More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_2151 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011353  ECH74115_2151  hypothetical protein  100 
 
 		 296 aa  617  1e-176  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0685659  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2110  diguanylate cyclase  98.65 
 
 		 296 aa  608  1e-173  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000973231  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1744  hypothetical protein  98.65 
 
 		 296 aa  608  1e-173  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00489018  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2123  hypothetical protein  98.99 
 
 		 296 aa  610  1e-173  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0850031  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1629  hypothetical protein  97.64 
 
 		 296 aa  602  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00134354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1625  hypothetical protein  97.64 
 
 		 296 aa  601  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000118322  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01494  hypothetical protein  97.3 
 
 		 296 aa  599  1e-170  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00154345  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01505  hypothetical protein  97.3 
 
 		 296 aa  599  1e-170  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00205706  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1707  putative ggdef domain  98.43 
 
 		 128 aa  258  6e-68  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.154698  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1669  hypothetical protein  42.61 
 
 		 298 aa  234  1.0000000000000001e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1336  diguanylate cyclase  41.51 
 
 		 495 aa  119  7e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.474489  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1587  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  37.36 
 
 		 297 aa  119  7e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.275085  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4400  diguanylate cyclase  37.5 
 
 		 493 aa  116  5e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3653  GGDEF  36.07 
 
 		 308 aa  115  6e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.203802  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1348  response regulator PleD  42.86 
 
 		 457 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0378  diguanylate cyclase  38.41 
 
 		 422 aa  113  3e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000891935  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1758  diguanylate cyclase with Chase2 sensor  38.34 
 
 		 583 aa  114  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.621597 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2855  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  40.76 
 
 		 415 aa  113  3e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.220747  hitchhiker  0.000676798 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0094  diguanylate cyclase  36.71 
 
 		 451 aa  113  4.0000000000000004e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0401  hypothetical protein  28.37 
 
 		 296 aa  111  1.0000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0125  GGDEF domain-containing protein  42.52 
 
 		 371 aa  111  2.0000000000000002e-23  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1739  GGDEF domain protein  35.62 
 
 		 308 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6915  diguanylate cyclase  33.9 
 
 		 202 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.322303  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1270  diguanylate cyclase  30.92 
 
 		 318 aa  110  4.0000000000000004e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0039  diguanylate cyclase  35.39 
 
 		 521 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1477  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  39.62 
 
 		 730 aa  109  5e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0457  diguanylate cyclase  31.39 
 
 		 349 aa  109  6e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.163256  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0269  diguanylate cyclase  36.14 
 
 		 485 aa  109  6e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.853723  hitchhiker  0.00000177476 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1332  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  40.12 
 
 		 306 aa  109  7.000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2395  diguanylate cyclase  37.72 
 
 		 359 aa  109  7.000000000000001e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.423308  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1516  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  39.52 
 
 		 352 aa  109  7.000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.0065858  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23130  sensory box GGDEF domain-containing protein  34.44 
 
 		 307 aa  109  7.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.561543  decreased coverage  0.0000866239 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1501  diguanylate cyclase  39.38 
 
 		 360 aa  108  8.000000000000001e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.15986  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2920  sensor diguanylate cyclase  36.94 
 
 		 623 aa  108  8.000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1952  hypothetical protein  34.44 
 
 		 306 aa  108  9.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.00612967  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1277  diguanylate cyclase  32.56 
 
 		 241 aa  108  1e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3316  diguanylate cyclase  38.15 
 
 		 307 aa  108  1e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2979  diguanylate cyclase  35.11 
 
 		 490 aa  108  1e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1733  diguanylate cyclase  39.62 
 
 		 464 aa  108  1e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000546701  normal  0.0234559 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2518  diguanylate cyclase  37.57 
 
 		 372 aa  108  2e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.165269  normal  0.0137006 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2249  response regulator/GGDEF domain-containing protein  38.51 
 
 		 400 aa  107  2e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1411  GGDEF domain-containing protein  35.62 
 
 		 493 aa  107  3e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0895588  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0507  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  39.74 
 
 		 557 aa  107  3e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0207  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  36.14 
 
 		 772 aa  107  3e-22  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.53871  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3309  diguanylate cyclase  35.44 
 
 		 514 aa  107  3e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.430472  hitchhiker  0.00145526 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2740  diguanylate cyclase  37.87 
 
 		 555 aa  107  3e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0279  diguanylate cyclase  36.14 
 
 		 486 aa  107  3e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00774453  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4311  diguanylate cyclase  35.62 
 
 		 493 aa  106  4e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.245548  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0689  putative diguanylate cyclase  37.35 
 
 		 306 aa  106  4e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0172  GGDEF domain-containing protein  40.96 
 
