More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_0629 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013515  Smon_0629  aminodeoxychorismate lyase  100 
 
 		 310 aa  621  1e-177  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2626  aminodeoxychorismate lyase  49.47 
 
 		 316 aa  278  9e-74  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0045  aminodeoxychorismate lyase  33.33 
 
 		 336 aa  138  1e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.266308  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2733  aminodeoxychorismate lyase  32.99 
 
 		 337 aa  137  2e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.269056  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1791  aminodeoxychorismate lyase  31.33 
 
 		 339 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00439567  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1129  aminodeoxychorismate lyase  29.19 
 
 		 336 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.399769 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2275  aminodeoxychorismate lyase  31.7 
 
 		 349 aa  134  9.999999999999999e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2026  hypothetical protein  30.16 
 
 		 333 aa  133  5e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0473  periplasmic solute-binding protein  32.57 
 
 		 345 aa  130  2.0000000000000002e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0206414  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1743  hypothetical protein  29.84 
 
 		 333 aa  130  4.0000000000000003e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3559  aminodeoxychorismate lyase  27.76 
 
 		 341 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000155777  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2514  aminodeoxychorismate lyase  29.46 
 
 		 337 aa  127  3e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.636222  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0733  aminodeoxychorismate lyase  31.89 
 
 		 335 aa  126  4.0000000000000003e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.224262  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1776  aminodeoxychorismate lyase  31.5 
 
 		 355 aa  125  6e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.81136  normal  0.183273 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05820  aminodeoxychorismate lyase  30.29 
 
 		 337 aa  125  9e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0160306  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2122  aminodeoxychorismate lyase  30.28 
 
 		 340 aa  125  1e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0918  aminodeoxychorismate lyase  30.86 
 
 		 345 aa  124  1e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.174013  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1716  aminodeoxychorismate lyase  31.82 
 
 		 333 aa  124  2e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.998027  normal  0.24374 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2303  aminodeoxychorismate lyase  33.45 
 
 		 422 aa  123  3e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0207028  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1988  aminodeoxychorismate lyase  31.82 
 
 		 345 aa  123  4e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2905  aminodeoxychorismate lyase  33.73 
 
 		 337 aa  121  9.999999999999999e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0900  aminodeoxychorismate lyase  31.97 
 
 		 338 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3387  aminodeoxychorismate lyase  31.89 
 
 		 329 aa  121  1.9999999999999998e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.107935  normal  0.0743499 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2534  aminodeoxychorismate lyase  33.98 
 
 		 339 aa  120  3e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.714245  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1863  aminodeoxychorismate lyase  28.32 
 
 		 356 aa  120  3.9999999999999996e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.322444  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2350  aminodeoxychorismate lyase  32.59 
 
 		 416 aa  119  7.999999999999999e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5194  aminodeoxychorismate lyase  32.16 
 
 		 339 aa  119  9e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.374187 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1803  aminodeoxychorismate lyase  32.16 
 
 		 339 aa  119  9e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0606768  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1831  aminodeoxychorismate lyase  32.16 
 
 		 339 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1380  aminodeoxychorismate lyase  30.86 
 
 		 339 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2262  aminodeoxychorismate lyase  29.64 
 
 		 344 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.945495  hitchhiker  0.000317634 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2264  hypothetical protein  30.71 
 
 		 345 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.188751  normal  0.305668 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2351  aminodeoxychorismate lyase  32.55 
 
 		 620 aa  117  3e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.260551 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1685  aminodeoxychorismate lyase  34.4 
 
 		 407 aa  117  3e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14960  hypothetical protein  30.19 
 
 		 358 aa  116  6e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6185  aminodeoxychorismate lyase  31.76 
 
 		 339 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1894  aminodeoxychorismate lyase  31.76 
 
 		 339 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.474153  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1661  aminodeoxychorismate lyase  31.33 
 
 		 341 aa  115  8.999999999999998e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.148869  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1917  aminodeoxychorismate lyase  30.86 
 
 		 339 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.136892 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2553  aminodeoxychorismate lyase  31.94 
 
 		 385 aa  115  1.0000000000000001e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2023  aminodeoxychorismate lyase  27.47 
 
 		 363 aa  114  2.0000000000000002e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.309788  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0842  aminodeoxychorismate lyase  29.11 
 
 		 327 aa  114  2.0000000000000002e-24  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0834555 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1632  aminodeoxychorismate lyase  29.26 
 
 		 351 aa  113  3e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05120  conserved hypothetical protein TIGR00247  30.72 
 
 		 403 aa  113  3e-24  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.924204  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1417  aminodeoxychorismate lyase  29.1 
 
 		 338 aa  112  6e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.626218  normal  0.75601 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1938  aminodeoxychorismate lyase  30.08 
 
 		 345 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.110627  normal  0.289211 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0459  aminodeoxychorismate lyase  29.92 
 
 		 451 aa  112  8.000000000000001e-24  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1042  aminodeoxychorismate lyase  31.1 
 
 		 336 aa  112  9e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0148163  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1254  aminodeoxychorismate lyase  29.62 
 
