183 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_0478 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008698  Tpen_0478  DEAD_2 domain-containing protein  100 
 
 		 588 aa  1167    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.738253  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1737  DEAD_2 domain-containing protein  33.1 
 
 		 574 aa  234  3e-60  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000703978 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1357  DEAD_2 domain-containing protein  32.33 
 
 		 575 aa  222  1.9999999999999999e-56  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0243831 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1117  DEAD_2 domain-containing protein  31.73 
 
 		 582 aa  215  1.9999999999999998e-54  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0620  DEAD_2 domain-containing protein  28.78 
 
 		 634 aa  211  2e-53  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0390  DEAD_2 domain-containing protein  29.4 
 
 		 580 aa  194  3e-48  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.12513 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4042  DEAD_2 domain protein  27.44 
 
 		 798 aa  161  2e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4133  DEAD_2 domain protein  27.85 
 
 		 798 aa  160  4e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0289  DEAD_2  26.68 
 
 		 785 aa  155  2e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00121679  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1867  DEAD_2 domain-containing protein  27.64 
 
 		 541 aa  154  5e-36  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.512598 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1847  DEAD_2 domain-containing protein  25.75 
 
 		 807 aa  153  8e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2112  DEAD_2 domain-containing protein  26.77 
 
 		 797 aa  152  1e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1217  ATP-dependent helicase, putative  26.62 
 
 		 781 aa  152  2e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.11747  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0660  DEAD_2 domain protein  26.26 
 
 		 790 aa  151  4e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0196  DEAD_2 domain protein  26.7 
 
 		 619 aa  150  5e-35  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.544403  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1408  putative ATP-dependent helicase  25.71 
 
 		 781 aa  149  1.0000000000000001e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2947  DEAD_2 domain protein  26.43 
 
 		 774 aa  146  9e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.443127  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1812  DEAD_2 domain-containing protein  29.53 
 
 		 617 aa  145  3e-33  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0429091  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1288  DEAD_2 domain protein  24.17 
 
 		 550 aa  136  9.999999999999999e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0995  DEAD_2 domain protein  23.64 
 
 		 777 aa  132  2.0000000000000002e-29  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1104  queuine tRNA-ribosyltransferase  25 
 
 		 676 aa  125  2e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0984  DEAD_2 domain-containing protein  26.65 
 
 		 773 aa  122  1.9999999999999998e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2690  DEAD_2  25.46 
 
 		 772 aa  118  3e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00215798 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0185  helicase c2  25.41 
 
 		 798 aa  118  3e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0224  DEAD_2 domain-containing protein  25.54 
 
 		 852 aa  117  7.999999999999999e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0115724  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5421  DEAD_2 domain protein  24.66 
 
 		 754 aa  116  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4111  helicase c2  25.7 
 
 		 766 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.620969 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5827  DEAD_2  26.03 
 
 		 779 aa  113  8.000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2806  DEAD_2 domain protein  25.63 
 
 		 785 aa  113  9e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.717048  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2972  DEAD_2 domain-containing protein  25.59 
 
 		 753 aa  113  9e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.114076 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40350  hypothetical protein  25.54 
 
 		 758 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.650358  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1180  hypothetical protein  23.71 
 
 		 754 aa  111  5e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.749053  normal  0.379614 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3423  hypothetical protein  24.63 
 
 		 758 aa  110  9.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2909  DEAD_2  25 
 
 		 775 aa  109  1e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0996428 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3036  hypothetical protein  25.71 
 
 		 761 aa  107  5e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0104594  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1498  helicase c2  24.96 
 
 		 773 aa  107  9e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.486316  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0134  DEAD_2 domain-containing protein  27.14 
 
 		 537 aa  106  1e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00117441 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5309  DEAD_2 domain-containing protein  24.45 
 
 		 756 aa  105  3e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.173286  hitchhiker  0.0033003 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1117  DEAD_2 domain-containing protein  23.73 
 
 		 712 aa  105  3e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.708962  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1536  DEAD_2 domain protein  26.77 
 
 		 537 aa  104  6e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.849616  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4268  helicase c2  24.75 
 
 		 766 aa  102  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0100597  normal  0.178799 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3801  helicase c2  24.75 
 
 		 766 aa  102  3e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.354929 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2943  DEAD_2 domain-containing protein  24.04 
 
 		 753 aa  102  3e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0015  DEAD_2 domain-containing protein  26.09 
 
 		 750 aa  100  6e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.338089  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1550  DNA repair helicase  24.92 
 
 		 745 aa  99.8  1e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5966  helicase c2  24.59 
 
 		 766 aa  100  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.224812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0789  helicase c2  22.51 
 
 		 669 aa  99.4  2e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.222881  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2850  DEAD_2 domain-containing protein  24.2 
 
 		 753 aa  99  2e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1361  helicase c2  24.75 
 
 		 801 aa  98.2  4e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2839  DEAD_2 domain protein  24.37 
 
