More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_2137 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_2137  aminodeoxychorismate lyase  100 
 
 
456 aa  932    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000886776  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2068  putative integral membrane protein  43.14 
 
 
685 aa  290  4e-77  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0278273  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3156  aminodeoxychorismate lyase  46.39 
 
 
536 aa  287  2e-76  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.489263  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2044  aminodeoxychorismate lyase  46.01 
 
 
385 aa  286  5.999999999999999e-76  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0389257  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2045  aminodeoxychorismate lyase  43.65 
 
 
342 aa  267  2.9999999999999995e-70  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0393494  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1328  aminodeoxychorismate lyase  40.7 
 
 
372 aa  257  4e-67  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0484668  normal  0.302335 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6091  aminodeoxychorismate lyase  42.5 
 
 
387 aa  252  9.000000000000001e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.384921  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3073  aminodeoxychorismate lyase  41.42 
 
 
456 aa  241  2e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.658866  normal  0.521991 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16340  predicted periplasmic solute-binding protein  39.69 
 
 
390 aa  228  2e-58  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2409  aminodeoxychorismate lyase  38.48 
 
 
397 aa  224  2e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.105419  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1349  aminodeoxychorismate lyase  37.03 
 
 
397 aa  211  3e-53  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1696  aminodeoxychorismate lyase  40.91 
 
 
468 aa  209  8e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.255824  normal  0.195294 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3212  aminodeoxychorismate lyase  38.67 
 
 
413 aa  207  2e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0548102  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12530  predicted periplasmic solute-binding protein  37.82 
 
 
368 aa  208  2e-52  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00811784  normal  0.477009 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3030  aminodeoxychorismate lyase  43.46 
 
 
368 aa  201  1.9999999999999998e-50  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1830  aminodeoxychorismate lyase  36.58 
 
 
401 aa  196  6e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.194696  normal  0.869905 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1820  aminodeoxychorismate lyase  36.69 
 
 
401 aa  196  1e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.111847  normal  0.624649 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1821  aminodeoxychorismate lyase  37.46 
 
 
401 aa  195  2e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000914518 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0845  periplasmic solute-binding protein-like protein  42.8 
 
 
320 aa  194  4e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0614  aminodeoxychorismate lyase  35.35 
 
 
393 aa  186  5e-46  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.415027  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12574  hypothetical protein  31.34 
 
 
417 aa  180  5.999999999999999e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00172093  normal  0.0835034 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3876  aminodeoxychorismate lyase  34.31 
 
 
395 aa  171  2e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1692  aminodeoxychorismate lyase  36.25 
 
 
382 aa  171  3e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5263  aminodeoxychorismate lyase  32.31 
 
 
409 aa  169  7e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1691  aminodeoxychorismate lyase  33.72 
 
 
376 aa  169  9e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.527988  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2016  aminodeoxychorismate lyase  32.39 
 
 
407 aa  169  1e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.658321  normal  0.0585657 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17720  predicted periplasmic solute-binding protein  33.64 
 
 
395 aa  162  1e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.412389  normal  0.31092 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2389  aminodeoxychorismate lyase  29.27 
 
 
415 aa  160  5e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0575785 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2348  aminodeoxychorismate lyase  29.27 
 
 
415 aa  160  5e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.776778  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2395  aminodeoxychorismate lyase  29.27 
 
 
415 aa  160  5e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.178925 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12700  predicted periplasmic solute-binding protein  31.34 
 
 
422 aa  159  1e-37  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0377  conserved hypothetical protein, YceG family  31.49 
 
 
396 aa  159  1e-37  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15290  predicted periplasmic solute-binding protein  30.35 
 
 
493 aa  155  1e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.444068  normal  0.602564 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3761  aminodeoxychorismate lyase  29.48 
 
 
415 aa  155  1e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.37487 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3295  aminodeoxychorismate lyase  30.42 
 
 
434 aa  155  1e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000545955  normal  0.0867897 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2642  aminodeoxychorismate lyase  29.5 
 
 
415 aa  151  2e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2905  aminodeoxychorismate lyase  32.53 
 
 
337 aa  150  4e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2459  aminodeoxychorismate lyase  35.21 
 
 
344 aa  149  8e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.5911  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0966  aminodeoxychorismate lyase  31.73 
 
 
363 aa  148  2.0000000000000003e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05820  aminodeoxychorismate lyase  30.99 
 
 
337 aa  148  2.0000000000000003e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0160306  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2122  aminodeoxychorismate lyase  33.64 
 
 
340 aa  144  3e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3021  aminodeoxychorismate lyase  31.41 
 
 
358 aa  144  3e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.157507  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2514  aminodeoxychorismate lyase  31.34 
 
 
337 aa  144  3e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.636222  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3618  aminodeoxychorismate lyase  37.56 
 
 
362 aa  144  3e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000276729  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2013  aminodeoxychorismate lyase  28.47 
 
 
588 aa  143  8e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000282457 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0459  aminodeoxychorismate lyase  28.97 
 
 
451 aa  142  9.999999999999999e-33  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1977  aminodeoxychorismate lyase  29.93 
 
 
418 aa  142  9.999999999999999e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.337407  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2275  aminodeoxychorismate lyase  30.81 
 
 
349 aa  141  1.9999999999999998e-32  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0900  aminodeoxychorismate lyase  29.91 
 
