More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RS05514 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS05514  hypothetical protein  100 
 
 		 482 aa  933    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.957983  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3642  multi anti extrusion protein MatE  49.57 
 
 		 496 aa  441  9.999999999999999e-123  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.104533  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3962  multi antimicrobial extrusion protein  48.61 
 
 		 492 aa  427  1e-118  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.789789  normal  0.0338284 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1160  MATE efflux family protein  51.93 
 
 		 486 aa  427  1e-118  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02151  multi antimicrobial extrusion family protein  48.23 
 
 		 503 aa  385  1e-105  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3884  MATE efflux family protein  48.54 
 
 		 521 aa  381  1e-104  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0022  MATE efflux family protein  40.82 
 
 		 524 aa  335  9e-91  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00967763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0031  MATE efflux family protein  40.72 
 
 		 503 aa  332  1e-89  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1044  MATE efflux family protein  42.55 
 
 		 494 aa  328  1.0000000000000001e-88  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1091  MATE efflux family protein  39.91 
 
 		 465 aa  301  2e-80  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.719825  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1899  putative MATE efflux protein  32.22 
 
 		 469 aa  261  2e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00227155  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1846  integral membrane protein, putative  32.22 
 
 		 469 aa  261  2e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.563684  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2639  MATE efflux family protein  41.57 
 
 		 481 aa  260  3e-68  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1787  putative MATE efflux protein  32.44 
 
 		 469 aa  260  4e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1621  Na+ driven multidrug efflux pump  32 
 
 		 469 aa  259  8e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1419  MATE efflux family protein  31.94 
 
 		 469 aa  259  8e-68  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.703884  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1591  Na+ driven multidrug efflux pump  32 
 
 		 469 aa  259  8e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.742873  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1823  putative MATE efflux protein  32 
 
 		 469 aa  259  8e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3557  putative MATE efflux protein  32 
 
 		 469 aa  258  1e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.43043  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1641  MATE efflux family protein  31.78 
 
 		 469 aa  258  2e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.725642  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3059  MATE efflux family protein  33.18 
 
 		 469 aa  253  6e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.231532  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3296  MATE efflux family protein  33.18 
 
 		 469 aa  253  6e-66  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.660304  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1159  MATE efflux family protein  32.68 
 
 		 478 aa  252  1e-65  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.666411  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1839  MATE efflux family protein  33.33 
 
 		 480 aa  249  8e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2862  MATE efflux family protein  33.41 
 
 		 469 aa  242  1e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.83664  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2889  MATE efflux family protein  35.57 
 
 		 471 aa  240  4e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.78127  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3177  MATE efflux family protein  33.03 
 
 		 469 aa  238  2e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.186099  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03157  hypothetical protein  37.53 
 
 		 455 aa  236  5.0000000000000005e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.367645 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3541  multi anti extrusion protein MatE  33.41 
 
 		 491 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.325016 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4281  MATE efflux family protein  36.02 
 
 		 455 aa  233  7.000000000000001e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.711709 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4169  MATE efflux family protein  36.02 
 
 		 455 aa  233  7.000000000000001e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0187  MATE efflux family protein  32.41 
 
 		 449 aa  227  3e-58  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0316  putative multi anti extrusion protein (MatE)  36.07 
 
 		 436 aa  224  3e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.915712 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2347  MATE efflux family protein  34.5 
 
 		 476 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2869  MATE efflux family protein  32.1 
 
 		 472 aa  212  1e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0768419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1972  putative multi anti extrusion protein (MatE)  31.8 
 
 		 458 aa  207  4e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.84525  normal  0.887527 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0162  multi anti extrusion protein MatE  30.73 
 
 		 449 aa  199  1.0000000000000001e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0931  MATE efflux family protein  31.11 
 
 		 448 aa  187  5e-46  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.102954  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1597  MATE efflux family protein  27.89 
 
 		 460 aa  184  3e-45  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  3.36267e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1461  MATE efflux family protein  30.99 
 
 		 500 aa  167  2.9999999999999998e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1338  MATE efflux family protein  29.18 
 
 		 481 aa  166  5.9999999999999996e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1529  MATE efflux family protein  27.18 
 
 		 554 aa  166  8e-40  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.130898  normal  0.344827 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1309  MATE efflux family protein  27.37 
 
 		 538 aa  165  2.0000000000000002e-39  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05190  MATE efflux family protein  27.74 
 
 		 454 aa  163  5.0000000000000005e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.969197  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3173  MATE efflux family protein  28 
 
 		 448 aa  162  1e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000170892  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0451  MATE efflux family protein  26.67 
 
 		 446 aa  160  6e-38  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000226029  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1318  MATE efflux family protein  26.64 
 
 		 443 aa  159  7e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000101978  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2439  MATE efflux family protein  27.44 
 
 		 485 aa  159  8e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.739641  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2591  MATE efflux family protein  29.35 
 
 		 525 aa  158  2e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.677976  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2492  MATE efflux family protein  29.56 
 
