More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_1090 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013512  Sdel_1090  aminodeoxychorismate lyase  100 
 
 
282 aa  581  1.0000000000000001e-165  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1046  aminodeoxychorismate lyase  55.36 
 
 
346 aa  328  8e-89  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.228175  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0927  hypothetical protein  54.61 
 
 
331 aa  323  2e-87  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.490267  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0554  hypothetical protein  55.96 
 
 
362 aa  313  1.9999999999999998e-84  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0633  hypothetical protein  55.6 
 
 
300 aa  308  6.999999999999999e-83  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1401  hypothetical protein  55.23 
 
 
362 aa  306  2.0000000000000002e-82  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.789797  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0820  4-amino-4-deoxychorismate lyase  53 
 
 
317 aa  299  3e-80  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1886  hypothetical protein  53.44 
 
 
316 aa  296  2e-79  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1089  hypothetical protein  49.82 
 
 
314 aa  296  4e-79  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.021227  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1134  hypothetical protein  48.72 
 
 
312 aa  262  4.999999999999999e-69  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.434841  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1497  aminodeoxychorismate lyase  38.34 
 
 
351 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0918  aminodeoxychorismate lyase  32.48 
 
 
345 aa  126  3e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.174013  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0900  aminodeoxychorismate lyase  36.68 
 
 
338 aa  122  7e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1353  hypothetical protein  36.86 
 
 
332 aa  121  9.999999999999999e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0204  aminodeoxychorismate lyase  42.2 
 
 
314 aa  120  1.9999999999999998e-26  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2470  aminodeoxychorismate lyase  35.84 
 
 
415 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.16603  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1743  hypothetical protein  39.41 
 
 
333 aa  120  1.9999999999999998e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2026  hypothetical protein  40 
 
 
333 aa  120  3e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3021  aminodeoxychorismate lyase  40.48 
 
 
358 aa  119  4.9999999999999996e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.157507  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2976  aminodeoxychorismate lyase  36.99 
 
 
425 aa  119  7e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.202928 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0650  periplasmic solute-binding protein, aminodeoxychorismate lyase-like  36.78 
 
 
356 aa  118  7.999999999999999e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.368295  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1685  aminodeoxychorismate lyase  35.26 
 
 
407 aa  118  9.999999999999999e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3481  aminodeoxychorismate lyase  35.26 
 
 
418 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.114938  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1349  hypothetical protein  36.55 
 
 
332 aa  117  1.9999999999999998e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2350  aminodeoxychorismate lyase  35.26 
 
 
416 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0531  aminodeoxychorismate lyase  30.53 
 
 
464 aa  117  3e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.40268 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2044  hypothetical protein  32.62 
 
 
324 aa  117  3e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.47923  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1410  aminodeoxychorismate lyase  36.16 
 
 
347 aa  116  3.9999999999999997e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0733  aminodeoxychorismate lyase  37.72 
 
 
335 aa  116  3.9999999999999997e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.224262  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0625  aminodeoxychorismate lyase  35.14 
 
 
357 aa  116  5e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0512441  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0748  aminodeoxychorismate lyase  34.29 
 
 
399 aa  115  6e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.309418  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2783  aminodeoxychorismate lyase  27.97 
 
 
456 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1591  aminodeoxychorismate lyase  33.46 
 
 
343 aa  114  1.0000000000000001e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0649717  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2179  hypothetical protein  34.59 
 
 
384 aa  114  1.0000000000000001e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0871  aminodeoxychorismate lyase  39.77 
 
 
339 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3195  aminodeoxychorismate lyase  30.29 
 
 
454 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.934507  hitchhiker  0.00937701 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2275  aminodeoxychorismate lyase  36.72 
 
 
349 aa  114  2.0000000000000002e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3356  aminodeoxychorismate lyase  33.71 
 
 
349 aa  113  3e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.681449 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3618  aminodeoxychorismate lyase  36.87 
 
 
362 aa  114  3e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000276729  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0495  aminodeoxychorismate lyase  29.2 
 
 
467 aa  112  7.000000000000001e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.843817  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0560  aminodeoxychorismate lyase  29.2 
 
 
467 aa  112  7.000000000000001e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.133777  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2459  aminodeoxychorismate lyase  34.33 
 
 
344 aa  112  9e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.5911  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05820  aminodeoxychorismate lyase  38.07 
 
 
337 aa  111  1.0000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0160306  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1765  aminodeoxychorismate lyase  31.28 
 
 
391 aa  111  1.0000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.310683  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3821  hypothetical protein  32.95 
 
 
406 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.133528 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2122  aminodeoxychorismate lyase  33.87 
 
 
340 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2303  aminodeoxychorismate lyase  32.95 
 
 
422 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0207028  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1501  aminodeoxychorismate lyase  28.83 
 
 
334 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00653214  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1361  aminodeoxychorismate lyase  38.01 
 
 
370 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0615754  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0473  periplasmic solute-binding protein  36.26 
 
 
345 aa  110  2.0000000000000002e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0206414  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1435  aminodeoxychorismate lyase  35.2 
 
