52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_05165 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_05165  hypothetical protein  100 
 
 		 282 aa  584  1e-166  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001280  small-conductance mechanosensitive channel  87.54 
 
 		 282 aa  528  1e-149  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1094  hypothetical protein  73.21 
 
 		 291 aa  431  1e-120  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.658963  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0966  mechanosensitive ion channel  76.34 
 
 		 266 aa  433  1e-120  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.247343  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2731  MscS mechanosensitive ion channel  74.28 
 
 		 282 aa  431  1e-119  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0729456  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0155  MscS mechanosensitive ion channel  71.74 
 
 		 300 aa  430  1e-119  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1959  MscS mechanosensitive ion channel  71.74 
 
 		 278 aa  419  1e-116  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00109223  normal  0.0228344 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2100  MscS mechanosensitive ion channel  71.01 
 
 		 278 aa  387  1e-107  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0259  MscS mechanosensitive ion channel  37.5 
 
 		 305 aa  208  7e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3690  MscS mechanosensitive ion channel  35.13 
 
 		 290 aa  192  6e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.158195 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01814  MscS Mechanosensitive ion channel  35.71 
 
 		 315 aa  187  2e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000781562  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1890  MscS mechanosensitive ion channel  37.4 
 
 		 284 aa  183  3e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0215932  normal  0.0189512 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5589  putative MscS mechanosensitive ion channel protein  28.77 
 
 		 275 aa  95.1  1e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.204924  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1921  cation efflux protein  28.06 
 
 		 275 aa  92.8  6e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000577471  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0474  MscS mechanosensitive ion channel  31.78 
 
 		 320 aa  60.8  0.00000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.738891  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1058  MscS Mechanosensitive ion channel  26.87 
 
 		 315 aa  60.8  0.00000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0786  MscS mechanosensitive ion channel  23.89 
 
 		 327 aa  55.5  0.0000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0154774  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2824  MscS mechanosensitive ion channel  19.83 
 
 		 330 aa  55.5  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3992  MscS Mechanosensitive ion channel  23.15 
 
 		 657 aa  54.3  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.27926  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3884  LigA  22.66 
 
 		 667 aa  53.5  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.47617  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03630  mechanosensitive ion channel  26.43 
 
 		 476 aa  52.4  0.000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4008  MscS mechanosensitive ion channel  24.19 
 
 		 583 aa  51.6  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.370784 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10263  putative transmembrane transport protein  30.37 
 
 		 428 aa  51.2  0.00002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.109786  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1546  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  24.14 
 
 		 479 aa  50.4  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.514924  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5647  MscS mechanosensitive ion channel  24.71 
 
 		 359 aa  49.3  0.00006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.560781 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2895  helix-turn-helix, AraC type  26.55 
 
 		 264 aa  47.8  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0170548 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0013  mechanosensitive ion channel family protein  31.82 
 
 		 682 aa  48.1  0.0002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1443  MscS Mechanosensitive ion channel  23.56 
 
 		 311 aa  46.2  0.0006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2608  mechanosensitive ion channel family protein  26.22 
 
 		 825 aa  46.2  0.0007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.349131  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1162  MscS Mechanosensitive ion channel  27.19 
 
 		 294 aa  45.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.102088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2117  mechanosensitive ion channel family protein  26.15 
 
 		 633 aa  45.1  0.001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2129  MscS mechanosensitive ion channel  29.47 
 
 		 442 aa  44.3  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1529  MscS Mechanosensitive ion channel  30.59 
 
 		 385 aa  44.7  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0289  mechanosensitive ion channel family protein  33.33 
 
 		 627 aa  44.7  0.002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.658149  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0263  mechanosensitive ion channel family protein  33.33 
 
 		 627 aa  44.3  0.002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0236  mechanosensitive ion channel family protein  31.91 
 
 		 627 aa  43.9  0.003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1504  conserved hypothetical integral membrane protein, mechanosensitive ion channel family  23.83 
 
 		 624 aa  43.9  0.003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3656  MscS mechanosensitive ion channel  26.8 
 
 		 856 aa  43.9  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.570339  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3862  MscS mechanosensitive ion channel  29.47 
 
 		 830 aa  43.5  0.004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.725538  normal  0.276406 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46240  hypothetical protein  29.17 
 
 		 807 aa  43.5  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.566889  normal  0.0303227 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6222  MscS Mechanosensitive ion channel  25.74 
 
 		 404 aa  43.5  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3931  hypothetical protein  29.17 
 
 		 806 aa  43.5  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.604151  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03384  small-conductance mechanosensitive channel  30.36 
 
 		 803 aa  43.1  0.005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.670806  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0707  MscS mechanosensitive ion channel  21.77 
 
 		 855 aa  43.1  0.005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.441898  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3758  MscS Mechanosensitive ion channel  26.79 
 
 		 809 aa  43.1  0.006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.992907  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2779  hypothetical protein  23.36 
 
 		 313 aa  43.1  0.006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.188203  normal  0.0353015 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1737  mechanosensitive ion channel family protein  29.9 
 
 		 624 aa  42.7  0.007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.64597  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1647  MscS Mechanosensitive ion channel  24.85 
 
 		 429 aa  42.4  0.008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0857  MscS mechanosensitive ion channel  27.55 
 
 		 840 aa  42.4  0.009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0786  MscS Mechanosensitive ion channel  27.55 
 
 		 840 aa  42.4  0.009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0434  MscS mechanosensitive ion channel  23.02 
 
 		 333 aa  42.4  0.009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.302543  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0209  MscS mechanosensitive ion channel  27.19 
 
 		 685 aa  42.4  0.01  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0673077 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>