More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE1543 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE1543  hypothetical protein  100 
 
 		 340 aa  689    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0732  hypothetical protein  38.3 
 
 		 343 aa  219  3.9999999999999997e-56  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1791  aminodeoxychorismate lyase  35.93 
 
 		 339 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00439567  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2459  aminodeoxychorismate lyase  37.2 
 
 		 344 aa  194  2e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.5911  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0871  aminodeoxychorismate lyase  39.12 
 
 		 339 aa  193  3e-48  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1637  aminodeoxychorismate lyase  39.26 
 
 		 352 aa  187  2e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.521882 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0918  aminodeoxychorismate lyase  34.74 
 
 		 345 aa  186  6e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.174013  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05820  aminodeoxychorismate lyase  36.21 
 
 		 337 aa  182  8.000000000000001e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0160306  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2122  aminodeoxychorismate lyase  35.26 
 
 		 340 aa  181  1e-44  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0557  aminodeoxychorismate lyase  33.54 
 
 		 326 aa  179  8e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.245938  normal  0.0550645 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2905  aminodeoxychorismate lyase  34.24 
 
 		 337 aa  177  2e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2514  aminodeoxychorismate lyase  32.82 
 
 		 337 aa  177  3e-43  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.636222  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2486  aminodeoxychorismate lyase  33.8 
 
 		 364 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00502838  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1497  aminodeoxychorismate lyase  38.26 
 
 		 351 aa  171  1e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2262  aminodeoxychorismate lyase  33.74 
 
 		 344 aa  171  2e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.945495  hitchhiker  0.000317634 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2026  hypothetical protein  33.74 
 
 		 333 aa  171  2e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0484  aminodeoxychorismate lyase  32.8 
 
 		 335 aa  171  2e-41  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0473  periplasmic solute-binding protein  33.14 
 
 		 345 aa  171  2e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0206414  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1776  aminodeoxychorismate lyase  34.97 
 
 		 355 aa  167  2.9999999999999998e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.81136  normal  0.183273 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0733  aminodeoxychorismate lyase  35.15 
 
 		 335 aa  167  2.9999999999999998e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.224262  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2516  aminodeoxychorismate lyase  34.09 
 
 		 351 aa  167  2.9999999999999998e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.470286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0625  aminodeoxychorismate lyase  34.34 
 
 		 357 aa  165  1.0000000000000001e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0512441  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1435  aminodeoxychorismate lyase  33.13 
 
 		 344 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1743  hypothetical protein  33.02 
 
 		 333 aa  164  2.0000000000000002e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2275  aminodeoxychorismate lyase  35.17 
 
 		 349 aa  163  3e-39  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1410  aminodeoxychorismate lyase  32.92 
 
 		 347 aa  163  4.0000000000000004e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0650  periplasmic solute-binding protein, aminodeoxychorismate lyase-like  34.24 
 
 		 356 aa  163  5.0000000000000005e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.368295  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4231  aminodeoxychorismate lyase  32.21 
 
 		 356 aa  162  7e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000711244  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3559  aminodeoxychorismate lyase  35.47 
 
 		 341 aa  162  7e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000155777  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2351  aminodeoxychorismate lyase  34.85 
 
 		 620 aa  162  1e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.260551 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0900  aminodeoxychorismate lyase  35.23 
 
 		 338 aa  161  1e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1090  aminodeoxychorismate lyase  32.33 
 
 		 331 aa  161  1e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1578  aminodeoxychorismate lyase  33.53 
 
 		 335 aa  160  2e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.853067  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4517  conserved hypothetical protein TIGR00247  31.93 
 
 		 356 aa  159  5e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000911066  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0030  aminodeoxychorismate lyase  32.82 
 
 		 349 aa  159  5e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.647846  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0966  aminodeoxychorismate lyase  33.53 
 
 		 363 aa  159  9e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1361  aminodeoxychorismate lyase  36.05 
 
 		 370 aa  158  1e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0615754  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0508  hypothetical protein  34.13 
 
 		 340 aa  157  2e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4128  aminodeoxychorismate lyase  31.93 
 
 		 356 aa  157  2e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000574197  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4464  conserved hypothetical protein TIGR00247  31.93 
 
 		 356 aa  158  2e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000911703 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3279  aminodeoxychorismate lyase  33.95 
 
 		 376 aa  157  3e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.258116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05120  conserved hypothetical protein TIGR00247  34.53 
 
 		 403 aa  156  4e-37  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.924204  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4612  hypothetical protein  31.93 
 
 		 351 aa  156  4e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000312577  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4117  aminodeoxychorismate lyase  31.93 
 
 		 356 aa  156  5.0000000000000005e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000093714  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0308  aminodeoxychorismate lyase  33.65 
 
 		 440 aa  156  5.0000000000000005e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1129  aminodeoxychorismate lyase  36.36 
 
 		 336 aa  155  8e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.399769 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07820  conserved hypothetical protein TIGR00247  34 
 
 		 389 aa  154  2e-36  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0223518 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4280  hypothetical protein  31.65 
 
 		 356 aa  154  2e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000498286  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4504  conserved hypothetical protein TIGR00247  31.65 
 
 		 356 aa  154  2e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4376  aminodeoxychorismate lyase  34.98 
 
 		 362 aa  153  2.9999999999999998e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0936456  normal  0.529135 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0732  hypothetical protein TIGR00247  31.37 
 
