103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_0745 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010465  YPK_0745  leucine-rich repeat-containing protein  100 
 
 		 301 aa  590  1e-167  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0746  leucine-rich repeat-containing protein  80.67 
 
 		 615 aa  470  1.0000000000000001e-131  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0675  putative outer membrane protein  70.67 
 
 		 318 aa  394  1e-109  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0676  outer membrane protein YopM  76.56 
 
 		 284 aa  394  1e-109  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0744  leucine-rich repeat-containing protein  70.33 
 
 		 622 aa  390  1e-107  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.559917  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0863  leucine-rich repeat protein  38.12 
 
 		 755 aa  184  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0926  hypothetical protein  38.12 
 
 		 731 aa  184  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.494882  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0894  hypothetical protein  38.12 
 
 		 755 aa  184  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0949  leucine-rich repeat protein  37.5 
 
 		 755 aa  177  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.697592  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0835  leucine-rich repeat protein  36.25 
 
 		 765 aa  171  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.226799  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2425  leucine-rich repeat protein  39.38 
 
 		 788 aa  157  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.190923 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2479  hypothetical protein  39.38 
 
 		 788 aa  157  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.869607  normal  0.03769 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2582  hypothetical protein  39.38 
 
 		 788 aa  157  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0480731 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1692  invasion plasmid antigen  37.55 
 
 		 583 aa  138  1e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.804686  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1257  leucine-rich repeat protein  45.9 
 
 		 776 aa  133  5e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2110  invasion plasmid antigen  39.16 
 
 		 568 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2592  invasion plasmid antigen  38.25 
 
 		 603 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0025  effector protein YopM  42.45 
 
 		 388 aa  128  1.0000000000000001e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.012796  normal  0.260783 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0253  invasion plasmid antigen  35.09 
 
 		 545 aa  125  8.000000000000001e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0402071  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2774  leucine rich repeat domain-containing protein  44.29 
 
 		 375 aa  123  3e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00259731 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1403  hypothetical protein  38.81 
 
 		 323 aa  119  7.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0575083  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0132  invasion plasmid antigen  37.37 
 
 		 574 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.102369  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0130  IpaH7.8  34.66 
 
 		 565 aa  108  1e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1016  invasion plasmid antigen  31.36 
 
 		 547 aa  107  3e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0087  IpaH1.4  34.78 
 
 		 575 aa  105  6e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00799741  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1958  hypothetical protein  36.96 
 
 		 435 aa  97.1  4e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.272689  normal  0.538677 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4612  hypothetical protein  40.44 
 
 		 416 aa  80.5  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.19236 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0713  invasion plasmid antigen  39.72 
 
 		 443 aa  76.3  0.0000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.29021  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3798  small GTP-binding protein  34.84 
 
 		 1041 aa  74.3  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2920  leucine-rich repeat-containing protein  29.06 
 
 		 763 aa  73.9  0.000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.660526  normal  0.0739949 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4909  Miro domain protein  35.62 
 
 		 1015 aa  72.4  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.903502 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0459  leucine-rich repeat-containing protein  37.57 
 
 		 581 aa  71.6  0.00000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.893142  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2306  leucine-rich repeat-containing protein  32.4 
 
 		 863 aa  65.9  0.0000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.98495 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09188  putative outermembrane protein  37.11 
 
 		 307 aa  62  0.00000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.885938  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2057  leucine-rich repeat protein  32.43 
 
 		 482 aa  60.5  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.723392  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7693  Phosphoprotein phosphatase  33.73 
 
 		 1263 aa  57.8  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2066  leucine-rich repeat protein  31.78 
 
 		 508 aa  55.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2359  leucine-rich repeat-containing protein  26.67 
 
 		 296 aa  54.7  0.000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.260952  normal  0.0814823 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5300  serine/threonine protein kinase  35.25 
 
 		 437 aa  54.3  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0570551 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_32564  predicted protein  37.5 
 
 		 692 aa  53.9  0.000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0991  hypothetical protein  29.96 
 
 		 354 aa  53.5  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1973  serine/threonine protein kinase  30 
 
 		 421 aa  53.1  0.000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0149  leucine-rich repeat-containing protein  34.12 
 
 		 436 aa  52.8  0.000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_5174  predicted protein  31.34 
 
 		 242 aa  52.8  0.000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1413  hypothetical protein  26.4 
 
 		 410 aa  51.2  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.173619  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1833  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  28.35 
 
 		 476 aa  51.6  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.113448  normal  0.602761 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2711  hypothetical protein  23.96 
 
 		 379 aa  50.8  0.00003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.838667  normal  0.430413 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3380  serine/threonine protein kinase  28.06 
 
 		 437 aa  50.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.367519  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4987  serine/threonine protein kinase  28.06 
 
 		 437 aa  50.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.815598  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1248  hypothetical protein  22.92 
 
 		 379 aa  50.1  0.00004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.48386  normal  0.670053 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2471  serine/threonine protein kinase  33.15 
 