 		 345 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.874489  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0892  aminodeoxychorismate lyase  31.19 
 
 		 579 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0855314 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0871  aminodeoxychorismate lyase  34.09 
 
 		 339 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1361  aminodeoxychorismate lyase  25.31 
 
 		 370 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0615754  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0005  aminodeoxychorismate lyase  28.57 
 
 		 327 aa  110  3e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000992333  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1435  aminodeoxychorismate lyase  29.74 
 
 		 344 aa  110  3e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3413  aminodeoxychorismate lyase  31.23 
 
 		 334 aa  110  3e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25730  hypothetical protein  30.57 
 
 		 349 aa  110  3e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0867332  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3821  hypothetical protein  32.66 
 
 		 406 aa  110  3e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.133528 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1093  aminodeoxychorismate lyase  29.48 
 
 		 332 aa  110  4.0000000000000004e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.72202  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1820  aminodeoxychorismate lyase  26.92 
 
 		 401 aa  109  5e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.111847  normal  0.624649 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07820  conserved hypothetical protein TIGR00247  30.98 
 
 		 389 aa  109  5e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0223518 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2520  aminodeoxychorismate lyase  27.5 
 
 		 325 aa  109  5e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0480566  hitchhiker  0.003327 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3134  aminodeoxychorismate lyase  31.27 
 
 		 442 aa  109  6e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.486263 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2198  aminodeoxychorismate lyase  33.73 
 
 		 331 aa  109  6e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.955684 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1891  aminodeoxychorismate lyase  30.93 
 
 		 345 aa  109  6e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.253385  normal  0.0515475 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2198  hypothetical protein  30.57 
 
 		 349 aa  108  8.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.850653  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1004  aminodeoxychorismate lyase  29.77 
 
 		 320 aa  108  9.000000000000001e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2453  aminodeoxychorismate lyase  30.93 
 
 		 345 aa  108  1e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0182667  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1997  hypothetical protein  26.78 
 
 		 331 aa  108  1e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2573  aminodeoxychorismate lyase  30.93 
 
 		 345 aa  108  1e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0650379  normal  0.0398652 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2460  aminodeoxychorismate lyase  30.93 
 
 		 345 aa  108  1e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00717262  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1830  aminodeoxychorismate lyase  27.85 
 
 		 342 aa  108  1e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1829  aminodeoxychorismate lyase  28.2 
 
 		 332 aa  108  1e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.021454  normal  0.121238 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2118  aminodeoxychorismate lyase  30.33 
 
 		 312 aa  108  1e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0134865  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2516  aminodeoxychorismate lyase  26.6 
 
 		 351 aa  107  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.470286  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3387  putative lipoprotein  28.06 
 
 		 339 aa  107  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1426  putative lipoprotein  28.06 
 
 		 339 aa  107  2e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.425496  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2282  putative lipoprotein  28.06 
 
 		 339 aa  107  2e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2444  hypothetical protein  28.06 
 
 		 339 aa  107  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.700087  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2470  aminodeoxychorismate lyase  32.02 
 
 		 415 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.16603  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1497  aminodeoxychorismate lyase  31.49 
 
 		 351 aa  107  2e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1190  putative lipoprotein  28.06 
 
 		 339 aa  107  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1917  hypothetical protein  28.06 
 
 		 339 aa  107  2e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2321  putative lipoprotein  28.06 
 
 		 339 aa  107  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2044  hypothetical protein  30.34 
 
 		 324 aa  108  2e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.47923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3356  aminodeoxychorismate lyase  31.46 
 
 		 349 aa  107  3e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.681449 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2215  aminodeoxychorismate lyase  29.59 
 
 		 345 aa  107  3e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2153  hypothetical protein  26.77 
 
 		 339 aa  106  4e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.692536  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1633  hypothetical protein  32.58 
 
 		 355 aa  107  4e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.153927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0417  aminodeoxychorismate lyase  25.6 
 
 		 331 aa  106  5e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1529  aminodeoxychorismate lyase  29.55 
 
 		 387 aa  106  5e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.538963 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2268  aminodeoxychorismate lyase  32.27 
 
 		 347 aa  106  6e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3279  aminodeoxychorismate lyase  31.3 
 
 		 376 aa  106  6e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.258116  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2254  aminodeoxychorismate lyase  29.5 
 
 		 323 aa  105  7e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0557  aminodeoxychorismate lyase  28.8 
 
 		 326 aa  105  7e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.245938  normal  0.0550645 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0484  aminodeoxychorismate lyase  29.84 
 
 		 335 aa  105  8e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0315  aminodeoxychorismate lyase  28.94 
 
 		 389 aa  105  9e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1410  aminodeoxychorismate lyase  32.89 
 
 		 347 aa  105  1e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1660  aminodeoxychorismate lyase  30.54 
 
 		 336 aa  105  1e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.132451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1735  aminodeoxychorismate lyase  30.54 
 
 		 336 aa  105  1e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.163239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0625  aminodeoxychorismate lyase  30.49 
 
 		 357 aa  105  1e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0512441  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>