More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_0474 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007955  Mbur_0474  MscS mechanosensitive ion channel  100 
 
 		 320 aa  640    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.738891  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2779  hypothetical protein  57.19 
 
 		 313 aa  343  2e-93  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.188203  normal  0.0353015 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0786  MscS mechanosensitive ion channel  37.78 
 
 		 327 aa  203  4e-51  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0154774  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1058  MscS Mechanosensitive ion channel  31.05 
 
 		 315 aa  149  4e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08930  MscS Mechanosensitive ion channel  40.64 
 
 		 225 aa  147  2.0000000000000003e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2824  MscS mechanosensitive ion channel  27.01 
 
 		 330 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2154  MscS Mechanosensitive ion channel  25.93 
 
 		 316 aa  117  3.9999999999999997e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.568534  normal  0.399111 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0855  mechanosensitive ion channel family protein  29.67 
 
 		 526 aa  112  7.000000000000001e-24  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1021  MscS mechanosensitive ion channel  28.12 
 
 		 548 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.69997  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2854  MscS Mechanosensitive ion channel  28.63 
 
 		 314 aa  110  3e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.247394  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5647  MscS mechanosensitive ion channel  25.47 
 
 		 359 aa  107  3e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.560781 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0434  MscS mechanosensitive ion channel  26.25 
 
 		 333 aa  106  4e-22  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.302543  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0086  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  26.59 
 
 		 529 aa  105  1e-21  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00266935  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1508  MscS Mechanosensitive ion channel  27.34 
 
 		 301 aa  105  1e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0603757 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1264  MscS Mechanosensitive ion channel  28.41 
 
 		 536 aa  103  4e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.908729  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1066  mechanosensitive ion channel family protein  27.78 
 
 		 528 aa  102  1e-20  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.0000663249  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1073  mechanosensitive ion channel family protein  27.86 
 
 		 535 aa  98.6  1e-19  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1030  MscS mechanosensitive ion channel  28.17 
 
 		 408 aa  97.8  2e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0697  mechanosensitive ion channel family protein  28.57 
 
 		 509 aa  97.1  4e-19  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5589  putative MscS mechanosensitive ion channel protein  24.82 
 
 		 275 aa  92.8  7e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.204924  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1025  mechanosensitive ion channel family protein  26.64 
 
 		 523 aa  86.7  5e-16  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.902569  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1087  mechanosensitive ion channel family protein  26.64 
 
 		 523 aa  86.3  7e-16  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0312609  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0782  mechanosensitive ion channel family protein  26.64 
 
 		 523 aa  85.1  0.000000000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.916079  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3992  MscS Mechanosensitive ion channel  25.11 
 
 		 657 aa  82  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.27926  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3884  LigA  24.66 
 
 		 667 aa  80.5  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.47617  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0940  MscS mechanosensitive ion channel  27.13 
 
 		 275 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.546965 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0259  MscS mechanosensitive ion channel  21.15 
 
 		 305 aa  70.5  0.00000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3778  MscS mechanosensitive ion channel  26.74 
 
 		 276 aa  70.1  0.00000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.981923 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2316  mechanosensitive ion channel family protein  27.81 
 
 		 291 aa  69.7  0.00000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.176359  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1438  MscS mechanosensitive ion channel  30.77 
 
 		 840 aa  69.7  0.00000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.139296  normal  0.137989 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3304  mechanosensitive channel MscS  32.17 
 
 		 286 aa  69.7  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1690  MscS mechanosensitive ion channel  25.25 
 
 		 476 aa  69.3  0.00000000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1250  MscS mechanosensitive ion channel  32.14 
 
 		 361 aa  69.3  0.00000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000000414305  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3409  mechanosensitive channel MscS  31.3 
 
 		 286 aa  69.3  0.00000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.427229  normal  0.109816 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3240  mechanosensitive channel MscS  31.3 
 
 		 286 aa  69.3  0.00000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3229  mechanosensitive channel MscS  31.3 
 
 		 286 aa  69.3  0.00000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.550002  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3307  mechanosensitive channel MscS  31.3 
 
 		 286 aa  69.3  0.00000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0452  MscS mechanosensitive ion channel  31.41 
 
 		 283 aa  69.3  0.00000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00426986  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1856  hypothetical protein  25.93 
 
 		 281 aa  68.6  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.130527  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4382  MscS mechanosensitive ion channel  29.7 
 
 		 262 aa  68.6  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.496887  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1689  MscS mechanosensitive ion channel  24.91 
 
 		 356 aa  67.8  0.0000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0390  MscS mechanosensitive ion channel  22.82 
 
 		 274 aa  67.8  0.0000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.855015  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1140  MscS mechanosensitive ion channel  24.75 
 
 		 274 aa  67  0.0000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.15609  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1300  MscS mechanosensitive ion channel  29.9 
 
 		 343 aa  66.6  0.0000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.987941  hitchhiker  0.00895683 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1890  MscS mechanosensitive ion channel  25.31 
 
 		 284 aa  66.6  0.0000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0215932  normal  0.0189512 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1852  MscS Mechanosensitive ion channel  26.46 
 
 		 344 aa  66.6  0.0000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.390235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02189  hypothetical protein  26.03 
 
 		 249 aa  66.6  0.0000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3337  mechanosensitive channel MscS  28.78 
 
 		 284 aa  66.2  0.0000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.306942  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0556  MscS Mechanosensitive ion channel  32.17 
 
 		 293 aa  65.9  0.0000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3061  mechanosensitive channel MscS  31.3 
 