 		 450 aa  50.1  0.00005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00766304  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3253  small GTP-binding protein  29.92 
 
 		 867 aa  49.7  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0782  leucine-rich repeat-containing protein  32.26 
 
 		 535 aa  48.9  0.00009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.200041 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0691  serine/threonine protein kinase  32.37 
 
 		 441 aa  48.9  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0557  Serine/threonine protein kinase  33.81 
 
 		 445 aa  48.9  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4041  small GTP-binding protein  30.61 
 
 		 937 aa  48.5  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.668162  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1854  serine/threonine protein kinase  29.63 
 
 		 440 aa  48.1  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.13717 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0461  small GTP-binding protein  30.57 
 
 		 761 aa  48.1  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.981237  normal  0.556808 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2764  hypothetical protein  25.84 
 
 		 410 aa  48.1  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00341411  hitchhiker  0.00074389 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0251  hypothetical protein  36.43 
 
 		 396 aa  48.1  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00111835  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3413  serine/threonine protein kinase  34.06 
 
 		 447 aa  47.4  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.287341 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1090  serine/threonine protein kinase  30.11 
 
 		 441 aa  47.4  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0085  serine/threonine protein kinase  35.38 
 
 		 464 aa  47  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00708032 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2142  serine/threonine protein kinase  32.19 
 
 		 439 aa  47  0.0004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.733899  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0814  serine/threonine protein kinase  32.45 
 
 		 432 aa  47  0.0004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.825478  normal  0.301688 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1488  hypothetical protein  31.58 
 
 		 473 aa  47  0.0004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0421806  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_48985  predicted protein  29.72 
 
 		 2198 aa  47  0.0004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3999  small GTP-binding protein  30.61 
 
 		 937 aa  47  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1493  small GTP-binding protein domain-containing protein  24.67 
 
 		 1107 aa  46.6  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0539  serine/threonine protein kinase  31.33 
 
 		 447 aa  46.6  0.0005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.652684 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4929  serine/threonine protein kinase  27.92 
 
 		 471 aa  46.6  0.0005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2708  hypothetical protein  26.09 
 
 		 379 aa  46.6  0.0005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.659455  normal  0.29624 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4737  serine/threonine protein kinase  32.14 
 
 		 436 aa  45.8  0.0008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3676  Serine/threonine protein kinase  34.13 
 
 		 437 aa  45.1  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1652  protein kinase  28.75 
 
 		 490 aa  45.4  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0364974  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28415  hypothetical protein  29.76 
 
 		 677 aa  45.8  0.001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.460739  normal  0.102552 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0593  internalin-related protein  28.46 
 
 		 631 aa  44.7  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.138946  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4016  hypothetical protein  33.33 
 
 		 447 aa  45.1  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG03670  adenylate cyclase, putative  24.79 
 
 		 1344 aa  44.7  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.338751  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0938  hypothetical protein  29.24 
 
 		 713 aa  45.1  0.002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.102754  unclonable  0.000027622 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2055  leucine-rich protein  29.91 
 
 		 565 aa  44.7  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.805099  normal  0.572158 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2351  serine/threonine protein kinase  31.4 
 
 		 414 aa  44.7  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00102293 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4410  serine/threonine protein kinase  26.86 
 
 		 469 aa  43.9  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.071312 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3256  protein kinase  28.37 
 
 		 446 aa  43.9  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3736  protein kinase  32.75 
 
 		 451 aa  43.5  0.004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28825  predicted protein  33.96 
 
 		 484 aa  43.9  0.004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.664736  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2737  leucine-rich repeat-containing protein kinase  31.58 
 
 		 440 aa  43.5  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32486  predicted protein  36.47 
 
 		 293 aa  43.5  0.005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.647095  hitchhiker  0.00961002 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1439  serine/threonine protein kinase  32.58 
 
 		 475 aa  43.1  0.005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4670  serine/threonine protein kinase  27.67 
 
 		 439 aa  43.5  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4131  serine/threonine protein kinase  30.69 
 
 		 445 aa  43.1  0.006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1696  hypothetical protein  28.44 
 
 		 384 aa  43.1  0.006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3397  serine/threonine protein kinase  31.54 
 
 		 444 aa  42.7  0.007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0650479  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3027  leucine-rich repeat-containing protein kinase  31.79 
 
 		 434 aa  42.7  0.008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.176048 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0937  hypothetical protein  26.78 
 
 		 757 aa  42.7  0.008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.107315  hitchhiker  0.00034151 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2938  serine/threonine protein kinase  33.33 
 
 		 459 aa  42.7  0.008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2056  hypothetical protein  28.29 
 
 		 559 aa  42.7  0.008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.809448  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2924  hypothetical protein  29.38 
 
 		 1262 aa  42.7  0.008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.240221  normal  0.200009 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003060  serine/threonine protein kinase  33.58 
 
 		 412 aa  42.4  0.008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.673161  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3274  serine/threonine protein kinase  31.54 
 
 		 444 aa  42.4  0.009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.470678  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>