 		 485 aa  158  3e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.544481  normal  0.228664 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3276  MATE efflux family protein  27.91 
 
 		 457 aa  156  9e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000381455  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2458  MATE efflux family protein  27.45 
 
 		 500 aa  154  2.9999999999999998e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.672094  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1936  MATE efflux family protein  28.22 
 
 		 486 aa  149  8e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0147  MATE efflux family protein  24.23 
 
 		 462 aa  148  3e-34  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000317216  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1058  MATE efflux family protein  24.02 
 
 		 453 aa  146  6e-34  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1808  MATE efflux family protein  27.44 
 
 		 499 aa  145  1e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.848054  normal  0.460632 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3762  MATE efflux family protein  29.38 
 
 		 442 aa  143  7e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000783437  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4033  MATE efflux family protein  31.71 
 
 		 458 aa  143  7e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000078929 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0906  MATE efflux family protein  24.89 
 
 		 448 aa  141  3e-32  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000766798  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2291  MATE efflux family protein  26.61 
 
 		 460 aa  141  3e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04830  MATE efflux family protein  26.65 
 
 		 468 aa  141  3e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000202645  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3948  MATE efflux family protein  30.49 
 
 		 458 aa  140  3.9999999999999997e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0747  MATE efflux family protein  27.35 
 
 		 490 aa  139  7.999999999999999e-32  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3677  MATE efflux family protein  24.64 
 
 		 500 aa  139  7.999999999999999e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.380257  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1810  MATE efflux family protein  24.28 
 
 		 446 aa  139  1e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.108169  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0465  MATE efflux family protein  31.99 
 
 		 500 aa  139  1e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0883  MATE efflux family protein  27.27 
 
 		 451 aa  137  3.0000000000000003e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000230192  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30280  putative efflux protein, MATE family  27.11 
 
 		 477 aa  137  5e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.155954 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1166  ABC transporter releated protein  24.74 
 
 		 463 aa  135  9.999999999999999e-31  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.403976 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3337  MATE efflux family protein  28.98 
 
 		 470 aa  134  3e-30  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0173  Na+-driven multidrug efflux pump  26.23 
 
 		 446 aa  133  6e-30  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000291986  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2358  MATE efflux family protein  25.46 
 
 		 467 aa  132  1.0000000000000001e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3385  MATE efflux family protein  26.11 
 
 		 453 aa  132  1.0000000000000001e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1642  Na+ driven multidrug antiporter, C-terminus  30.09 
 
 		 270 aa  131  3e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3019  MATE efflux family protein  30.11 
 
 		 453 aa  130  4.0000000000000003e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000108454  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1895  MATE efflux family protein  23.82 
 
 		 498 aa  129  1.0000000000000001e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0707  MATE efflux family protein  25.39 
 
 		 518 aa  128  2.0000000000000002e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.376903  normal  0.476505 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1641  Na+ driven multidrug antiporter, N-terminus  33.78 
 
 		 238 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.908649  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1454  MATE efflux family protein  26.26 
 
 		 477 aa  128  3e-28  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3120  MATE efflux family protein  25.78 
 
 		 461 aa  125  2e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.369114  normal  0.932515 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0645  MATE efflux family protein  21.65 
 
 		 462 aa  124  3e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000346552  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1579  MATE efflux family protein  27.47 
 
 		 445 aa  124  4e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1055  MATE efflux family protein  27.3 
 
 		 449 aa  124  5e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000467502  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1353  MATE efflux family protein  23.76 
 
 		 453 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0762  MATE efflux family protein  26 
 
 		 458 aa  120  4.9999999999999996e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2508  multi anti extrusion protein MatE  27.86 
 
 		 463 aa  120  6e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3565  MATE efflux family protein  26.45 
 
 		 452 aa  120  7e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2315  MATE efflux family protein  27.49 
 
 		 470 aa  120  7e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.1458  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2653  MATE efflux family protein  28.79 
 
 		 484 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1842  MATE efflux family protein  29.12 
 
 		 442 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000407528  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18080  putative efflux protein, MATE family  32.32 
 
 		 468 aa  114  4.0000000000000004e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.98273 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3692  MATE efflux family protein  25.49 
 
 		 461 aa  114  4.0000000000000004e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000025823  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4310  MATE efflux family protein  26.55 
 
 		 451 aa  113  8.000000000000001e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0293  MATE efflux family protein  23.49 
 
 		 467 aa  113  9e-24  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3371  MATE efflux family protein  28.98 
 
 		 494 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000918656 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0086  MATE efflux family protein  25.28 
 
 		 522 aa  112  1.0000000000000001e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1180  MATE efflux family protein  22.69 
 
 		 455 aa  113  1.0000000000000001e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0217  MATE efflux family protein  24.65 
 
 		 445 aa  111  4.0000000000000004e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000958822  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1371  MATE efflux family protein  27.35 
 
 		 463 aa  109  1e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2964  MATE efflux family protein  28.5 
 
 		 453 aa  109  1e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000632854  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>