More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0215 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_0215  Lytic transglycosylase catalytic  100 
 
 		 733 aa  1473    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2042  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  34.34 
 
 		 617 aa  284  5.000000000000001e-75  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000130746  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1354  Lytic transglycosylase catalytic  35.48 
 
 		 661 aa  275  3e-72  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.828484  normal  0.0280405 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0549  lytic transglycosylase, catalytic  30.62 
 
 		 638 aa  273  1e-71  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.357331  normal  0.13799 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1124  Lytic transglycosylase catalytic  33.39 
 
 		 596 aa  267  4e-70  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.331825  normal  0.414792 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1010  Slt family transglycosylase  36.2 
 
 		 506 aa  265  3e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0695  Lytic transglycosylase catalytic  36.91 
 
 		 499 aa  263  6.999999999999999e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000410524  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0087  Lytic transglycosylase catalytic  36.47 
 
 		 620 aa  262  2e-68  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4010  lytic transglycosylase, catalytic  34.64 
 
 		 507 aa  260  7e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000241761  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2556  peptidoglycan-binding LysM:lytic transglycosylase, catalytic  35.18 
 
 		 499 aa  251  3e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000626959  hitchhiker  0.0000000459399 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0976  lytic transglycosylase, catalytic  28.82 
 
 		 610 aa  249  1e-64  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.773866  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0489  Lytic transglycosylase catalytic  34.5 
 
 		 487 aa  245  1.9999999999999999e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000573639 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0393  lytic transglycosylase, catalytic  34.1 
 
 		 498 aa  242  1e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00582053  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0472  lytic transglycosylase catalytic protein  41.79 
 
 		 484 aa  239  1e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0026  peptidoglycan-binding lytic transglycosylase  33.88 
 
 		 495 aa  239  1e-61  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.250795  normal  0.876942 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03310  Peptidoglycan-binding LysM  33.53 
 
 		 523 aa  238  3e-61  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4500  Lytic transglycosylase catalytic  30.9 
 
 		 523 aa  237  5.0000000000000005e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3580  peptidoglycan-binding LysM  34.58 
 
 		 544 aa  235  2.0000000000000002e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2744  Lytic transglycosylase catalytic  32.85 
 
 		 448 aa  233  7.000000000000001e-60  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  6.42143e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0965  Lytic transglycosylase catalytic  33.02 
 
 		 570 aa  231  3e-59  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01980  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase  32.41 
 
 		 554 aa  230  6e-59  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.531039  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0305  Lytic transglycosylase catalytic  39.22 
 
 		 440 aa  229  1e-58  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0139  membrane-bound lytic murein transglycosylase D, putative  37.39 
 
 		 451 aa  228  3e-58  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.518176 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1537  lytic transglycosylase, catalytic  32.2 
 
 		 580 aa  227  6e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.324928  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1087  lytic transglycosylase, catalytic  33.13 
 
 		 650 aa  227  7e-58  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.106498  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2218  Lytic transglycosylase catalytic  31.06 
 
 		 618 aa  224  4.9999999999999996e-57  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.70593 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1379  peptidoglycan-binding LysM  33.13 
 
 		 556 aa  220  7.999999999999999e-56  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3908  lytic transglycosylase catalytic  34.58 
 
 		 544 aa  219  1e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0496507 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2728  Lytic transglycosylase catalytic  36.83 
 
 		 547 aa  219  1e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2024  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  32.24 
 
 		 543 aa  219  1e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000444434  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1998  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase  30.43 
 
 		 552 aa  218  4e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2115  lytic transglycosylase, catalytic  30.92 
 
 		 511 aa  213  7e-54  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000101549  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1895  Lytic transglycosylase catalytic  30.37 
 
 		 693 aa  209  2e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3715  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  31.45 
 
 		 530 aa  207  4e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.284464  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0953  lytic transglycosylase, catalytic  32.61 
 
 		 556 aa  207  4e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3789  peptidoglycan-binding lytic transglycosylase  39.3 
 
 		 572 aa  204  4e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.145262  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1760  peptidoglycan-binding LysM:SLT:MLTD_N  31.81 
 
 		 534 aa  204  7e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.721447 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0661  Lytic transglycosylase catalytic  30.02 
 
 		 415 aa  202  9.999999999999999e-51  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.398223  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1522  Lytic transglycosylase catalytic  36.81 
 
 		 561 aa  202  1.9999999999999998e-50  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00867161  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41090  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  31.65 
 
 		 534 aa  202  3e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3484  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  32.35 
 
 		 515 aa  202  3e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0499239  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3846  Lytic transglycosylase catalytic  39.59 
 
 		 573 aa  201  3.9999999999999996e-50  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1767  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  30.44 
 
 		 499 aa  200  6e-50  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.247006  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2022  lytic transglycosylase, catalytic  30.86 
 
 		 518 aa  200  9e-50  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000299101  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2063  lytic transglycosylase, catalytic  32.64 
 
 		 498 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.829079  normal  0.0945255 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0694  lytic transglycosylase catalytic  32.39 
 
 		 595 aa  200  1.0000000000000001e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000324493  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0420  Slt family transglycosylase  30.24 
 
 		 487 aa  199  2.0000000000000003e-49  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00605393  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1829  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  31.24 
 
 		 532 aa  198  2.0000000000000003e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03214  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  29.82 
 
 		 528 aa  198  3e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1894  lytic transglycosylase, catalytic  29.48 
 
