More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_1046 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007575  Suden_1046  aminodeoxychorismate lyase  100 
 
 
346 aa  715    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.228175  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1401  hypothetical protein  53.25 
 
 
362 aa  367  1e-100  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.789797  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0554  hypothetical protein  52.96 
 
 
362 aa  364  1e-99  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0633  hypothetical protein  56.55 
 
 
300 aa  348  7e-95  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0927  hypothetical protein  53.97 
 
 
331 aa  344  1e-93  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.490267  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1089  hypothetical protein  55.33 
 
 
314 aa  340  2e-92  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.021227  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0820  4-amino-4-deoxychorismate lyase  53.11 
 
 
317 aa  337  1.9999999999999998e-91  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1886  hypothetical protein  57.41 
 
 
316 aa  333  3e-90  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1090  aminodeoxychorismate lyase  55.36 
 
 
282 aa  328  1.0000000000000001e-88  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1134  hypothetical protein  42.07 
 
 
312 aa  263  2e-69  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.434841  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3021  aminodeoxychorismate lyase  38.2 
 
 
358 aa  123  6e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.157507  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0732  hypothetical protein  39.56 
 
 
343 aa  123  6e-27  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2459  aminodeoxychorismate lyase  29.62 
 
 
344 aa  122  9e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.5911  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1497  aminodeoxychorismate lyase  35.75 
 
 
351 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1612  hypothetical protein  35.62 
 
 
340 aa  119  6e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000845082  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2026  hypothetical protein  31.85 
 
 
333 aa  119  9.999999999999999e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1743  hypothetical protein  31.9 
 
 
333 aa  119  9.999999999999999e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0900  aminodeoxychorismate lyase  29.28 
 
 
338 aa  117  3e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3618  aminodeoxychorismate lyase  30.56 
 
 
362 aa  117  3e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000276729  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0871  aminodeoxychorismate lyase  28.48 
 
 
339 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0204  aminodeoxychorismate lyase  33.46 
 
 
314 aa  114  2.0000000000000002e-24  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2303  aminodeoxychorismate lyase  28.07 
 
 
422 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0207028  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2268  aminodeoxychorismate lyase  28.79 
 
 
343 aa  113  4.0000000000000004e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.642  normal  0.198206 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1591  aminodeoxychorismate lyase  38.24 
 
 
343 aa  113  5e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0649717  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2044  hypothetical protein  33.33 
 
 
324 aa  113  6e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.47923  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0650  periplasmic solute-binding protein, aminodeoxychorismate lyase-like  27.91 
 
 
356 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.368295  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2976  aminodeoxychorismate lyase  29.33 
 
 
425 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.202928 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1410  aminodeoxychorismate lyase  35 
 
 
347 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1361  aminodeoxychorismate lyase  35.03 
 
 
370 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0615754  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0484  aminodeoxychorismate lyase  29.96 
 
 
335 aa  112  1.0000000000000001e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0625  aminodeoxychorismate lyase  34.43 
 
 
357 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0512441  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2470  aminodeoxychorismate lyase  28.74 
 
 
415 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.16603  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1661  aminodeoxychorismate lyase  32.07 
 
 
341 aa  110  3e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.148869  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05820  aminodeoxychorismate lyase  33.47 
 
 
337 aa  110  3e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0160306  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0918  aminodeoxychorismate lyase  36.21 
 
 
345 aa  110  5e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.174013  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1578  aminodeoxychorismate lyase  32.61 
 
 
335 aa  108  1e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.853067  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1765  aminodeoxychorismate lyase  25.88 
 
 
391 aa  108  1e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.310683  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2045  aminodeoxychorismate lyase  28.78 
 
 
342 aa  108  1e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0393494  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01093  predicted aminodeoxychorismate lyase  33.19 
 
 
340 aa  108  2e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000123905  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2550  aminodeoxychorismate lyase  33.19 
 
 
340 aa  108  2e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000202204  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1219  hypothetical protein  33.19 
 
 
340 aa  108  2e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000544785  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2499  aminodeoxychorismate lyase  38.82 
 
 
339 aa  107  2e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00196213  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01101  hypothetical protein  33.19 
 
 
340 aa  108  2e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000104993  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2227  hypothetical protein  33.19 
 
 
340 aa  108  2e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000358206  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2504  hypothetical protein  33.19 
 
 
340 aa  108  2e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000670285  unclonable  0.0000000117832 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2030  hypothetical protein  33.19 
 
 
340 aa  108  2e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000821549  hitchhiker  0.00000424543 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1218  hypothetical protein  33.19 
 
 
340 aa  108  2e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000109839  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2179  hypothetical protein  35.15 
 
 
384 aa  107  2e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2521  aminodeoxychorismate lyase  35.43 
 
 
372 aa  108  2e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1298  hypothetical protein  33.77 
 
 
340 aa  107  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.166048  hitchhiker  0.00000000000000101215 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1313  hypothetical protein  33.77 
 
