More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2851 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_2851  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 204 aa  400  1e-111  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.313937  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6035  transcriptional regulator, TetR family  41 
 
 		 203 aa  132  3.9999999999999996e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5008  TetR family transcriptional regulator  36.68 
 
 		 201 aa  107  2e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0778  TetR family transcriptional regulator  34.9 
 
 		 199 aa  99.4  3e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.308556  normal  0.547023 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3270  transcriptional regulator, TetR family  30.73 
 
 		 199 aa  95.5  5e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4515  transcriptional regulator, TetR family  32.99 
 
 		 191 aa  95.1  6e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4348  transcriptional regulator, TetR family  30.93 
 
 		 198 aa  87  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14850  transcriptional regulator  33.69 
 
 		 224 aa  78.2  0.00000000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.126744 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1275  transcriptional regulator, TetR family  32.98 
 
 		 214 aa  78.2  0.00000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3111  transcriptional regulator, TetR family  32.75 
 
 		 203 aa  75.9  0.0000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.268901  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5223  TetR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 197 aa  73.2  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.325156 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4754  transcriptional regulator, TetR family  54.69 
 
 		 216 aa  72.8  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00853884  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1684  regulatory protein TetR  32.14 
 
 		 211 aa  71.6  0.000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.817144  normal  0.172233 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7472  transcriptional regulator, TetR family  28.26 
 
 		 228 aa  69.7  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1461  putative transcriptional regulator  29.74 
 
 		 212 aa  69.3  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16790  TetR family transcriptional regulator  29.74 
 
 		 212 aa  69.3  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.297454  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0061  transcriptional regulator, TetR family  32.45 
 
 		 224 aa  69.7  0.00000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1030  transcriptional regulator, TetR family  31.52 
 
 		 204 aa  68.6  0.00000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.468417  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1252  TetR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 202 aa  68.2  0.00000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0581191  normal  0.11609 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3998  transcriptional regulator, TetR family  32.43 
 
 		 245 aa  67  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000456955  normal  0.178314 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0884  TetR family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 237 aa  66.2  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.214434 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2037  transcriptional regulator, TetR family  29.74 
 
 		 234 aa  66.6  0.0000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3771  transcriptional regulator, TetR family  30.72 
 
 		 223 aa  65.9  0.0000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4219  transcriptional regulator, TetR family  31.47 
 
 		 202 aa  65.5  0.0000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3148  TetR family transcriptional regulator  35.43 
 
 		 231 aa  65.1  0.0000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.647957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4496  TetR family transcriptional regulator  50.82 
 
 		 202 aa  63.9  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0468943  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1763  TetR family transcriptional regulator  33.13 
 
 		 287 aa  63.5  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000686866 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19500  transcriptional regulator, tetR family  31.58 
 
 		 181 aa  63.2  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.64021  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1248  AcrR family transcriptional regulator  27.53 
 
 		 199 aa  63.9  0.000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1870  TetR family transcriptional regulator  51.67 
 
 		 200 aa  62.4  0.000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.524009  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4603  regulatory protein TetR  32 
 
 		 211 aa  62.8  0.000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.204139  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02619  transcriptional regulator  44.44 
 
 		 217 aa  62.4  0.000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1467  hypothetical protein  47.37 
 
 		 213 aa  61.6  0.000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.165444  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1975  transcriptional regulator, TetR family  27.59 
 
 		 199 aa  60.8  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.382484  normal  0.828211 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4208  TetR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 213 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.826614 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1515  TetR family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 213 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5908  TetR family transcriptional regulator  47.46 
 
 		 200 aa  60.1  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.889059 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1119  TetR family transcriptional regulator  28.78 
 
 		 213 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1697  transcriptional regulator, TetR family  27.98 
 
 		 230 aa  60.5  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1993  TetR family transcriptional regulator  27.67 
 
 		 210 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.209055  normal  0.134866 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1561  TetR family transcriptional regulator  51.72 
 
 		 200 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.478798  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1585  TetR family transcriptional regulator  51.72 
 
 		 200 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13188  TetR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 208 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.166406 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1531  TetR family transcriptional regulator  51.72 
 
 		 200 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.556905 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11192  transcriptional regulator  29.5 
 
 		 201 aa  59.7  0.00000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1478  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 217 aa  59.7  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4433  putative transcriptional regulator, TetR family  31.21 
 
 		 199 aa  59.7  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.304497  hitchhiker  0.00999637 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1616  transcriptional regulator, TetR family  52.54 
 
 		 224 aa  59.7  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.86283 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1370  transcriptional regulator, TetR family  29.11 
 
 		 199 aa  59.3  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3333  transcriptional regulator, TetR family  34.13 
 
