97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Taci_1647 on replicon NC_013522
Organism: Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013522  Taci_1647  transcriptional regulator, SARP family  100 
 
 
549 aa  1077    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4424  transcriptional activator domain-containing protein  33.73 
 
 
1055 aa  99.8  1e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.518741  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4327  transcriptional activator domain-containing protein  30.83 
 
 
1029 aa  89.7  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.425746 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0215  transcriptional activator domain protein  30.86 
 
 
1163 aa  84.7  0.000000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.6802 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5030  transcriptional activator domain-containing protein  28.63 
 
 
1056 aa  83.6  0.000000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.311949  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2154  transcriptional activator domain protein  29.74 
 
 
1139 aa  79.7  0.0000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0522112 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0233  transcriptional regulator, SARP family  32.33 
 
 
911 aa  79  0.0000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1015  SARP family transcriptional regulator  30.04 
 
 
1216 aa  76.3  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2962  transcriptional activator domain protein  29.31 
 
 
1013 aa  75.1  0.000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000192637 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2768  SARP family transcriptional regulator  26.77 
 
 
1050 aa  74.3  0.000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4928  transcriptional activator domain-containing protein  30.38 
 
 
1075 aa  73.2  0.00000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.66885  normal  0.971064 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2258  SARP family transcriptional regulator  29.46 
 
 
647 aa  70.5  0.00000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0203775  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3701  SARP family transcriptional regulator  28.69 
 
 
1064 aa  70.5  0.00000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000037794 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3287  transcriptional activator domain protein  28.8 
 
 
1044 aa  69.3  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0920226  hitchhiker  0.00000903469 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3683  transcriptional activator domain-containing protein  26.42 
 
 
1034 aa  69.3  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00198659  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2832  transcriptional regulator, SARP family  25.55 
 
 
1145 aa  68.6  0.0000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3347  transcriptional activator domain-containing protein  29.84 
 
 
1109 aa  65.5  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1630  SARP family transcriptional regulator  30.21 
 
 
1089 aa  65.1  0.000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3122  SARP family transcriptional regulator  29.5 
 
 
773 aa  65.1  0.000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1930  transcriptional activator domain-containing protein  28 
 
 
991 aa  63.9  0.000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.816243  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0063  transcriptional regulator  29.15 
 
 
1190 aa  60.8  0.00000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.82825  normal  0.766346 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7386  SARP family transcriptional regulator(alpha/beta hydrolase superfamily)  28.14 
 
 
514 aa  60.5  0.00000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.18914  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1624  SARP family transcriptional regulator  23.94 
 
 
349 aa  59.3  0.0000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1046  transcriptional activator domain protein  27.88 
 
 
1143 aa  59.3  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.203225 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2548  transcriptional regulator, SARP family  26.69 
 
 
992 aa  59.3  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.709979  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1406  transcriptional activator domain-containing protein  27.04 
 
 
1067 aa  59.3  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3681  SARP family transcriptional regulator  28.17 
 
 
1217 aa  58.5  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.134161  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4724  transcriptional activator domain-containing protein  24.08 
 
 
713 aa  58.2  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3523  transcriptional activator domain  24.55 
 
 
1055 aa  57.8  0.0000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3797  SARP family transcriptional regulator  32.32 
 
 
584 aa  57.4  0.0000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.231924  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0315  SARP family transcriptional regulator  31 
 
 
648 aa  57  0.0000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.658605  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1697  SARP family transcriptional regulator  24.38 
 
 
349 aa  56.6  0.000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000546308  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5465  SARP family transcriptional regulator  27.27 
 
 
775 aa  56.6  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0338  transcriptional regulator  30.05 
 
 
1193 aa  55.8  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.497277  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1512  response regulator receiver/SARP domain-containing protein  25.11 
 
 
561 aa  55.8  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0226395 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5818  SARP family transcriptional regulator  31.25 
 
 
202 aa  55.5  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3996  transcriptional activator domain protein  30.38 
 
 
1009 aa  55.8  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.306526  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2653  response regulator receiver/SARP domain-containing protein  24.68 
 
 
572 aa  55.5  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3289  SARP family transcriptional regulator  30 
 
 
1116 aa  55.1  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.16943  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0173  ATP-dependent transcriptional regulator-like protein  22.18 
 
 
1111 aa  54.7  0.000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2867  response regulator receiver protein  27.45 
 
 
449 aa  53.5  0.000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3418  TPR repeat-containing protein  24.89 
 
 
973 aa  53.1  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0495  response regulator receiver and SARP domain protein  22.6 
 
 
365 aa  52.8  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000108458  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3364  transcriptional activator domain  31.58 
 
 
1118 aa  53.5  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3408  transcriptional activator domain protein  31.58 
 
 
1118 aa  53.5  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2581  transcriptional activator domain-containing protein  29.56 
 
 
1183 aa  53.5  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.808302  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2600  transcriptional activator domain protein  25.42 
 
 
1108 aa  53.1  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5093  transcriptional regulator, SARP family  25.89 
 
 
516 aa  52.4  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.093357  normal  0.464925 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1735  SARP family transcriptional regulator  27.8 
 
