More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_0206 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_0206  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 1064 aa  2111    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.676581 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3993  TonB-dependent receptor plug  38.71 
 
 		 1081 aa  651    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.356607  hitchhiker  0.00078443 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0203  TonB-dependent receptor plug  54.7 
 
 		 1047 aa  1060    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.671806  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4238  TonB-dependent receptor plug  37.74 
 
 		 1101 aa  645    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.324015  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7043  TonB-dependent receptor plug  38.18 
 
 		 1189 aa  622  1e-176  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6039  TonB-dependent receptor plug  37.42 
 
 		 1059 aa  572  1.0000000000000001e-162  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.29047  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2718  TonB-dependent receptor plug  35.37 
 
 		 1068 aa  571  1e-161  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0458  TonB-dependent receptor plug  36.56 
 
 		 1071 aa  565  1.0000000000000001e-159  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0080  TonB-dependent receptor plug  33.55 
 
 		 1040 aa  557  1e-157  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6878  TonB-dependent receptor  34.09 
 
 		 1078 aa  550  1e-155  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.581395  normal  0.385444 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2043  TonB-dependent receptor, plug  34.62 
 
 		 1028 aa  527  1e-148  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.495836  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4500  TonB-dependent receptor, plug  34.61 
 
 		 1058 aa  527  1e-148  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1098  TonB-dependent receptor  33.66 
 
 		 1105 aa  525  1e-147  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.939091  normal  0.767755 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1460  TonB-dependent receptor plug  35.3 
 
 		 1065 aa  523  1e-147  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2438  TonB-dependent receptor plug  33.64 
 
 		 1129 aa  518  1.0000000000000001e-145  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2624  TonB-dependent receptor plug  33.73 
 
 		 1051 aa  512  1e-143  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0405  TonB-dependent receptor plug  34.5 
 
 		 1011 aa  505  1e-141  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000611509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2345  TonB-dependent receptor  33.72 
 
 		 1050 aa  491  1e-137  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.117274 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0613  TonB-dependent receptor plug  34.08 
 
 		 1059 aa  485  1e-135  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4977  TonB-dependent receptor plug  33.7 
 
 		 1031 aa  484  1e-135  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000497416  normal  0.504247 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0967  TonB-dependent receptor  32.5 
 
 		 1093 aa  481  1e-134  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4801  TonB-dependent receptor plug  33.54 
 
 		 1074 aa  476  1e-133  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0616  TonB-dependent receptor plug  33.7 
 
 		 1063 aa  470  1.0000000000000001e-131  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1893  TonB-dependent receptor plug  32.7 
 
 		 1038 aa  464  1e-129  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.41839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4941  TonB-dependent receptor  32.27 
 
 		 1039 aa  454  1.0000000000000001e-126  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3384  TonB-dependent receptor  33.67 
 
 		 1166 aa  451  1e-125  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.880161  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6880  TonB-dependent receptor plug  32.44 
 
 		 1081 aa  451  1e-125  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0740093  normal  0.354898 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0328  TonB-dependent receptor plug  30.28 
 
 		 1127 aa  450  1e-125  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4562  TonB-dependent receptor, plug  31.41 
 
 		 1065 aa  440  9.999999999999999e-123  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0744  TonB-dependent receptor plug  31.03 
 
 		 1088 aa  442  9.999999999999999e-123  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04165  outer membrane protein  30.6 
 
 		 1071 aa  440  9.999999999999999e-123  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3553  TonB-dependent receptor plug  32.97 
 
 		 1081 aa  439  9.999999999999999e-123  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.467854  decreased coverage  0.00228984 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3978  TonB-dependent receptor plug  30.87 
 
 		 1059 aa  436  1e-120  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00000935862  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2719  TonB-dependent receptor plug  33.51 
 
 		 1073 aa  435  1e-120  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0834373  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0593  TonB-dependent receptor plug  32.61 
 
 		 1135 aa  426  1e-117  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0125278 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1166  TonB-dependent receptor plug  33.07 
 
 		 1084 aa  424  1e-117  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.689476  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1103  TonB-dependent receptor plug  31.96 
 
 		 1138 aa  421  1e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.240572  normal  0.101301 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3031  TonB-dependent receptor plug  32.67 
 
 		 1022 aa  422  1e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.258909  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1167  TonB-dependent receptor plug  31.2 
 
 		 1071 aa  417  9.999999999999999e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0369  TonB-dependent receptor  30.52 
 
 		 1234 aa  419  9.999999999999999e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3367  TonB-dependent receptor plug  31.77 
 
 		 1033 aa  417  9.999999999999999e-116  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.994528 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3959  TonB-dependent receptor plug  32.35 
 
 		 1044 aa  417  9.999999999999999e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.734415  normal  0.166506 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3363  TonB-dependent receptor plug  31.63 
 
 		 1043 aa  414  1e-114  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0179499  normal  0.688062 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1006  TonB-dependent receptor plug  31.08 
 
 		 1038 aa  413  1e-114  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0320899  normal  0.449755 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1886  TonB-dependent receptor plug  32.05 
 
 		 1063 aa  415  1e-114  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6733  TonB-dependent receptor  31.26 
 
 		 1098 aa  412  1e-113  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00154569  normal  0.0819442 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3220  TonB-dependent receptor plug  32.7 
 
 		 1115 aa  410  1e-113  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1897  TonB-dependent receptor plug  29.67 
 
 		 1102 aa  409  1.0000000000000001e-112  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.734415  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3946  TonB-dependent receptor plug  31.01 
 
 		 1043 aa  401  9.999999999999999e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3960  TonB-dependent receptor plug  31.43 
 
 		 1142 aa  400  9.999999999999999e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0403  TonB-dependent receptor, plug  32.52 
 