 
344 aa  110  3e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2023  aminodeoxychorismate lyase  37.85 
 
 
363 aa  110  3e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.309788  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1055  aminodeoxychorismate lyase  31.79 
 
 
384 aa  109  4.0000000000000004e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.921254  normal  0.096534 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1060  aminodeoxychorismate lyase  31.44 
 
 
412 aa  109  4.0000000000000004e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.017221 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0732  hypothetical protein  38.51 
 
 
343 aa  109  5e-23  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1203  aminodeoxychorismate lyase  31.44 
 
 
405 aa  108  8.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00148773 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1627  aminodeoxychorismate lyase  35.45 
 
 
343 aa  108  8.000000000000001e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000211162  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1532  hypothetical protein  30.7 
 
 
414 aa  108  8.000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0269325  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1008  aminodeoxychorismate lyase  38.33 
 
 
373 aa  108  9.000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00821655  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2514  aminodeoxychorismate lyase  34.5 
 
 
337 aa  108  1e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.636222  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0484  aminodeoxychorismate lyase  34.93 
 
 
335 aa  108  1e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2534  aminodeoxychorismate lyase  35.09 
 
 
339 aa  108  1e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.714245  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1661  aminodeoxychorismate lyase  32.5 
 
 
341 aa  107  2e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.148869  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0908  aminodeoxychorismate lyase  32.94 
 
 
329 aa  107  3e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.112601  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2296  aminodeoxychorismate lyase  33.33 
 
 
599 aa  107  3e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4376  aminodeoxychorismate lyase  36.05 
 
 
362 aa  107  3e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0936456  normal  0.529135 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1093  aminodeoxychorismate lyase  35.35 
 
 
332 aa  107  3e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.72202  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3134  aminodeoxychorismate lyase  26.39 
 
 
442 aa  106  4e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.486263 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1544  aminodeoxychorismate lyase  32.17 
 
 
333 aa  106  4e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0483176  normal  0.0781021 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3717  aminodeoxychorismate lyase  31.21 
 
 
471 aa  106  4e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.444196  normal  0.13956 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15290  predicted periplasmic solute-binding protein  35.57 
 
 
493 aa  105  6e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.444068  normal  0.602564 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1129  aminodeoxychorismate lyase  33.89 
 
 
336 aa  105  7e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.399769 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2905  aminodeoxychorismate lyase  32.95 
 
 
337 aa  105  9e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2733  aminodeoxychorismate lyase  32.42 
 
 
337 aa  104  1e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.269056  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12574  hypothetical protein  35.47 
 
 
417 aa  104  2e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00172093  normal  0.0835034 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0892  aminodeoxychorismate lyase  32 
 
 
579 aa  103  2e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0855314 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0005  aminodeoxychorismate lyase  26.39 
 
 
327 aa  104  2e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000992333  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003000  hypothetical protein  37.57 
 
 
338 aa  104  2e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0577137  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2499  aminodeoxychorismate lyase  33.71 
 
 
339 aa  104  2e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00196213  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3279  aminodeoxychorismate lyase  30.47 
 
 
376 aa  104  2e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.258116  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0967  aminodeoxychorismate lyase  30 
 
 
357 aa  104  2e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.829028  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0466  hypothetical protein  34.29 
 
 
438 aa  103  3e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.262236  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2045  aminodeoxychorismate lyase  27.83 
 
 
342 aa  103  3e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0393494  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0607  hypothetical protein  30.71 
 
 
370 aa  103  4e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000669467  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0717  aminodeoxychorismate lyase  30.38 
 
 
335 aa  103  4e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.16974  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02904  hypothetical protein  35.03 
 
 
338 aa  103  4e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0462  hypothetical protein  34.29 
 
 
412 aa  102  5e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.218984  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0682  aminodeoxychorismate lyase  32.22 
 
 
333 aa  102  5e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0424367  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1578  hypothetical protein  30.71 
 
 
343 aa  103  5e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00227984  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2803  aminodeoxychorismate lyase  32.06 
 
 
339 aa  102  6e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0153211  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02331  hypothetical protein  33.87 
 
 
316 aa  102  6e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2262  aminodeoxychorismate lyase  32.2 
 
 
344 aa  102  6e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.945495  hitchhiker  0.000317634 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0694  aminodeoxychorismate lyase  34.12 
 
 
327 aa  102  6e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000296609 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2268  aminodeoxychorismate lyase  30.57 
 
 
343 aa  102  6e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.642  normal  0.198206 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2241  aminodeoxychorismate lyase  45.76 
 
 
337 aa  102  6e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1776  aminodeoxychorismate lyase  34.1 
 
 
355 aa  102  7e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.81136  normal  0.183273 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0882  aminodeoxychorismate lyase  30.7 
 
 
357 aa  102  8e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.871937 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0574  aminodeoxychorismate lyase  34.29 
 
 
403 aa  102  8e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1783  hypothetical protein  29.93 
 
 
377 aa  102  9e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0308564  normal  0.608544 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2649  aminodeoxychorismate lyase  29.75 
 
 
335 aa  101  1e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.108193 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>