More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0473 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0473  aminodeoxychorismate lyase  100 
 
 		 330 aa  650    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0117874  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0204  aminodeoxychorismate lyase  40.99 
 
 		 314 aa  205  7e-52  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2459  aminodeoxychorismate lyase  32.23 
 
 		 344 aa  163  3e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.5911  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0842  aminodeoxychorismate lyase  31.5 
 
 		 327 aa  160  2e-38  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0834555 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1497  aminodeoxychorismate lyase  37.3 
 
 		 351 aa  160  2e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0682  aminodeoxychorismate lyase  31.53 
 
 		 333 aa  160  2e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0424367  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1544  aminodeoxychorismate lyase  32.44 
 
 		 333 aa  160  3e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0483176  normal  0.0781021 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0694  aminodeoxychorismate lyase  33.45 
 
 		 327 aa  160  4e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000296609 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3618  aminodeoxychorismate lyase  31.39 
 
 		 362 aa  159  8e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000276729  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3279  aminodeoxychorismate lyase  32.78 
 
 		 376 aa  158  9e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.258116  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0508  hypothetical protein  31.74 
 
 		 340 aa  157  3e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05820  aminodeoxychorismate lyase  36.54 
 
 		 337 aa  157  3e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0160306  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1361  aminodeoxychorismate lyase  33.44 
 
 		 370 aa  155  1e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0615754  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1435  aminodeoxychorismate lyase  30.3 
 
 		 344 aa  155  1e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3021  aminodeoxychorismate lyase  29.57 
 
 		 358 aa  153  2.9999999999999998e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.157507  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1467  aminodeoxychorismate lyase  29.62 
 
 		 332 aa  152  1e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0630531  normal  0.0141986 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2023  aminodeoxychorismate lyase  32.69 
 
 		 363 aa  150  3e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.309788  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0484  aminodeoxychorismate lyase  32.66 
 
 		 335 aa  150  3e-35  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1871  aminodeoxychorismate lyase  27.74 
 
 		 336 aa  150  3e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1090  aminodeoxychorismate lyase  30.33 
 
 		 331 aa  150  3e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0650  periplasmic solute-binding protein, aminodeoxychorismate lyase-like  28.75 
 
 		 356 aa  150  4e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.368295  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1783  hypothetical protein  30.1 
 
 		 377 aa  149  5e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0308564  normal  0.608544 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1578  hypothetical protein  29.07 
 
 		 343 aa  148  1.0000000000000001e-34  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00227984  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0607  hypothetical protein  29.03 
 
 		 370 aa  147  2.0000000000000003e-34  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000669467  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1829  aminodeoxychorismate lyase  30.87 
 
 		 332 aa  147  3e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.021454  normal  0.121238 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0918  aminodeoxychorismate lyase  34.65 
 
 		 345 aa  146  5e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.174013  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1501  aminodeoxychorismate lyase  31.33 
 
 		 334 aa  145  8.000000000000001e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00653214  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0030  aminodeoxychorismate lyase  29.15 
 
 		 349 aa  145  8.000000000000001e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.647846  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2262  aminodeoxychorismate lyase  33.04 
 
 		 344 aa  144  1e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.945495  hitchhiker  0.000317634 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2026  hypothetical protein  35.49 
 
 		 333 aa  145  1e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0557  aminodeoxychorismate lyase  29.43 
 
 		 326 aa  144  2e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.245938  normal  0.0550645 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1776  aminodeoxychorismate lyase  32.06 
 
 		 355 aa  144  2e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.81136  normal  0.183273 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1426  aminodeoxychorismate lyase  30.29 
 
 		 332 aa  144  3e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.219736  normal  0.242343 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0871  aminodeoxychorismate lyase  34.52 
 
 		 339 aa  144  3e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1743  hypothetical protein  34.81 
 
 		 333 aa  142  7e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2044  hypothetical protein  28.61 
 
 		 324 aa  142  8e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.47923  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0717  aminodeoxychorismate lyase  30.87 
 
 		 335 aa  142  9.999999999999999e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.16974  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1660  aminodeoxychorismate lyase  30.87 
 
 		 336 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.132451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1735  aminodeoxychorismate lyase  30.87 
 
 		 336 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.163239  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0473  periplasmic solute-binding protein  31.76 
 
 		 345 aa  142  9.999999999999999e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0206414  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1410  aminodeoxychorismate lyase  29.55 
 
 		 347 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2460  aminodeoxychorismate lyase  31.54 
 
 		 345 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00717262  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2573  aminodeoxychorismate lyase  31.54 
 
 		 345 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0650379  normal  0.0398652 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2453  aminodeoxychorismate lyase  31.54 
 
 		 345 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0182667  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1891  aminodeoxychorismate lyase  31.54 
 
 		 345 aa  140  3e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.253385  normal  0.0515475 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2118  aminodeoxychorismate lyase  31.15 
 
 		 312 aa  139  7e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0134865  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1129  aminodeoxychorismate lyase  28.66 
 
 		 336 aa  137  2e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.399769 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1587  aminodeoxychorismate lyase  29.81 
 
 		 332 aa  137  2e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.076405 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0900  aminodeoxychorismate lyase  31.99 
 