 		 356 aa  153  4e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000024462  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0908  aminodeoxychorismate lyase  31.35 
 
 		 329 aa  153  4e-36  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.112601  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2534  aminodeoxychorismate lyase  32.75 
 
 		 339 aa  153  5e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.714245  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2733  aminodeoxychorismate lyase  31.83 
 
 		 337 aa  152  7e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.269056  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3021  aminodeoxychorismate lyase  31.36 
 
 		 358 aa  151  1e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.157507  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1501  aminodeoxychorismate lyase  29.7 
 
 		 334 aa  151  1e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00653214  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1837  aminodeoxychorismate lyase  34.58 
 
 		 360 aa  151  1e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0045  aminodeoxychorismate lyase  34.05 
 
 		 336 aa  151  2e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.266308  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0204  aminodeoxychorismate lyase  32.96 
 
 		 314 aa  150  4e-35  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4657  aminodeoxychorismate lyase  30.28 
 
 		 362 aa  149  5e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.333524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3618  aminodeoxychorismate lyase  32.03 
 
 		 362 aa  149  5e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000276729  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1910  aminodeoxychorismate lyase  33.82 
 
 		 341 aa  149  9e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000953369  decreased coverage  0.000000738863 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1008  aminodeoxychorismate lyase  31.64 
 
 		 373 aa  148  1.0000000000000001e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00821655  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1605  aminodeoxychorismate lyase  29.49 
 
 		 339 aa  148  1.0000000000000001e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0288124  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2118  aminodeoxychorismate lyase  33.44 
 
 		 312 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0134865  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2268  aminodeoxychorismate lyase  31.21 
 
 		 347 aa  147  4.0000000000000006e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3097  aminodeoxychorismate lyase  30.94 
 
 		 355 aa  146  5e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00109006  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1532  hypothetical protein  34.35 
 
 		 414 aa  146  6e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0269325  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1231  aminodeoxychorismate lyase  34.47 
 
 		 343 aa  145  8.000000000000001e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2044  hypothetical protein  33.55 
 
 		 324 aa  145  1e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.47923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1472  aminodeoxychorismate lyase  35.05 
 
 		 424 aa  144  2e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.120948  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0315  aminodeoxychorismate lyase  33.21 
 
 		 389 aa  144  2e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1919  aminodeoxychorismate lyase  30.57 
 
 		 363 aa  144  2e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.402452  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0574  aminodeoxychorismate lyase  34.68 
 
 		 403 aa  144  3e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3387  aminodeoxychorismate lyase  29.39 
 
 		 329 aa  144  3e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.107935  normal  0.0743499 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1632  aminodeoxychorismate lyase  28.9 
 
 		 351 aa  142  7e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1203  aminodeoxychorismate lyase  32.73 
 
 		 405 aa  142  8e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00148773 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2023  aminodeoxychorismate lyase  31.29 
 
 		 363 aa  142  8e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.309788  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2198  aminodeoxychorismate lyase  29.55 
 
 		 331 aa  142  9.999999999999999e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.955684 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2634  aminodeoxychorismate lyase  33.79 
 
 		 343 aa  142  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1328  aminodeoxychorismate lyase  32.02 
 
 		 372 aa  141  9.999999999999999e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0484668  normal  0.302335 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0005  aminodeoxychorismate lyase  30.82 
 
 		 327 aa  142  9.999999999999999e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000992333  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0748  aminodeoxychorismate lyase  36.27 
 
 		 399 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.309418  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2728  aminodeoxychorismate lyase  33.79 
 
 		 343 aa  140  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1716  aminodeoxychorismate lyase  30.29 
 
 		 333 aa  140  3e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.998027  normal  0.24374 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0694  aminodeoxychorismate lyase  29.5 
 
 		 327 aa  140  3e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000296609 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2504  aminodeoxychorismate lyase  29.64 
 
 		 337 aa  140  3.9999999999999997e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.917927  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2301  hypothetical protein  35.59 
 
 		 337 aa  140  3.9999999999999997e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.142743  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0462  hypothetical protein  35.81 
 
 		 412 aa  139  6e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.218984  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25730  hypothetical protein  29.38 
 
 		 349 aa  139  7e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0867332  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1591  aminodeoxychorismate lyase  31.07 
 
 		 343 aa  139  7.999999999999999e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0649717  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1060  aminodeoxychorismate lyase  31.93 
 
 		 412 aa  139  7.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.017221 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0682  aminodeoxychorismate lyase  29.97 
 
 		 333 aa  139  7.999999999999999e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0424367  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2296  aminodeoxychorismate lyase  31.6 
 
 		 599 aa  139  8.999999999999999e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0892  aminodeoxychorismate lyase  32.93 
 
 		 579 aa  139  8.999999999999999e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0855314 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1830  aminodeoxychorismate lyase  29.07 
 
 		 342 aa  138  1e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0466  hypothetical protein  35.69 
 
 		 438 aa  138  1e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.262236  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1863  aminodeoxychorismate lyase  28.4 
 
 		 356 aa  138  1e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.322444  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3494  hypothetical protein  32.25 
 
 		 363 aa  137  2e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000556203  normal  0.010619 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1690  aminodeoxychorismate lyase  31.78 
 
 		 341 aa  137  2e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0437285  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>