50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_1066 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009802  CCC13826_0086  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  73.16 
 
 		 529 aa  810    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00266935  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1066  mechanosensitive ion channel family protein  100 
 
 		 528 aa  1076    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.0000663249  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0855  mechanosensitive ion channel family protein  61.38 
 
 		 526 aa  644    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1073  mechanosensitive ion channel family protein  55.86 
 
 		 535 aa  575  1.0000000000000001e-163  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1264  MscS Mechanosensitive ion channel  53.85 
 
 		 536 aa  553  1e-156  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.908729  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0697  mechanosensitive ion channel family protein  49.79 
 
 		 509 aa  498  1e-139  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1021  MscS mechanosensitive ion channel  48.77 
 
 		 548 aa  469  1.0000000000000001e-131  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.69997  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1087  mechanosensitive ion channel family protein  51.49 
 
 		 523 aa  464  1e-129  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0312609  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0782  mechanosensitive ion channel family protein  51.28 
 
 		 523 aa  462  1e-129  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.916079  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1025  mechanosensitive ion channel family protein  51.28 
 
 		 523 aa  462  1e-129  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.902569  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1690  MscS mechanosensitive ion channel  25.16 
 
 		 476 aa  142  9.999999999999999e-33  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0786  MscS mechanosensitive ion channel  27.27 
 
 		 327 aa  117  6.9999999999999995e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0154774  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0474  MscS mechanosensitive ion channel  26.77 
 
 		 320 aa  105  2e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.738891  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2824  MscS mechanosensitive ion channel  23.57 
 
 		 330 aa  103  7e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1058  MscS Mechanosensitive ion channel  24.45 
 
 		 315 aa  99.8  1e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08930  MscS Mechanosensitive ion channel  30.11 
 
 		 225 aa  98.6  3e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0434  MscS mechanosensitive ion channel  25.53 
 
 		 333 aa  87.8  4e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.302543  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2779  hypothetical protein  22.1 
 
 		 313 aa  87.8  4e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.188203  normal  0.0353015 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4008  MscS mechanosensitive ion channel  22.88 
 
 		 583 aa  72  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.370784 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3992  MscS Mechanosensitive ion channel  24.34 
 
 		 657 aa  71.2  0.00000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.27926  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3884  LigA  24.34 
 
 		 667 aa  70.9  0.00000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.47617  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2154  MscS Mechanosensitive ion channel  23.71 
 
 		 316 aa  65.5  0.000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.568534  normal  0.399111 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08271  hypothetical protein  21.53 
 
 		 329 aa  59.7  0.0000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1508  MscS Mechanosensitive ion channel  25.74 
 
 		 301 aa  58.5  0.0000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0603757 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2854  MscS Mechanosensitive ion channel  19.8 
 
 		 314 aa  57.8  0.0000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.247394  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5647  MscS mechanosensitive ion channel  24.35 
 
 		 359 aa  57.4  0.0000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.560781 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1106  small-conductance mechanosensitive channel  25.68 
 
 		 265 aa  55.1  0.000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2393  MscS Mechanosensitive ion channel  20.34 
 
 		 408 aa  52.8  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3016  MscS mechanosensitive ion channel  25.6 
 
 		 426 aa  51.6  0.00004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1633  hypothetical protein  21.92 
 
 		 364 aa  50.8  0.00006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.246622  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5589  putative MscS mechanosensitive ion channel protein  23.18 
 
 		 275 aa  49.3  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.204924  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3271  putative small conductance mechanosensitive ion channel  25.48 
 
 		 306 aa  48.5  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.451043 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2780  hypothetical protein  24.1 
 
 		 301 aa  48.1  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.188886  normal  0.0383383 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1737  mechanosensitive ion channel family protein  22.87 
 
 		 624 aa  48.1  0.0004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.64597  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1220  MscS mechanosensitive ion channel  26.62 
 
 		 305 aa  47.4  0.0006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0859387 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1066  MscS Mechanosensitive ion channel  25.75 
 
 		 261 aa  46.6  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1280  MscS Mechanosensitive ion channel  24.84 
 
 		 269 aa  45.8  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.138834  normal  0.117258 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1093  MscS Mechanosensitive ion channel  20.54 
 
 		 389 aa  45.4  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.464677  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4003  MscS mechanosensitive ion channel  23.11 
 
 		 362 aa  45.4  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0737574  normal  0.463755 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1496  MscS Mechanosensitive ion channel  24.05 
 
 		 295 aa  45.4  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0617  MscS mechanosensitive ion channel  20.27 
 
 		 338 aa  45.8  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.210835  normal  0.752053 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1417  MscS Mechanosensitive ion channel  21.92 
 
 		 304 aa  46.2  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2696  MscS Mechanosensitive ion channel  19.51 
 
 		 369 aa  45.1  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.415509  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1701  phosphoglycerate mutase  26.07 
 
 		 310 aa  45.4  0.003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1630  MscS Mechanosensitive ion channel  26.71 
 
 		 303 aa  45.1  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.131144 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0625  small-conductance mechanosensitive ion channel  26.53 
 
 		 291 aa  45.1  0.003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.286405  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0145  MscS Mechanosensitive ion channel  21.65 
 
 		 795 aa  44.7  0.005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.584574 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2529  MscS Mechanosensitive ion channel  19.17 
 
 		 864 aa  43.9  0.006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19990  small-conductance mechanosensitive channel  23.33 
 
 		 264 aa  43.9  0.007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3343  mechanosensitive ion channel protein  24.71 
 
 		 813 aa  43.5  0.01  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.183155 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>