More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_2636 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_2636  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 747 aa  1536    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.942188 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2302  TonB-dependent receptor  46.03 
 
 		 738 aa  644    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1945  TonB-dependent receptor  46.03 
 
 		 738 aa  644    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3363  TonB-dependent receptor  51.84 
 
 		 765 aa  713    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.451607  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4483  TonB-dependent receptor:TonB-dependent receptor  44.37 
 
 		 768 aa  628  1e-178  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.793937  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0671  TonB-dependent receptor, putative  44.05 
 
 		 768 aa  624  1e-177  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02512  TonB-dependent receptor  44.81 
 
 		 777 aa  615  1e-175  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2269  TonB-dependent receptor  43.41 
 
 		 772 aa  564  1.0000000000000001e-159  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1484  TonB-dependent receptor  41.12 
 
 		 777 aa  525  1e-147  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.828493  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3415  TonB-dependent receptor  39.58 
 
 		 792 aa  499  1e-139  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.151131 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4625  TonB-dependent receptor  37.88 
 
 		 753 aa  473  1e-132  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.175039  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3525  TonB-dependent receptor  39.14 
 
 		 766 aa  457  1e-127  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2385  TonB-dependent receptor  33.61 
 
 		 799 aa  383  1e-105  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.817554  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2634  TonB-dependent receptor plug  31.21 
 
 		 814 aa  294  4e-78  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1455  TonB-dependent receptor  27.06 
 
 		 835 aa  245  3e-63  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0940  TonB-dependent receptor  26.97 
 
 		 780 aa  224  4.9999999999999996e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03673  TonB-dependent receptor  26.73 
 
 		 768 aa  222  1.9999999999999999e-56  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4420  TonB-dependent receptor  26.91 
 
 		 762 aa  217  7e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0308  TonB-dependent receptor  26.37 
 
 		 791 aa  196  1e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.264582  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2585  TonB-dependent receptor  25.51 
 
 		 790 aa  183  9.000000000000001e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0776775  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3784  TonB-dependent receptor  24.87 
 
 		 772 aa  174  5.999999999999999e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.562566 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0913  TonB-dependent receptor  25.21 
 
 		 786 aa  172  1e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0111103  normal  0.947577 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02852  TonB-dependent receptor  24.21 
 
 		 808 aa  168  4e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1495  TonB-dependent receptor  27.58 
 
 		 792 aa  166  2.0000000000000002e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.879614 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1876  TonB-dependent receptor  25.22 
 
 		 815 aa  155  2.9999999999999998e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0562721 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2519  TonB-dependent receptor  23.25 
 
 		 782 aa  147  8.000000000000001e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0131105 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4698  TonB-dependent receptor  23.95 
 
 		 828 aa  144  7e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.648479 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2543  TonB-dependent receptor  29.51 
 
 		 796 aa  142  3e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.546908  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0702  TonB-dependent receptor  23.65 
 
 		 729 aa  141  4.999999999999999e-32  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0169584  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1014  TonB-dependent receptor, putative  24.39 
 
 		 760 aa  139  2e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0510  TonB-dependent receptor  23.58 
 
 		 798 aa  137  5e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.426482  hitchhiker  0.00139676 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0876  TonB-dependent receptor:TonB-dependent receptor, C-terminal  23.6 
 
 		 760 aa  137  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.341234  normal  0.740329 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0602  TonB-dependent receptor  23.44 
 
 		 747 aa  131  4.0000000000000003e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.520923  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0810  TonB-dependent receptor  24.34 
 
 		 746 aa  130  9.000000000000001e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0160  outer membrane receptor protein  23.58 
 
 		 740 aa  120  9.999999999999999e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3410  TonB-dependent receptor  26.82 
 
 		 781 aa  112  3e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0440  TonB-dependent receptor, putative  21.21 
 
 		 734 aa  107  8e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1253  TonB-dependent receptor, putative  21.64 
 
 		 740 aa  105  2e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0080071  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3042  TonB-dependent receptor  23.46 
 
 		 841 aa  103  1e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04406  TonB-dependent outer membrane Receptor  25.72 
 
 		 766 aa  103  2e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0676  TonB-dependent receptor  21.58 
 
 		 756 aa  99.4  2e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.102109  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2134  TonB-dependent receptor plug  21.22 
 
 		 781 aa  92.4  3e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.682313 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1540  TonB-dependent receptor, putative  20.84 
 
 		 730 aa  89.4  2e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1997  TonB-dependent receptor, putative  19.95 
 
 		 741 aa  84  0.000000000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1512  TonB-dependent receptor  28.85 
 
 		 782 aa  80.9  0.00000000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.116652 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0865  TonB-dependent receptor  23.95 
 
 		 700 aa  79.3  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0848071  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0734  TonB-dependent receptor  27.27 
 
 		 736 aa  73.9  0.00000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3229  TonB-dependent receptor  23.81 
 
 		 768 aa  71.2  0.00000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2832  TonB-dependent receptor  23.81 
 
 		 768 aa  71.2  0.00000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2061  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 742 aa  70.1  0.0000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.302386  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1644  TonB-dependent siderophore receptor  25.24 
 
 		 745 aa  69.7  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0931  TonB-dependent siderophore receptor  26.47 
 
