More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG1694 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG1694  hypothetical protein  100 
 
 		 364 aa  750    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.717086 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5013  aminodeoxychorismate lyase  46.72 
 
 		 345 aa  271  2e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1845  aminodeoxychorismate lyase  42.68 
 
 		 348 aa  266  4e-70  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.575162  hitchhiker  0.00667659 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1618  aminodeoxychorismate lyase  41 
 
 		 345 aa  263  4e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.122439  normal  0.126639 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5921  aminodeoxychorismate lyase  38.8 
 
 		 352 aa  252  6e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.108379  normal  0.71245 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1094  hypothetical protein  40.4 
 
 		 352 aa  242  7.999999999999999e-63  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.38305 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1072  hypothetical protein  36.61 
 
 		 337 aa  237  2e-61  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.524315 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12763  putative aminodeoxychorismate lyase  33.53 
 
 		 347 aa  208  1e-52  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1696  aminodeoxychorismate lyase  32.84 
 
 		 341 aa  199  6e-50  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0016  aminodeoxychorismate lyase  33.63 
 
 		 344 aa  193  4e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0321  aminodeoxychorismate lyase-like protein  36.63 
 
 		 363 aa  181  2.9999999999999997e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2268  aminodeoxychorismate lyase  36.64 
 
 		 347 aa  179  8e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2459  aminodeoxychorismate lyase  31.07 
 
 		 344 aa  151  2e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.5911  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2733  aminodeoxychorismate lyase  35.29 
 
 		 337 aa  150  4e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.269056  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2521  aminodeoxychorismate lyase  34.91 
 
 		 372 aa  149  1.0000000000000001e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2534  aminodeoxychorismate lyase  32.86 
 
 		 339 aa  146  5e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.714245  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0045  aminodeoxychorismate lyase  31.4 
 
 		 336 aa  145  1e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.266308  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2275  aminodeoxychorismate lyase  31.42 
 
 		 349 aa  145  1e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2351  aminodeoxychorismate lyase  30.12 
 
 		 620 aa  144  3e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.260551 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0625  aminodeoxychorismate lyase  28.53 
 
 		 357 aa  144  3e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0512441  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1497  aminodeoxychorismate lyase  31.06 
 
 		 351 aa  143  5e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2514  aminodeoxychorismate lyase  33.85 
 
 		 337 aa  140  3.9999999999999997e-32  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.636222  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0918  aminodeoxychorismate lyase  30.15 
 
 		 345 aa  137  2e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.174013  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2122  aminodeoxychorismate lyase  31.63 
 
 		 340 aa  138  2e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1637  aminodeoxychorismate lyase  29.55 
 
 		 352 aa  135  8e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.521882 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1417  aminodeoxychorismate lyase  32.12 
 
 		 338 aa  135  9.999999999999999e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.626218  normal  0.75601 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0900  aminodeoxychorismate lyase  28.44 
 
 		 338 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0308  aminodeoxychorismate lyase  31.29 
 
 		 440 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1435  aminodeoxychorismate lyase  31.85 
 
 		 344 aa  133  5e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2783  aminodeoxychorismate lyase  29.38 
 
 		 456 aa  132  6.999999999999999e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2905  aminodeoxychorismate lyase  32.7 
 
 		 337 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2262  aminodeoxychorismate lyase  28.44 
 
 		 344 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.945495  hitchhiker  0.000317634 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1501  aminodeoxychorismate lyase  27.94 
 
 		 334 aa  130  3e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00653214  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02713  hypothetical protein  34.16 
 
 		 357 aa  129  1.0000000000000001e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.117678  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1042  aminodeoxychorismate lyase  29.13 
 
 		 336 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0148163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0967  aminodeoxychorismate lyase  27.89 
 
 		 357 aa  128  2.0000000000000002e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.829028  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1765  aminodeoxychorismate lyase  33.72 
 
 		 336 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0979727  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0607  hypothetical protein  32.08 
 
 		 370 aa  127  3e-28  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000669467  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2264  hypothetical protein  30 
 
 		 345 aa  127  3e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.188751  normal  0.305668 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1938  aminodeoxychorismate lyase  29.19 
 
 		 345 aa  127  3e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.110627  normal  0.289211 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1578  hypothetical protein  31.27 
 
 		 343 aa  126  5e-28  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00227984  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0560  aminodeoxychorismate lyase  29.11 
 
 		 467 aa  126  5e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.133777  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0531  aminodeoxychorismate lyase  29.48 
 
 		 464 aa  126  5e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.40268 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0495  aminodeoxychorismate lyase  29.11 
 
 		 467 aa  126  5e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.843817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3021  aminodeoxychorismate lyase  25.65 
 
 		 358 aa  126  6e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.157507  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1660  aminodeoxychorismate lyase  33.33 
 
 		 336 aa  126  6e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.132451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1735  aminodeoxychorismate lyase  33.33 
 
 		 336 aa  126  6e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.163239  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0871  aminodeoxychorismate lyase  30 
 
 		 339 aa  125  1e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2296  aminodeoxychorismate lyase  30.9 
 
 		 599 aa  125  1e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1791  aminodeoxychorismate lyase  30.21 
 
 		 339 aa  125  1e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00439567  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2803  aminodeoxychorismate lyase  30.41 
 