 		 211 aa  59.3  0.00000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.618946 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2332  regulatory protein, TetR  31.72 
 
 		 204 aa  58.9  0.00000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000899921 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2555  TetR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 205 aa  58.9  0.00000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.776584  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1121  TetR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 210 aa  58.5  0.00000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0496337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3407  TetR family transcriptional regulator  26.46 
 
 		 218 aa  58.5  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0155576  normal  0.84746 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3006  TetR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 194 aa  58.5  0.00000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.313875  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0736  transcriptional regulator  31.3 
 
 		 219 aa  58.9  0.00000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0112088  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3052  TetR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 194 aa  58.5  0.00000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6292  TetR family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 210 aa  58.5  0.00000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1045  TetR family transcriptional regulator  33.74 
 
 		 226 aa  58.2  0.00000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.446098  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2281  transcriptional regulator, TetR family  46.77 
 
 		 215 aa  58.2  0.00000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2623  TetR family transcriptional regulator  46.77 
 
 		 209 aa  58.2  0.00000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0845142 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4851  TetR family transcriptional regulator  57.14 
 
 		 194 aa  58.2  0.00000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2436  TetR family transcriptional regulator  52.54 
 
 		 243 aa  57.4  0.0000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.747053 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3058  TetR family transcriptional regulator  25.59 
 
 		 209 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.765793  normal  0.0466418 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3352  TetR family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 211 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.586652  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3953  TetR family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 232 aa  57.4  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0396138  normal  0.024229 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4993  transcriptional regulator, TetR family  31.41 
 
 		 202 aa  57.4  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.309228 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3021  TetR family transcriptional regulator  29.26 
 
 		 194 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.49231  normal  0.167388 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4446  TetR family transcriptional regulator  25.59 
 
 		 210 aa  57  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1078  TetR family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 211 aa  57  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0706  TetR family transcriptional regulator  49.15 
 
 		 383 aa  57.4  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18080  TetR family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 212 aa  57  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2442  transcriptional regulator, TetR family  30.71 
 
 		 218 aa  56.6  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.510523  normal  0.120027 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5564  transcriptional regulator, TetR family  32.14 
 
 		 201 aa  56.6  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0872  transcriptional regulator, TetR family  31.95 
 
 		 212 aa  56.6  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.83423  normal  0.281851 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1456  transcriptional regulator, TetR family  32 
 
 		 211 aa  56.2  0.0000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4158  TetR family transcriptional regulator  51.85 
 
 		 205 aa  56.2  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.000188504  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3363  transcriptional regulator, TetR family  43.28 
 
 		 199 aa  56.6  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1569  putative transcriptional regulator  27.98 
 
 		 212 aa  56.2  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00486  transcriptional regulator, TetR family protein  29.6 
 
 		 224 aa  55.8  0.0000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5089  putative transcriptional regulator, TetR family  28.89 
 
 		 210 aa  55.8  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.627316 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2599  TetR family transcriptional regulator  30.52 
 
 		 233 aa  55.8  0.0000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.87329  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0824  TetR family transcriptional regulator  27.81 
 
 		 206 aa  55.5  0.0000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2593  putative transcriptional regulator, TetR family  43.75 
 
 		 205 aa  55.5  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0854341 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1149  transcriptional regulator, TetR family protein  25 
 
 		 226 aa  55.1  0.0000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3225  TetR family transcriptional regulator  47.46 
 
 		 213 aa  55.5  0.0000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.314279  normal  0.210871 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1551  TetR family transcriptional regulator  39.76 
 
 		 227 aa  54.7  0.0000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.386957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06672  hypothetical protein  29.73 
 
 		 198 aa  54.3  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4006  transcriptional regulator, TetR family  32.28 
 
 		 193 aa  54.3  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.685052  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1166  transcriptional regulator, TetR family  27.92 
 
 		 215 aa  54.3  0.000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.522591  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3317  TetR family transcriptional regulator  28.73 
 
 		 214 aa  54.7  0.000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.305506  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0075  transcriptional regulator, TetR family  29.11 
 
 		 194 aa  54.7  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3063  regulatory protein TetR  34.81 
 
 		 191 aa  54.3  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4359  transcriptional regulator, TetR family  26.98 
 
 		 205 aa  53.9  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.23587 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2636  transcriptional regulator, TetR family  31.39 
 
 		 222 aa  54.3  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4044  TetR family transcriptional regulator  28.73 
 
 		 214 aa  54.7  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1528  transcriptional regulator, TetR family  29.7 
 
 		 194 aa  54.7  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.680556  normal  0.906011 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5233  TetR family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 184 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.494471  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3324  transcriptional regulator, TetR family  45.16 
 
 		 225 aa  53.5  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.748824 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5613  TetR family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 184 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.687182  normal  0.405211 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>