 		 762 aa  97.1  8e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1672  helicase c2  24.09 
 
 		 739 aa  97.1  8e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1699  DEAD_2 domain protein  24.25 
 
 		 670 aa  96.3  1e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0524758  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1416  helicase c2  25.53 
 
 		 855 aa  92.8  2e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2428  helicase c2  24.36 
 
 		 855 aa  92.4  2e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.376304  normal  0.732574 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2510  helicase c2  24.47 
 
 		 788 aa  92  3e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00268076 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5813  helicase c2  30.09 
 
 		 790 aa  84.7  0.000000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.208635 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0965  helicase c2  24.07 
 
 		 654 aa  84  0.000000000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.228923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1186  putative ATP-dependent helicase  24.66 
 
 		 755 aa  81.3  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.146047  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2454  Uvs006  24.15 
 
 		 746 aa  80.9  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.107257  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1260  putative ATP-dependent helicase  24.15 
 
 		 755 aa  80.9  0.00000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2535  helicase C2  23.68 
 
 		 645 aa  79.3  0.0000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.801549  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0335  DEAD_2 domain protein  22.36 
 
 		 723 aa  78.2  0.0000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1630  Rad3-related DNA helicases-like  28.32 
 
 		 766 aa  77.8  0.0000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.138986  normal  0.527518 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3978  helicase c2  27.71 
 
 		 766 aa  77  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0904062  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4389  helicase c2  27.71 
 
 		 766 aa  77  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.787433  normal  0.56553 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4233  helicase c2  27.27 
 
 		 757 aa  75.9  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.134799  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0909  hypothetical protein  28.02 
 
 		 773 aa  75.5  0.000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.205853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0928  ATP-dependent helicase, putative  24.21 
 
 		 495 aa  74.7  0.000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.568065  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1376  DNA repair helicase, truncation  23.98 
 
 		 431 aa  73.2  0.00000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.731908  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1416  DEAD_2 domain protein  22.78 
 
 		 722 aa  73.2  0.00000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1769  DEAD_2 domain protein  22.12 
 
 		 729 aa  72.8  0.00000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.863576  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4835  helicase c2  23.51 
 
 		 874 aa  72  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0589586 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2627  DEAD_2 domain protein  23.48 
 
 		 723 aa  71.6  0.00000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.510755 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0823  DEAD_2 domain protein  22.09 
 
 		 739 aa  71.2  0.00000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1727  helicase c2  23.24 
 
 		 641 aa  69.3  0.0000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1859  helicase c2  22.64 
 
 		 674 aa  69.3  0.0000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.347581  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1805  helicase c2  22.64 
 
 		 659 aa  68.6  0.0000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2809  helicase c2  23.74 
 
 		 707 aa  67.4  0.0000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2172  helicase c2  22.48 
 
 		 659 aa  67.4  0.0000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2081  ATP-dependent helicase DinG  22.02 
 
 		 633 aa  65.9  0.000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2424  helicase c2  22.03 
 
 		 669 aa  65.9  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1934  helicase c2  22.28 
 
 		 640 aa  65.9  0.000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.101214  normal  0.540234 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2532  helicase c2  22.19 
 
 		 640 aa  65.9  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.139439 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2302  ATP-dependent helicase, DinG family protein  23.38 
 
 		 662 aa  65.1  0.000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.783815  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2413  helicase c2  22.03 
 
 		 669 aa  64.3  0.000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0561182  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB05090  CHL1 helicase, putative  21.97 
 
 		 849 aa  63.9  0.000000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2097  helicase c2  23.16 
 
 		 644 aa  63.9  0.000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0479006  normal  0.269462 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1575  putative ATP-dependent helicase  25.27 
 
 		 646 aa  63.5  0.000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.718112  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1824  helicase c2  22.4 
 
 		 664 aa  62  0.00000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.678424  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1566  Rad3-related DNA helicases  20.78 
 
 		 726 aa  61.6  0.00000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000243015  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0897  helicase c2  25.75 
 
 		 647 aa  61.6  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10414  DNA helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G05590)  24.02 
 
 		 841 aa  61.2  0.00000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_24915  predicted protein  25.87 
 
 		 791 aa  61.2  0.00000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.615618  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0911  putative ATP-dependent helicase  23.26 
 
 		 651 aa  61.2  0.00000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0733  ATP-dependent DNA helicase  23.25 
 
 		 640 aa  60.5  0.00000008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.982369  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2455  helicase c2  21.66 
 
 		 641 aa  60.5  0.00000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54439  YPL008W (CHL1)-like protein  21.54 
 
 		 835 aa  59.7  0.0000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.106037 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37445  predicted protein  21.76 
 
 		 938 aa  59.7  0.0000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.258887  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1619  helicase c2  21.33 
 
 		 629 aa  58.5  0.0000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1543  DnaQ family exonuclease/DinG family helicase  24.34 
 
 		 897 aa  58.5  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.959984  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>