 		 339 aa  125  2e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0153211  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0030  aminodeoxychorismate lyase  29.22 
 
 		 349 aa  125  2e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.647846  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05820  aminodeoxychorismate lyase  28.62 
 
 		 337 aa  124  3e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0160306  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3559  aminodeoxychorismate lyase  28.43 
 
 		 341 aa  124  3e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000155777  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2499  aminodeoxychorismate lyase  30.41 
 
 		 339 aa  124  3e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00196213  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3279  aminodeoxychorismate lyase  28.39 
 
 		 376 aa  124  3e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.258116  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1997  hypothetical protein  32.23 
 
 		 331 aa  124  4e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2303  aminodeoxychorismate lyase  27.14 
 
 		 422 aa  123  4e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0207028  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1776  aminodeoxychorismate lyase  25.96 
 
 		 355 aa  123  5e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.81136  normal  0.183273 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1863  aminodeoxychorismate lyase  30.34 
 
 		 356 aa  123  6e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.322444  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1467  aminodeoxychorismate lyase  27.6 
 
 		 332 aa  122  7e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0630531  normal  0.0141986 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0892  aminodeoxychorismate lyase  29.35 
 
 		 579 aa  122  8e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0855314 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0508  hypothetical protein  28.44 
 
 		 340 aa  122  9e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2614  hypothetical protein  32.31 
 
 		 336 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3195  aminodeoxychorismate lyase  32.28 
 
 		 454 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.934507  hitchhiker  0.00937701 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1603  hypothetical protein  27.8 
 
 		 338 aa  121  1.9999999999999998e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0141578  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1532  hypothetical protein  29.97 
 
 		 414 aa  121  1.9999999999999998e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0269325  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0882  aminodeoxychorismate lyase  28.03 
 
 		 357 aa  121  1.9999999999999998e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.871937 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1584  aminodeoxychorismate lyase  32.71 
 
 		 364 aa  120  3e-26  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0339039  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0484  aminodeoxychorismate lyase  28.39 
 
 		 335 aa  120  3e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1488  hypothetical protein  33.58 
 
 		 346 aa  120  3e-26  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0806646  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1641  hypothetical protein  32.71 
 
 		 350 aa  120  3.9999999999999996e-26  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.667934  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3717  aminodeoxychorismate lyase  30.07 
 
 		 471 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.444196  normal  0.13956 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1783  hypothetical protein  27.81 
 
 		 377 aa  120  4.9999999999999996e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0308564  normal  0.608544 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0315  aminodeoxychorismate lyase  27.58 
 
 		 389 aa  119  6e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0419  aminodeoxychorismate lyase  28.61 
 
 		 328 aa  119  7.999999999999999e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.290965  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1426  aminodeoxychorismate lyase  28.43 
 
 		 332 aa  119  7.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.219736  normal  0.242343 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1433  aminodeoxychorismate lyase  28.89 
 
 		 331 aa  119  9e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0650  periplasmic solute-binding protein, aminodeoxychorismate lyase-like  26.83 
 
 		 356 aa  119  9.999999999999999e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.368295  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0717  aminodeoxychorismate lyase  29.18 
 
 		 335 aa  118  9.999999999999999e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.16974  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2153  hypothetical protein  28.24 
 
 		 339 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.692536  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2976  aminodeoxychorismate lyase  27.43 
 
 		 425 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.202928 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1612  hypothetical protein  30.35 
 
 		 340 aa  119  9.999999999999999e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000845082  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0473  periplasmic solute-binding protein  27.38 
 
 		 345 aa  118  9.999999999999999e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0206414  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0966  aminodeoxychorismate lyase  28.22 
 
 		 363 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3387  aminodeoxychorismate lyase  29.97 
 
 		 329 aa  118  1.9999999999999998e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.107935  normal  0.0743499 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1203  aminodeoxychorismate lyase  28.18 
 
 		 405 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00148773 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2350  aminodeoxychorismate lyase  27.07 
 
 		 416 aa  118  1.9999999999999998e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1803  aminodeoxychorismate lyase  29.28 
 
 		 339 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0606768  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1410  aminodeoxychorismate lyase  29.51 
 
 		 347 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1831  aminodeoxychorismate lyase  29.28 
 
 		 339 aa  117  3e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1891  aminodeoxychorismate lyase  32.18 
 
 		 345 aa  117  3e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.253385  normal  0.0515475 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2301  hypothetical protein  27.52 
 
 		 337 aa  117  3.9999999999999997e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.142743  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1685  aminodeoxychorismate lyase  26.57 
 
 		 407 aa  117  3.9999999999999997e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1917  aminodeoxychorismate lyase  28.96 
 
 		 339 aa  116  5e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.136892 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2460  aminodeoxychorismate lyase  31.8 
 
 		 345 aa  116  5e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00717262  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2573  aminodeoxychorismate lyase  31.8 
 
 		 345 aa  116  5e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0650379  normal  0.0398652 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2198  aminodeoxychorismate lyase  28.38 
 
 		 331 aa  117  5e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.955684 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2453  aminodeoxychorismate lyase  31.8 
 
 		 345 aa  116  5e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0182667  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1830  aminodeoxychorismate lyase  28.34 
 
 		 342 aa  116  6e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>