 
340 aa  107  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000010184 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1275  hypothetical protein  33.77 
 
 
340 aa  107  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.310439  normal  0.846206 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2170  hypothetical protein  33.77 
 
 
340 aa  107  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.7368  hitchhiker  0.0000000000000363112 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1987  hypothetical protein  33.77 
 
 
340 aa  107  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000318105  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1476  hypothetical protein  33.62 
 
 
340 aa  107  4e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000304616  hitchhiker  0.00000000000128745 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1627  aminodeoxychorismate lyase  37.06 
 
 
343 aa  106  6e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000211162  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3134  aminodeoxychorismate lyase  26.53 
 
 
442 aa  106  6e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.486263 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5921  aminodeoxychorismate lyase  33.33 
 
 
352 aa  106  8e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.108379  normal  0.71245 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2803  aminodeoxychorismate lyase  38.24 
 
 
339 aa  106  8e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0153211  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2350  aminodeoxychorismate lyase  32.03 
 
 
416 aa  105  9e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0508  hypothetical protein  28.45 
 
 
340 aa  105  1e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1922  aminodeoxychorismate lyase  34.89 
 
 
335 aa  105  1e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2023  aminodeoxychorismate lyase  33.65 
 
 
363 aa  104  2e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.309788  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1582  hypothetical protein  32.02 
 
 
341 aa  104  3e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000314961  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0005  aminodeoxychorismate lyase  26.58 
 
 
327 aa  103  3e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000992333  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0090  aminodeoxychorismate lyase  37.16 
 
 
323 aa  103  4e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.537273  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1203  aminodeoxychorismate lyase  28.99 
 
 
405 aa  103  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00148773 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1501  aminodeoxychorismate lyase  34.32 
 
 
334 aa  103  4e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00653214  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1685  aminodeoxychorismate lyase  34.29 
 
 
407 aa  103  5e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0531  aminodeoxychorismate lyase  30.26 
 
 
464 aa  103  5e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.40268 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1690  aminodeoxychorismate lyase  32.02 
 
 
341 aa  103  5e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0437285  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3494  hypothetical protein  32.02 
 
 
363 aa  103  6e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000556203  normal  0.010619 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3481  aminodeoxychorismate lyase  35.96 
 
 
418 aa  103  6e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.114938  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2614  hypothetical protein  33.91 
 
 
336 aa  102  7e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0694  aminodeoxychorismate lyase  27.3 
 
 
327 aa  102  7e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000296609 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0748  aminodeoxychorismate lyase  31.76 
 
 
399 aa  102  8e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.309418  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2122  aminodeoxychorismate lyase  32.8 
 
 
340 aa  102  9e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1544  aminodeoxychorismate lyase  35.2 
 
 
333 aa  102  1e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0483176  normal  0.0781021 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0495  aminodeoxychorismate lyase  28.95 
 
 
467 aa  102  1e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.843817  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0733  aminodeoxychorismate lyase  35.12 
 
 
335 aa  102  1e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.224262  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0560  aminodeoxychorismate lyase  28.95 
 
 
467 aa  102  1e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.133777  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1435  aminodeoxychorismate lyase  31.11 
 
 
344 aa  101  2e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1060  aminodeoxychorismate lyase  28.32 
 
 
412 aa  101  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.017221 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0717  aminodeoxychorismate lyase  28.25 
 
 
335 aa  101  2e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.16974  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2516  aminodeoxychorismate lyase  35.03 
 
 
351 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.470286  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2275  aminodeoxychorismate lyase  36.52 
 
 
349 aa  101  2e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1532  hypothetical protein  32.33 
 
 
414 aa  101  2e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0269325  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1919  aminodeoxychorismate lyase  27.62 
 
 
363 aa  100  2e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.402452  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2534  aminodeoxychorismate lyase  31.55 
 
 
339 aa  101  2e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.714245  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2733  aminodeoxychorismate lyase  34.87 
 
 
337 aa  101  2e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.269056  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0682  aminodeoxychorismate lyase  31.44 
 
 
333 aa  101  2e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0424367  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07820  conserved hypothetical protein TIGR00247  37.5 
 
 
389 aa  100  3e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0223518 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0473  aminodeoxychorismate lyase  29.5 
 
 
330 aa  100  3e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0117874  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2254  aminodeoxychorismate lyase  31.56 
 
 
323 aa  100  4e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1129  aminodeoxychorismate lyase  27.7 
 
 
336 aa  100  4e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.399769 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0908  aminodeoxychorismate lyase  30.61 
 
 
329 aa  99.8  7e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.112601  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0125  aminodeoxychorismate lyase  37.87 
 
 
393 aa  99.8  7e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000881139  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1660  aminodeoxychorismate lyase  33.04 
 
 
336 aa  99.4  8e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.132451  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1735  aminodeoxychorismate lyase  33.04 
 
 
336 aa  99.4  8e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.163239  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1765  aminodeoxychorismate lyase  33.04 
 
 
336 aa  99.4  8e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0979727  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>