153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_15980 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_15980  transcriptional regulator  100 
 
 		 179 aa  347  7e-95  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.47032  normal  0.185748 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0280  TetR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 196 aa  77  0.0000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3503  TetR family transcriptional regulator  32.92 
 
 		 198 aa  69.3  0.00000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2813  TetR family transcriptional regulator  34.08 
 
 		 215 aa  67  0.0000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3573  transcriptional regulator, TetR family  35.43 
 
 		 196 aa  67.4  0.0000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5734  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 199 aa  59.7  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.801726 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1647  transcriptional regulator, TetR family  38.02 
 
 		 197 aa  59.7  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7752  putative transcriptional regulator, TetR family  36.76 
 
 		 202 aa  59.3  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2803  transcriptional regulator, TetR family  26.16 
 
 		 194 aa  58.2  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.014286  normal  0.214284 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3314  transcriptional regulator, TetR family  26.16 
 
 		 194 aa  58.2  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1335  transcriptional regulator, TetR family  31.3 
 
 		 194 aa  56.2  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.293374 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19310  hypothetical protein  31.58 
 
 		 215 aa  56.2  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0818404  normal  0.200215 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0541  transcriptional regulator, TetR family  32.62 
 
 		 192 aa  56.2  0.0000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.451413  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25560  transcriptional regulator  33.06 
 
 		 207 aa  55.8  0.0000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0772  transcriptional regulator, TetR family  42.53 
 
 		 223 aa  54.7  0.0000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7124  transcriptional regulator  33.54 
 
 		 203 aa  54.7  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5790  hypothetical protein  30.05 
 
 		 207 aa  53.5  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209005  normal  0.0606988 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6137  transcriptional regulator, TetR family  32.61 
 
 		 196 aa  53.1  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.780623 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5404  transcriptional regulator, TetR family  27.48 
 
 		 192 aa  52.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0587042  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2529  transcriptional regulator, TetR family  31.85 
 
 		 202 aa  53.1  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000510912 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2399  TetR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 204 aa  52.8  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0482124  hitchhiker  0.0000585185 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2809  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 206 aa  52  0.000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00640157  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5475  transcriptional regulator, TetR family  38.14 
 
 		 202 aa  52.4  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2786  transcriptional regulator, TetR family  37.08 
 
 		 190 aa  52.4  0.000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.06199  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5235  transcriptional regulator  36.89 
 
 		 207 aa  52  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.16745 
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4308  transcriptional regulator, TetR family  33.55 
 
 		 195 aa  51.6  0.000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0100295  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6061  TetR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 191 aa  51.2  0.000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.660328  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1921  transcriptional regulator, TetR family  29.31 
 
 		 197 aa  51.2  0.000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0409606  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31350  hypothetical protein  34.71 
 
 		 203 aa  50.8  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.112877  normal  0.357558 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0538  transcriptional regulator, TetR family  38.04 
 
 		 254 aa  50.8  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5697  TetR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 227 aa  50.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.949992  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7518  TetR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 185 aa  49.7  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6545  TetR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 227 aa  50.1  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.129926 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1836  transcriptional regulator, TetR family  37 
 
 		 207 aa  48.9  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0359893  normal  0.350648 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0401  TetR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 239 aa  48.9  0.00004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.533862  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2924  TetR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 235 aa  48.1  0.00006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.480778  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0378  TetR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 199 aa  47.8  0.00009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.585496  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0254  transcriptional regulator, TetR family  34.35 
 
 		 198 aa  47.8  0.00009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.631026 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2855  transcriptional regulator, TetR family  26.73 
 
 		 199 aa  47.8  0.00009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00414349  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0462  TetR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 239 aa  47.4  0.0001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.573533  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6105  TetR family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 201 aa  47.4  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.93473  normal  0.666323 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2619  transcriptional regulator, TetR family  28.22 
 
 		 221 aa  47.4  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.844619 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5866  TetR family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 236 aa  47  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2094  transcriptional regulator, TetR family  23.87 
 
 		 186 aa  47.4  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000324065 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2341  TetR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 206 aa  46.6  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.554096 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0293  transcriptional regulator, TetR family  34.21 
 
 		 230 aa  47  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5593  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 233 aa  46.2  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.531399  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2788  transcriptional regulator, TetR family  28.76 
 
 		 201 aa  45.8  0.0003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1664  transcriptional regulator, TetR family  28.95 
 
