More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_2016 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_2016  aminodeoxychorismate lyase  100 
 
 		 407 aa  816    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.658321  normal  0.0585657 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1820  aminodeoxychorismate lyase  42.24 
 
 		 401 aa  248  1e-64  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.111847  normal  0.624649 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1692  aminodeoxychorismate lyase  46.79 
 
 		 382 aa  248  2e-64  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16340  predicted periplasmic solute-binding protein  40.45 
 
 		 390 aa  219  7e-56  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1691  aminodeoxychorismate lyase  42.86 
 
 		 376 aa  217  2.9999999999999998e-55  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.527988  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17720  predicted periplasmic solute-binding protein  41.54 
 
 		 395 aa  211  2e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.412389  normal  0.31092 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3156  aminodeoxychorismate lyase  40.13 
 
 		 536 aa  204  2e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.489263  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0614  aminodeoxychorismate lyase  36.09 
 
 		 393 aa  203  5e-51  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.415027  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0377  conserved hypothetical protein, YceG family  32.63 
 
 		 396 aa  197  3e-49  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17710  predicted periplasmic solute-binding protein  37.97 
 
 		 388 aa  197  3e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0437467  normal  0.304384 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6091  aminodeoxychorismate lyase  39.63 
 
 		 387 aa  195  1e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.384921  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2409  aminodeoxychorismate lyase  36.16 
 
 		 397 aa  193  4e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.105419  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2068  putative integral membrane protein  36.7 
 
 		 685 aa  193  5e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0278273  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2044  aminodeoxychorismate lyase  36.88 
 
 		 385 aa  190  4e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0389257  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1328  aminodeoxychorismate lyase  38.2 
 
 		 372 aa  190  4e-47  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0484668  normal  0.302335 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2045  aminodeoxychorismate lyase  35.76 
 
 		 342 aa  186  7e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0393494  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1349  aminodeoxychorismate lyase  34.02 
 
 		 397 aa  185  1.0000000000000001e-45  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3030  aminodeoxychorismate lyase  40.42 
 
 		 368 aa  182  9.000000000000001e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2348  aminodeoxychorismate lyase  35.95 
 
 		 415 aa  176  5e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.776778  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2395  aminodeoxychorismate lyase  35.95 
 
 		 415 aa  176  5e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.178925 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2389  aminodeoxychorismate lyase  35.95 
 
 		 415 aa  176  5e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0575785 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1696  aminodeoxychorismate lyase  38.55 
 
 		 468 aa  173  5.999999999999999e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.255824  normal  0.195294 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12530  predicted periplasmic solute-binding protein  33.7 
 
 		 368 aa  169  1e-40  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00811784  normal  0.477009 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2642  aminodeoxychorismate lyase  36.76 
 
 		 415 aa  168  2e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3761  aminodeoxychorismate lyase  35.71 
 
 		 415 aa  167  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.37487 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2013  aminodeoxychorismate lyase  32.66 
 
 		 588 aa  166  8e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000282457 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3212  aminodeoxychorismate lyase  39.18 
 
 		 413 aa  165  1.0000000000000001e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0548102  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3876  aminodeoxychorismate lyase  33.94 
 
 		 395 aa  164  2.0000000000000002e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2276  aminodeoxychorismate lyase  31.7 
 
 		 485 aa  161  2e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.204886  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2137  aminodeoxychorismate lyase  33.23 
 
 		 456 aa  157  3e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000886776  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1830  aminodeoxychorismate lyase  36.25 
 
 		 401 aa  157  4e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.194696  normal  0.869905 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12574  hypothetical protein  32.99 
 
 		 417 aa  154  2e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00172093  normal  0.0835034 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1821  aminodeoxychorismate lyase  34.69 
 
 		 401 aa  153  5.9999999999999996e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000914518 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5263  aminodeoxychorismate lyase  30.37 
 
 		 409 aa  148  2.0000000000000003e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12700  predicted periplasmic solute-binding protein  32.76 
 
 		 422 aa  144  4e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3073  aminodeoxychorismate lyase  31.69 
 
 		 456 aa  141  1.9999999999999998e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.658866  normal  0.521991 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15290  predicted periplasmic solute-binding protein  33.42 
 
 		 493 aa  133  5e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.444068  normal  0.602564 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0845  periplasmic solute-binding protein-like protein  37.02 
 
 		 320 aa  129  8.000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3295  aminodeoxychorismate lyase  31.27 
 
 		 434 aa  126  7e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000545955  normal  0.0867897 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1977  aminodeoxychorismate lyase  31.66 
 
 		 418 aa  122  9.999999999999999e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.337407  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0459  aminodeoxychorismate lyase  28.69 
 
 		 451 aa  119  7.999999999999999e-26  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2026  hypothetical protein  26.94 
 
 		 333 aa  114  2.0000000000000002e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1743  hypothetical protein  26.39 
 
 		 333 aa  113  6e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1361  aminodeoxychorismate lyase  32.24 
 
 		 370 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0615754  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4517  conserved hypothetical protein TIGR00247  26.7 
 
 		 356 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000911066  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4144  aminodeoxychorismate lyase  30.87 
 
 		 409 aa  112  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0208419  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4128  aminodeoxychorismate lyase  27.25 
 
 		 356 aa  111  3e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000574197  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0900  aminodeoxychorismate lyase  31.12 
 
 		 338 aa  110  6e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2380  aminodeoxychorismate lyase  28.73 
 
