110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_3690 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_3690  MscS mechanosensitive ion channel  100 
 
 
290 aa  598  1e-170  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.158195 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0259  MscS mechanosensitive ion channel  40.49 
 
 
305 aa  252  5.000000000000001e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1890  MscS mechanosensitive ion channel  43.48 
 
 
284 aa  240  2e-62  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0215932  normal  0.0189512 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01814  MscS Mechanosensitive ion channel  39.22 
 
 
315 aa  204  1e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000781562  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001280  small-conductance mechanosensitive channel  37.32 
 
 
282 aa  198  7.999999999999999e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0155  MscS mechanosensitive ion channel  36.23 
 
 
300 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05165  hypothetical protein  35.13 
 
 
282 aa  197  2.0000000000000003e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2731  MscS mechanosensitive ion channel  39.04 
 
 
282 aa  195  9e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0729456  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0966  mechanosensitive ion channel  38.7 
 
 
266 aa  192  4e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.247343  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1959  MscS mechanosensitive ion channel  39.39 
 
 
278 aa  191  2e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00109223  normal  0.0228344 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1094  hypothetical protein  37.19 
 
 
291 aa  186  3e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.658963  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2100  MscS mechanosensitive ion channel  36.9 
 
 
278 aa  177  2e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5589  putative MscS mechanosensitive ion channel protein  38.29 
 
 
275 aa  92.8  5e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.204924  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1921  cation efflux protein  25.1 
 
 
275 aa  72.8  0.000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000577471  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0474  MscS mechanosensitive ion channel  26.49 
 
 
320 aa  62.8  0.000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.738891  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2154  MscS Mechanosensitive ion channel  31.01 
 
 
316 aa  61.6  0.00000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.568534  normal  0.399111 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2779  hypothetical protein  28.76 
 
 
313 aa  58.5  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.188203  normal  0.0353015 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0987  MscS Mechanosensitive ion channel  37.96 
 
 
238 aa  56.2  0.0000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1867  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  24.7 
 
 
480 aa  55.8  0.0000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0456814  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5647  MscS mechanosensitive ion channel  28.57 
 
 
359 aa  55.8  0.0000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.560781 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0444  MscS Mechanosensitive ion channel  28.99 
 
 
404 aa  55.1  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.920627  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1936  MscS mechanosensitive ion channel  28.07 
 
 
413 aa  55.5  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0057  MscS Mechanosensitive ion channel  24 
 
 
421 aa  54.3  0.000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.185804  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1647  MscS Mechanosensitive ion channel  24.28 
 
 
429 aa  55.1  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1058  MscS Mechanosensitive ion channel  24.46 
 
 
315 aa  53.9  0.000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2854  MscS Mechanosensitive ion channel  22.97 
 
 
314 aa  53.9  0.000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.247394  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5256  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  36.56 
 
 
475 aa  53.5  0.000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.584441  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2981  hypothetical protein  22.88 
 
 
298 aa  53.5  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0759175  normal  0.0858863 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5166  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  36.56 
 
 
475 aa  53.5  0.000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0740457  normal  0.0860349 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2780  hypothetical protein  35.71 
 
 
301 aa  52.8  0.000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.188886  normal  0.0383383 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2393  MscS Mechanosensitive ion channel  24.22 
 
 
408 aa  52.8  0.000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2229  MscS Mechanosensitive ion channel  22.8 
 
 
400 aa  52.8  0.000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.224666  normal  0.568068 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2755  MscS mechanosensitive ion channel:conserved TM helix  24.73 
 
 
276 aa  51.6  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.661967 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1791  small-conductance mechanosensitive channel  23.68 
 
 
369 aa  51.6  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0722785  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08930  MscS Mechanosensitive ion channel  26.72 
 
 
225 aa  52  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1093  MscS Mechanosensitive ion channel  23.42 
 
 
389 aa  52  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.464677  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1529  MscS Mechanosensitive ion channel  25.52 
 
 
385 aa  50.4  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0407  MscS mechanosensitive ion channel  28.85 
 
 
315 aa  50.4  0.00003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.323817  normal  0.0164618 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5308  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  34.41 
 
 
508 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.119708 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1508  MscS Mechanosensitive ion channel  27.46 
 
 
301 aa  50.4  0.00003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0603757 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2105  MscS Mechanosensitive ion channel  23.35 
 
 
414 aa  50.8  0.00003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0600957  normal  0.059013 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01308  conserved inner membrane protein  23.31 
 
 
343 aa  49.7  0.00005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2315  MscS Mechanosensitive ion channel  23.31 
 
 
343 aa  49.7  0.00005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0901587  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1447  small conductance mechanosensitive ion channel family protein  23.31 
 
 
343 aa  49.7  0.00005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1543  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  23.31 
 
 
343 aa  49.7  0.00005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2294  MscS mechanosensitive ion channel  23.31 
 
 
343 aa  49.7  0.00005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1791  small conductance mechanosensitive ion channel family protein  23.31 
 
 
343 aa  49.7  0.00005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1570  transporter, small conductance mechanosensitive ion channel family  23.31 
 
 
343 aa  49.7  0.00005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1978  transporter, small conductance mechanosensitive ion channel family  23.31 
 
