More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_0321 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_0321  aminodeoxychorismate lyase-like protein  100 
 
 		 363 aa  758    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1845  aminodeoxychorismate lyase  36.42 
 
 		 348 aa  207  2e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.575162  hitchhiker  0.00667659 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5921  aminodeoxychorismate lyase  33.65 
 
 		 352 aa  199  5e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.108379  normal  0.71245 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5013  aminodeoxychorismate lyase  34.05 
 
 		 345 aa  193  4e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1618  aminodeoxychorismate lyase  31.87 
 
 		 345 aa  187  2e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.122439  normal  0.126639 
 
 
-
 
NC_002950  PG1694  hypothetical protein  36.63 
 
 		 364 aa  181  2e-44  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.717086 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1094  hypothetical protein  35.02 
 
 		 352 aa  180  2.9999999999999997e-44  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.38305 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0016  aminodeoxychorismate lyase  31.66 
 
 		 344 aa  167  2.9999999999999998e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1072  hypothetical protein  32.15 
 
 		 337 aa  166  5.9999999999999996e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.524315 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12763  putative aminodeoxychorismate lyase  30.35 
 
 		 347 aa  157  3e-37  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2268  aminodeoxychorismate lyase  30.53 
 
 		 347 aa  153  4e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2275  aminodeoxychorismate lyase  31.72 
 
 		 349 aa  149  5e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1696  aminodeoxychorismate lyase  30.57 
 
 		 341 aa  148  1.0000000000000001e-34  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2122  aminodeoxychorismate lyase  28.74 
 
 		 340 aa  145  1e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2534  aminodeoxychorismate lyase  32.31 
 
 		 339 aa  144  3e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.714245  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2514  aminodeoxychorismate lyase  30.84 
 
 		 337 aa  144  3e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.636222  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2905  aminodeoxychorismate lyase  29.14 
 
 		 337 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2733  aminodeoxychorismate lyase  30.2 
 
 		 337 aa  135  9.999999999999999e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.269056  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0045  aminodeoxychorismate lyase  32.06 
 
 		 336 aa  133  5e-30  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.266308  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1497  aminodeoxychorismate lyase  29.63 
 
 		 351 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1532  hypothetical protein  28.14 
 
 		 414 aa  116  7.999999999999999e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0269325  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2351  aminodeoxychorismate lyase  29.22 
 
 		 620 aa  114  3e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.260551 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0682  aminodeoxychorismate lyase  29.25 
 
 		 333 aa  113  5e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0424367  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0694  aminodeoxychorismate lyase  29.59 
 
 		 327 aa  113  7.000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000296609 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1871  aminodeoxychorismate lyase  30.39 
 
 		 336 aa  112  9e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0650  periplasmic solute-binding protein, aminodeoxychorismate lyase-like  24.77 
 
 		 356 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.368295  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1637  aminodeoxychorismate lyase  27.36 
 
 		 352 aa  111  2.0000000000000002e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.521882 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1776  aminodeoxychorismate lyase  26.26 
 
 		 355 aa  111  2.0000000000000002e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.81136  normal  0.183273 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1488  hypothetical protein  28.24 
 
 		 346 aa  110  3e-23  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0806646  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1410  aminodeoxychorismate lyase  27.6 
 
 		 347 aa  110  5e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1501  aminodeoxychorismate lyase  26.15 
 
 		 334 aa  109  9.000000000000001e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00653214  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1591  aminodeoxychorismate lyase  28.31 
 
 		 343 aa  108  1e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0649717  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3618  aminodeoxychorismate lyase  27.15 
 
 		 362 aa  108  2e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000276729  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0871  aminodeoxychorismate lyase  27.79 
 
 		 339 aa  107  3e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0918  aminodeoxychorismate lyase  29.82 
 
 		 345 aa  107  3e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.174013  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1129  aminodeoxychorismate lyase  26.67 
 
 		 336 aa  107  3e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.399769 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02904  hypothetical protein  27.36 
 
 		 338 aa  106  6e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0448  aminodeoxychorismate lyase  32.17 
 
 		 312 aa  104  2e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.83946 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1361  aminodeoxychorismate lyase  26.77 
 
 		 370 aa  104  2e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0615754  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0473  aminodeoxychorismate lyase  28.75 
 
 		 330 aa  104  3e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0117874  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02331  hypothetical protein  36.52 
 
 		 316 aa  103  4e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3021  aminodeoxychorismate lyase  28.35 
 
 		 358 aa  103  5e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.157507  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1203  aminodeoxychorismate lyase  26.59 
 
 		 405 aa  103  5e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00148773 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1060  aminodeoxychorismate lyase  26.72 
 
 		 412 aa  103  6e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.017221 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0308  aminodeoxychorismate lyase  41.09 
 
 		 440 aa  102  8e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2521  aminodeoxychorismate lyase  26.22 
 
 		 372 aa  102  9e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0967  aminodeoxychorismate lyase  26.21 
 
 		 357 aa  102  1e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.829028  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2045  aminodeoxychorismate lyase  26.16 
 
 		 342 aa  102  1e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0393494  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0419  aminodeoxychorismate lyase  27.71 
 
 		 328 aa  101  2e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.290965  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0748  aminodeoxychorismate lyase  28.38 
 
