  31.09 
 
 		 351 aa  137  5e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000312577  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0204  aminodeoxychorismate lyase  38.29 
 
 		 314 aa  137  6.0000000000000005e-31  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4231  aminodeoxychorismate lyase  29.78 
 
 		 356 aa  136  7.000000000000001e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000711244  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1472  aminodeoxychorismate lyase  31.77 
 
 		 424 aa  136  8e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.120948  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1582  hypothetical protein  30.56 
 
 		 341 aa  135  9.999999999999999e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000314961  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3494  hypothetical protein  30.81 
 
 		 363 aa  135  9.999999999999999e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000556203  normal  0.010619 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2275  aminodeoxychorismate lyase  30.74 
 
 		 349 aa  135  1.9999999999999998e-30  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0030  aminodeoxychorismate lyase  29.32 
 
 		 349 aa  135  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.647846  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05820  aminodeoxychorismate lyase  29.65 
 
 		 337 aa  135  1.9999999999999998e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0160306  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0732  hypothetical protein TIGR00247  29.78 
 
 		 356 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000024462  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1690  aminodeoxychorismate lyase  30.65 
 
 		 341 aa  134  3.9999999999999996e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0437285  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0466  hypothetical protein  31.89 
 
 		 438 aa  134  3.9999999999999996e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.262236  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4504  conserved hypothetical protein TIGR00247  29.51 
 
 		 356 aa  134  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0462  hypothetical protein  32.82 
 
 		 412 aa  133  6e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.218984  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1532  hypothetical protein  32.31 
 
 		 414 aa  133  6e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0269325  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3481  aminodeoxychorismate lyase  28.81 
 
 		 418 aa  133  7.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.114938  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2198  aminodeoxychorismate lyase  31.34 
 
 		 331 aa  132  9e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.955684 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1765  aminodeoxychorismate lyase  29.59 
 
 		 391 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.310683  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0748  aminodeoxychorismate lyase  32.8 
 
 		 399 aa  132  1.0000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.309418  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2733  aminodeoxychorismate lyase  31.45 
 
 		 337 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.269056  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2534  aminodeoxychorismate lyase  29.87 
 
 		 339 aa  130  3e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.714245  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1543  hypothetical protein  30.31 
 
 		 340 aa  130  4.0000000000000003e-29  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1910  aminodeoxychorismate lyase  30.66 
 
 		 341 aa  130  4.0000000000000003e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000953369  decreased coverage  0.000000738863 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2303  aminodeoxychorismate lyase  29.89 
 
 		 422 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0207028  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0694  aminodeoxychorismate lyase  30.16 
 
 		 327 aa  130  4.0000000000000003e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000296609 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0574  aminodeoxychorismate lyase  31.86 
 
 		 403 aa  130  4.0000000000000003e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0953  aminodeoxychorismate lyase  33.33 
 
 		 335 aa  130  5.0000000000000004e-29  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.316253  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1691  aminodeoxychorismate lyase  33.87 
 
 		 376 aa  130  6e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.527988  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0682  aminodeoxychorismate lyase  29.28 
 
 		 333 aa  130  6e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0424367  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0308  aminodeoxychorismate lyase  30.99 
 
 		 440 aa  129  9.000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1988  aminodeoxychorismate lyase  29.63 
 
 		 345 aa  129  1.0000000000000001e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2137  aminodeoxychorismate lyase  30.29 
 
 		 456 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000886776  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2044  aminodeoxychorismate lyase  31.72 
 
 		 385 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0389257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2803  aminodeoxychorismate lyase  30.68 
 
 		 339 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0153211  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1685  aminodeoxychorismate lyase  32.06 
 
 		 407 aa  128  2.0000000000000002e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1716  aminodeoxychorismate lyase  30.06 
 
 		 333 aa  129  2.0000000000000002e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.998027  normal  0.24374 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1661  aminodeoxychorismate lyase  32.69 
 
 		 341 aa  128  3e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.148869  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0531  aminodeoxychorismate lyase  29.2 
 
 		 464 aa  127  3e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.40268 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2350  aminodeoxychorismate lyase  29.81 
 
 		 416 aa  128  3e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0892  aminodeoxychorismate lyase  33.09 
 
 		 579 aa  127  3e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0855314 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1613  hypothetical protein  30.61 
 
 		 600 aa  127  4.0000000000000003e-28  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1578  hypothetical protein  31.2 
 
 		 343 aa  127  5e-28  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00227984  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2470  aminodeoxychorismate lyase  28.77 
 
 		 415 aa  127  5e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.16603  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2976  aminodeoxychorismate lyase  29.74 
 
 		 425 aa  127  5e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.202928 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0495  aminodeoxychorismate lyase  29.65 
 
 		 467 aa  127  5e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.843817  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0560  aminodeoxychorismate lyase  29.65 
 
 		 467 aa  127  6e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.133777  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2351  aminodeoxychorismate lyase  31.35 
 
 		 620 aa  126  6e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.260551 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>