 		 553 aa  198  4.0000000000000005e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0630277  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3932  Lytic transglycosylase catalytic  39.3 
 
 		 573 aa  197  6e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1995  lytic transglycosylase, catalytic  33.26 
 
 		 539 aa  197  6e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0964783  normal  0.42715 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2920  lytic transglycosylase, catalytic  30.48 
 
 		 587 aa  197  7e-49  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.654046 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1701  lytic transglycosylase catalytic  32.47 
 
 		 548 aa  196  1e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000779386  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2612  lytic transglycosylase catalytic  32.89 
 
 		 517 aa  196  2e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00320162  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1354  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase D  40.34 
 
 		 372 aa  194  5e-48  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.401236  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002769  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  30.58 
 
 		 527 aa  192  1e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0709625  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0748  membrane-bound lytic murein transglycosylase D, putative  40 
 
 		 372 aa  192  2e-47  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0499  lytic transglycosylase, catalytic  29.61 
 
 		 524 aa  192  2e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0979868 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2208  lytic transglycosylase, catalytic  30.14 
 
 		 517 aa  191  4e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.738412  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3834  Lytic transglycosylase catalytic  35.61 
 
 		 405 aa  191  4e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0673  membrane-bound lytic murein transglycosylase D, putative  39.66 
 
 		 372 aa  191  5e-47  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1174  peptidoglycan-binding LysM  35.71 
 
 		 522 aa  190  7e-47  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.106358 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1256  hypothetical protein  30.04 
 
 		 479 aa  189  2e-46  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1775  MltD domain-containing protein  30.46 
 
 		 514 aa  186  1.0000000000000001e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000157284  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1257  hypothetical protein  29.16 
 
 		 479 aa  184  6e-45  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1588  lytic transglycosylase, catalytic  31.82 
 
 		 550 aa  184  7e-45  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.128959  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1482  lytic transglycosylase, catalytic  32.24 
 
 		 518 aa  183  1e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00124104  normal  0.157348 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2010  MltD domain-containing protein  30.1 
 
 		 515 aa  182  2e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000075439  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0925  lytic transglycosylase, catalytic  29.95 
 
 		 546 aa  182  2e-44  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2058  MltD domain-containing protein  30.1 
 
 		 515 aa  182  2e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000280518  decreased coverage  0.000141788 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1995  MltD domain-containing protein  30.1 
 
 		 519 aa  181  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0597997  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2162  MltD domain-containing protein  30.26 
 
 		 515 aa  182  2.9999999999999997e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000015187  normal  0.0463947 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1885  Slt family transglycosylase  33.72 
 
 		 495 aa  181  2.9999999999999997e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000159239  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2328  MLTD_N domain protein  30.1 
 
 		 515 aa  181  4e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000191267  hitchhiker  0.00043621 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2239  MltD domain-containing protein  30.06 
 
 		 515 aa  180  9e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000290674  normal  0.325041 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2370  MltD domain-containing protein  29.8 
 
 		 515 aa  180  9e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000191622  normal  0.0274164 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29630  Peptidoglycan-binding LysM:SLT:MLTD_N domain protein  35.41 
 
 		 446 aa  179  1e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0925428  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2564  Slt family transglycosylase  30.1 
 
 		 515 aa  178  2e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4463  Lytic transglycosylase catalytic  37.94 
 
 		 498 aa  177  7e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.689594  normal  0.530069 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0459  putative Signal recognition particle protein (Fifty-four-like protein)  36.24 
 
 		 403 aa  175  1.9999999999999998e-42  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1254  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase  30.17 
 
 		 564 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000724921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1988  lytic transglycosylase, catalytic  29.27 
 
 		 519 aa  175  2.9999999999999996e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.010206  hitchhiker  0.00147511 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1334  Lytic transglycosylase catalytic  37.4 
 
 		 451 aa  175  2.9999999999999996e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0498  Lytic transglycosylase catalytic  33.89 
 
 		 527 aa  174  3.9999999999999995e-42  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.112584  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1988  lytic transglycosylase, catalytic  31.03 
 
 		 474 aa  174  5.999999999999999e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.49985  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1987  Dyp-type peroxidase  34.93 
 
 		 403 aa  174  6.999999999999999e-42  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3584  MltD domain-containing protein  29.41 
 
 		 474 aa  172  2e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2407  lytic transglycosylase catalytic  30.13 
 
 		 519 aa  172  3e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000206679  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2402  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  29.46 
 
 		 517 aa  171  4e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2870  Lytic transglycosylase catalytic  29.3 
 
 		 564 aa  171  4e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00000269929  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3414  MltD domain-containing protein  29.55 
 
 		 474 aa  171  6e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.387896 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0625  MltD domain-containing protein  29.79 
 
 		 483 aa  170  8e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0538  MltD domain-containing protein  29.79 
 
 		 474 aa  170  1e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0652  MltD domain-containing protein  30.5 
 
 		 483 aa  169  1e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3737  MltD domain-containing protein  30.26 
 
 		 483 aa  169  2e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0648  MLTD_N domain protein  30.26 
 
 		 483 aa  169  2e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0411  Lytic transglycosylase catalytic  39.09 
 
 		 447 aa  167  4e-40  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000674118  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2149  Slt family transglycosylase  30.71 
 
 		 442 aa  166  1.0000000000000001e-39  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.20197  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1857  lytic transglycosylase, catalytic  30.82 
 
 		 485 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>