 		 691 aa  109  7.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4464  conserved hypothetical protein TIGR00247  26.98 
 
 		 356 aa  108  1e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000911703 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4280  hypothetical protein  26.98 
 
 		 356 aa  107  3e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000498286  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4612  hypothetical protein  26.98 
 
 		 351 aa  108  3e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000312577  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2322  aminodeoxychorismate lyase  30.96 
 
 		 587 aa  107  3e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.284127  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4117  aminodeoxychorismate lyase  26.98 
 
 		 356 aa  107  4e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000093714  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1060  aminodeoxychorismate lyase  26.74 
 
 		 412 aa  107  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.017221 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0288  aminodeoxychorismate lyase  26.22 
 
 		 658 aa  106  8e-22  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0733  aminodeoxychorismate lyase  27.15 
 
 		 335 aa  105  1e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.224262  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3559  aminodeoxychorismate lyase  26.65 
 
 		 341 aa  105  1e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000155777  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1203  aminodeoxychorismate lyase  26.74 
 
 		 405 aa  105  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00148773 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4536  aminodeoxychorismate lyase  35.51 
 
 		 371 aa  104  2e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4504  conserved hypothetical protein TIGR00247  26.43 
 
 		 356 aa  105  2e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0732  hypothetical protein TIGR00247  26.43 
 
 		 356 aa  104  2e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000024462  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07820  conserved hypothetical protein TIGR00247  30.82 
 
 		 389 aa  103  5e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0223518 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4231  aminodeoxychorismate lyase  26.16 
 
 		 356 aa  103  6e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000711244  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2303  aminodeoxychorismate lyase  29.86 
 
 		 422 aa  103  6e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0207028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05120  conserved hypothetical protein TIGR00247  30.8 
 
 		 403 aa  102  8e-21  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.924204  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2055  aminodeoxychorismate lyase  31.76 
 
 		 407 aa  102  9e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0125  aminodeoxychorismate lyase  30.62 
 
 		 393 aa  102  2e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000881139  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3036  aminodeoxychorismate lyase  31.27 
 
 		 623 aa  102  2e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0256494  normal  0.08592 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0495  aminodeoxychorismate lyase  29.38 
 
 		 467 aa  100  3e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.843817  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0560  aminodeoxychorismate lyase  29.38 
 
 		 467 aa  100  3e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.133777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0966  aminodeoxychorismate lyase  28.29 
 
 		 363 aa  100  6e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3097  aminodeoxychorismate lyase  25.61 
 
 		 355 aa  99.8  7e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00109006  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2976  aminodeoxychorismate lyase  27.46 
 
 		 425 aa  99  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.202928 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2350  aminodeoxychorismate lyase  27.42 
 
 		 416 aa  99  1e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1637  aminodeoxychorismate lyase  29.02 
 
 		 352 aa  97.8  3e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.521882 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1837  aminodeoxychorismate lyase  28.57 
 
 		 360 aa  96.7  6e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0918  aminodeoxychorismate lyase  29.17 
 
 		 345 aa  96.3  8e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.174013  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1765  aminodeoxychorismate lyase  27.86 
 
 		 391 aa  96.3  9e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.310683  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1685  aminodeoxychorismate lyase  26.78 
 
 		 407 aa  95.9  1e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2486  aminodeoxychorismate lyase  26.87 
 
 		 364 aa  95.1  2e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00502838  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4657  aminodeoxychorismate lyase  25.77 
 
 		 362 aa  94.7  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.333524  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0871  aminodeoxychorismate lyase  23.85 
 
 		 339 aa  94  4e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1830  aminodeoxychorismate lyase  29.28 
 
 		 342 aa  93.6  6e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3821  hypothetical protein  27.03 
 
 		 406 aa  93.6  6e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.133528 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0625  aminodeoxychorismate lyase  29.71 
 
 		 357 aa  92.4  1e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0512441  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0842  aminodeoxychorismate lyase  28.07 
 
 		 327 aa  92.4  1e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0834555 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0607  hypothetical protein  25.27 
 
 		 370 aa  92.8  1e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000669467  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0225  aminodeoxychorismate lyase  29.55 
 
 		 322 aa  92.8  1e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.58497  normal  0.0291883 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1776  aminodeoxychorismate lyase  30.39 
 
 		 355 aa  91.7  2e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.81136  normal  0.183273 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0953  aminodeoxychorismate lyase  30.26 
 
 		 335 aa  91.7  2e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.316253  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2783  aminodeoxychorismate lyase  29 
 
 		 456 aa  92  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0417  aminodeoxychorismate lyase  29.48 
 
 		 331 aa  91.7  2e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3717  aminodeoxychorismate lyase  31.74 
 
 		 471 aa  91.7  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.444196  normal  0.13956 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0531  aminodeoxychorismate lyase  29.01 
 
 		 464 aa  91.3  3e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.40268 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2803  aminodeoxychorismate lyase  26.72 
 
 		 339 aa  91.3  3e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0153211  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2470  aminodeoxychorismate lyase  28.21 
 
 		 415 aa  91.3  3e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.16603  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3481  aminodeoxychorismate lyase  27.22 
 
 		 418 aa  90.9  4e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.114938  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3021  aminodeoxychorismate lyase  27.48 
 
 		 358 aa  90.9  4e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.157507  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1218  aminodeoxychorismate lyase  28.34 
 
 		 348 aa  90.5  5e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.319435 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>