 		 328 aa  106  4e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2538  GGDEF domain-containing protein  40.65 
 
 		 648 aa  106  4e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000110944  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0276  diguanylate cyclase  36.14 
 
 		 486 aa  106  4e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0272  diguanylate cyclase  36.14 
 
 		 486 aa  106  4e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0280  diguanylate cyclase  36.14 
 
 		 486 aa  106  4e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1723  diguanylate cyclase  38.75 
 
 		 420 aa  106  5e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.428268  hitchhiker  0.00000158997 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2951  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  38.32 
 
 		 306 aa  105  6e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3614  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  39.41 
 
 		 310 aa  106  6e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0178  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  33.72 
 
 		 322 aa  105  6e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.895619 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4124  diguanylate cyclase  35.62 
 
 		 485 aa  105  8e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1914  GGDEF domain-containing protein  36.48 
 
 		 381 aa  105  8e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.743896  normal  0.638845 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3566  diguanylate cyclase  37.8 
 
 		 561 aa  105  8e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0665818  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0050  putative diguanylate cyclase  37.13 
 
 		 696 aa  105  9e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.315879  normal  0.219682 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2835  response regulator receiver domain-containing protein  37.11 
 
 		 346 aa  105  9e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.157532  normal  0.231861 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2931  diguanylate cyclase  35.8 
 
 		 432 aa  105  1e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0471  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  29.34 
 
 		 572 aa  105  1e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.634401  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0787  GGDEF  41.29 
 
 		 585 aa  105  1e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.109099  hitchhiker  0.00379197 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3851  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  36.97 
 
 		 634 aa  105  1e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0571122  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1759  GGDEF domain-containing protein  35.09 
 
 		 355 aa  105  1e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.538539  normal  0.0215764 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2165  diguanylate cyclase  38.06 
 
 		 460 aa  105  1e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0799  diguanylate cyclase  36.63 
 
 		 538 aa  105  1e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0186826  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0294  diguanylate cyclase  38.38 
 
 		 432 aa  105  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3102  GGDEF domain-containing protein  41.29 
 
 		 580 aa  104  1e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1842  diguanylate cyclase  37.76 
 
 		 308 aa  105  1e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.721538  normal  0.677546 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0319  diguanylate cyclase  38.65 
 
 		 732 aa  105  1e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1551  GGDEF domain-containing protein  34.81 
 
 		 518 aa  104  2e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0809  hypothetical protein  36.02 
 
 		 516 aa  104  2e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2021  diguanylate cyclase  38.36 
 
 		 381 aa  104  2e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1277  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  38.27 
 
 		 454 aa  104  2e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.410696  normal  0.0388481 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0157  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  38.56 
 
 		 917 aa  104  2e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0963  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  34.15 
 
 		 300 aa  104  2e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2015  diguanylate cyclase  33.68 
 
 		 249 aa  103  2e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3010  diguanylate cyclase  36.48 
 
 		 382 aa  104  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.359257 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0223  diguanylate cyclase  39.62 
 
 		 357 aa  103  2e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.133267  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0754  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  37.13 
 
 		 463 aa  104  2e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.952691  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1907  diguanylate cyclase  37.64 
 
 		 487 aa  104  2e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.230991 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1293  diguanylate cyclase  36.42 
 
 		 432 aa  104  2e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.32079e-19 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3458  diguanylate cyclase  34.18 
 
 		 518 aa  104  2e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000037754 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0845  diguanylate cyclase  34.32 
 
 		 578 aa  104  2e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3032  diguanylate cyclase  38.01 
 
 		 547 aa  104  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1306  diguanylate cyclase  37.06 
 
 		 615 aa  104  2e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.550913  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3261  diguanylate cyclase  40.12 
 
 		 360 aa  104  2e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.455053  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0268  diguanylate cyclase  35.76 
 
 		 485 aa  104  2e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.624982  hitchhiker  0.000186113 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2490  diguanylate cyclase  40.12 
 
 		 341 aa  104  2e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.316308  normal  0.521612 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1845  diguanylate cyclase  40.74 
 
 		 341 aa  103  3e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.103325  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1750  response regulator PleD  38.75 
 
 		 457 aa  103  3e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.263569  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0743  diguanylate cyclase  38.61 
 
 		 680 aa  103  3e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.500154  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2716  diguanylate cyclase  37.66 
 
 		 636 aa  103  3e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0179449 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4314  diguanylate cyclase  35.85 
 
 		 379 aa  103  3e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2254  sensory box protein  34.05 
 
 		 422 aa  103  3e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3753  diguanylate cyclase  36.36 
 
 		 485 aa  103  3e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.580016  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>