 
343 aa  49.7  0.00005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.218747 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01318  hypothetical protein  23.31 
 
 
343 aa  49.7  0.00005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.831445  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4382  MscS mechanosensitive ion channel  28.41 
 
 
262 aa  49.7  0.00006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.496887  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2387  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  30.69 
 
 
490 aa  48.1  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.178532  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0786  MscS mechanosensitive ion channel  25.87 
 
 
327 aa  47.8  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0154774  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0426  MscS mechanosensitive ion channel  24.6 
 
 
273 aa  47.8  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000444789  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1059  MscS mechanosensitive ion channel  27.7 
 
 
384 aa  48.1  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.196377 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0857  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  25.5 
 
 
383 aa  47.8  0.0002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.017497  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1546  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  28.12 
 
 
479 aa  47.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.514924  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0207  MscS Mechanosensitive ion channel  23.21 
 
 
283 aa  48.1  0.0002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1247  transmembrane protein  21.71 
 
 
435 aa  47.4  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.072199  normal  0.308743 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1073  mechanosensitive ion channel family protein  25.53 
 
 
535 aa  47.4  0.0003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1177  mechanosensitive ion channel  25.5 
 
 
383 aa  47.4  0.0003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.180784  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2824  MscS mechanosensitive ion channel  21.26 
 
 
330 aa  47  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6131  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  27.72 
 
 
489 aa  47.4  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03384  small-conductance mechanosensitive channel  25.25 
 
 
803 aa  47.4  0.0003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.670806  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3758  MscS Mechanosensitive ion channel  25.6 
 
 
809 aa  47.4  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.992907  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0663  MscS Mechanosensitive ion channel  28.91 
 
 
336 aa  47  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1154  hypothetical protein  27.73 
 
 
363 aa  46.6  0.0004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0298455  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4629  MscS mechanosensitive ion channel  23.16 
 
 
832 aa  47  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1888  MscS Mechanosensitive ion channel  21.47 
 
 
362 aa  47  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05088  hypothetical protein  25.13 
 
 
399 aa  46.6  0.0005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0442  MscS Mechanosensitive ion channel  28.57 
 
 
279 aa  46.6  0.0005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6691  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  29.25 
 
 
485 aa  46.6  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2790  MscS mechanosensitive ion channel  29.27 
 
 
335 aa  46.2  0.0006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.756482  normal  0.557915 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1153  MscS Mechanosensitive ion channel  24.16 
 
 
352 aa  46.2  0.0006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2332  MscS Mechanosensitive ion channel  20.62 
 
 
362 aa  46.2  0.0006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1446  MscS mechanosensitive ion channel  25 
 
 
648 aa  45.8  0.0007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.770596  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02189  hypothetical protein  24.87 
 
 
249 aa  45.8  0.0007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0970  small-conductance mechanosensitive ion channel  25 
 
 
650 aa  45.4  0.001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00371389 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1968  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  35 
 
 
475 aa  45.1  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.805203  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2451  small-conductance mechanosensitive channel  24.3 
 
 
380 aa  45.4  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3066  MscS mechanosensitive ion channel  25.13 
 
 
452 aa  45.1  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2357  hypothetical protein  27.08 
 
 
348 aa  44.3  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.116724  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0552  MscS Mechanosensitive ion channel  31.11 
 
 
296 aa  44.7  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0855  mechanosensitive ion channel family protein  24 
 
 
526 aa  44.3  0.002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3246  MscS mechanosensitive ion channel  27.18 
 
 
381 aa  44.3  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00298811  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1066  mechanosensitive ion channel family protein  25.62 
 
 
528 aa  44.3  0.002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.0000663249  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1264  MscS Mechanosensitive ion channel  25.51 
 
 
536 aa  44.3  0.002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.908729  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00593  MscS Mechanosensitive ion channel  23.26 
 
 
356 aa  44.7  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.863063  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0460  transporter, small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  24.64 
 
 
280 aa  44.3  0.002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.00313509  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3626  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  23.02 
 
 
489 aa  43.9  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2608  mechanosensitive ion channel family protein  25 
 
 
825 aa  43.5  0.004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.349131  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1295  MscS mechanosensitive ion channel  22.87 
 
 
391 aa  43.5  0.004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1690  MscS mechanosensitive ion channel  25.15 
 
 
476 aa  43.5  0.004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1076  MscS mechanosensitive ion channel  25.59 
 
 
378 aa  43.9  0.004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.119695  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0617  MscS mechanosensitive ion channel  21.98 
 
 
338 aa  43.1  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.210835  normal  0.752053 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0890  MscS mechanosensitive ion channel  26.56 
 
 
330 aa  43.1  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  unclonable  0.000000201965 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0047  MscS mechanosensitive ion channel  27.92 
 
 
270 aa  43.1  0.006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4003  MscS mechanosensitive ion channel  26.72 
 
 
362 aa  43.1  0.006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0737574  normal  0.463755 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1504  conserved hypothetical integral membrane protein, mechanosensitive ion channel family  23.83 
 
 
624 aa  43.1  0.006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2527  MscS mechanosensitive ion channel  24.86 
 
 
427 aa  42.7  0.007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>