134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_1890 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_1890  MscS mechanosensitive ion channel  100 
 
 		 284 aa  583  1.0000000000000001e-165  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0215932  normal  0.0189512 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0259  MscS mechanosensitive ion channel  58.21 
 
 		 305 aa  333  2e-90  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01814  MscS Mechanosensitive ion channel  41.89 
 
 		 315 aa  242  3.9999999999999997e-63  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000781562  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3690  MscS mechanosensitive ion channel  43.48 
 
 		 290 aa  234  2.0000000000000002e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.158195 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0155  MscS mechanosensitive ion channel  39.46 
 
 		 300 aa  194  1e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1959  MscS mechanosensitive ion channel  42.54 
 
 		 278 aa  191  1e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00109223  normal  0.0228344 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0966  mechanosensitive ion channel  39.77 
 
 		 266 aa  189  5.999999999999999e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.247343  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05165  hypothetical protein  37.4 
 
 		 282 aa  183  3e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001280  small-conductance mechanosensitive channel  36.26 
 
 		 282 aa  179  4e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1094  hypothetical protein  41.15 
 
 		 291 aa  176  4e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.658963  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2731  MscS mechanosensitive ion channel  39.82 
 
 		 282 aa  176  4e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0729456  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2100  MscS mechanosensitive ion channel  39.15 
 
 		 278 aa  171  2e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5589  putative MscS mechanosensitive ion channel protein  32.23 
 
 		 275 aa  90.1  4e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.204924  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0474  MscS mechanosensitive ion channel  25.31 
 
 		 320 aa  66.6  0.0000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.738891  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08930  MscS Mechanosensitive ion channel  31.37 
 
 		 225 aa  66.6  0.0000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2779  hypothetical protein  30.91 
 
 		 313 aa  64.7  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.188203  normal  0.0353015 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3758  MscS Mechanosensitive ion channel  24.16 
 
 		 809 aa  63.2  0.000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.992907  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03384  small-conductance mechanosensitive channel  26.36 
 
 		 803 aa  61.2  0.00000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.670806  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1546  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  24.03 
 
 		 479 aa  57  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.514924  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0207  MscS Mechanosensitive ion channel  26.37 
 
 		 283 aa  56.6  0.0000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2154  MscS Mechanosensitive ion channel  25.16 
 
 		 316 aa  56.2  0.0000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.568534  normal  0.399111 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0108  MscS mechanosensitive ion channel  29.36 
 
 		 291 aa  55.5  0.0000009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1921  cation efflux protein  31.58 
 
 		 275 aa  55.1  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000577471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0786  MscS mechanosensitive ion channel  24.07 
 
 		 327 aa  55.1  0.000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0154774  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1508  MscS Mechanosensitive ion channel  25.47 
 
 		 301 aa  54.3  0.000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0603757 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5470  MscS mechanosensitive ion channel  23.85 
 
 		 835 aa  53.9  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4476  MscS mechanosensitive ion channel  18.62 
 
 		 799 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.878237 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2824  MscS mechanosensitive ion channel  21.47 
 
 		 330 aa  52.4  0.000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1852  mechanosensitive ion channel family protein  19.07 
 
 		 804 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0601787  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0057  MscS Mechanosensitive ion channel  25 
 
 		 421 aa  51.6  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.185804  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2229  MscS Mechanosensitive ion channel  22.17 
 
 		 400 aa  52  0.00001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.224666  normal  0.568068 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3549  MscS mechanosensitive ion channel  19.59 
 
 		 803 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.566467  normal  0.27975 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3656  MscS mechanosensitive ion channel  22.45 
 
 		 856 aa  50.4  0.00003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.570339  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1529  MscS Mechanosensitive ion channel  21.21 
 
 		 385 aa  50.4  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2528  MscS mechanosensitive ion channel  21.43 
 
 		 817 aa  50.4  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.290655  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1647  MscS Mechanosensitive ion channel  21.69 
 
 		 429 aa  50.4  0.00003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1461  MscS Mechanosensitive ion channel  24.71 
 
 		 785 aa  50.4  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1784  mechanosensitive ion channel family protein  24.52 
 
 		 891 aa  50.1  0.00005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0434  MscS mechanosensitive ion channel  34.09 
 
 		 333 aa  49.7  0.00006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.302543  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0452  MscS Mechanosensitive ion channel  25 
 
 		 853 aa  49.3  0.00007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.372575 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1712  MscS mechanosensitive ion channel  24.48 
 
 		 291 aa  48.9  0.00009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0940  MscS mechanosensitive ion channel  26.5 
 
 		 275 aa  48.9  0.00009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.546965 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1066  MscS Mechanosensitive ion channel  25.16 
 
 		 261 aa  48.9  0.00009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45100  potassium efflux protein KefA  25 
 
 		 1117 aa  48.9  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.534635  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2715  small-conductance mechanosensitive channel  30.97 
 
 		 270 aa  48.5  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0857  MscS mechanosensitive ion channel  23.47 
 
 		 840 aa  48.1  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0740  MscS mechanosensitive ion channel  18.18 
 
 		 803 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.333087  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3222  MscS mechanosensitive ion channel  22.4 
 
 		 866 aa  48.5  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0786  MscS Mechanosensitive ion channel  24.75 
 
 		 840 aa  48.1  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2730  potassium efflux system KEFA  21.37 
 