 
338 aa  142  1.9999999999999998e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2276  aminodeoxychorismate lyase  28.96 
 
 
485 aa  141  1.9999999999999998e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.204886  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2262  aminodeoxychorismate lyase  29.37 
 
 
344 aa  140  3e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.945495  hitchhiker  0.000317634 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2322  aminodeoxychorismate lyase  28.69 
 
 
587 aa  140  3.9999999999999997e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.284127  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1435  aminodeoxychorismate lyase  28.95 
 
 
344 aa  140  4.999999999999999e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1361  aminodeoxychorismate lyase  29.3 
 
 
370 aa  139  8.999999999999999e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0615754  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0918  aminodeoxychorismate lyase  30.15 
 
 
345 aa  139  2e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.174013  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1410  aminodeoxychorismate lyase  29.8 
 
 
347 aa  137  4e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1637  aminodeoxychorismate lyase  30 
 
 
352 aa  137  5e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.521882 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3559  aminodeoxychorismate lyase  27.94 
 
 
341 aa  137  6.0000000000000005e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000155777  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0045  aminodeoxychorismate lyase  29.45 
 
 
336 aa  136  9.999999999999999e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.266308  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17710  predicted periplasmic solute-binding protein  33.33 
 
 
388 aa  135  1.9999999999999998e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0437467  normal  0.304384 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1837  aminodeoxychorismate lyase  31.15 
 
 
360 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0650  periplasmic solute-binding protein, aminodeoxychorismate lyase-like  31.89 
 
 
356 aa  134  3e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.368295  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1497  aminodeoxychorismate lyase  29.3 
 
 
351 aa  134  3e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2486  aminodeoxychorismate lyase  31.51 
 
 
364 aa  133  7.999999999999999e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00502838  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2026  hypothetical protein  30.58 
 
 
333 aa  132  1.0000000000000001e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2380  aminodeoxychorismate lyase  28.49 
 
 
691 aa  132  1.0000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2733  aminodeoxychorismate lyase  31.31 
 
 
337 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.269056  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2534  aminodeoxychorismate lyase  28.57 
 
 
339 aa  130  6e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.714245  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0508  hypothetical protein  32.91 
 
 
340 aa  130  7.000000000000001e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2950  aminodeoxychorismate lyase  32.34 
 
 
353 aa  130  7.000000000000001e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0315  aminodeoxychorismate lyase  31.11 
 
 
389 aa  127  4.0000000000000003e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07820  conserved hypothetical protein TIGR00247  29.97 
 
 
389 aa  126  7e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0223518 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0842  aminodeoxychorismate lyase  30.77 
 
 
327 aa  125  1e-27  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0834555 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1743  hypothetical protein  28.78 
 
 
333 aa  125  1e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0288  aminodeoxychorismate lyase  26.85 
 
 
658 aa  125  1e-27  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1008  aminodeoxychorismate lyase  30.35 
 
 
373 aa  125  2e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00821655  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2351  aminodeoxychorismate lyase  30.38 
 
 
620 aa  125  2e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.260551 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0953  aminodeoxychorismate lyase  40.4 
 
 
335 aa  124  3e-27  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.316253  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0484  aminodeoxychorismate lyase  30.29 
 
 
335 aa  124  3e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0625  aminodeoxychorismate lyase  29.62 
 
 
357 aa  124  3e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0512441  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1090  aminodeoxychorismate lyase  32.11 
 
 
331 aa  124  4e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0682  aminodeoxychorismate lyase  30.69 
 
 
333 aa  124  5e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0424367  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0225  aminodeoxychorismate lyase  30.27 
 
 
322 aa  123  5e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.58497  normal  0.0291883 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4657  aminodeoxychorismate lyase  27.25 
 
 
362 aa  123  5e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.333524  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4144  aminodeoxychorismate lyase  30 
 
 
409 aa  124  5e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0208419  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2516  aminodeoxychorismate lyase  31.01 
 
 
351 aa  122  9e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.470286  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1129  aminodeoxychorismate lyase  31.02 
 
 
336 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.399769 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0871  aminodeoxychorismate lyase  27.68 
 
 
339 aa  120  4.9999999999999996e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0694  aminodeoxychorismate lyase  28.8 
 
 
327 aa  119  7.999999999999999e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000296609 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1543  hypothetical protein  29.87 
 
 
340 aa  118  1.9999999999999998e-25  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4231  aminodeoxychorismate lyase  29.88 
 
 
356 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000711244  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1563  aminodeoxychorismate lyase  28.73 
 
 
369 aa  118  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3279  aminodeoxychorismate lyase  27.81 
 
 
376 aa  118  1.9999999999999998e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.258116  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1472  aminodeoxychorismate lyase  29.45 
 
 
424 aa  118  3e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.120948  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4117  aminodeoxychorismate lyase  27.51 
 
 
356 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000093714  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4128  aminodeoxychorismate lyase  27.73 
 
 
356 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000574197  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2044  hypothetical protein  29.74 
 
 
324 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.47923  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3036  aminodeoxychorismate lyase  28.3 
 
 
623 aa  117  3.9999999999999997e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0256494  normal  0.08592 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3414  aminodeoxychorismate lyase  28.73 
 
 
369 aa  117  6e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0388714  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4517  conserved hypothetical protein TIGR00247  27.47 
 
 
356 aa  116  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000911066  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>