 
636 aa  52.4  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.271583 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2428  transcriptional regulator, SARP family  25.83 
 
 
494 aa  52  0.00003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13144  transcriptional regulator  24.02 
 
 
297 aa  51.6  0.00004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.149221 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2859  transcriptional activator domain protein  27.03 
 
 
999 aa  50.8  0.00005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0853  transcriptional regulator, SARP family  27.44 
 
 
1010 aa  51.2  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1636  TPR repeat transcriptional activator domain-containing protein  22.92 
 
 
1126 aa  50.8  0.00006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3477  hypothetical protein  24.71 
 
 
996 aa  50.8  0.00006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7741  transcriptional regulator, SARP family  26.84 
 
 
1013 aa  50.8  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0132103  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1963  transcriptional regulator, SARP family  28.07 
 
 
248 aa  50.4  0.00009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0662749  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2896  response regulator receiver and SARP domain-containing protein  27.4 
 
 
268 aa  49.7  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.264133 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0326  transcriptional regulator, SARP family  31.88 
 
 
647 aa  48.9  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0337  transcriptional regulator, SARP family  31.88 
 
 
647 aa  49.3  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1875  transcriptional regulator, SARP family  28.44 
 
 
921 aa  49.3  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0222305  decreased coverage  0.00126827 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4971  transcriptional regulator, SARP family  28.03 
 
 
261 aa  49.3  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.602293  normal  0.15867 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4482  transcriptional regulator, SARP family  29.23 
 
 
941 aa  49.3  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.434883  normal  0.14218 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3177  transcriptional regulator, SARP family  30.8 
 
 
526 aa  48.5  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0715298  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0538  SARP family transcriptional regulator  30.47 
 
 
266 aa  48.5  0.0003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.224574  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3806  SARP family transcriptional regulator  21.74 
 
 
423 aa  48.5  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0119583  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1222  transcriptional activator domain protein  26.89 
 
 
1018 aa  47.4  0.0007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.983461  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5193  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.81 
 
 
582 aa  47  0.0008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.117733  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29840  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  25.81 
 
 
496 aa  47  0.0008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3884  transcriptional regulator, SARP family  28.03 
 
 
990 aa  46.6  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.039717  normal  0.641225 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1953  transcriptional activator domain protein  24.04 
 
 
1083 aa  47  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00247822 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3158  response regulator receiver protein  29.69 
 
 
446 aa  46.2  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3989  transcriptional regulator, SARP family  25.61 
 
 
1003 aa  46.6  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0138619  normal  0.888144 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0829  ATPase-like protein  28.41 
 
 
1092 aa  46.6  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0910  transcriptional activator domain-containing protein  34.94 
 
 
1064 aa  47  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0084  transcriptional activator domain  25.5 
 
 
1071 aa  47  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6503  transcriptional regulator, SARP family  25.68 
 
 
252 aa  46.6  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.287037  normal  0.225314 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5039  transcriptional regulator, SARP family  26.72 
 
 
993 aa  46.6  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4249  transcriptional regulator, SARP family  25.31 
 
 
1108 aa  46.6  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.319347 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6515  transcriptional regulator, SARP family  28.05 
 
 
1004 aa  45.8  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.409149  normal  0.360927 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2405  transcriptional activator domain protein  28.97 
 
 
1025 aa  45.8  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.375799  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4139  SARP family transcriptional regulator  27.41 
 
 
309 aa  45.4  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0699  transcriptional activator domain-containing protein  25.96 
 
 
1094 aa  45.1  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00060152 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1245  transcriptional regulator, winged helix family  27.78 
 
 
1158 aa  45.4  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.275106  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3460  transcriptional activator domain-containing protein  27.57 
 
 
1061 aa  45.1  0.004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1206  hypothetical protein  26.05 
 
 
1142 aa  45.1  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0243  transcriptional activator domain protein  30.7 
 
 
1083 aa  45.1  0.004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0968  TPR repeat-containing protein  32.37 
 
 
584 aa  44.3  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2444  SARP family transcriptional regulator  25.18 
 
 
259 aa  44.7  0.005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.467324  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2003  transcriptional regulator, SARP family  26.64 
 
 
867 aa  44.7  0.005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.228987  hitchhiker  0.0000000440234 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2412  transcriptional regulator, SARP family  24.23 
 
 
370 aa  44.3  0.006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0744334 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4653  transcriptional regulator  23.79 
 
 
1148 aa  44.3  0.006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.346184  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4345  transcriptional activator domain-containing protein  25.36 
 
 
1095 aa  44.3  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00663384 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3322  transcriptional activator domain-containing protein  23.11 
 
 
1204 aa  43.9  0.008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.11039  normal  0.190141 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1372  transcriptional regulator, winged helix family  31.6 
 
 
1227 aa  43.5  0.009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.291577  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4966  transcriptional regulator, SARP family  27.67 
 
 
1030 aa  43.5  0.009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.998552 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0366  transcriptional activator domain protein  25.82 
 
 
1097 aa  43.9  0.009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.37715 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>