More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_3876 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_3876  aminodeoxychorismate lyase  100 
 
 		 395 aa  809    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1830  aminodeoxychorismate lyase  49.48 
 
 		 401 aa  335  1e-90  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.194696  normal  0.869905 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1821  aminodeoxychorismate lyase  50.72 
 
 		 401 aa  333  3e-90  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000914518 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3156  aminodeoxychorismate lyase  41.21 
 
 		 536 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.489263  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2068  putative integral membrane protein  36.66 
 
 		 685 aa  199  6e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0278273  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2044  aminodeoxychorismate lyase  35.88 
 
 		 385 aa  193  4e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0389257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6091  aminodeoxychorismate lyase  39.32 
 
 		 387 aa  190  4e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.384921  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1328  aminodeoxychorismate lyase  35.03 
 
 		 372 aa  185  1.0000000000000001e-45  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0484668  normal  0.302335 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2045  aminodeoxychorismate lyase  36.45 
 
 		 342 aa  181  2e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0393494  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2348  aminodeoxychorismate lyase  34.6 
 
 		 415 aa  180  4e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.776778  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2389  aminodeoxychorismate lyase  34.6 
 
 		 415 aa  180  4e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0575785 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2395  aminodeoxychorismate lyase  34.6 
 
 		 415 aa  180  4e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.178925 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2409  aminodeoxychorismate lyase  35.13 
 
 		 397 aa  173  5e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.105419  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16340  predicted periplasmic solute-binding protein  34.44 
 
 		 390 aa  170  4e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3761  aminodeoxychorismate lyase  32.63 
 
 		 415 aa  169  7e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.37487 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2016  aminodeoxychorismate lyase  32.69 
 
 		 407 aa  168  2e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.658321  normal  0.0585657 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2642  aminodeoxychorismate lyase  32.8 
 
 		 415 aa  167  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2137  aminodeoxychorismate lyase  34.12 
 
 		 456 aa  163  5.0000000000000005e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000886776  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1820  aminodeoxychorismate lyase  34.25 
 
 		 401 aa  162  7e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.111847  normal  0.624649 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3295  aminodeoxychorismate lyase  31.7 
 
 		 434 aa  162  9e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000545955  normal  0.0867897 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12530  predicted periplasmic solute-binding protein  34.82 
 
 		 368 aa  161  2e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00811784  normal  0.477009 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12574  hypothetical protein  31.97 
 
 		 417 aa  160  3e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00172093  normal  0.0835034 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3073  aminodeoxychorismate lyase  33.53 
 
 		 456 aa  160  4e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.658866  normal  0.521991 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5263  aminodeoxychorismate lyase  31.25 
 
 		 409 aa  156  6e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15290  predicted periplasmic solute-binding protein  30.92 
 
 		 493 aa  155  1e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.444068  normal  0.602564 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1349  aminodeoxychorismate lyase  32.48 
 
 		 397 aa  154  2.9999999999999998e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3212  aminodeoxychorismate lyase  33.16 
 
 		 413 aa  149  6e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0548102  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0377  conserved hypothetical protein, YceG family  30.93 
 
 		 396 aa  149  7e-35  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1696  aminodeoxychorismate lyase  32.58 
 
 		 468 aa  149  1.0000000000000001e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.255824  normal  0.195294 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2322  aminodeoxychorismate lyase  29.09 
 
 		 587 aa  147  4.0000000000000006e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.284127  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0614  aminodeoxychorismate lyase  31.16 
 
 		 393 aa  147  5e-34  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.415027  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1691  aminodeoxychorismate lyase  32.34 
 
 		 376 aa  142  7e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.527988  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3030  aminodeoxychorismate lyase  34.38 
 
 		 368 aa  137  2e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17720  predicted periplasmic solute-binding protein  32.23 
 
 		 395 aa  138  2e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.412389  normal  0.31092 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2013  aminodeoxychorismate lyase  30.21 
 
 		 588 aa  137  3.0000000000000003e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000282457 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0845  periplasmic solute-binding protein-like protein  34.55 
 
 		 320 aa  136  8e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12700  predicted periplasmic solute-binding protein  29.65 
 
 		 422 aa  135  9.999999999999999e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1977  aminodeoxychorismate lyase  28.57 
 
 		 418 aa  135  9.999999999999999e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.337407  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1692  aminodeoxychorismate lyase  33.83 
 
 		 382 aa  133  3.9999999999999996e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4657  aminodeoxychorismate lyase  27.3 
 
 		 362 aa  125  2e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.333524  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1361  aminodeoxychorismate lyase  28.83 
 
 		 370 aa  119  7e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0615754  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1203  aminodeoxychorismate lyase  27.74 
 
 		 405 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00148773 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2276  aminodeoxychorismate lyase  27.88 
 
 		 485 aa  117  5e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.204886  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0288  aminodeoxychorismate lyase  27.23 
 
 		 658 aa  116  6e-25  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2055  aminodeoxychorismate lyase  27.11 
 
 		 407 aa  115  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3021  aminodeoxychorismate lyase  29.66 
 
 		 358 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.157507  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1060  aminodeoxychorismate lyase  27.92 
 
 		 412 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.017221 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1776  aminodeoxychorismate lyase  30.94 
 
 		 355 aa  113  5e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.81136  normal  0.183273 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4536  aminodeoxychorismate lyase  30.88 
 