 		 1083 aa  399  1e-109  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4810  TonB-dependent receptor plug  31.54 
 
 		 1073 aa  399  1e-109  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0674411  normal  0.790047 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6611  TonB-dependent receptor plug  32.91 
 
 		 1137 aa  395  1e-108  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0615  TonB-dependent receptor plug  31.89 
 
 		 1098 aa  393  1e-108  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1413  TonB-dependent receptor plug  31.07 
 
 		 1165 aa  394  1e-108  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.177661  normal  0.496706 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2451  TonB-dependent receptor plug  30.73 
 
 		 1153 aa  392  1e-107  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.117099  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0339  TonB-dependent receptor plug  30.92 
 
 		 1087 aa  385  1e-105  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.135408  decreased coverage  0.000558504 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05670  outer membrane protein  30.72 
 
 		 1025 aa  385  1e-105  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.40002  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4131  TonB-dependent receptor plug  30.11 
 
 		 1027 aa  382  1e-104  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.28448  normal  0.339257 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2711  TonB-dependent receptor, plug  29.15 
 
 		 1032 aa  375  1e-102  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7182  TonB-dependent receptor plug  29.34 
 
 		 1186 aa  373  1e-102  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.893491  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2721  TonB-dependent receptor plug  29.02 
 
 		 1072 aa  372  1e-101  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1702  TonB-dependent receptor plug  30.08 
 
 		 1176 aa  366  2e-99  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.456283  normal  0.767755 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1387  TonB-dependent receptor plug  29.08 
 
 		 1008 aa  365  3e-99  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.840954  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4225  TonB-dependent receptor plug  29.67 
 
 		 1041 aa  365  4e-99  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.501222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3789  TonB-dependent receptor plug  29.71 
 
 		 1169 aa  364  5.0000000000000005e-99  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.474486  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6466  TonB-dependent receptor plug  30.12 
 
 		 1147 aa  363  9e-99  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000431216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4559  TonB-dependent receptor, plug  29.16 
 
 		 1010 aa  363  1e-98  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0665  TonB-dependent receptor, plug  29.54 
 
 		 1051 aa  362  3e-98  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6729  TonB-dependent receptor plug  29.73 
 
 		 1036 aa  361  5e-98  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3036  TonB-dependent receptor plug  29.66 
 
 		 1033 aa  356  2e-96  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000276569  normal  0.556141 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4175  TonB-dependent receptor plug  30.1 
 
 		 1099 aa  349  2e-94  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000931261  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5278  TonB-dependent receptor plug  29.6 
 
 		 1163 aa  348  3e-94  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.054683  normal  0.154876 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0570  TonB-dependent receptor plug  30.2 
 
 		 1088 aa  346  1e-93  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.7399  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1888  TonB-dependent receptor plug  27.5 
 
 		 1153 aa  344  5e-93  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3040  TonB-dependent receptor plug  29.04 
 
 		 1107 aa  343  1e-92  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0955373 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4505  TonB-dependent receptor plug  28.72 
 
 		 1046 aa  328  4.0000000000000003e-88  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3400  TonB-dependent receptor plug  28.27 
 
 		 1057 aa  317  5e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.101583 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6451  TonB-dependent receptor plug  29.7 
 
 		 1062 aa  315  2.9999999999999996e-84  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.402176  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4206  TonB-dependent receptor plug  28.31 
 
 		 1023 aa  315  2.9999999999999996e-84  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.43352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4210  TonB-dependent receptor plug  28.34 
 
 		 1027 aa  311  5e-83  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2768  TonB-dependent receptor plug  29.19 
 
 		 1067 aa  308  3e-82  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000113347 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0801  TonB-dependent receptor plug  28.52 
 
 		 1116 aa  301  6e-80  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.383306  normal  0.353517 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6791  TonB-dependent receptor plug  26.81 
 
 		 1138 aa  293  1e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00672159 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0725  TonB-dependent receptor plug  27.35 
 
 		 1129 aa  290  7e-77  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6808  TonB-dependent receptor plug  27.23 
 
 		 1040 aa  290  1e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.14685  hitchhiker  0.0000111053 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0754  TonB-dependent receptor plug  27.23 
 
 		 1038 aa  278  4e-73  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0868  TonB-dependent receptor plug  26.72 
 
 		 1117 aa  268  5.999999999999999e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.503541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2231  TonB-dependent receptor  26.01 
 
 		 1037 aa  264  4.999999999999999e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0106  TonB-dependent receptor plug  26.97 
 
 		 1161 aa  264  6e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.813272 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0633  TonB-dependent receptor plug  26.56 
 
 		 1051 aa  263  8.999999999999999e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1497  TonB-dependent receptor plug  28.19 
 
 		 1102 aa  263  8.999999999999999e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0349817  normal  0.348136 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2137  TonB-dependent receptor  28.18 
 
 		 1050 aa  264  8.999999999999999e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.341252 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1473  TonB-dependent receptor plug  25.95 
 
 		 1021 aa  263  1e-68  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0507296  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4782  TonB-dependent receptor  28.57 
 
 		 1144 aa  263  1e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0517  TonB-dependent receptor plug  28.07 
 
 		 1079 aa  261  5.0000000000000005e-68  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00691283 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1905  TonB-dependent receptor plug  25.65 
 
 		 1070 aa  258  3e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4269  TonB-dependent receptor  26.45 
 
 		 1038 aa  257  9e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.927077  normal  0.139586 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2116  TonB-dependent receptor plug  25.95 
 
 		 1114 aa  256  2.0000000000000002e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.398452  normal  0.942953 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01945  putative outer membrane protein  25.85 
 
 		 977 aa  254  7e-66  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.783839  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>