 		 291 aa  66.2  0.0000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.397816  normal  0.219365 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1674  MscS mechanosensitive ion channel  29.33 
 
 		 270 aa  65.9  0.0000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.702305  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0786  mechanosensitive channel MscS  31.3 
 
 		 286 aa  65.9  0.0000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02755  mechanosensitive channel  31.3 
 
 		 286 aa  65.9  0.000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0769  MscS Mechanosensitive ion channel  31.3 
 
 		 286 aa  65.9  0.000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3082  mechanosensitive channel MscS  31.3 
 
 		 286 aa  65.9  0.000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3251  mechanosensitive channel MscS  31.3 
 
 		 286 aa  65.9  0.000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4221  mechanosensitive channel MscS  31.3 
 
 		 286 aa  65.9  0.000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3013  MscS mechanosensitive ion channel  26.58 
 
 		 275 aa  65.5  0.000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000253066  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4008  MscS mechanosensitive ion channel  25.88 
 
 		 583 aa  65.1  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.370784 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02718  hypothetical protein  31.3 
 
 		 286 aa  65.9  0.000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1093  MscS Mechanosensitive ion channel  25.43 
 
 		 389 aa  65.5  0.000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.464677  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3349  mechanosensitive channel MscS  31.3 
 
 		 286 aa  65.9  0.000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1094  hypothetical protein  31.71 
 
 		 291 aa  64.7  0.000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.658963  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1350  MscS Mechanosensitive ion channel  26.58 
 
 		 275 aa  64.7  0.000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000676183  hitchhiker  0.0000000000523866 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3171  MscS mechanosensitive ion channel  26.58 
 
 		 275 aa  64.7  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000563606  hitchhiker  0.0000513684 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3028  MscS mechanosensitive ion channel  26.58 
 
 		 275 aa  64.7  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000445897  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00921  small conductance mechanosensitive ion channel  28.9 
 
 		 322 aa  63.9  0.000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.230623  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1465  hypothetical protein  26.8 
 
 		 753 aa  64.3  0.000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2137  MscS mechanosensitive ion channel  28.34 
 
 		 288 aa  64.3  0.000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.857102  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1359  MscS mechanosensitive ion channel  28.57 
 
 		 275 aa  64.3  0.000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000000124466  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2675  MscS mechanosensitive ion channel  27.27 
 
 		 275 aa  64.3  0.000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00133263  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2295  mechanosensitive ion channel family protein  27.17 
 
 		 289 aa  63.9  0.000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0442  MscS Mechanosensitive ion channel  27.59 
 
 		 279 aa  63.9  0.000000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2393  MscS Mechanosensitive ion channel  24.71 
 
 		 408 aa  63.9  0.000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2465  putative small-conductance mechanosensitive channel  27.36 
 
 		 275 aa  63.5  0.000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.404234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1752  MscS Mechanosensitive ion channel  25.29 
 
 		 356 aa  63.2  0.000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0460  transporter, small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  26.98 
 
 		 280 aa  63.5  0.000000005  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.00313509  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0955  MscS mechanosensitive ion channel  25.52 
 
 		 298 aa  63.2  0.000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1152  MscS mechanosensitive ion channel  29.56 
 
 		 274 aa  63.5  0.000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0163398  normal  0.0148083 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1206  MscS mechanosensitive ion channel  24.79 
 
 		 275 aa  63.2  0.000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0281  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1533  MscS Mechanosensitive ion channel  26.29 
 
 		 276 aa  63.2  0.000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1569  MscS mechanosensitive ion channel  32.31 
 
 		 342 aa  63.2  0.000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.50156  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2740  MscS mechanosensitive ion channel  27.42 
 
 		 288 aa  63.2  0.000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3333  MscS mechanosensitive ion channel  32.62 
 
 		 275 aa  63.2  0.000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001280  small-conductance mechanosensitive channel  26.88 
 
 		 282 aa  62.8  0.000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2326  MscS mechanosensitive ion channel  21.32 
 
 		 1127 aa  62.8  0.000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3896  MscS Mechanosensitive ion channel  25 
 
 		 283 aa  62.8  0.000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0427  MscS mechanosensitive ion channel  28.66 
 
 		 288 aa  62.8  0.000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0918944  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01814  MscS Mechanosensitive ion channel  26.28 
 
 		 315 aa  62.4  0.000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000781562  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0155  MscS mechanosensitive ion channel  26.32 
 
 		 300 aa  61.6  0.00000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3699  MscS Mechanosensitive ion channel  26.14 
 
 		 283 aa  62.4  0.00000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0047  MscS mechanosensitive ion channel  32.02 
 
 		 270 aa  62  0.00000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3671  MscS mechanosensitive ion channel  26.92 
 
 		 277 aa  62.4  0.00000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1518  hypothetical protein  25.77 
 
 		 732 aa  61.6  0.00000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2128  MscS mechanosensitive ion channel  23.36 
 
 		 270 aa  61.6  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0141  MscS Mechanosensitive ion channel  28 
 
 		 373 aa  61.6  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.195967  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0515  MscS Mechanosensitive ion channel  30.43 
 
 		 292 aa  61.2  0.00000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05165  hypothetical protein  31.78 
 
 		 282 aa  60.8  0.00000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1245  MscS mechanosensitive ion channel  25.74 
 
 		 274 aa  60.8  0.00000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.016266  normal  0.622604 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1276  MscS mechanosensitive ion channel  27.5 
 
 		 275 aa  60.8  0.00000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000188457  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>