 		 338 aa  137  3.0000000000000003e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2521  aminodeoxychorismate lyase  28.41 
 
 		 372 aa  136  4e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2351  aminodeoxychorismate lyase  28.66 
 
 		 620 aa  136  6.0000000000000005e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.260551 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0308  aminodeoxychorismate lyase  28.2 
 
 		 440 aa  136  6.0000000000000005e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1863  aminodeoxychorismate lyase  27.78 
 
 		 356 aa  135  9.999999999999999e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.322444  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2275  aminodeoxychorismate lyase  31.29 
 
 		 349 aa  134  1.9999999999999998e-30  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2301  hypothetical protein  29.77 
 
 		 337 aa  134  1.9999999999999998e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.142743  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0625  aminodeoxychorismate lyase  27.42 
 
 		 357 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0512441  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1077  aminodeoxychorismate lyase  28.99 
 
 		 315 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.578473  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1637  aminodeoxychorismate lyase  31.15 
 
 		 352 aa  134  1.9999999999999998e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.521882 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2215  aminodeoxychorismate lyase  30.98 
 
 		 345 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2614  hypothetical protein  30.43 
 
 		 336 aa  134  3e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02904  hypothetical protein  28.45 
 
 		 338 aa  134  3e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1417  aminodeoxychorismate lyase  29.57 
 
 		 338 aa  134  3e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.626218  normal  0.75601 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1042  aminodeoxychorismate lyase  28.77 
 
 		 336 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0148163  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4376  aminodeoxychorismate lyase  31.72 
 
 		 362 aa  133  3.9999999999999996e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0936456  normal  0.529135 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1765  aminodeoxychorismate lyase  30.2 
 
 		 336 aa  132  6e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0979727  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2122  aminodeoxychorismate lyase  28.27 
 
 		 340 aa  132  7.999999999999999e-30  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1231  aminodeoxychorismate lyase  30.38 
 
 		 343 aa  131  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2254  aminodeoxychorismate lyase  29.9 
 
 		 323 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1632  aminodeoxychorismate lyase  28.96 
 
 		 351 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2153  hypothetical protein  29.11 
 
 		 339 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.692536  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2514  aminodeoxychorismate lyase  28.05 
 
 		 337 aa  130  3e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.636222  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0732  hypothetical protein  32.93 
 
 		 343 aa  130  4.0000000000000003e-29  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1938  aminodeoxychorismate lyase  30.57 
 
 		 345 aa  129  6e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.110627  normal  0.289211 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0315  aminodeoxychorismate lyase  28.93 
 
 		 389 aa  129  6e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2728  aminodeoxychorismate lyase  29.5 
 
 		 343 aa  129  6e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003000  hypothetical protein  28.16 
 
 		 338 aa  129  7.000000000000001e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0577137  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07820  conserved hypothetical protein TIGR00247  29.58 
 
 		 389 aa  129  7.000000000000001e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0223518 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1380  aminodeoxychorismate lyase  27.88 
 
 		 339 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2470  aminodeoxychorismate lyase  30.72 
 
 		 415 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.16603  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2264  hypothetical protein  29.94 
 
 		 345 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.188751  normal  0.305668 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2634  aminodeoxychorismate lyase  29.46 
 
 		 343 aa  129  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6185  aminodeoxychorismate lyase  27.56 
 
 		 339 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1894  aminodeoxychorismate lyase  27.56 
 
 		 339 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.474153  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2733  aminodeoxychorismate lyase  29.77 
 
 		 337 aa  129  1.0000000000000001e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.269056  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05120  conserved hypothetical protein TIGR00247  30.67 
 
 		 403 aa  128  1.0000000000000001e-28  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.924204  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1803  aminodeoxychorismate lyase  28.71 
 
 		 339 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0606768  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0733  aminodeoxychorismate lyase  31.76 
 
 		 335 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.224262  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5194  aminodeoxychorismate lyase  27.8 
 
 		 339 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.374187 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1831  aminodeoxychorismate lyase  28.71 
 
 		 339 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2198  aminodeoxychorismate lyase  30.74 
 
 		 331 aa  126  4.0000000000000003e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.955684 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3036  aminodeoxychorismate lyase  27.69 
 
 		 623 aa  126  5e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0256494  normal  0.08592 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0967  aminodeoxychorismate lyase  30.51 
 
 		 357 aa  126  5e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.829028  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1917  aminodeoxychorismate lyase  27.56 
 
 		 339 aa  126  5e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.136892 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2241  aminodeoxychorismate lyase  30.12 
 
 		 337 aa  126  5e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0045  aminodeoxychorismate lyase  28.78 
 
 		 336 aa  126  6e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.266308  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2516  aminodeoxychorismate lyase  29.18 
 
 		 351 aa  126  7e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.470286  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3481  aminodeoxychorismate lyase  31.02 
 
 		 418 aa  125  7e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.114938  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2534  aminodeoxychorismate lyase  31.08 
 
 		 339 aa  125  7e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.714245  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1543  hypothetical protein  30.3 
 
 		 340 aa  125  8.000000000000001e-28  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2649  aminodeoxychorismate lyase  28.07 
 
 		 335 aa  125  9e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.108193 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>