 		 809 aa  68.2  0.0000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.79278  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0369  TonB-dependent receptor  21.45 
 
 		 782 aa  67.8  0.0000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3345  TonB-dependent siderophore receptor  23.1 
 
 		 705 aa  67.4  0.0000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0305411 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1853  TonB-dependent receptor  24.43 
 
 		 721 aa  65.5  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.80471  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0687  TonB-dependent siderophore receptor  23.82 
 
 		 797 aa  65.9  0.000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.862135  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3327  TonB-dependent siderophore receptor  30.85 
 
 		 799 aa  65.9  0.000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21730  putative TonB-dependent receptor  25.42 
 
 		 721 aa  65.5  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2953  TonB-dependent siderophore receptor  27.78 
 
 		 792 aa  64.7  0.000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5806  ferric citrate outer membrane transporter  26.91 
 
 		 731 aa  63.5  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0305  TonB-dependent receptor  24.74 
 
 		 786 aa  63.5  0.00000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.301005 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2772  TonB-dependent receptor  27.17 
 
 		 794 aa  63.5  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.600395  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1775  TonB-dependent siderophore receptor  25.26 
 
 		 721 aa  63.9  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.441598 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5169  TonB-dependent siderophore receptor  24.3 
 
 		 723 aa  63.9  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32740  TonB-dependent receptor  27.17 
 
 		 820 aa  62.8  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.014522  hitchhiker  0.000022757 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1076  iron transporter  28.89 
 
 		 743 aa  63.2  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.337763 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2882  TonB-dependent receptor  24.62 
 
 		 786 aa  62.8  0.00000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4358  TonB-dependent receptor  27.01 
 
 		 756 aa  62.4  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2950  TonB-dependent siderophore receptor  25.3 
 
 		 720 aa  62  0.00000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3574  TonB-dependent siderophore receptor, putative  22.71 
 
 		 706 aa  61.6  0.00000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3724  TonB-dependent receptor for iron transport  26.61 
 
 		 765 aa  61.2  0.00000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0957  TonB-dependent receptor  23.56 
 
 		 790 aa  61.2  0.00000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1595  TonB-dependent siderophore receptor  25.71 
 
 		 744 aa  61.2  0.00000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.603088  normal  0.0988814 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2308  TonB-dependent siderophore receptor  24.39 
 
 		 693 aa  60.8  0.00000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00270239  normal  0.034674 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2072  TonB-dependent receptor  28.36 
 
 		 786 aa  60.5  0.0000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.516649  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1994  TonB-dependent receptor  22.61 
 
 		 698 aa  60.1  0.0000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0121  TonB-dependent siderophore receptor  26.14 
 
 		 797 aa  59.3  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0179  TonB-dependent siderophore receptor  26.36 
 
 		 828 aa  59.7  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.267617 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0685  TonB-dependent siderophore receptor  23.1 
 
 		 781 aa  59.3  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00630295  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3270  TonB-dependent siderophore receptor  24.66 
 
 		 831 aa  59.7  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0050464 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2103  TonB-dependent receptor  25.81 
 
 		 873 aa  59.3  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0210734  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4173  TonB-dependent receptor  30.16 
 
 		 739 aa  59.3  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1714  TonB-dependent siderophore receptor  23.88 
 
 		 729 aa  58.9  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.666149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0897  TonB-dependent siderophore receptor  23.43 
 
 		 809 aa  58.9  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.448435  normal  0.28892 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1499  TonB-dependent siderophore receptor  25.72 
 
 		 747 aa  58.9  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0006  TonB-dependent siderophore receptor  26.62 
 
 		 709 aa  58.5  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0867  FecA-like outer membrane receptor  23.43 
 
 		 809 aa  58.5  0.0000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.272294  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2121  TonB-dependent siderophore receptor  26.1 
 
 		 722 aa  58.5  0.0000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0440064  normal  0.552205 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0160  TonB-dependent siderophore receptor  26.36 
 
 		 828 aa  58.5  0.0000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.728985  hitchhiker  0.000124393 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0858  TonB-dependent siderophore receptor  28.07 
 
 		 796 aa  58.2  0.0000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2497  TonB-dependent receptor  25.81 
 
 		 873 aa  58.5  0.0000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.842174 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4606  TonB-dependent siderophore receptor  27.8 
 
 		 796 aa  57.8  0.0000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1876  TonB-dependent siderophore receptor  25.4 
 
 		 744 aa  57.8  0.0000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.150042  normal  0.0292257 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0911  TonB-dependent siderophore receptor  23.6 
 
 		 809 aa  57.4  0.0000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.11228 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2570  TonB-dependent receptor  23.45 
 
 		 694 aa  57  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00469469  hitchhiker  0.000000281684 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01120  TonB-dependent siderophore receptor  22.6 
 
 		 793 aa  57  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0241  TonB-dependent receptor  22.19 
 
 		 675 aa  57.4  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.571494  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0493  TonB-dependent siderophore receptor  22.4 
 
 		 696 aa  56.2  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.478973 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2266  TonB-dependent siderophore receptor  22.53 
 
 		 724 aa  56.6  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.238084  normal  0.145177 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3577  hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  22.8 
 
 		 718 aa  56.2  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.601026  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>