 		 197 aa  45.4  0.0004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.294171  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5365  transcriptional regulator, TetR family  43.08 
 
 		 176 aa  45.4  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23720  transcriptional regulator, tetR family  39.39 
 
 		 192 aa  45.4  0.0005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.232738 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2281  regulatory protein, TetR  31.11 
 
 		 205 aa  45.4  0.0005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.45314 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2186  TetR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 214 aa  45.1  0.0005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0785456  normal  0.820524 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4915  transcriptional regulator, TetR family  31.48 
 
 		 206 aa  45.1  0.0006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.259096  normal  0.574827 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2687  transcriptional regulator, TetR family  27.51 
 
 		 202 aa  45.1  0.0006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.782088  normal  0.486602 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0235  transcriptional regulator, TetR family  32.22 
 
 		 199 aa  45.1  0.0006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0309861  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3850  TetR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 207 aa  44.7  0.0007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.349935 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3520  TetR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 198 aa  44.7  0.0007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.140443 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5643  putative TetR family transcriptional regulator  48.98 
 
 		 232 aa  44.7  0.0008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.375487 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3510  TetR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 197 aa  44.3  0.0008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0074  TetR/AcrR family transcriptional regulator  23.84 
 
 		 196 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1684  TetR family transcriptional regulator  27.42 
 
 		 227 aa  43.9  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24710  transcriptional regulator, tetR family  36.51 
 
 		 198 aa  44.3  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4073  TetR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 245 aa  43.9  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2354  regulatory protein, TetR  35.53 
 
 		 202 aa  44.3  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.291853  normal  0.0619707 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0565  transcriptional regulator BetI  38.16 
 
 		 202 aa  43.9  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.359685 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1884  TetR family transcriptional regulator  45.65 
 
 		 189 aa  43.9  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.652086  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2845  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 197 aa  43.9  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.735257  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4165  TetR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 198 aa  43.9  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.774051  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1561  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 214 aa  43.9  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2499  TetR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 204 aa  44.3  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0292579 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10080  Transcriptional regulator, TetR family  33.01 
 
 		 217 aa  44.3  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.530554  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0425  transcriptional regulator, TetR family  30.97 
 
 		 195 aa  43.9  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.752712  normal  0.122961 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2076  transcriptional regulator, TetR family  31.43 
 
 		 209 aa  44.3  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.954712 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2666  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 213 aa  43.5  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4429  TetR family transcriptional regulator  31.45 
 
 		 192 aa  43.5  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.247191  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3158  TetR family transcriptional regulator  26.43 
 
 		 202 aa  43.5  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.303852  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2692  TetR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 195 aa  43.1  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.728372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3783  TetR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 197 aa  43.5  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.539516 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5718  putative transcriptional regulator  30.95 
 
 		 215 aa  43.5  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4321  regulatory protein TetR  33.1 
 
 		 194 aa  43.5  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0684654  normal  0.242009 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1768  TetR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 211 aa  43.1  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.570427  normal  0.275415 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0731  TetR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 227 aa  43.1  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00250469 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0961  TetR family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 202 aa  43.1  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0186381 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3578  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 198 aa  43.1  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00935563  normal  0.0256006 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2508  TetR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 195 aa  43.1  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0332011  normal  0.924216 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2482  transcriptional regulator, TetR family  29.68 
 
 		 196 aa  43.1  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4654  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 199 aa  42.4  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.416931  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3171  transcriptional regulator, TetR family  34.85 
 
 		 216 aa  42.7  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.323724  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3036  regulatory protein, TetR  34.85 
 
 		 216 aa  42.7  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0300267  normal  0.0658454 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2737  TetR family transcriptional regulator  24.64 
 
 		 220 aa  42.4  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4250  transcriptional regulator, TetR family  41.46 
 
 		 194 aa  42.7  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.229004  normal  0.19782 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1650  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 196 aa  42.7  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00305011  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0876  TetR family transcriptional regulator  21.53 
 
 		 226 aa  42.4  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.140831 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5991  TetR family transcriptional regulator  48 
 
 		 244 aa  42.4  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0553876 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2214  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 195 aa  42.7  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2883  TetR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 223 aa  42.7  0.003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.683731  normal  0.331569 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3308  transcriptional regulator BetI  27.41 
 
 		 196 aa  42.7  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3316  transcriptional regulator, TetR family  30.08 
 
 		 249 aa  42.7  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.655704  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2999  transcriptional regulator, TetR family  32.32 
 
 		 235 aa  42.7  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>