 		 371 aa  113  6e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0459  aminodeoxychorismate lyase  24.75 
 
 		 451 aa  111  2.0000000000000002e-23  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1543  hypothetical protein  29.5 
 
 		 340 aa  110  4.0000000000000004e-23  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3036  aminodeoxychorismate lyase  28.65 
 
 		 623 aa  110  4.0000000000000004e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0256494  normal  0.08592 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3821  hypothetical protein  28.12 
 
 		 406 aa  110  5e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.133528 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2350  aminodeoxychorismate lyase  28.28 
 
 		 416 aa  110  6e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2351  aminodeoxychorismate lyase  28.33 
 
 		 620 aa  110  6e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.260551 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2380  aminodeoxychorismate lyase  28.57 
 
 		 691 aa  108  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0918  aminodeoxychorismate lyase  27.93 
 
 		 345 aa  108  2e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.174013  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2303  aminodeoxychorismate lyase  27.76 
 
 		 422 aa  108  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0207028  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0732  hypothetical protein TIGR00247  28.65 
 
 		 356 aa  107  3e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000024462  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0030  aminodeoxychorismate lyase  27.63 
 
 		 349 aa  107  3e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.647846  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1685  aminodeoxychorismate lyase  28.02 
 
 		 407 aa  107  3e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0748  aminodeoxychorismate lyase  27.89 
 
 		 399 aa  107  3e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.309418  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4504  conserved hypothetical protein TIGR00247  28.92 
 
 		 356 aa  107  4e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3134  aminodeoxychorismate lyase  29.62 
 
 		 442 aa  107  4e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.486263 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4128  aminodeoxychorismate lyase  29.41 
 
 		 356 aa  106  6e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000574197  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4280  hypothetical protein  28.88 
 
 		 356 aa  105  1e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000498286  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4612  hypothetical protein  28.88 
 
 		 351 aa  105  1e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000312577  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4517  conserved hypothetical protein TIGR00247  28.88 
 
 		 356 aa  105  1e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000911066  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0501  hypothetical protein  26.52 
 
 		 369 aa  105  1e-21  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0871  aminodeoxychorismate lyase  27.2 
 
 		 339 aa  105  1e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0308  aminodeoxychorismate lyase  26.55 
 
 		 440 aa  105  1e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4117  aminodeoxychorismate lyase  28.61 
 
 		 356 aa  104  2e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000093714  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05820  aminodeoxychorismate lyase  27.92 
 
 		 337 aa  105  2e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0160306  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4464  conserved hypothetical protein TIGR00247  29.14 
 
 		 356 aa  105  2e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000911703 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0900  aminodeoxychorismate lyase  26.78 
 
 		 338 aa  104  2e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4231  aminodeoxychorismate lyase  28.18 
 
 		 356 aa  105  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000711244  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0484  aminodeoxychorismate lyase  28.4 
 
 		 335 aa  104  3e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3097  aminodeoxychorismate lyase  27.25 
 
 		 355 aa  104  3e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00109006  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1613  hypothetical protein  30.37 
 
 		 600 aa  103  4e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2296  aminodeoxychorismate lyase  27.08 
 
 		 599 aa  103  4e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1633  hypothetical protein  28.65 
 
 		 355 aa  103  5e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.153927  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17710  predicted periplasmic solute-binding protein  29.88 
 
 		 388 aa  103  6e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0437467  normal  0.304384 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0733  aminodeoxychorismate lyase  29.09 
 
 		 335 aa  102  8e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.224262  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0508  hypothetical protein  29.43 
 
 		 340 aa  102  1e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1603  hypothetical protein  27.78 
 
 		 338 aa  102  1e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0141578  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05120  conserved hypothetical protein TIGR00247  28.07 
 
 		 403 aa  101  2e-20  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.924204  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0495  aminodeoxychorismate lyase  29.38 
 
 		 467 aa  100  6e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.843817  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0560  aminodeoxychorismate lyase  29.38 
 
 		 467 aa  100  6e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.133777  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0473  periplasmic solute-binding protein  25.75 
 
 		 345 aa  99.8  7e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0206414  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0732  hypothetical protein  25.89 
 
 		 343 aa  99.4  9e-20  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1501  aminodeoxychorismate lyase  29.48 
 
 		 334 aa  99  1e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00653214  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1765  aminodeoxychorismate lyase  26.53 
 
 		 391 aa  99.4  1e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.310683  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2903  aminodeoxychorismate lyase  30.42 
 
 		 392 aa  99  1e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.167786  normal  0.431828 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3481  aminodeoxychorismate lyase  27.7 
 
 		 418 aa  98.6  2e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.114938  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1651  hypothetical protein  36.51 
 
 		 371 aa  97.8  3e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.245799  normal  0.342253 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0315  aminodeoxychorismate lyase  27.25 
 
 		 389 aa  97.8  3e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1630  aminodeoxychorismate lyase  36.02 
 
 		 385 aa  97.4  3e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.118431  normal  0.589184 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4376  aminodeoxychorismate lyase  28.13 
 
 		 362 aa  97.8  3e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0936456  normal  0.529135 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1129  aminodeoxychorismate lyase  26.48 
 
 		 336 aa  97.4  4e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.399769 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2470  aminodeoxychorismate lyase  26.94 
 
 		 415 aa  97.4  4e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.16603  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>