 		 399 aa  101  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.309418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3134  aminodeoxychorismate lyase  25.58 
 
 		 442 aa  101  2e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.486263 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2504  aminodeoxychorismate lyase  27.99 
 
 		 337 aa  100  3e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.917927  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1077  aminodeoxychorismate lyase  27.36 
 
 		 315 aa  100  4e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.578473  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1633  hypothetical protein  25.87 
 
 		 355 aa  100  4e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.153927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1605  aminodeoxychorismate lyase  24.53 
 
 		 339 aa  100  4e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0288124  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1417  aminodeoxychorismate lyase  26.35 
 
 		 338 aa  100  4e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.626218  normal  0.75601 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2459  aminodeoxychorismate lyase  25.23 
 
 		 344 aa  100  5e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.5911  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2499  aminodeoxychorismate lyase  25.81 
 
 		 339 aa  99.4  9e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00196213  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0315  aminodeoxychorismate lyase  33.02 
 
 		 389 aa  99  1e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1791  aminodeoxychorismate lyase  27.59 
 
 		 339 aa  98.6  1e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00439567  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3279  aminodeoxychorismate lyase  30.32 
 
 		 376 aa  99.4  1e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.258116  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05820  aminodeoxychorismate lyase  27.36 
 
 		 337 aa  98.2  2e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0160306  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0625  aminodeoxychorismate lyase  30.16 
 
 		 357 aa  98.2  2e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0512441  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2803  aminodeoxychorismate lyase  26.84 
 
 		 339 aa  98.2  2e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0153211  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0966  aminodeoxychorismate lyase  24.71 
 
 		 363 aa  98.2  2e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1641  hypothetical protein  26.27 
 
 		 350 aa  97.8  2e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.667934  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1093  aminodeoxychorismate lyase  27.18 
 
 		 332 aa  98.2  2e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.72202  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1584  aminodeoxychorismate lyase  26.27 
 
 		 364 aa  97.8  3e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0339039  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0473  periplasmic solute-binding protein  33.16 
 
 		 345 aa  97.4  3e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0206414  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1529  aminodeoxychorismate lyase  29.08 
 
 		 331 aa  97.8  3e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.305783  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2486  aminodeoxychorismate lyase  25.24 
 
 		 364 aa  97.4  4e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00502838  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0005  aminodeoxychorismate lyase  27.91 
 
 		 327 aa  97.4  4e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000992333  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2465  hypothetical protein  39.1 
 
 		 393 aa  96.7  5e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.347128  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1127  aminodeoxychorismate lyase  39.1 
 
 		 392 aa  97.1  5e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.66542 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2215  aminodeoxychorismate lyase  28.14 
 
 		 345 aa  96.7  6e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0574  aminodeoxychorismate lyase  24.67 
 
 		 403 aa  96.7  6e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1716  aminodeoxychorismate lyase  25.94 
 
 		 333 aa  96.7  6e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.998027  normal  0.24374 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1988  aminodeoxychorismate lyase  26.4 
 
 		 345 aa  95.5  1e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0030  aminodeoxychorismate lyase  25.32 
 
 		 349 aa  95.9  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.647846  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1008  aminodeoxychorismate lyase  27.62 
 
 		 373 aa  95.9  1e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00821655  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003000  hypothetical protein  27.33 
 
 		 338 aa  95.5  1e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0577137  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1353  hypothetical protein  38.46 
 
 		 332 aa  95.5  1e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2262  aminodeoxychorismate lyase  27.49 
 
 		 344 aa  95.5  1e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.945495  hitchhiker  0.000317634 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1660  aminodeoxychorismate lyase  26.69 
 
 		 336 aa  95.5  1e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.132451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1735  aminodeoxychorismate lyase  26.69 
 
 		 336 aa  95.5  1e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.163239  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0733  aminodeoxychorismate lyase  26.42 
 
 		 335 aa  95.5  1e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.224262  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0531  aminodeoxychorismate lyase  29.86 
 
 		 464 aa  94.7  2e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.40268 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1997  hypothetical protein  25.57 
 
 		 331 aa  94.7  2e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0484  aminodeoxychorismate lyase  26.64 
 
 		 335 aa  94.7  2e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1349  hypothetical protein  38.46 
 
 		 332 aa  94.7  2e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3717  aminodeoxychorismate lyase  32.2 
 
 		 471 aa  94.7  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.444196  normal  0.13956 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14960  hypothetical protein  27.92 
 
 		 358 aa  94.7  2e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3481  aminodeoxychorismate lyase  25.71 
 
 		 418 aa  95.1  2e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.114938  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4657  aminodeoxychorismate lyase  26.47 
 
 		 362 aa  94.7  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.333524  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2118  aminodeoxychorismate lyase  26.67 
 
 		 312 aa  95.1  2e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0134865  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2023  aminodeoxychorismate lyase  34.86 
 
 		 363 aa  95.1  2e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.309788  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1134  hypothetical protein  31.61 
 
 		 312 aa  94.4  3e-18  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.434841  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1467  aminodeoxychorismate lyase  36.62 
 
 		 332 aa  94.4  3e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0630531  normal  0.0141986 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1582  hypothetical protein  27.12 
 
 		 341 aa  94.4  3e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000314961  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1072  aminodeoxychorismate lyase  38.35 
 
 		 392 aa  93.6  4e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.232656  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>