 		 825 aa  48.1  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.668875  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2608  mechanosensitive ion channel family protein  21.54 
 
 		 825 aa  47.4  0.0003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.349131  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2854  MscS Mechanosensitive ion channel  23.72 
 
 		 314 aa  47.4  0.0003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.247394  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1093  MscS mechanosensitive ion channel  23.96 
 
 		 271 aa  47.4  0.0003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.746887  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0541  MscS mechanosensitive ion channel  29.17 
 
 		 273 aa  47  0.0003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5647  MscS mechanosensitive ion channel  23.57 
 
 		 359 aa  47  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.560781 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0741  MscS mechanosensitive ion channel  18.18 
 
 		 803 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0987  MscS Mechanosensitive ion channel  27.96 
 
 		 238 aa  47  0.0004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1197  MscS mechanosensitive ion channel  25 
 
 		 247 aa  46.6  0.0004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2215  MscS mechanosensitive ion channel  20.23 
 
 		 820 aa  46.6  0.0004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.311174 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1606  MscS mechanosensitive ion channel  24.1 
 
 		 307 aa  46.6  0.0005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.696801  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46240  hypothetical protein  19.62 
 
 		 807 aa  46.6  0.0005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.566889  normal  0.0303227 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3862  MscS mechanosensitive ion channel  25.17 
 
 		 830 aa  46.6  0.0005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.725538  normal  0.276406 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3931  hypothetical protein  19.62 
 
 		 806 aa  46.6  0.0005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.604151  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02489  putative mechanosensitive channel protein (MscS family)  26.06 
 
 		 367 aa  46.6  0.0005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0553  MscS mechanosensitive ion channel  25.25 
 
 		 874 aa  46.2  0.0006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.362584 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1800  MscS mechanosensitive ion channel  19.2 
 
 		 859 aa  45.8  0.0007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000387595 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1862  MscS mechanosensitive ion channel  21.59 
 
 		 867 aa  45.8  0.0007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4139  MscS Mechanosensitive ion channel  19.87 
 
 		 815 aa  45.8  0.0009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0707  MscS mechanosensitive ion channel  18.24 
 
 		 855 aa  45.4  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.441898  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2316  mechanosensitive ion channel family protein  20.2 
 
 		 773 aa  45.4  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1093  MscS Mechanosensitive ion channel  20.94 
 
 		 389 aa  45.4  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.464677  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1245  ion channel protein  30.56 
 
 		 261 aa  45.4  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.306888 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1293  MscS Mechanosensitive ion channel  19.25 
 
 		 814 aa  45.1  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2869  MscS Mechanosensitive ion channel  17.86 
 
 		 815 aa  45.1  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.266209  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03562  hypothetical protein  22.03 
 
 		 288 aa  45.4  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05088  hypothetical protein  24.2 
 
 		 399 aa  45.4  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4382  MscS mechanosensitive ion channel  25.56 
 
 		 262 aa  45.1  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.496887  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2326  MscS mechanosensitive ion channel  24.77 
 
 		 1127 aa  45.1  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0141  MscS Mechanosensitive ion channel  21.71 
 
 		 373 aa  45.4  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.195967  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10253  hypothetical protein  28.81 
 
 		 307 aa  45.1  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  decreased coverage  0.00229932  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2983  Small-conductance mechanosensitive channel-like protein  23.89 
 
 		 1144 aa  45.4  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3482  MscS mechanosensitive ion channel  18.63 
 
 		 813 aa  44.3  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.144458  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1021  MscS mechanosensitive ion channel  28.4 
 
 		 548 aa  44.3  0.002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.69997  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1608  MscS mechanosensitive ion channel  23.76 
 
 		 868 aa  44.7  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0661  MscS Mechanosensitive ion channel  24.15 
 
 		 295 aa  44.3  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4629  MscS mechanosensitive ion channel  19.53 
 
 		 832 aa  44.3  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4003  MscS mechanosensitive ion channel  21.35 
 
 		 362 aa  44.3  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0737574  normal  0.463755 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0390  MscS mechanosensitive ion channel  28 
 
 		 274 aa  44.7  0.002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.855015  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2094  MscS mechanosensitive ion channel  26.32 
 
 		 860 aa  44.3  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.183403  normal  0.195823 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1062  MscS Mechanosensitive ion channel  32.53 
 
 		 310 aa  44.3  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.771269  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3059  MscS mechanosensitive ion channel  23.23 
 
 		 879 aa  44.7  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0365719  normal  0.0542576 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6131  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  29.07 
 
 		 489 aa  44.3  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4556  MscS Mechanosensitive ion channel  22.22 
 
 		 883 aa  44.3  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0198839  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0552  MscS Mechanosensitive ion channel  26.36 
 
 		 296 aa  43.9  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0914  MscS mechanosensitive ion channel  23.36 
 
 		 842 aa  43.9  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00707445 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1438  MscS mechanosensitive ion channel  24.86 
 
 		 840 aa  43.9  0.003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.139296  normal  0.137989 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0253  mechanosensitive ion channel family protein  31.78 
 
 		 378 aa  44.3  0.003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0247  mechanosensitive ion channel family protein  31.78 
 
 		 378 aa  43.9  0.003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3200  MscS mechanosensitive ion channel  25.87 
 
 		 590 aa  43.9  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01983  MscS Mechanosensitive ion channel ei VT8  23.73 
 
 		 279 aa  43.9  0.003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.865643  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>